DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NIPBL and Nipbl

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_597677.2 Gene:NIPBL / 25836 HGNCID:28862 Length:2804 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001414626.1 Gene:Nipbl / 294787 RGDID:1306393 Length:2798 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2804 Identity:2702/2804 - (96%)
Similarity:2762/2804 - (98%) Gaps:6/2804 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNARIAEEVNCLLACRDDNLVSQL 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat     1 MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNSRIAEEVNCLLACRDDNLVSQL 65

Human    66 VHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDIPVLLQAVLARSPNVFREKSMQNRYVQSGMMMSQYKLSQ 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 VHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDIPVLLQAVLARSPNVFREKSMQNRYVQSGMMMSQYKLSQ 130

Human   131 NSMHSSPASSNYQQTTISHSPSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAPQSPAGYMPYSHPSSY 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 NSMHSSPASSNYQQTTISHSPSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAPQSPAGYMPYSHPSSY 195

Human   196 TTHPQMQQASVSSPIVAGGLRNIHDNKVSGPLSGNSANHHADNPRHGSSEDYLHMVHRLSSDDGD 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat   196 TTHPQMQQASVSSPIVAGGLRNIHDNKVSGPLSGNSANHHADNPRHGSSDDYLHMVHRLSSDDGD 260

Human   261 SSTMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSEGTPKGSRPPLILQSQSLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKK 325
            ||.|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 SSAMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSDGTPKGSRPPLILQSQSLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKK 325

Human   326 QKKMKLGKDEKEQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTLRLSRVRSSDMDQQEDMISGVENSNVSENDI 390
            |||||||||||:|:||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:||:||||||||||
  Rat   326 QKKMKLGKDEKDQNEKAAMYDIISSPTKDSTKLTLRLSRVRSSDMDQQEDMLSGMENSNVSENDI 390

Human   391 PFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSVAAKQPQTSVVQN 455
            |||||||||||||||||||:||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat   391 PFNVQYPGQTSKTPITPQDVNRSLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSVATKQPQTSVVQN 455

Human   456 QQQISQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGG 520
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 QQQVSQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGG 520

Human   521 NRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGRVDSQASITQDSDSIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDI 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||:|||||:||||||.|||||||:||||||.
  Rat   521 NRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGRADSQASLTQDSDNIKKPEETKQCNDAPISVLQEDS 585

Human   586 VGSLKSTPENHPETPKKKSDPELSKSEMKQSESRLAESKPNENRLVETKSSENKLETKVETQTEE 650
            ||||||.|||||||||.|||||||||||||:||||:|||||||:|.|:||:|:|||||.||||||
  Rat   586 VGSLKSIPENHPETPKNKSDPELSKSEMKQNESRLSESKPNENQLGESKSNESKLETKTETQTEE 650

Human   651 LKQNESRTTECKQNESTIVEPKQNENRLSDTKPNDNKQNNGRSETTKSRPETPKQKGESRPETPK 715
            |||:|::|||.||:||.:||||||||||.|||||||||||.|||.||:||||||||.||||||||
  Rat   651 LKQSENKTTESKQSESAVVEPKQNENRLCDTKPNDNKQNNTRSENTKARPETPKQKAESRPETPK 715

Human   716 QKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGESRPETPKQKNEGRPETPKHRHDNRRDSGKPSTEKKPEVS 780
            |||:|.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||:||:|||||||||||:||
  Rat   716 QKSEGRPETPKQKGDGRPETPKQKSEGRPETPKQKGEGRPETPKHRHENRKDSGKPSTEKKPDVS 780

Human   781 KHKQDTKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDNKQKSDDRGESERHRGDQSRVRRPET 845
            |||||.||||.|||||||||||||||||  |||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 KHKQDIKSDSSRLKSERAEALKQRPDGR--SESLRRDHDSKQKSDDRGESERHRGDQSRVRRPET 843

Human   846 LRSSSRNEHGIKSDSSKTDKLERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDSNKSRSDKLGF 910
            |||||||||..|||.|||:||||||||||||||:|| |||||||||||||||||:||||.   ||
  Rat   844 LRSSSRNEHSTKSDGSKTEKLERKHRHESGDSRDRP-SGEQKSRPDSPRVKQGDTNKSRP---GF 904

Human   911 KSPTSKDDKRTEGNKSKVDTNKAHPDNKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPKIKRDKDGNVTQETKK 975
            |||.||||||||||:||||:||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||:||||||
  Rat   905 KSPNSKDDKRTEGNRSKVDSNKAHTDNKAEFPSYLLGGRSSALKNFVIPKIKRDKDGNITQETKK 969

Human   976 MEMKGEPKDKVEKIGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKNKPSKSNK 1040
            |:||||.||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.:|||||||||
  Rat   970 MDMKGEQKDKVEKMGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDREEKSRSSLKSLKNKPSKSNK 1034

Human  1041 GSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRK 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1035 GSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRK 1099

Human  1106 RHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVAR 1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1100 RHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHDGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVAR 1164

Human  1171 KMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFKRFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGK 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1165 KMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFKRFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGK 1229

Human  1236 HQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLI 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1230 HQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLI 1294

Human  1301 MERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGL 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1295 MERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGL 1359

Human  1366 LSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSEL 1430
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1360 LSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSEL 1424

Human  1431 QLCAIKLVTAVFSRYEKHRQLILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVL 1495
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat  1425 QLCAIKLVTAVFSRYEKHRQLILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDVDGEPMYIQMVTALVL 1489

Human  1496 QLIQCVVHLPSSEKDSNAEEDSNKKIDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCGSKQGEEDYRP 1560
            |||||||||||||||.|:|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1490 QLIQCVVHLPSSEKDPNSEEDSNKKVDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCGSKQGEEDYRP 1554

Human  1561 LFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKSTEMALRVASLDYLGTVAARLRKDAV 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1555 LFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKSTEMALRVASLDYLGTVAARLRKDAV 1619

Human  1626 TSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQLQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQWFRDTTLETEK 1690
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1620 TSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQLQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQWFRDTTLETEK 1684

Human  1691 AMKSQKDEESSEGTHHAKEIETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFSTLKMNSDTVDYDDACL 1755
            |||||||||||:|.|||||||||||||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1685 AMKSQKDEESSDGAHHAKEIETTGQIMHRAESRKRFLRSIIKTTPSQFSTLKMNSDTVDYDDACL 1749

Human  1756 IVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVVAVDPSILARLDMQRGVHGRL 1820
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1750 IVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVVAVDPSILARLDMQRGVHGRL 1814

Human  1821 MDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYYDMLIERILDTGISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKI 1885
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1815 MDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYYDMLIERILDTGISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKI 1879

Human  1886 TEMCVKMIRRVNDEEGIKKLVNETFQKLWFTPTPHNDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQ 1950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1880 TEMCVKMIRRVNDEEGIKKLVNETFQKLWFTPTPHNDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQ 1944

Human  1951 LLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVEHILKYEESLADSDNKGVNSGRLVACITTLFLFSKI 2015
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1945 LLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVEHILKYEESLADSDNKGVNSGRLVACITTLFLFSKI 2009

Human  2016 RPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQNDFMVICNVAKILELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKY 2080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2010 RPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQNDFMVICNVAKILELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKY 2074

Human  2081 GMTVVQHCVSCLGAVVNKVTQNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLF 2145
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2075 GMTVVQHCVSCLGAVVNKVTQNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLF 2139

Human  2146 TVGALCRHFDFDLEDFKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAFIQHPSLMFEQ 2210
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2140 TVGALCRHFDFDLEDFKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAFIQHPSLMFEQ 2204

Human  2211 EVKNLYNNILSDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMS 2275
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2205 EVKNLYNSILSDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMS 2269

Human  2276 SSIMQLYLKQVLEAFFHTQSSVRHFALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQ 2340
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2270 SSIMQLYLKQVLEAFFHTQSSVRHFALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQ 2334

Human  2341 QLVEIDKKYAGFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIRGNRQH 2405
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2335 QLVEIDKKYAGFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIRGNRQH 2399

Human  2406 RRAFLISLLNLFDDTAKTDVTMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIMHHIDITLSVSGSNLLQSFKE 2470
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2400 RRAFLISLLNLFDDTAKTEVTMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIMHHIDITLSVSGSNLLQSFKE 2464

Human  2471 SMVKDKRKERKSSPSKENESSDSEEEVSRPRKSRKRVDSDSDSDSEDDINSVMKCLPENSAPLIE 2535
            |||||||||||:||:||||||:|||||.|||||||||||:||||||||:||||||||||||||||
  Rat  2465 SMVKDKRKERKTSPAKENESSESEEEVCRPRKSRKRVDSESDSDSEDDVNSVMKCLPENSAPLIE 2529

Human  2536 FANVSQGILLLLMLKQHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAINRKTGVHFHPKQTLDFLRSD 2600
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2530 FANVSQGILLLLMLKQHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAINRKTGVHFHPKQTLDFLRSD 2594

Human  2601 MANSKITEEVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVSASTNARNKAITSLLGGGSPKNNTAA 2665
            |||||:||:||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat  2595 MANSKLTEDVKRSIVRQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVSASTNARNKAITSLLGGGSPKNNPAA 2659

Human  2666 ETEDDESDGEDRGGGTSGSLRRSKRNSDSTELAAQMNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQK 2730
            :|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat  2660 DTEDEESDGEDRGGGTSGSLRRSKRNSDSTELAAQMNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQR 2724

Human  2731 TSSGFSVQWMAGSYSGSWTEAKRRDGRKLVPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSL 2795
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2725 TSSGVSVQWMAGSYSGSWTEAKRRDGRKLVPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSL 2789

Human  2796 YAAKDGTSS 2804
            |||||||||
  Rat  2790 YAAKDGTSS 2798

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NIPBLNP_597677.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 128..340 207/211 (98%)
PTZ00121 <476..1092 CDD:173412 551/615 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 482..946 407/463 (88%)
PspC_subgroup_2 <597..832 CDD:468202 200/234 (85%)
PxVxL motif. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20562864, ECO:0000269|PubMed:28167679 996..1009 12/12 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1017..1047 26/29 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1060..1191 129/130 (99%)
SCC2 1263..2473 CDD:467937 1199/1209 (99%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1691..1710 16/18 (89%)
HEAT 1 1767..1805 37/37 (100%)
HEAT repeat 1811..1839 CDD:293787 27/27 (100%)
HEAT 2 1843..1881 37/37 (100%)
HEAT repeat 1848..1874 CDD:293787 25/25 (100%)
HEAT 3 1945..1984 38/38 (100%)
HEAT 4 2227..2267 39/39 (100%)
HEAT 5 2313..2351 37/37 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2473..2520 41/46 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2651..2696 41/44 (93%)
NipblNP_001414626.1 None

Return to query results.
Submit another query.