DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dmd and Dys

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_017457398.1 Gene:Dmd / 24907 RGDID:2507 Length:3682 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:NP_001036722.1 Gene:Dys / 42327 FlyBaseID:FBgn0260003 Length:3598 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:3940 Identity:1128/3940 - (28%)
Similarity:1806/3940 - (45%) Gaps:797/3940 - (20%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat    12 EREDVQKKTFTKWINAQFSKFGKQHIDNLFSDLQDGKRLLDLLEGLTGQKLPKEKGSTRVHALNN 76
            ||:.:||||||||||:.........:.:||.||:||.|||.||..||...|..|||..|||.:||
  Fly     9 ERQHIQKKTFTKWINSHLIDTQCTPVKDLFLDLRDGHRLLALLSTLTQTNLKPEKGRMRVHHINN 73

  Rat    77 VNKALQVLQKNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKTIMAGLQQTNS-EKIL 140
            :||.:..:|::.|.||||.|.|||.||.||||||||.|.|.:..::::|:     ..:|. ||.|
  Fly    74 LNKVITEIQQHGVKLVNISSDDIVGGNAKLTLGLIWLIALEFNGQHLVKS-----HSSNGVEKSL 133

  Rat   141 LSWVRESTRNYP-QVNVLNFTSSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWN-SVVSQQSATQRLEHAFNIA 203
            |:|.|:.|..:. |:|  :|:||||||.|...::.:|..:|   | ....||.|.:||..||::|
  Fly   134 LAWARQYTEPHGLQLN--DFSSSWSDGRAFLMILDAHVEEL---NLQAALQQHALKRLHLAFDLA 193

  Rat   204 KCQLGIEKLLDPEDVATTYPDKKSILMYITSLFQVL-------------------PQQVSIEAIR 249
            .....||||||.|||.|..||.|||.||:..|:..:                   |.:|...:|.
  Fly   194 HRHFKIEKLLDAEDVHTHKPDNKSIQMYVMCLYHAMESMRTRQQEQEQDEGQDQDPGRVPCTSIT 258

  Rat   250 EVEMLPRPSKVTREEHFQLHHQMHYSQQITVSLAQGYEQTSSSPKPRFKSYAFTQAAYVATSDSS 314
            :::.:|..:                            :|||             ...|.:.|..|
  Fly   259 DLDEVPLDN----------------------------DQTS-------------LGLYTSDSAGS 282

  Rat   315 QSPYPSQHLEAPGSKSFGSSLIETEVNLDSYQTALEEVLSWLLSAEDTLRAQGEISKDVEEVKEQ 379
            .....|..|:....:.. |:.....|.:..||:|||.||:.||..|..|.......:|.:..|.|
  Fly   283 MEQRSSGELKTHSMRPL-STATNASVEISGYQSALEAVLTLLLEDEQLLSQNLPDPQDFQTAKLQ 346

  Rat   380 FHAHEGFMMDLTSHQGLVGNVLQLGSRLVGKGK-----LTEDEETEVQEQMNLLNSRWECLRVAS 439
            ||.:|.||:.||.||..||..|:.||.|:.:.:     |:::::.||::||.|||.|||.||:.:
  Fly   347 FHENESFMLKLTEHQEYVGEALEEGSNLINESQKAGAGLSQEDQNEVRQQMVLLNERWETLRLRA 411

  Rat   440 MEKQSNLHKVLMDLQNQKLKELDDWLTKTEERTKKMEEEPLGPDLEDLKCQVQQHKVLQEDLEQE 504
            ::.|:.:...|.:.|.|||::|..:||..|:|...|.:  :||.||:.:.|:.:.:.|:.||.::
  Fly   412 LDVQAKILMRLAEFQKQKLEQLRQFLTSVEDRISHMSD--IGPTLEEAEKQLLEAQKLKADLSEQ 474

  Rat   505 QVRVNSLTHMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICKWTEDRWILLQDILLKWQRFTEEQ 569
            |..|:||:.|||:|:::||:...  ||::|..||:||:::.||::          |:.::..:.:
  Fly   475 QELVDSLSSMVVIVNDTSGNFND--LEDRLSALGERWSHVVKWSD----------LRKEKLQQYK 527

  Rat   570 CLFSKWLSEKEDAMKNIQTSGFEDQNEMVSSLQNISALKIDLEKKKQSMEKLSSLNQDLLSALKN 634
            |: |:||..:|..:|.:::   .|..::....|.|:.|....:...:....|..|.|.:.:.|::
  Fly   528 CI-SRWLDAREQDLKLMES---RDVTDVGGITQRINELNYCAKDLLELQRYLIDLRQMVAATLQD 588

  Rat   635 -KSVTQKMEMWMENFAQRWDNLTQKLEKSSAQISQAVTTTQPSLTQTTVMETVTMVTTREQIMVK 698
             ....:::.:.:|::..|.|.|.|.:|                 .||..:||......|::....
  Fly   589 GDDKGERVLIQLESYEDRLDALKQIVE-----------------VQTVRIETKGFNFGRDRASYD 636

  Rat   699 HAQEELPPPPPQKKRQITVDSEIRKRLDVDIT----ELHSWITRSEAVLQSSEFAVYRKEGNISD 759
            .::...|        :..||.::..|...|.:    :.|...::...:..:..|           
  Fly   637 DSRVVRP--------EGWVDYQMIIRFGEDDSQEDDDEHDLASKKRKLRNADNF----------- 682

  Rat   760 LKEKVNAIAREKAEKFRKLQDASRSAQALVEQMVNEGVNAESIRQASEQL------NSRWTEFCQ 818
                 ||:.....|.|..:|:..:..|.|..|         |:||..|.|      |||   .|.
  Fly   683 -----NALENHIMEHFGYVQEVEQKLQQLQRQ---------SLRQQCELLKELQAENSR---RCG 730

  Rat   819 LLSERVNWLEY------QNNIITFYNQLQQLEQMTTTAENLLKTQP----TTLSEP------TAI 867
            .|.|.....|.      ..|::.....::||||........|.:|.    |.|::.      |..
  Fly   731 TLPELKKLYEVCELEDPSRNLLLEETHIKQLEQRYANLSQKLSSQQSESHTLLAKEKYYNSLTGF 795

  Rat   868 KSQLKICKDEVNRLSA------LQPQIERLKIQSLTLKEKGQGPMFLDADFVAFTNHFNYVFDGV 926
            |..|...:|...:.:.      |:.::..::..:..:.|.......||.:.:.:...|...:|..
  Fly   796 KLVLADSRDWYKQHAGSASGNELEQRLSHMESLASEISEAKTATEELDDNLIEWKQDFGLFYDSW 860

  Rat   927 RAREKELQTIFDTLPPMRYQETMSSIRTWIQQSENKLSIPHLSVTEYEIMEERLGKLQALQSSLK 991
            ...::.||.:..    .|..|::|.....||....|:|...:.|:..|:|:|:...|..|   |.
  Fly   861 HDMKQALQALIQ----QRGGESLSRQLKQIQDFVTKVSNQKVRVSNLEVMQEQQHFLNQL---LD 918

  Rat   992 EQQNGFNYLNATVKEIAKKAPSEISQKYQSEFEEVEGRWKKLSTQLVEHCQKLEEHMNKLRKFQN 1056
            |.::    |..|...|.|....          ||::..|.:|..||.|...|....:..|..|  
  Fly   919 EMES----LRLTYDNIPKHLIG----------EELQTAWNRLPEQLNERVIKQTTAIENLNHF-- 967

  Rat  1057 HKKTLQKWMAEVDVFLKEEWPALGDAEILKKQLKQCRLLVGDIQTIQPSLNSVNEGGQKIKSEAE 1121
                ..::.|.:.:........|..::....|         |::.::..:.|.....:.:..|||
  Fly   968 ----AAEYNAIIAMLRSAADSKLNGSDGASSQ---------DLRKLEIDVISARNFSEILIKEAE 1019

  Rat  1122 FEFASRLEKELKELNTQWDHICRQVYTRKEALKAGLDKTVSL-QKDLSEMHEWMTQAEEEYLERD 1185
            ......|:.:::.|||.:|.: .||:..|:..:..|...:.| |..|.|..:|:|         |
  Fly  1020 PAQKESLQSQIRALNTLYDQV-EQVHREKKEQQTVLQSHIDLIQLRLKETDQWLT---------D 1074

  Rat  1186 FEYKTP----------DELQTAVEEMKRAKEEALQKEAKVKLLTETVNSVISQAPPAAQEALKKE 1240
            .|..||          :||..:....:..||...::..:.:.|.|....::.|......:..:..
  Fly  1075 LESNTPKSGISDIVNSNELFQSKSRFQTLKETCERETTQFRDLNERGGELLLQMDELQDQDRESR 1139

  Rat  1241 LETLTTNYQWLCTRLNGK---------CKT--LEEVWACWHELLSYLEKANKWLNEVELKLKATE 1294
            ..:|...:    ||:|.:         .||  ||.:.....|...::.....:|:::|.|::.|.
  Fly  1140 YGSLAKQF----TRINARWTEVTELVYAKTALLEHISTQLGEFKKFMVSETGYLDKLENKIRNTP 1200

  Rat  1295 NVPAGAEEITEVLESLENLMH-HSEENPNQIRLLAQTLTDGGVMDELINEELETFNSRWRELHEE 1358
            ...|.||||.|.|:.|||::. ||||..::|:.:...|.|...|.:.|..:::....||.:|.::
  Fly  1201 ENAADAEEIMEELDDLENVLRSHSEEWLDKIQEIGNELIDNEFMADSIRRDIDETVQRWTQLQQQ 1265

  Rat  1359 AVRKQKLLEQSIQSAQEIEKSLHLIQESLEFIDKQLAAYIADKVDAAQMPQEAQKIQSDLTSHEI 1423
            |.::.:||||.:..|::.||.:...::.|..:|..|:.::.:.|.....|:|.|::..:..::|.
  Fly  1266 AKKRTELLEQKVSEAEQSEKCIVQFEKWLTRVDDILSDHLDNDVTIVDQPEEFQRLAHEFVANEK 1330

  Rat  1424 SLEEMKKHNQGKDANQRVLSQIDVAQKKLQDVSIKFRLFQKPA--------NFEQRLEESKMILD 1480
            :.:|:.:.......|.:| ...:..|::|..:.::|:..|...        ::|.||..:...|.
  Fly  1331 NFKEISELIDEHTRNGKV-GAANRLQEQLNLMEVRFKYCQAKLSKCTAIQHSYESRLNRAYTDLR 1394

  Rat  1481 EVKMHLPALETKSVEQEVVQSQLSHCVNLYKSLSEVKSEVEMVIKTGRQIVQKKQTENPKELDER 1545
            .|:.....::..|.....||:|...|:.:|::|||:|||:|..|||||::.:.:.|::||:|.:|
  Fly  1395 NVERSTEVVDVASAGPNTVQTQYQKCLQIYRTLSEIKSEIESTIKTGRRVCEDRYTKSPKQLSQR 1459

  Rat  1546 VTALKLHYNELGAKVTERKQQLEKCLKLSRKMRK------------------------------- 1579
            :.|||..||.||..||:.|..||:.|.|:|::.:                               
  Fly  1460 IDALKHLYNTLGENVTQSKATLERLLTLARQLEECFDSADNLIRRFESPQEVHDRNSILLEFEDV 1524

  Rat  1580 ---------EMNVLTEWLAATDTELTKRSAVEGMPSNLDSEVAWGKATQKEIEKQKAHLKSVTEL 1635
                     |.|...:.....:|    |..::|:      :..:.|.|..:|.|:...:|:..:.
  Fly  1525 LRRCEDHYNEYNKSCDQSCMVET----RQRIDGL------KATYHKLTSADIIKRLTEMKTTLQN 1579

  Rat  1636 GD--SLKTVLGKKETLVE------DKLTLLNSNWIAVT-----SRVEEWLNLLLEYQKHMESFDQ 1687
            .|  ||:|:...:..|.|      .::..|....||:.     :|..|...|........::.|.
  Fly  1580 LDNISLETLRAMEHDLKEINVPSNPEIEKLQQQVIAIVVDVLKTRFNEATTLAARNTSSPDNDDT 1644

  Rat  1688 NVEHITKWIIHTDELLDESEKRKPQQKED----ILKRLKAEMNDIRPKVDATRDQAAKLMANRGD 1748
            .       |:...:.:.:...|.||..|.    .....::....:.....|..||...       
  Fly  1645 E-------IVVVSDTVRQRRARTPQSGESPSSAHTSSSESPTKGVENSPGAVGDQVMP------- 1695

  Rat  1749 YCRKIVEPQ---ISELNRRFAAIS------------HRIKTGK---------ASIPLKELEQFNS 1789
               .::.||   ::|.:..|:.||            ...||.:         ..|.:|.::....
  Fly  1696 ---DLLPPQTFRLAESSTLFSQISLNPQKVTNTPPPKPAKTKRKAPSSPAQVVEIRVKNIQNDKM 1757

  Rat  1790 DIQKL-LEPLEAEIQQGVNLKE--EDFNK---------DMSEDNEGTVNELLQRGDNLQQRITDE 1842
            .:|.: |||.:.||...||:.|  |.|..         |:|||::.:|            |:..:
  Fly  1758 SVQNIDLEPQQGEIVDTVNILESVEPFVPEYVETVQIVDLSEDSDSSV------------RVDSQ 1810

  Rat  1843 RKREEIKLKQQLLQTKHNALKDLRSQRRKKAL------EISHQWYQYKSQADDLLKCLDE----- 1896
            .                   |::|..:.|.:|      ::|........|.:|||:...|     
  Fly  1811 G-------------------KEMRRSKSKHSLNETPLPKVSDNDEDSAEQEEDLLRPSAENTSTP 1856

  Rat  1897 ---IEKKLASLPEPRDERKIKEIDRELQKKKEELNAVRRQAESLSENGAAMAVEPTQIQLSKRWR 1958
               :||:..|..|   :||....:|::.:..||     .:.::.....||...:|      ||||
  Fly  1857 FLRVEKRRISFDE---KRKRVANERDILRDSEE-----EEPKTPDTPRAAQVSKP------KRWR 1907

  Rat  1959 EI--------------ESNFAQFRRLNFAQIHTLHEETMVVT-TEDMPLDVSYVPSTYLTEISHI 2008
            ::              :|.::..:...|      ..|.:|.: .||:|        .:..|::..
  Fly  1908 QLQPEMDALEPESPGRDSFYSPDKESGF------DAEPLVFSDDEDIP--------RFSLEMTST 1958

  Rat  2009 LQALSEVEQLLNAPELNAKDFEDLFKQEESLKNIKENLQQISGRIDVIHKKKTAALQSATPMERV 2073
            :.:.|:..:::.....|...|            :.:.|:.:|..:|               ...|
  Fly  1959 IDSDSDTSRIMTPSTKNPNPF------------LSKVLESLSSPVD---------------DSNV 1996

  Rat  2074 KLQEAVSQMDFHWEKLNRMYKERQGRFDRSVEKWRHFHYDMKVFNQWLNDVEQFFKKTQNPENWE 2138
            .|:..:|      |:..:...:|...||:..   :...|.:|:...   .:||..:..       
  Fly  1997 TLKSPIS------EEQPQNLDDRVREFDKQA---KQMIYKLKLTKA---KIEQCHESE------- 2042

  Rat  2139 HAKYKWYLKELQDGIGQRQAVVRTLNATGEEIIQQSSKTDANILQEKLGSLSLRWHEVCKELAER 2203
                   .::|:..|....|   ||.:.|:.::.::...     |..:..|.:|...:   |.|:
  Fly  2043 -------AEDLRLLIAPDAA---TLISQGDSLVLETHGR-----QGSISRLVMRTQII---LREQ 2089

  Rat  2204 RKRVEEQKNVFSEFQRDLNEFVSWLEEADNIATTPPGDEEQLKEKLEQVKLLTEELPLRQGILKQ 2268
            .:.|::.::                :.:.:.|..||.|...::|      |:|:.       |::
  Fly  2090 FREVQQARS----------------KTSGSGAPAPPLDSVNIEE------LVTKG-------LRR 2125

  Rat  2269 LNETGGAVLVSAPIRPEEQDKLEKKLKQTN-----LQWI--------KVSRALPEKQGELEVHIK 2320
            :|     ||:...:..:....|||:::..|     ||.|        ::.:..|....|:|   |
  Fly  2126 IN-----VLIEKTVDLKSSTDLEKRMEDINERHDDLQVIVSAIGKNAQMPKVTPLMMNEIE---K 2182

  Rat  2321 DFRQFEEQLDHLLLWLSPIRNQLEIYNQPSQPGPFDLKETEVTVQAKQPDVERLLSKGQHLYKEK 2385
            .........|.:.|.|:.:||           ||                   .:|.|    ||:
  Fly  2183 TKNNLIAHADSIELSLTELRN-----------GP-------------------RISNG----KER 2213

  Rat  2386 PSTQPVKRKLEDLRSEWEAVNHLLWELRTKQPDRAPGLSTTGASASQTVTVVTQPVDTKETVISK 2450
            |........  ..|||:           ..:|      |.|||.|                    
  Fly  2214 PDASSAATM--SCRSEY-----------NNEP------SGTGALA-------------------- 2239

  Rat  2451 LEMPSSLLLEVPALADFNRAWTELTDWLSLLDRVIKSQRVMVGDLEDINEMIIKQKATLQDLEQR 2515
                          ..|:::..:::|||:....:||.|.|:|.|.:.:...|.||:..|::|:.:
  Fly  2240 --------------GSFDKSVLQISDWLTWEQNMIKIQSVLVDDGDAVRLAIEKQEKVLRELKMK 2290

  Rat  2516 RPQLEELITAAQNLKNKTSNQE-----------ARTIITD--------RIERIQIQWDEVQEQLQ 2561
            :|||.||:..|:.||.....|:           |.....|        ::.|::..|||..:.:.
  Fly  2291 KPQLNELVHTAEVLKGDVKRQQLQEKELKQFSLAPHCSADLDYMRCCLKVTRLREHWDETSQCVL 2355

  Rat  2562 NRRQQLNEMLKDSTQWLEAKE-EAEQVIGQARGKLDSWKEGPHTMDAIQKKITETKQLAKDLRQR 2625
            .|..||..||.|| |..|||. |.|:.:.:...:.:.......|.|.::.:..|.|....:|.|.
  Fly  2356 QRAAQLKNMLSDS-QRFEAKRLELEKWLARMEQRAERMGTIATTADILEAQQKEQKSFHAELHQN 2419

  Rat  2626 QINVDVANDLALKLLRDYSADDTRKVHMITENINTSWGNILKRVSEREAALEETQRLLQQFPLDL 2690
            :.:.|:.|:|..||:..|..|||.::..:||.||..:.|:...|..|...|......||.|...:
  Fly  2420 KQHFDIFNELTQKLIAVYPNDDTTRIKKMTEVINQRYANLNSGVINRGKQLHAAVHSLQSFDRAM 2484

  Rat  2691 EKFLAWITEAETTA-NVLQDASRKEKLLEDSRGVRELMKPWQDLQGEIEAHTDIYHNLDENGQKI 2754
            ::|||:::|.||.. |...|..|...:             ::|||.|||.|..:|..||..|:|:
  Fly  2485 DQFLAFLSETETLCENAESDIERNPLM-------------FKDLQSEIETHRVVYDRLDGTGRKL 2536

  Rat  2755 LRSLEGSDEAPLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEVSSDQWKRLHLSLQELLVWLQLKDDE 2819
            |.||...::|.:||||||.||.:|:.|:.||:.||:.||.:|:.|..|.|||:||..|:..||.|
  Fly  2537 LGSLTSQEDAVMLQRRLDEMNQRWNNLKSKSIAIRNRLESNSEHWNALLLSLRELTEWVIRKDTE 2601

  Rat  2820 LSR--QAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRIFLTEQ----PLEGLEKLY- 2877
            ||.  ..|:.||..::|||.|.|:||:|:|:.|.|::.|.|.:.|.::..:    .....|..: 
  Fly  2602 LSTLGLGPVRGDAVSLQKQLDDHKAFRRQLEDKRPIVESNLTSGRQYIANEAAVSDTSDTEANHD 2666

  Rat  2878 QEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWDKLNLHSADWQRKIDEALERLQELQEAADELDLKL 2942
            .:.|.:..||:::.:||.:|::..:::.:|:.|...|.:|:.::||.:.::::.|:..::|..::
  Fly  2667 SDSRYMSAEEQSRELTRSIRREVGKLSEQWNNLIDRSDNWKHRLDEYMTKMRQFQKILEDLSSRV 2731

  Rat  2943 RQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKENVNHVNDLAHHLTTLGIQLSPYNLS 3007
            ..||..|.||.|...  :....:.:::::.||.::......::..|:.....|...:.:....||
  Fly  2732 ALAEQTKTSWLPPSS--VGEANEQMQQLQRLRDKMTTASALLDDCNEQQSFFTANQVLVPTPCLS 2794

  Rat  3008 ILEDLNTRWRLLQVAVEDR--------VRQLHEAHRD---------FGPASQHFLSTSVQGPWER 3055
            .|||||||.:|||:|:::|        .:|.||...|         .||...  |..||:.||||
  Fly  2795 KLEDLNTRMKLLQIAMDERQKVLCQAGAQQTHENGDDGRTTSNSGTIGPLPN--LGQSVKPPWER 2857

  Rat  3056 AISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSA 3120
            |.:...|||||:||.:||.||||:|.||.:.|||||.:||||||||||||.:||.|.||.:|:|.
  Fly  2858 ATTAANVPYYIDHERETTHWDHPEMIELMKGLADLNEIRFSAYRTAMKLRSVQKRLALDRISMST 2922

  Rat  3121 ACDALDQHNLK-QNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHNNLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTG 3184
            ||::.|:|.|: |||:.:||..:...|.::|..:::     :::.|.:|:.:||:|||||:.|||
  Fly  2923 ACESFDRHGLRAQNDKLIDIPDMTTVLHSLYVTIDK-----IDLTLMLDLAINWILNVYDSQRTG 2982

  Rat  3185 RIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQRRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGS 3249
            :|||||||.|::.|||.|||:||||||:.||.:....|||||||||||.||:||||||||:||||
  Fly  2983 QIRVLSFKVGLVLLCKGHLEEKYRYLFRLVADTDRRADQRRLGLLLHDCIQVPRQLGEVAAFGGS 3047

  Rat  3250 NIEPSVRSCFQFA---------NNKPEIEAALFLDWMRLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKC 3305
            |||||||||.:.|         |....||...||.|::.||||:||||||||:||||.|||||||
  Fly  3048 NIEPSVRSCLEQAGISQEAIDGNQDISIELQHFLGWLQHEPQSLVWLPVLHRLAAAEAAKHQAKC 3112

  Rat  3306 NICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHKMHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKN 3370
            |||||.||:|||||.||.||:|:||.|||.||.||.||:.:||.||||.|||.||||||.:.|||
  Fly  3113 NICKEYPIVGFRYRCLKCFNFDMCQKCFFFGRNAKNHKLTHPMHEYCTTTTSTEDVRDFTRALKN 3177

  Rat  3371 KFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPASSPQ-LSH---DDTHSRIEHYASRLAEME-NSN 3430
            ||::::||.||||:||||||:|||||.:|:||.||| .:|   :|.|||:|.||||||::| ...
  Fly  3178 KFKSRKYFKKHPRVGYLPVQSVLEGDALESPAPSPQHTTHQLQNDMHSRLEMYASRLAQVEYGGT 3242

  Rat  3431 GSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYCQSLNQDSPLSQPRSPAQILISLESEERGELERILADLEEE 3495
            ||    :.:|:.  ||||.||..|||:|...|..|.|:||.|::.::::|:|.|||.|:.|||||
  Fly  3243 GS----NSTPDS--DDEHQLIAQYCQALPGTSNGSAPKSPVQVMAAMDAEQREELEAIIRDLEEE 3301

  Rat  3496 NRNLQAEYDRL--KQQ----HEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEAR 3554
            |.||||||.:|  |:|    .:..|:.  .|...|...|.|..:..:::||||||||||||||||
  Fly  3302 NANLQAEYQQLCSKEQSGMPEDSNGMQ--HSSSSMTGLSGQGEQGQDMMAEAKLLRQHKGRLEAR 3364

  Rat  3555 MQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSESM 3619
            ||||||||:|||:||.||||||::|      ||...|:.|:.|..:..|.               
  Fly  3365 MQILEDHNRQLEAQLQRLRQLLDEP------NGGGSSATSSGLPSAPGSA--------------- 3408

  Rat  3620 GEEDLLSPPQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGHNVGSLFH 3659
                |.|.|....| ......|||...|:......|...|
  Fly  3409 ----LNSKPNTLQT-RSVTASQLNTDSPAKMNQQNGHYEH 3443

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DmdXP_017457398.1 None
DysNP_001036722.1 CH 13..111 CDD:278723 54/97 (56%)
CH 129..225 CDD:278723 45/100 (45%)
SPEC 312..525 CDD:238103 82/226 (36%)
SbcC <325..957 CDD:223496 172/723 (24%)
Smc <816..1591 CDD:224117 186/835 (22%)
SPEC 1174..1365 CDD:238103 48/191 (25%)
SPEC 1289..1485 CDD:295325 55/196 (28%)
SPEC 2369..2576 CDD:238103 72/219 (33%)
SPEC 2477..2714 CDD:238103 88/249 (35%)
WW 2852..2882 CDD:238122 18/29 (62%)
EF-hand_2 2883..2997 CDD:286194 58/118 (49%)
EF-hand_3 3001..3100 CDD:286195 62/98 (63%)
ZZ_dystrophin 3110..3158 CDD:239074 33/47 (70%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 247 1.000 Domainoid score I2085
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG4286
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 1367 1.000 Inparanoid score I116
OMA 1 1.010 - - QHG46633
OrthoDB 1 1.010 - - D46278at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001792
OrthoInspector 1 1.000 - - otm46205
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR11915
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X2389
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1211.980

Return to query results.
Submit another query.