DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DIP2 and Dip2c

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_612019.2 Gene:DIP2 / 252479 FlyBaseID:FBgn0024806 Length:1773 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038951677.1 Gene:Dip2c / 307067 RGDID:1560155 Length:1626 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1826 Identity:959/1826 - (52%)
Similarity:1194/1826 - (65%) Gaps:267/1826 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     6 SLPGYVREKLAELDLELSEGDITQKGYEKKRAKLLQPFLKKPEGDKVKSTPPPPYYNVKNANNST 70
            :||..||.:||||:|||||||||||||||||:||:..:|           |.||..|        
  Rat    10 ALPLEVRARLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLIGAYL-----------PQPPTAN-------- 55

  Fly    71 NHGNINNDGVIV------SSEGYSYVTEVPSLSSSQQRHSKKIDFHQQAAMSLSSAPQSGNAGAP 129
                    |..|      ..||   |...|..|:    |....|..:.||.. .:|..:||  .|
  Rat    56 --------GAAVVRCRLQPGEG---VPRRPFRSA----HIGVCDIREAAARE-RAASAAGN--RP 102

  Fly   130 ------GYENMRPQGGAVGDPGYQNTREPSAFQNQQSTNNSQHRQRRTQRKVTHNEKRYHSEVRQ 188
                  |.:...|          |..|.|..    .|:.:..||:|.:..:    ::||.|:|..
  Rat   103 LFYFRFGVDQALP----------QERRAPVT----PSSASRYHRRRSSGSR----DERYRSDVHT 149

  Fly   189 EAVQQALAALKGRPKPSLPMPSKRTSVL-----------NRSPGCNDELDSSTDDESIPEETISP 242
            ||||.|||..|.| |.::||||||.|::           :.|.|..||.....|.:..|..:   
  Rat   150 EAVQAALAKHKER-KMAVPMPSKRRSLVVQTSMDAYTPPDTSSGSEDEGSVQGDSQGTPTSS--- 210

  Fly   243 DKEYNYPRDH-ISNSILPPEPIIKPPIRESSMGS-QQHARTDV-KQNQITNQKYTAPNSAPERRP 304
              :.:...:| ||.:|..............|.|| ..|...|| .|..|.|      :|||    
  Rat   211 --QGSINMEHWISQAIHGSTTSTTSSSSTQSGGSGAAHRLADVMAQTHIEN------HSAP---- 263

  Fly   305 PQNLPPLPTSEPLSSDYPPIAYKRENDFSDKAFKQKQYNAPDITQFNNAH-----RAADRVT--- 361
                                                    ||:|.:.:.|     |.....|   
  Rat   264 ----------------------------------------PDVTTYTSEHSIQVERPQGSTTSRT 288

  Fly   362 --RYVNVSQNELNETDANG---KWKVSAKIQQLLNTLKRPKRRPLPEFYEDNDIELEIAANTKDP 421
              :|.|.   ||.|| .:|   ..:||||||||:||||||||.||.||:.| |.|..:.....||
  Rat   289 APKYGNA---ELMET-GDGVPVSSRVSAKIQQLVNTLKRPKRPPLREFFVD-DFEELLEVQQPDP 348

  Fly   422 NAPKPEGSTMTPVQGEQLSIPAGLPRTLECALQRYGTNSFKSPMATVLDPNGKVTTTLTYGKLLS 486
            |.|||||:.|...:||||.:....|.:||.||||:||.|.|:|..|.:|.|||....||||||.:
  Rat   349 NQPKPEGAQMLATRGEQLGVVTNWPPSLEAALQRWGTISPKAPCLTTMDTNGKPLYILTYGKLWT 413

  Fly   487 RAQKIAHALSTKIFSKGPEQVTLKPGDRVALVYPNNDPLSFITAWYGCMFRGLVPLPIELPLSSS 551
            |:.|:|:.:..|:.:|  ::..::||||||||:|||||.:|:.|:|||:...:||:|||:||:..
  Rat   414 RSMKVAYNILHKLGTK--QEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMVAFYGCLLAEVVPVPIEVPLTRK 476

  Fly   552 DTPPQQVGFLLSSCGITVALTSEACLKGLPKSTTTGEIAKLKGWPRLQWFVTE--HLPKPPKEFN 614
            |...||:||||.|||:||||||:||.|||||| .||||.:.||||:|.|||||  ||.|||::: 
  Rat   477 DAGSQQIGFLLGSCGVTVALTSDACHKGLPKS-PTGEIPQFKGWPKLLWFVTESKHLSKPPRDW- 539

  Fly   615 VGNLRADDSAAAYIEYTTDKEGSVMGVTVTRAAMINHCRALTMACHYTEGETIVCVLDFKREVGL 679
            ..:::..::..|||||.|.|:|||:||||||.|::.||:|||.||.|||.||||.|||||::|||
  Rat   540 FPHIKDANNDTAYIEYKTCKDGSVLGVTVTRIALLTHCQALTQACGYTEAETIVNVLDFKKDVGL 604

  Fly   680 WHSVLTSVLNGMHVIFIPYALMKLRPSSWMQLITKHRASCCLVKSRDLHWGLLATKDHKDISLSS 744
            ||.:||||:|.||||.|||||||:.|.||:|.:.:::|....|||||:||.|:|.:|.:|::|||
  Rat   605 WHGILTSVMNMMHVISIPYALMKVNPLSWIQKVCQYKAKVACVKSRDMHWALVAHRDQRDVNLSS 669

  Fly   745 LRMLLVADGANPWSLSSCDQFLSVFQAKGLRSDAICPCASSSEVFTVSLRRPGRGSCGFSPSATG 809
            ||||:|||||||||:||||.||:|||:||||.:.|||||||.|..||::|||    ...|....|
  Rat   670 LRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSKGLRQEVICPCASSPEALTVAIRRP----TDDSNQPPG 730

  Fly   810 RGVLSMAALSHGVVRVDSEDSLTSLTLQDCGQVMPAAQMVVVRSEGPPVLCKTDQVGEICVTSGS 874
            ||||||..|::||:|||||:.|:.||:||.|.|||.|.|..|:.:|.|.||:||::||:||.:.:
  Rat   731 RGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTVQDVGLVMPGAIMCSVKPDGVPQLCRTDEIGELCVCAVA 795

  Fly   875 TSASYFGLDGMTNSTFKVQPLLEELEQPKDGNGTVNIISKPIGEDFYVRSGLLGFLGPGGLVFVC 939
            |..||:||.|||.:||:|.|:...              ..||.|..::|:|||||:||||||||.
  Rat   796 TGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMTSS--------------GAPISEYPFIRTGLLGFVGPGGLVFVV 846

  Fly   940 GSRDGLMTVTGRKHNADDIIATVLAVEPMRFIYRGRIAVFSIKVLRDERVCVIAEQRPDCSEEES 1004
            |..||||.|:||:||||||:||.||||||:|:|||||||||:.||.|||:.::||||||.:||:|
  Rat   847 GKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKFVYRGRIAVFSVTVLHDERIVIVAEQRPDSTEEDS 911

  Fly  1005 FQWMSRVLQAVDSIHQVGIYCLALVPPNHLPKTPLGGIHLCEARRRFLEGSLHPANVLMCPHTCV 1069
            ||||||||||:|||||||:|||||||.|.|||||||||||.|.::.||||||||.||||||||||
  Rat   912 FQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHLSETKQLFLEGSLHPCNVLMCPHTCV 976

  Fly  1070 TNLPKPRELHQGVQTAAKLSSSSGCGITDTGVGPASVMVGNLVQGNRLAEAHGRDVGLAEDCERK 1134
            |||||||:                   ....:|||||||||||.|.|:|:|.|||:|..||.::.
  Rat   977 TNLPKPRQ-------------------KQPEIGPASVMVGNLVSGKRIAQASGRDLGQIEDNDQA 1022

  Fly  1135 PQL------ITGVLRWRANTSPDHIIFTLLNSKGAIAKTLTCSELHKRAEKIAALLQERGRIEPG 1193
            .::      ::.||:|||.|:|||:::||||.:|.||.:|||.:|||||||||.:|.|||.::.|
  Rat  1023 RKVRTEFLFLSEVLQWRAQTTPDHLLYTLLNCRGTIANSLTCVQLHKRAEKIAVMLMERGHLQDG 1087

  Fly  1194 DHVALIFPPGLDLLCAFYGCLYLGAIPITIRPPHPQNLNTTLPTVRMIVDVSKSGIVLSIQPIIK 1258
            |||||::|||:||:.|||||||.|.:|||:|||||||:.||||||:|||:||:|..:::.|.|.|
  Rat  1088 DHVALVYPPGIDLIAAFYGCLYAGCVPITVRPPHPQNIATTLPTVKMIVEVSRSACLMTTQLICK 1152

  Fly  1259 LLKSREAATSIDPKTWPPILDIDDNPKRKYAGIATVSF-DSSAYLDFSVSTCGRLSGVNITHRSL 1322
            ||:|||||.::|.:|||.|||.||.||::.|.|...|. |:.|||||||||.|.|:||.::|.:.
  Rat  1153 LLRSREAAAAVDVRTWPLILDTDDLPKKRPAQIYKPSNPDTLAYLDFSVSTTGMLAGVKMSHAAT 1217

  Fly  1323 SSLCASLKLACELYPSRHVALCLDPYCGLGFVMWTLIGVYSGHHSILIAPYEVEANPSLWLSTLS 1387
            |:.|.|:||.|||||||.||:|||||||||||:|.|..|||||.||||.|.|:|.||:|||..:|
  Rat  1218 SAFCRSIKLQCELYPSREVAICLDPYCGLGFVLWCLCSVYSGHQSILIPPSELETNPALWLLAVS 1282

  Fly  1388 QHRVRDTFCSYGVIELCTKALSNSIPSLKQRNIDLRCVRTCVVVAEERPRVQLTQQFCKLFQALG 1452
            |::||||||||.|:|||||.|.:...|||.|.:||..|||||||||||||:.|||.|.|||:.||
  Rat  1283 QYKVRDTFCSYSVMELCTKGLGSQTESLKARGLDLSRVRTCVVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLG 1347

  Fly  1453 LNTRCVSTSFGCRVNPAICV----------QGASSAESAQVYVDMRALRNNRVALVERGAPNSLC 1507
            |:.|.||||||||||.|||:          ||.|..:...|||||||||::||.|||||:|:||.
  Rat  1348 LHPRAVSTSFGCRVNLAICLQPHRLWTLAEQGTSGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLP 1412

  Fly  1508 VIESGKLLPGVKVIIANPETKGHCGDSHLGEIWVQAPHNANGYFTIYGDETDYNDHFNAKLVTGA 1572
            ::||||:||||::|||||||||..||||||||||.:.|||:|||||||||:..:||||::|..|.
  Rat  1413 LMESGKILPGVRIIIANPETKGPLGDSHLGEIWVHSAHNASGYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFGD 1477

  Fly  1573 TSELYARTGYLGFLRRTECSQSASLLDETTPSVASRDSDTESLNSISQLQLNFSNVSLGGNSEHS 1637
            |..::|||||||||||||                                               
  Rat  1478 TQTIWARTGYLGFLRRTE----------------------------------------------- 1495

  Fly  1638 LVGGASNANDQELHDAVYVVGAVDEVISLRGMNYHPIDIENSVMRCHKKIAECAVFTWTNLLVVV 1702
                .::||. |.|||:|||||:||.:.||||.|||||||.||:|.||.:.||||||||||||||
  Rat  1496 ----LTDANG-ERHDALYVVGALDEAMELRGMRYHPIDIETSVIRAHKSVTECAVFTWTNLLVVV 1555

  Fly  1703 VELDGNESEALDLVPLVTNTVLEDHQLIVGVVVVVDPGVVPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPI 1767
            |||||:|.|||||||||||.|||:|.||||||||||.||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1556 VELDGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVIPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPI 1620

  Fly  1768 YVAYNM 1773
            ||||||
  Rat  1621 YVAYNM 1626

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DIP2NP_612019.2 DMAP_binding 3..115 CDD:283995 42/114 (37%)
ARG80 33..369 CDD:227400 86/371 (23%)
PRK09192 470..1061 CDD:236403 356/592 (60%)
Dip2 470..1054 CDD:213273 350/585 (60%)
AMP-binding 1142..1587 CDD:278902 291/455 (64%)
AFD_class_I 1159..1762 CDD:302604 379/613 (62%)
Dip2cXP_038951677.1 DMAP_binding 8..174 CDD:368923 76/219 (35%)
Dip2 392..968 CDD:341231 357/597 (60%)
Dip2 1048..1622 CDD:341231 389/625 (62%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166334835
Domainoid 1 1.000 611 1.000 Domainoid score I180
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG0318
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H40996
Inparanoid 1 1.050 1706 1.000 Inparanoid score I69
OMA 1 1.010 - - QHG52530
OrthoDB 1 1.010 - - D539697at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001187
OrthoInspector 1 1.000 - - otm46214
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101035
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR22754
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1019
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1615.770

Return to query results.
Submit another query.