DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Atp7a and ATP7

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_434690.1 Gene:Atp7a / 24941 RGDID:2179 Length:1492 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:NP_001259466.1 Gene:ATP7 / 32142 FlyBaseID:FBgn0030343 Length:1254 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1296 Identity:577/1296 - (44%)
Similarity:791/1296 - (61%) Gaps:123/1296 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat   274 PSD-------SAITFTIDGMHCKSCVSNIESALSTLQYVSSIVVSLENRSAIVKYNASLVTPEIL 331
            |||       |.:...|.||.|:|||.||...:.....:..:.|.||..:....|:.....|..:
  Fly     2 PSDERVEATMSTVRLPIVGMTCQSCVRNITEHIGQKSGILGVRVILEENAGYFDYDPRQTDPARI 66

  Rat   332 RKAIEAVSPGQYRVSISSEVESPTSSPSSSSLQKMPLNLVSQPLTQEVVININGMTCNSCVQSIE 396
            ...|:.:.   :..|...:...|..:|:|:...                |.:.||||.|||::||
  Fly    67 ASDIDDMG---FECSYPGDAADPPETPASAWTN----------------IRVVGMTCQSCVRNIE 112

  Rat   397 GVISKKPGVKSIHVSLTNSTGTIEYDPLLTSPEPLREAIEDMGFDAVL-----PADMKEPLVVIA 456
            |.|..|||:.||.|.|......::|||....|..:.|.|:||||:|.:     |:....|....:
  Fly   113 GNIGTKPGIHSIEVQLAAKNARVQYDPAQYDPAQIAELIDDMGFEASVQEPRSPSQSPSPAPASS 177

  Rat   457 QPSLETPLLPSTTEPEN---VMTPVQ----NKCYIQVSGMTCASCVANIERNLRREEGIYSVLVA 514
            .....||..|..:..:|   |..||:    .||::.:.|||||||||.||::.::..|:.|:|||
  Fly   178 PKKRATPTPPPPSYAQNGSAVAIPVEQELLTKCFLHIRGMTCASCVAAIEKHCKKIYGLDSILVA 242

  Rat   515 LMAGKAEVRYNPAVIQPRVIAELIRELGFGAVVMENAGEGNGILELVVRGMTCASCVHKIESTLT 579
            |:|.||||::|..|:....||:.|.||||...:::....|...:||.:.||||||||:||||.:.
  Fly   243 LLAAKAEVKFNANVVTAENIAKSITELGFPTELIDEPDNGEAEVELEIMGMTCASCVNKIESHVL 307

  Rat   580 KHKGIFYCSVALATNKAHIKYDPEIIGPRDIIHTIGNLGFEASLVK-KDRSA-NHLDHKREIKQW 642
            |.:|:...||.|.|.:...:|..|..|||.|...|..|||||.|:. :|:.| |:|:||.||::|
  Fly   308 KIRGVTTASVTLLTKRGKFRYITEETGPRSICEAIEALGFEAKLMTGRDKMAHNYLEHKEEIRKW 372

  Rat   643 RGSFLVSLFFCIPVMGLMIYMMVMDHHLATLNHNQNMSNEEMINMHSSMFLERQILPGLSIMNLL 707
            |.:|||||.|..|.|..|||.|:            .||::...||..       ::||||:.||:
  Fly   373 RNAFLVSLIFGGPCMVAMIYFML------------EMSDKGHANMCC-------LVPGLSMENLV 418

  Rat   708 SLLLCLPVQFCGGWYFYIQAYKALRHKTANMDVLIVLATTIAFAYSLVILLVAMYERAKVNPITF 772
            ..||..||||.||::||:|:|:|::|.|.||||||.:.|||::.||:.:::.|:......:|:||
  Fly   419 MFLLSTPVQFFGGFHFYVQSYRAIKHGTTNMDVLISMVTTISYVYSVAVVIAAVLLEQNSSPLTF 483

  Rat   773 FDTPPMLFVFIALGRWLEHIAKGKTSEALAKLISLQATEATIVTLNSENLLLSEEQVDVELVQRG 837
            |||||||.:||:|||||||||||||||||:||:||:|.:|.:|.::.:..::||:.:.|:.||||
  Fly   484 FDTPPMLLIFISLGRWLEHIAKGKTSEALSKLLSLKAADALLVEISPDFDIISEKVISVDYVQRG 548

  Rat   838 DIIKVVPGGKFPVDGRVIEGHSMVDESLITGEAMPVAKKPGSTVIAGSINQNGSLLIRATHVGAD 902
            ||:||:||.|.||||:|:.|||..||||||||:|||||:.||.||.|||||||.||:.|||.|.:
  Fly   549 DILKVIPGAKVPVDGKVLYGHSSCDESLITGESMPVAKRKGSVVIGGSINQNGVLLVEATHTGEN 613

  Rat   903 TTLSQIVKLVEEAQTSKAPIQQFADKLSGYFVPFIVLVSIVTLLVWIIIGFQNFEIVEAYFPGYN 967
            |||:|||:||||||||||||||.||:::||||||:|:||.:||:.||||||.|..:|..... :.
  Fly   614 TTLAQIVRLVEEAQTSKAPIQQLADRIAGYFVPFVVVVSSITLIAWIIIGFSNPNLVPVAME-HK 677

  Rat   968 RSISRTETIIRFAFQASITVLCIACPCSLGLATPTAVMVGTGVGAQNGILIKGGEPLEMAHKVKV 1032
            ..:.:...|:.:||:.:::||.|||||:|||||||||||.||.||.||:|:||...||.|||||.
  Fly   678 MHMDQNTIIVSYAFKCALSVLAIACPCALGLATPTAVMVATGTGAINGVLVKGATALENAHKVKT 742

  Rat  1033 VVFDKTGTITHGTPVVNQVKVLVESNKISRNKILAIVGTAESNSEHPLGAAVTKYCKQELD---- 1093
            ||||||||||||||:.::|.:.|.:...|..:.|.|||.||.|||||:.:|:..:.|..|:    
  Fly   743 VVFDKTGTITHGTPMTSKVTLFVTAQVCSLARALTIVGAAEQNSEHPIASAIVHFAKDMLNVGAT 807

  Rat  1094 --TETLGTCTDFQVVPGCGISCKVTNIEGLLHKS-------------------NLKIE-----EN 1132
              ..:.|..:.||.||||||...|:|.|..|.::                   ::.::     |:
  Fly   808 PQAGSFGKSSHFQAVPGCGIRVTVSNYEQTLRQACNADRIINYENLHRTHPQGSVPVDNGASIEH 872

  Rat  1133 NIKNASLVQIDAINEQS-------SPSSSMIIDAHLSNAVNTQQYKVLIGNREWMIRNGLVISND 1190
            .:...|:.:...:|.|.       .|...::.|..:   :::.:..|||||||||.||.:.:..:
  Fly   873 LLPQRSVRKSMELNNQQLLSDLVLEPEEELLTDQKI---IDSPEILVLIGNREWMERNAIEVPLE 934

  Rat  1191 VDESMIEHERRGRTAVLVTIDDELCGLIAIADTVKPEAELAVHILKSMGLEVVLMTGDNSKTARS 1255
            :.:.|...||:|.||||..::.:|..:.|::|.|||||.|||:.||.||::|||:||||..||.|
  Fly   935 ISDCMTHEERKGHTAVLCALNGQLVCMFAVSDMVKPEAHLAVYTLKRMGIDVVLLTGDNKNTAAS 999

  Rat  1256 IASQVGITKVFAEVLPSHKVAKVKQLQEEGKRVAMVGDGINDSPALAMASVGIAIGTGTDVAIEA 1320
            ||.:|||..|:|||||||||||::::|..|.||||||||:|||||||.|.|||.|..|||||.||
  Fly  1000 IAREVGIRTVYAEVLPSHKVAKIQRIQANGIRVAMVGDGVNDSPALAQADVGITIAAGTDVAAEA 1064

  Rat  1321 ADVVLIRNDLLDVVASIDLSRKTVKRIRINFVFALIYNLIGIPIAAGVFLPIGLVLQPWMGSAAM 1385
            :|:||:|||||||||.:||||.||:|||.||.||.:|||:|||:|:|:|.|.|..|.|||.|.||
  Fly  1065 SDIVLMRNDLLDVVACLDLSRCTVRRIRYNFFFASMYNLLGIPLASGLFAPYGFTLLPWMASVAM 1129

  Rat  1386 AASSVSVVLSSLFLKLYRKPTYD-----NYELRPRSHTGQRSPSE---ISVHVGIDDT------- 1435
            ||||||||.|||.||:|||||..     .||.:..:.....|..|   :|:|.|:||.       
  Fly  1130 AASSVSVVCSSLLLKMYRKPTAKTLRTAEYEAQLAAERASGSEDELDKLSLHRGLDDLPEKGRMP 1194

  Rat  1436 -SRNSPRLGLLDRIVNYSRASINSLLSDKRSLNSVVTSEPD---KHSLLVGDFREDDDTTL 1492
             .|:|  ..|:.||..:...:|.|  .|.:....::..|..   :..::...|..:|.|.|
  Fly  1195 FKRSS--TSLISRIFMHDYGNITS--PDAKYGEGLLDPEEQYDGRTKIVRSRFHANDSTEL 1251

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

Software error:

Illegal division by zero at /www/www.flyrnai.org/docroot/cgi-bin/DRSC_prot_align.pl line 591.

For help, please send mail to the webmaster (ritg@hms.harvard.edu), giving this error message and the time and date of the error.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Atp7aNP_434690.1 HMA 11..73 CDD:238219
HMA 174..236 CDD:238219
HMA 280..337 CDD:238219 15/56 (27%)
HMA 380..442 CDD:238219 29/61 (48%)
HMA 484..545 CDD:238219 31/60 (52%)
HMA 559..622 CDD:238219 31/62 (50%)
P-type_ATPase_Cu-like 646..1380 CDD:319783 393/770 (51%)