DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ABL1 and Abl1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_009297.2 Gene:ABL1 / 25 HGNCID:76 Length:1149 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001094320.1 Gene:Abl1 / 311860 RGDID:1584969 Length:1143 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1154 Identity:1013/1154 - (87%)
Similarity:1056/1154 - (91%) Gaps:16/1154 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGQQPGKVLGDQRRPSLPALHFIKGAGKKESSRHGGPHCNVFVEHEALQRPVASDFEPQGLSEAA 65
            ||||||||||||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MGQQPGKVLGDQRRPSLPALHFIKGAGKRDSSRHGGPHCNVFVEHEALQRPVASDFEPQGLSEAA 65

Human    66 RWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWV 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 RWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWV 130

Human   131 PSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRI 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 PSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRI 195

Human   196 NTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTD 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat   196 NTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTIYGVSPNYDKWEMERTD 260

Human   261 ITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCT 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 ITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCT 325

Human   326 REPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLV 390
            |||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 REPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVSAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLV 390

Human   391 GENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYG 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 GENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYG 455

Human   456 MSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESS 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 MSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESS 520

Human   521 ISDEVEKELGKQGVRGAVSTLLQAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEMPHSKGQGESDPLDHEP 585
            |||||||||||:|:|||..:.||||||||||||.|:.||.:|..|..|:.|:||.||||.||.||
  Rat   521 ISDEVEKELGKRGMRGAAGSTLQAPELPTKTRTCRKTAEQKDAPDALELLHTKGLGESDALDSEP 585

Human   586 AVSPLLPRKERGPPEGGLNEDERLLPKDKKTNLFSALIKKKKKTAPTPPKRSSSFREMDGQPERR 650
            ||||||||||||||:|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
  Rat   586 AVSPLLPRKERGPPDGSLNEDERLLPKDKKTNLFSALIKKKKKMAPTPPKRSSSFREMDGQSERR 650

Human   651 GAGEEEGRDISNGALAFTPLDTADPAKSPKPSNGAGVPNGALRESGGSGFRSPHLWKKSSTLTSS 715
            ||.|::||:||||..|.|. |..:|.||||.||||||||||.||.|.|||||||:||||||||||
  Rat   651 GASEDDGREISNGPPALTS-DAVEPTKSPKASNGAGVPNGAFREPGNSGFRSPHVWKKSSTLTSS 714

Human   716 RLATGEEEGGGSSSKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSSTFGGHKSEKPA 780
            |||..|||.|.||||||||||||||:|||.:|||||||||||||.|.|:||||||||||||||||
  Rat   715 RLAAAEEESGLSSSKRFLRSCSASCMPHGVRDTEWRSVTLPRDLPSAGKQFDSSTFGGHKSEKPA 779

Human   781 LPRKRAGENRSDQVTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEVFKDIMESSPGSSPPNLTPKPLRRQVTVAP 845
            |||||..|:||:||.:.|.|||||||||.||||::|||| .|||||||||:||||.|||||..:|
  Rat   780 LPRKRTSESRSEQVAKSTATPPPRLVKKTEEAAEDVFKD-TESSPGSSPPSLTPKLLRRQVPASP 843

Human   846 ASGLPHKEEAGKGSA--LGTPAAAEPVTPTSKAGSGAPGGTSKGPAEESRVRRHKHSSESPGRDK 908
            :||..||:||.||:|  :||||.|||..|::||      |.||..:||.|.||||||||||||||
  Rat   844 SSGPSHKDEATKGNASGMGTPATAEPAAPSNKA------GLSKASSEEPRARRHKHSSESPGRDK 902

Human   909 GKLSRLKPAPPPPPAASAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATSL-VDAVNSDAAKPSQPGE 972
            |:||:||||||||| :|.||| |||:|||||:.||||....|||.||| |||||||..|..||||
  Rat   903 GRLSKLKPAPPPPP-SSTGKA-GKPAQSPSQDVAGEAGGATKTKCTSLSVDAVNSDPTKAGQPGE 965

Human   973 GLKKPVLPATPKPQSA-KPSGTPISPAPVPSTLPSASSALAGD-QPSSTAFIPLISTRVSLRKTR 1035
            ||:|.|.|:.|||||| ||.|||.||...|||.| |.|.|||| ||||.||||||||||||||||
  Rat   966 GLRKSVPPSVPKPQSATKPPGTPTSPVSTPSTAP-APSPLAGDQQPSSAAFIPLISTRVSLRKTR 1029

Human  1036 QPPERIASGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGKNLYTFCVSYVDSIQQMRNKF 1100
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1030 QPPERIASGTITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGKNLYTFCVSYVDSIQQMRNKF 1094

Human  1101 AFREAINKLENNLRELQICPATAGSGPAATQDFSKLLSSVKEISDIVQR 1149
            ||||||||||:||||||||||||.|||||||||||||||||||||||:|
  Rat  1095 AFREAINKLESNLRELQICPATASSGPAATQDFSKLLSSVKEISDIVRR 1143

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ABL1NP_009297.2 SH3_Abl 84..137 CDD:212784 52/52 (100%)
SH2_ABL 142..235 CDD:198189 92/92 (100%)
PTKc_Abl 254..516 CDD:270645 260/261 (100%)
Pkinase_Tyr 261..512 CDD:285015 249/250 (100%)
FABD 1025..1149 CDD:197885 120/123 (98%)
Abl1NP_001094320.1 SH3_Abl 84..137 CDD:212784 52/52 (100%)
SH2_ABL 142..235 CDD:198189 92/92 (100%)
PTKc_Abl 254..516 CDD:270645 260/261 (100%)
Pkinase_Tyr 261..512 CDD:285015 249/250 (100%)
FABD 1019..1143 CDD:197885 120/123 (98%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83690599
Domainoid 1 1.000 768 1.000 Domainoid score I2925
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG4278
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H3783
Inparanoid 1 1.050 1916 1.000 Inparanoid score I1620
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG42186
OrthoDB 1 1.010 - - D102126at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000006
OrthoInspector 1 1.000 - - oto139344
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100013
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24418
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X88
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.