DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DIP2 and Dip2b

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_612019.2 Gene:DIP2 / 252479 FlyBaseID:FBgn0024806 Length:1773 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017450819.1 Gene:Dip2b / 300231 RGDID:1305671 Length:1574 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1796 Identity:897/1796 - (49%)
Similarity:1146/1796 - (63%) Gaps:262/1796 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 ASLPGYVREKLAELDLELSEGDITQKGYEKKRAKLLQPFLKKPEGDKVKSTPPPPYYNVKNANNS 69
            |:||..||.:||||:|||||||||||||||||:|||.|:  .|:..:..||              
  Rat    14 AALPPEVRAQLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLLSPY--SPQTQETDST-------------- 62

  Fly    70 TNHGNINNDGVIVSSEGYSYVTEVPSLSSSQQRHSKKIDFHQQAAMSLSSAPQSGNAGAPGYENM 134
                                        ..::|:.             :.||.:....||...:.
  Rat    63 ----------------------------GQKERNQ-------------TPAPTAAQTSAPSKYHR 86

  Fly   135 RPQGGAVGDPGYQNTREPSAFQNQQSTNNSQHRQRRTQRKVTHNEKRYHSEVRQEAVQQALAALK 199
            ...|||                                     .::||.|::..||||.|||..|
  Rat    87 SRSGGA-------------------------------------RDERYRSDIHTEAVQAALAKHK 114

  Fly   200 GRPKPSLPMPSKRTSVLNRSPGCNDELDSSTDDESIPEETISPDKEYNYPRDH------ISNSIL 258
             ..|.:||||:||.|...:||.          |...|.:|.|..::....|..      :..|:.
  Rat   115 -EQKMALPMPTKRRSTFVQSPA----------DACTPPDTSSASEDEGSLRRQAALSAALQQSLQ 168

  Fly   259 PPEPIIKPPIRESSMGSQQHARTDVKQNQITNQKYT-APNSAPERRPPQNLPPLPTS-------- 314
            ..|..|...|:.||..|.  |.:.:...::.....: |...|..|....:.||..|:        
  Rat   169 NAESWINRSIQGSSTSSS--ASSTLSHGEVKGTSGSLADVFANTRIENVSAPPDVTATTSSSSSL 231

  Fly   315 -EPLSSDYPPIAYKRENDFSDKAFKQKQYNAPDITQFNNAHRAADRVTRYVNVSQNELNETDANG 378
             .|.:.|.||....:                       ..|:.::|         :.|.:| |:|
  Rat   232 LRPANIDLPPSGIVK-----------------------GMHKGSNR---------SSLMDT-ADG 263

  Fly   379 ---KWKVSAKIQQLLNTLKRPKRRPLPEFYEDNDIELEIAANTKDPNAPKPEGSTMTPVQGEQLS 440
               ..:||.||||||||||||||.||.||:.|:..|:.......|||.|||||..||||:||.|.
  Rat   264 VPVNSRVSTKIQQLLNTLKRPKRPPLKEFFVDDSEEIVEGIPQPDPNQPKPEGRQMTPVKGEPLG 328

  Fly   441 IPAGLPRTLECALQRYGTNSFKSPMATVLDPNGKVTTTLTYGKLLSRAQKIAHALSTKIFSKGPE 505
            :....|..||.||||:||...|.|..|.||..||...|||||||.||:.|:|:.|..|:.:|  .
  Rat   329 VICNWPPALESALQRWGTTQAKCPCLTGLDVTGKPVYTLTYGKLWSRSLKLAYTLLNKLGTK--N 391

  Fly   506 QVTLKPGDRVALVYPNNDPLSFITAWYGCMFRGLVPLPIELPLSSSDTPPQQVGFLLSSCGITVA 570
            :..||||||||||||||||:.|:.|:|||:...::|:|||:||:..|...||:||||.||||.:|
  Rat   392 EPVLKPGDRVALVYPNNDPVMFMVAFYGCLLAEVIPVPIEVPLTRKDAGGQQIGFLLGSCGIALA 456

  Fly   571 LTSEACLKGLPKSTTTGEIAKLKGWPRLQWFVTE--HLPKPPKEFNVGNLRADDSAAAYIEYTTD 633
            ||||.||||||| |..|||.:.||||||:|.||:  :|.||||::. .::....:..|||||.|.
  Rat   457 LTSEICLKGLPK-TQNGEIVQFKGWPRLKWVVTDSKYLSKPPKDWQ-PHISPAGTEPAYIEYKTS 519

  Fly   634 KEGSVMGVTVTRAAMINHCRALTMACHYTEGETIVCVLDFKREVGLWHSVLTSVLNGMHVIFIPY 698
            ||||||||||:|.||::||:||:.||.|:||||:|.|||||::.||||.:..:|:|.||.|.:||
  Rat   520 KEGSVMGVTVSRLAMLSHCQALSQACSYSEGETVVNVLDFKKDAGLWHGMFANVMNKMHTISVPY 584

  Fly   699 ALMKLRPSSWMQLITKHRASCCLVKSRDLHWGLLATKDHKDISLSSLRMLLVADGANPWSLSSCD 763
            ::||..|.||:|.:..|:|...|||.|||||.::|.:|.:|:||||||||:|.|||||||:||||
  Rat   585 SVMKTCPLSWVQRVHAHKAKVALVKCRDLHWAMMAHRDQRDVSLSSLRMLIVTDGANPWSVSSCD 649

  Fly   764 QFLSVFQAKGLRSDAICPCASSSEVFTVSLRRPGRGSCGFSPSA--TGRGVLSMAALSHGVVRVD 826
            .|||:||:.||:.:||||||:|:|..|:::||||      .|.|  .||.:|||..||:||:||:
  Rat   650 AFLSLFQSHGLKPEAICPCATSAEAMTIAIRRPG------VPGAPLPGRAILSMNGLSYGVIRVN 708

  Fly   827 SEDSLTSLTLQDCGQVMPAAQMVVVRSEGPPVLCKTDQVGEICVTSGSTSASYFGLDGMTNSTFK 891
            :||..::||:||.|.|||...|.:|:.:|.|.|||||::|||||:|.:....||||.|:|.:||:
  Rat   709 TEDKNSALTVQDVGHVMPGGMMCIVKPDGLPQLCKTDEIGEICVSSRTGGMMYFGLAGVTKNTFE 773

  Fly   892 VQPLLEELEQPKDGNGTVNIISKPIGEDFYVRSGLLGFLGPGGLVFVCGSRDGLMTVTGRKHNAD 956
            |.|              |.....|:|:..::|||||||:|||.||||.|..|||:.|:||:||||
  Rat   774 VIP--------------VTSSGSPVGDVPFIRSGLLGFVGPGSLVFVVGKMDGLLMVSGRRHNAD 824

  Fly   957 DIIATVLAVEPMRFIYRGRIAVFSIKVLRDERVCVIAEQRPDCSEEESFQWMSRVLQAVDSIHQV 1021
            ||:||.||||.::.:|||||||||:.|..|||:.|:||||||.|||:|||||||||||:|:||||
  Rat   825 DIVATGLAVESIKTVYRGRIAVFSVSVFYDERIVVVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAIDTIHQV 889

  Fly  1022 GIYCLALVPPNHLPKTPLGGIHLCEARRRFLEGSLHPANVLMCPHTCVTNLPKPRELHQGVQTAA 1086
            |:|||||||.|.||||||||||:.:.::.||||||||.|:|||||||||||||||:         
  Rat   890 GVYCLALVPANTLPKTPLGGIHISQTKQLFLEGSLHPCNILMCPHTCVTNLPKPRQ--------- 945

  Fly  1087 KLSSSSGCGITDTGVGPASVMVGNLVQGNRLAEAHGRDVGLAE--DCERKPQLITGVLRWRANTS 1149
                      ...|||||||||||||.|.|:|:|.|||:|..|  |..||.|.:..:|:|||..:
  Rat   946 ----------KQPGVGPASVMVGNLVAGKRIAQAAGRDLGQIEENDLVRKHQFLAEILQWRAQAT 1000

  Fly  1150 PDHIIFTLLNSKGAIAKTLTCSELHKRAEKIAALLQERGRIEPGDHVALIFPPGLDLLCAFYGCL 1214
            |||:::.|||:||....|.:|.:||||||:||::|.::|.:..||:|.|::|||::|:.||||||
  Rat  1001 PDHVLYVLLNAKGTTVCTASCLQLHKRAERIASVLGDKGHLNAGDNVVLLYPPGIELIAAFYGCL 1065

  Fly  1215 YLGAIPITIRPPHPQNLNTTLPTVRMIVDVSKSGIVLSIQPIIKLLKSREAATSIDPKTWPPILD 1279
            |.|.||:|:||||.|||..|||||||:|||||:..||:.|.:::||||||||.::|.||||.|:|
  Rat  1066 YAGCIPVTVRPPHAQNLTATLPTVRMVVDVSKAACVLTTQTLMRLLKSREAAAAVDVKTWPAIID 1130

  Fly  1280 IDDNPKRKYAGI-ATVSFDSSAYLDFSVSTCGRLSGVNITHRSLSSLCASLKLACELYPSRHVAL 1343
            .||.|:::...: ...:.:..|||||||||.|.|:||.::|.::::||.::||.||||.||.:|:
  Rat  1131 TDDLPRKRLPQLYKPPTPEMLAYLDFSVSTTGMLTGVKMSHSAVNALCRAIKLQCELYSSRQIAI 1195

  Fly  1344 CLDPYCGLGFVMWTLIGVYSGHHSILIAPYEVEANPSLWLSTLSQHRVRDTFCSYGVIELCTKAL 1408
            ||||||||||.:|.|..|||||.|:||.|.|:|:|.||||:|::|:::|||||||.|:|||||.|
  Rat  1196 CLDPYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLIPPMELESNLSLWLATVNQYKIRDTFCSYSVMELCTKGL 1260

  Fly  1409 SNSIPSLKQRNIDLRCVRTCVVVAEERPRVQLTQQFCKLFQALGLNTRCVSTSFGCRVNPAICVQ 1473
            .:.:.:||.|.|:|.|:|||||||||||||.|.|.|.|||:.:||:.|.|||:||.|||.|||:|
  Rat  1261 GSQVEALKTRGINLSCIRTCVVVAEERPRVTLQQSFSKLFKDIGLSPRAVSTTFGSRVNVAICLQ 1325

  Fly  1474 GASSAESAQVYVDMRALRNNRVALVERGAPNSLCVIESGKLLPGVKVIIANPETKGHCGDSHLGE 1538
            |.|..:...||||:::||::||.|||||||.||.:.||||:||||||:|.||||||..|||||||
  Rat  1326 GTSGPDPTTVYVDLKSLRHDRVRLVERGAPQSLLLSESGKILPGVKVVIVNPETKGPVGDSHLGE 1390

  Fly  1539 IWVQAPHNANGYFTIYGDETDYNDHFNAKLVTG-ATSELYARTGYLGFLRRTECSQSASLLDETT 1602
            |||.:||.|:||:|||..||...||||.:|..| |...|:||||||||:||||.:.:..      
  Rat  1391 IWVNSPHTASGYYTIYDSETLQADHFNTRLSFGDAAQTLWARTGYLGFVRRTELTAATG------ 1449

  Fly  1603 PSVASRDSDTESLNSISQLQLNFSNVSLGGNSEHSLVGGASNANDQELHDAVYVVGAVDEVISLR 1667
                                                          |.|||:|||||:||.:.||
  Rat  1450 ----------------------------------------------ERHDALYVVGALDETLELR 1468

  Fly  1668 GMNYHPIDIENSVMRCHKKIAECAVFTWTNLLVVVVELDGNESEALDLVPLVTNTVLEDHQLIVG 1732
            |:.|||||||.||.|.|:.|||||||||||||||||||.|:|.|||||||||||.|||:|.||||
  Rat  1469 GLRYHPIDIETSVSRVHRSIAECAVFTWTNLLVVVVELCGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVG 1533

  Fly  1733 VVVVVDPGVVPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM 1773
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat  1534 VVVVVDPGVVPINSRGEKQRMHLRDSFLADQLDPIYVAYNM 1574

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DIP2NP_612019.2 DMAP_binding 3..115 CDD:283995 34/109 (31%)
ARG80 33..369 CDD:227400 65/351 (19%)
PRK09192 470..1061 CDD:236403 341/594 (57%)
Dip2 470..1054 CDD:213273 335/587 (57%)
AMP-binding 1142..1587 CDD:278902 264/446 (59%)
AFD_class_I 1159..1762 CDD:302604 351/604 (58%)
Dip2bXP_017450819.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166334834
Domainoid 1 1.000 611 1.000 Domainoid score I180
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 1706 1.000 Inparanoid score I69
OMA 1 1.010 - - QHG52530
OrthoDB 1 1.010 - - D539697at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001187
OrthoInspector 1 1.000 - - otm46214
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101035
Panther 1 1.100 - - O PTHR22754
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1019
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1312.910

Return to query results.
Submit another query.