DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment BRWD3 and Brwd3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_694984.5 Gene:BRWD3 / 254065 HGNCID:17342 Length:1802 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_008771579.2 Gene:Brwd3 / 317213 RGDID:1559445 Length:1799 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1802 Identity:1705/1802 - (94%)
Similarity:1751/1802 - (97%) Gaps:3/1802 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAAPTQIEAELYYLIARFLQSGPCNKSAQVLVQELEEHQLIPRRLDWEGKEHRRSFEDLVAANA 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAAAPTQIEAELYYLIARFLQSGPCNKSAQVLVQELEEHQLIPRRLDWEGKEHRRSFEDLVAANA 65

Human    66 HIPPDYLLKICERIGPLLDKEIPQSVPGVQTLLGVGRQSLLRDAKDCKSTLWNGSAFAALHRGRP 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat    66 HIPPDYLLKICERIGPLLDKEIPQSVPGVQTLLGVGRQSLLRDAKDCKNTLWNGSAFAALHRGRP 130

Human   131 PELPVNYVKPPNVVNITSARQLTGCSRFGHIFPSSAYQHIKMHKRILGHLSSVYCVAFDRSGRRI 195
            ||||||||||||||||||||||||||||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 PELPVNYVKPPNVVNITSARQLTGCSRFSHVFPSSAYQHIKMHKRILGHLSSVYCVAFDRSGRRI 195

Human   196 FTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHSAEISDMAVNYENTLIAAGSCDKVVRVWCLRTCAPVAVL 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 FTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHSAEISDMAVNYENTLIAAGSCDKVVRVWCLRTCAPVAVL 260

Human   261 QGHSASITSIQFCPSTKGTNRYLTSTGADGTICFWQWHVKTMKFRDRPVKFTERSRPGVQISCSS 325
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 QGHSASITSIQFCPSTKGTTRYLTSTGADGTICFWQWHVKTMKFRDRPVKFTERSRPGVQISCSS 325

Human   326 FSSGGMFITTGSTDHVIRIYYLGSEVPEKIAELESHTDKVVAVQFCNNGDSLRFVSGSRDGTARI 390
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 FSSGGMFITTGSTDHVIRIYYLGSEIPEKIAELESHTDKVVAVQFCNNGDSLRFVSGSRDGTARI 390

Human   391 WQYQQQEWKSIVLDMATKMTGNNLPSGEDKITKLKVTMVAWDRYDTTVITAVNNFLLKVWNSITG 455
            |||||||||||||||||||:||||.|.|||:|||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   391 WQYQQQEWKSIVLDMATKMSGNNLTSTEDKVTKLKVTMVAWDRYDTTVITAVNNFLLKVWNSVTG 455

Human   456 QLLHTLSGHDDEVFVLEAHPFDQRIILSAGHDGNIFIWDLDRGTKIRNYFNMIEGQGHGAVFDCK 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 QLLHTLSGHDDEVFVLEAHPFDQRIILSAGHDGNIFIWDLDRGTKIRNYFNMIEGQGHGAVFDCK 520

Human   521 FSPDGNHFACTDSHGHLLLFGFGCSKYYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDANNYVLDEQTQQAPHLMP 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 FSPDGNHFACTDSHGHLLLFGFGCSKYYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDANNYVLDEQTQQAPHLMP 585

Human   586 PPFLVDVDGNPHPTKFQRLVPGRENCKDEQLIPQLGYVANGDGEVVEQVIGQQTNDQDESILDGI 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
  Rat   586 PPFLVDVDGNPHPTKFQRLVPGRENCKDEQLIPQLGYVANGDGEVVEQVIGQQTNDQEESILDGI 650

Human   651 IRELQREQDLRLINEGDVPHLPVNRAYSVNGALRSPNMDISSSPNIRLRRHSSQIEGVRQMHNNA 715
            ||||||||||||||||||||.|:||:|||||||.||||||.|||||.||| |.||||||||||||
  Rat   651 IRELQREQDLRLINEGDVPHFPINRSYSVNGALSSPNMDIPSSPNIGLRR-SGQIEGVRQMHNNA 714

Human   716 PRSQMATERDLMAWSRRVVVNELNNGVSRVQEECRTAKGDIEISLYTVEKKKKPSYTTQRNDYEP 780
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||.||||:|:|||||||||||||..|||||:|
  Rat   715 PRSQMATERDLMAWSRRVVVNELNSGVSRVQEECRNAKGDLEVSLYTVEKKKKPSYPIQRNDYQP 779

Human   781 SCGRSLRRTQRKRQHTYQTRSNIEHNSQASCQNSGVQEDSDSSSEEDETVGTSDASVEDPVVEWQ 845
            |||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||||
  Rat   780 SCGRSLRRTQRKRQHTYLTRSNIEHNSQASSQNSGVQGDSDSSSEEDETVGTSDASAEDPVVEWQ 844

Human   846 SESSSSDSSSEYSDWTADAGINLQPPKRQTRQTTRKICSSSDEENLKSLEERQKKPKQTRKKKGG 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|:||.|||::||:||.|:||||||||||||||
  Rat   845 SESSSSDSSSEYSDWTADAGINLQPPKRQTRQATQKIYSSSEDENVKSSEDRQKKPKQTRKKKGG 909

Human   911 LVSIAGEPNEEWFAPQWILDTIPRRSPFVPQMGDELIYFRQGHEAYVRAVRKSKIYSVNLQKQPW 975
            |||:||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   910 LVSMAGEPNEEWLAPQWILDTIPRRSPFVPQMGDELIYFRQGHEAYVRAVRKSKIYSVNLQKQPW 974

Human   976 NKMDLREQEFVKIVGIKYEVGPPTLCCLKLAFLDPISGKMTGESFSIKYHDMPDVIDFLVLHQFY 1040
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   975 NKMDLREQEFVKIVGIKYEIGPPTLCCLKLAFLDPISGKMTGESFSIKYHDMPDVIDFLVLHQFY 1039

Human  1041 NEAKERNWQIGDRFRSIIDDAWWFGTVESQQPFQPEYPDSSFQCYSVHWDNNEREKMSPWDMEPI 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1040 NEAKERNWQIGDRFRSIIDDAWWFGTVESQQPFQPEYPDSSFQCYSVHWDNNEREKMSPWDMEPI 1104

Human  1106 PEGTAFPDEVGAGVPVSQEELTALLYKPQEGEWGAHSRDEECERVIQGINHLLSLDFASPFAVPV 1170
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat  1105 PEGTAFPDEVGAGIPVSQEELTALLYKPQEGEWGAHSRDEECERVIQGINNLLSLDFASPFAVPV 1169

Human  1171 DLSAYPLYCTVVAYPTDLNTIRRRLENRFYRRISALMWEVRYIEHNARTFNEPDSPIVKAAKIVT 1235
            |||||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1170 DLSAYPLYCTVVAYPTDLNTIKQRLENRFYRRISALMWEVRYIEHNARTFNEPDSPIVKAAKIVT 1234

Human  1236 DVLLRFIGDQSCTDILDTYNKIKAEERNSTDAEEDTEIVDLDSDGPGTSSGRKVKCRGRRQSLKC 1300
            |||||||||||||||||||||||||..||:|.|||||:||||||||||||||:.|||||||||||
  Rat  1235 DVLLRFIGDQSCTDILDTYNKIKAENPNSSDPEEDTEMVDLDSDGPGTSSGRRAKCRGRRQSLKC 1299

Human  1301 NPDAWKKQCKELLSLIYEREDSEPFRQPADLLSYPGHQEQEGESSESVVPERQQDSSLSEDYQDV 1365
            ||||||:|||||||||||||||||||||||..|:|. |:|||||||||.|:| ||.|||||||||
  Rat  1300 NPDAWKQQCKELLSLIYEREDSEPFRQPADPHSHPA-QQQEGESSESVPPDR-QDPSLSEDYQDV 1362

Human  1366 IDTPVDFSTVKETLEAGNYGSPLEFYKDVRQIFNNSKAYTSNKKSRIYSMMLRLSALFESHIKNI 1430
            :|||:||||||||||:|||.|||||||||||||:||||||||||||||||.||||||||:.||||
  Rat  1363 VDTPMDFSTVKETLESGNYDSPLEFYKDVRQIFSNSKAYTSNKKSRIYSMTLRLSALFENRIKNI 1427

Human  1431 ISEYKSAIQSQKRRRPRYRKRLRSSSSSLSSSGAPSPKGKQKQMKLQPKNDQNTSVSHARTSSPF 1495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.:|||||||
  Rat  1428 ISEYKSAIQSQKRRRPRYRKRLRSSSSSLSSSRAPSPKGKQKQMKLQPKNDQNTSVVYARTSSPF 1492

Human  1496 SSPVSDAAEGLSLYLLDDEPDGPFSSSSFGGYSRSGNSHDPGKAKSFRNRVLPVKQDHSLDGPLT 1560
            ||||||||||:||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
  Rat  1493 SSPVSDAAEGVSLYLLDDEGDGPFSPSSCSGYSRSGNSHDPGKAKSFRNRVLPAKQDHSLDGPLT 1557

Human  1561 NGDGREPRTGIKRKLLSASEEDENMGGEDKEKKETKEKSHLSTSESGELGSSLSSESTCGSDSDS 1625
            |.||||||||.||||||||||||:||||:||.||||||:|||:|||||||||||||||.||||||
  Rat  1558 NVDGREPRTGAKRKLLSASEEDESMGGEEKEMKETKEKAHLSSSESGELGSSLSSESTSGSDSDS 1622

Human  1626 ESTSRTDQDYVDGDHDYSKFIQTRPKRKLRKQHGNGKRNWKTRGTGGRGRWGRWGRWSRGGRGRG 1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||..||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1623 ESTSRTDQDYVDGDHDYSKFIQTRPKRKLRRQHATGKRNWKTRGTGGRGRWGRWGRWSRGGRGRG 1687

Human  1691 GRGRGSRGRGGGGTRGRGRGRGGRGASRGATRAKRARIADDEFDTMFSGRFSRLPRIKTRNQGRR 1755
            |||||.|||||||.||||||||||||||||:|.||||:|||||||||:|||||||||||||||||
  Rat  1688 GRGRGGRGRGGGGGRGRGRGRGGRGASRGASRTKRARVADDEFDTMFAGRFSRLPRIKTRNQGRR 1752

Human  1756 TVLYNDDSDNDNFVSTEDPLNLGTSRSGRVRKMTEKARVSHLMGWNY 1802
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1753 TVLYNDDSDNDNFVSTEDPLNLGTSRSGRVRKMTEKARVSHLMGWNY 1799

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
BRWD3NP_694984.5 WD 1 170..209 38/38 (100%)
WD40 <178..496 CDD:441893 310/317 (98%)
WD40 repeat 183..220 CDD:293791 36/36 (100%)
WD 2 213..251 37/37 (100%)
WD40 repeat 226..262 CDD:293791 35/35 (100%)
WD 3 255..297 40/41 (98%)
WD40 repeat 267..313 CDD:293791 44/45 (98%)
WD 4 307..347 39/39 (100%)
WD40 repeat 321..359 CDD:293791 36/37 (97%)
WD 5 353..393 39/39 (100%)
WD40 repeat 365..425 CDD:293791 55/59 (93%)
WD 6 400..452 47/51 (92%)
WD40 repeat 426..462 CDD:293791 34/35 (97%)
WD 7 456..495 38/38 (100%)
WD40 repeat 468..493 CDD:293791 24/24 (100%)
WD 8 502..542 39/39 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 768..910 126/141 (89%)
Bromo_WDR9_I_like 1130..1242 CDD:99958 108/111 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1262..1292 23/29 (79%)
Bromodomain 1301..1442 CDD:445827 121/140 (86%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1326..1361 24/34 (71%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1438..1500 58/61 (95%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1520..1725 185/204 (91%)
Brwd3XP_008771579.2 WD40 <178..496 CDD:441893 310/317 (98%)
WD40 repeat 183..220 CDD:293791 36/36 (100%)
WD40 repeat 226..262 CDD:293791 35/35 (100%)
WD40 repeat 267..313 CDD:293791 44/45 (98%)
WD40 repeat 321..359 CDD:293791 36/37 (97%)
WD40 repeat 365..410 CDD:293791 44/44 (100%)
WD40 repeat 426..462 CDD:293791 34/35 (97%)
WD40 repeat 468..493 CDD:293791 24/24 (100%)
Bromo_WDR9_I_like 1129..1241 CDD:99958 108/111 (97%)
Bromodomain 1300..1439 CDD:445827 121/140 (86%)

Return to query results.
Submit another query.