DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SETBP1 and Setbp1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_024306917.1 Gene:SETBP1 / 26040 HGNCID:15573 Length:1622 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038953130.1 Gene:Setbp1 / 291423 RGDID:1306229 Length:1582 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1622 Identity:1437/1622 - (88%)
Similarity:1504/1622 - (92%) Gaps:40/1622 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MESRETLSSSRQRGGESDFLPVSSAKPPAAPGCAGEPLLSTPGPGKGIPVGGERMEPEEEDELGS 65
            |||||.||||||||.||:|||.||::.||.|||:||||       |||.|||||:||||||||||
  Rat     1 MESREILSSSRQRGSESEFLPGSSSRSPATPGCSGEPL-------KGISVGGERIEPEEEDELGS 58

Human    66 GRDVDSNSNADSEKWVAGDGLEEQEFSIKEANFTEGSLKLKIQTTKRAKKPPKNLENYICPPEIK 130
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    59 GRDVDCNSNADSEKWVAGDGLEEQEFSIKEANFSEGSLKLKIQTTKRAKKPPKNLENYICPPEIK 123

Human   131 ITIKQSGDQKVSRAGKNSKATKEEERSHSKKKGVTVTYSDLPSCVWHSAVIAEDCLGILLTASDL 195
            |||||||||||||||||.||||||||:|||||                          ||||||.
  Rat   124 ITIKQSGDQKVSRAGKNGKATKEEERNHSKKK--------------------------LLTASDP 162

Human   196 AASDLKGFQPQAYERPQKHSTLHYDTGLPQDFTGDTLKPKHQQKSSSQNHMDWSTNSDSGPVTQN 260
            |||||||||.||||||||||||.||.||.|.||.||||||||||||||:|||||:||||||.|||
  Rat   163 AASDLKGFQTQAYERPQKHSTLQYDPGLSQGFTSDTLKPKHQQKSSSQSHMDWSSNSDSGPATQN 227

Human   261 CFISPESGRETASTSKIPALEPVASFAKAQGKKGSAGNTWSQLSNNNKDLLLGGVAPSPSSHSSP 325
            |.|||||||:|.||||||||||||||||.|.||||.|:||||||:::||||||.|.|||.|||||
  Rat   228 CIISPESGRDTTSTSKIPALEPVASFAKTQSKKGSTGSTWSQLSSSSKDLLLGSVVPSPGSHSSP 292

Human   326 APPSSSAECNGLQPLVDQDGGGTKEPPEPPTVGSKKKSSKKDVISQTIPNPDLDWVKNAQKAFDN 390
            |.||:||||||||||.||:|||||:.|||||:.|||||||||:|||||||.||||||:|||||:.
  Rat   293 ATPSNSAECNGLQPLGDQEGGGTKDLPEPPTISSKKKSSKKDLISQTIPNSDLDWVKSAQKAFET 357

Human   391 TEGKREGYSADSAQEASPARQNVSSASNPENDSSHVRITIPIKAPSLDPTNHKRKKRQSIKAVVE 455
            ||||||.||||:|||.||.||::||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
  Rat   358 TEGKRETYSADNAQETSPTRQSISSVSNPENDSSHVRITIPIKTPSLDPTNHKRKKRQSIKAVVE 422

Human   456 KIMPEKALASGITMSSEVVNRILSNSEGNKKDPRVPKLSKMIENESPSVGLETGGNAEKVIPGGV 520
            ||:|||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||.||||::||||
  Rat   423 KIIPEKALASGITMSSEVVNRILSNSEGSKKDPRVPKLSKMIENESPSVGLETGANAEKIVPGGV 487

Human   521 SKPRKPPMVMTPPTCTDHSPSRKLPEIQHPKFAAKRRWTCSKPKPSTMLREAVMATSDKLMLEPP 585
            ||.||||:|||.||..:|:||.|||||||||||||||  |||.||..||||||:||::|||:|||
  Rat   488 SKQRKPPLVMTSPTRAEHAPSGKLPEIQHPKFAAKRR--CSKAKPPAMLREAVLATAEKLMVEPP 550

Human   586 SAYPITPSSPLYTNTDSLTVITPVKKKRGRPKKQPLLTVETIHEGTSTSPVSPISREFPGTKKRK 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   551 SAYPITPSSPLYTNTDSLTVITPVKKKRGRPKKQPLLTVETIHEGTSTSPVSPISREFPGTKKRK 615

Human   651 RRRNLAKLAQLVPGEDKPMSEMKFHKKVGKLGVLDKKTIKTINKMKTLKRKNILNQILSCSSSVA 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   616 RRRNLAKLAQLVPGEDKPMSEMKFHKKVGKLGVLDKKTIKTINKMKTLKRKNILNQILSCSSSVA 680

Human   716 LKAKAPPETSPGAAAIESKLGKQINVSKRGTIYIGKKRGRKPRAELPPPSEEPKTAIKHPRPVSS 780
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
  Rat   681 LKAKAPPETSPGAASIESKLGKQINVSKRGTIYIGKKRGRKPRTELPPPSEEPKTAIKHPRPVSS 745

Human   781 QPDVPAVPSNFQSLVASSPAAMHPLSTQLGGSNGNLSPASTETNFSELKTMPNLQPISALPTKTQ 845
            |||||||||:|||.|||||||:|||:||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   746 QPDVPAVPSSFQSPVASSPAAVHPLATQLGGSHGNLSPASTETNFSELKTMPNLQPISALPTKTQ 810

Human   846 KGIHSGTWKLSPPRLMANSPSHLCEIGSLKEITLSPVSESHSEETIPSDSGIGTDNNSTSDQAEK 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   811 KGIHSGTWKLSPPRLMANSPSHLCEIGSLKEITLSPVSESHSEETIPSDSGIGTDNNSTSDQAEK 875

Human   911 SSESRRRYSFDFCSLDNPEAIPSDTSTKNRHGHRQKHLIVDNFLAHESLKKPKHKRKRKSLQNRD 975
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
  Rat   876 SSESRRRYSFDFCSLDNPEAIPPDTSTKNRHGHRQKHLIVDTFLAHESLKKPKHKRKRKSLQNRD 940

Human   976 DLQFLADLEELITKFQVFRISHRSYTFYHENPYPSIFRINFDHYYPVPYIQYDPLLYLRRTSDLK 1040
            ||||||:||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   941 DLQFLAELEELITKFQVFRISHRGYTFYHENPYPSIFRINFDHYYPVPYIQYDPLLYLRRTSDLK 1005

Human  1041 SKKKRGRPAKTNDTMTKVPFLQGFSYPIPSGSYYAPYGMPYTSMPMMNLGYYGQYPAPLYLSHTL 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1006 SKKKRGRPAKTNDTMTKVPFLQGFSYPIPSGSYYAPYGMPYTSMPMMNLGYYGQYPAPLYLSHTL 1070

Human  1106 GAASPFMRPTVPPPQFHTNSHVKMSGAAKHKAKHGVHLQGPVSMGLGDMQPSLNPPKVGSASLSS 1170
            ||||||||||||||||||:||||||||.||||||||||||.|.|||||:||||||||||.|:|||
  Rat  1071 GAASPFMRPTVPPPQFHTSSHVKMSGATKHKAKHGVHLQGTVGMGLGDIQPSLNPPKVGGAALSS 1135

Human  1171 GRLHKRKHKHKHKHKEDRILGTHDNLSGLFAGKATGFSSHILSERLSSADKELPLVSEKNKHKEK 1235
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|:||||||||||:||||:
  Rat  1136 SRLHKRKHKHKHKHKEDRILGTHDNLSGLFAGKATGFSSHLLSERLNSSDKELPLVSEKSKHKER 1200

Human  1236 QKHQHSEAGHKASKNNFEVDTLSTLSLSDAQHWTQAKEKGDLSSEPVDSCTKRYSGSGGDGGSTR 1300
            |||||.:|.||.|||||||||||||||||||||||||:|||||:|||:||.|||||||||  |||
  Rat  1201 QKHQHGDASHKVSKNNFEVDTLSTLSLSDAQHWTQAKDKGDLSNEPVESCAKRYSGSGGD--STR 1263

Human  1301 SENLDVFSEMNPSNDKWDSDVSGSKRRSYEGFGTYREKDIQAFKMNRKERSSYDSSMSPGMPSPH 1365
            ||:||||||||||:||||||:||||||.:|||||||||||||||||||||.||:|||:|||||||
  Rat  1264 SESLDVFSEMNPSSDKWDSDMSGSKRRGFEGFGTYREKDIQAFKMNRKERGSYESSMTPGMPSPH 1328

Human  1366 LKVDQTAVHSKNEGSVPTMMTRKKPAAVDSVTIPPAPVLSLLAASAATSDAVGSSLKKRFKRREI 1430
            ||||||.||||:||||.|||.||||.|||||.||.||||||||||||||||..||||||||||||
  Rat  1329 LKVDQTTVHSKSEGSVSTMMARKKPTAVDSVAIPSAPVLSLLAASAATSDAASSSLKKRFKRREI 1393

Human  1431 EAIQCEVRKMCNYTKILSTKKNLDHVNKILKAKRLQRQSKTGNNFVKKRRGRPRKQPTQFDEDSR 1495
            |||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
  Rat  1394 EAIQCEVRKMCHYTKLLSTKKNLDHVNKILKAKRLQRQSKTGNNFVKKRRGRPRKQPSQFDEDSR 1458

Human  1496 DQMPVLEKCIDLPSKRGQKPSLSPLVLEPAASQDTIMATIEAVIHMAREAPPLPPPPPPPLPPPP 1560
            |||||||||||||||||||||||||.||||:.||.:||||||||||||||||| |||||||||||
  Rat  1459 DQMPVLEKCIDLPSKRGQKPSLSPLALEPASGQDAVMATIEAVIHMAREAPPL-PPPPPPLPPPP 1522

Human  1561 PPPLPPPPPLPKTPRGGKRKHKPQAPAQPPQQSPPQQPLPQEEEVKAKRQRKSRGSESEVLP 1622
            |||.|||||||||.|||||||:||.||||.|  ||.|||||||||||||.||||.|||:|||
  Rat  1523 PPPPPPPPPLPKTSRGGKRKHRPQPPAQPAQ--PPPQPLPQEEEVKAKRPRKSRASESDVLP 1582



Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 2266 1.000 Domainoid score I183
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H9192
Inparanoid 1 1.050 2266 1.000 Inparanoid score I1043
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG40022
OrthoDB 1 1.010 - - D10533at9347
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0012397
OrthoInspector 1 1.000 - - oto139536
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_117557
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR46147
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X10361
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1414.480

Return to query results.
Submit another query.