DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Atp1a3 and Atpalpha

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_017444264.1 Gene:Atp1a3 / 24213 RGDID:2169 Length:1026 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:NP_732572.1 Gene:Atpalpha / 48971 FlyBaseID:FBgn0002921 Length:1041 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1032 Identity:784/1032 - (75%)
Similarity:892/1032 - (86%) Gaps:9/1032 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat     4 GGSDSYRVATSQDKKDD--------KSSPK-KSKAKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYN 59
            |.:|||||||.....||        ||..| .:|..::.:|||||:|:.:..||:|.||:.:::.
  Fly    10 GRADSYRVATVIATDDDNRTADGQYKSRRKMPAKVNKKENLDDLKQELDIDFHKISPEELYQRFQ 74

  Rat    60 TDCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAGT 124
            |....||:|:||:|.|.||||||||||..||||||||:.|||||::||||||||||:||.|||.|
  Fly    75 THPENGLSHAKAKENLERDGPNALTPPKQTPEWVKFCKNLFGGFAMLLWIGAILCFVAYSIQAST 139

  Rat   125 EDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQVNAEEVV 189
            .::|:.|||||||||:||||:||.||||||:|||||||||||||||.|.|||||||:.:.||::|
  Fly   140 SEEPADDNLYLGIVLSAVVIVTGIFSYYQESKSSKIMESFKNMVPQFATVIREGEKLTLRAEDLV 204

  Rat   190 VGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPLETRNITFFSTNCVE 254
            :||:||:|.|||:|||:|||.|...||||||||||||||:|..:.||:|||||:|:.|||||.||
  Fly   205 LGDVVEVKFGDRIPADIRIIEARNFKVDNSSLTGESEPQSRGAEFTHENPLETKNLAFFSTNAVE 269

  Rat   255 GTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVAVFLGVSFFILSLILGYT 319
            |||:|||::.||.|||||||.|||||:.|:||||.||.|||.|||||||||||:||:::.||||.
  Fly   270 GTAKGVVISCGDHTVMGRIAGLASGLDTGETPIAKEIHHFIHLITGVAVFLGVTFFVIAFILGYH 334

  Rat   320 WLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTL 384
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   335 WLDAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTL 399

  Rat   385 TQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRD 449
            ||||||||||||||||.||||||||||..:|::|..:.|||.||.|||||.||||||.:|:||::
  Fly   400 TQNRMTVAHMWFDNQIIEADTTEDQSGVQYDRTSPGFKALSRIATLCNRAEFKGGQDGVPILKKE 464

  Rat   450 VAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAP 514
            |:|||||:|||||:||:.|.|..:|:||||:||:|||||||||:|||||||.||.||||||||||
  Fly   465 VSGDASEAALLKCMELALGDVMNIRKRNKKIAEVPFNSTNKYQVSIHETEDTNDPRYLLVMKGAP 529

  Rat   515 ERILDRCATILLQGKEQPLDEEMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDV 579
            ||||:||:||.:.|||:.|||||||||.|||:|||||||||||||.:.||.:::|.||.|:.||:
  Fly   530 ERILERCSTIFINGKEKVLDEEMKEAFNNAYMELGGLGERVLGFCDFMLPSDKYPNGFKFNTDDI 594

  Rat   580 NFTTDNLCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETV 644
            ||..|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
  Fly   595 NFPIDNLRFVGLMSMIDPPRAAVPDAVAKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKSVGIISEGNETV 659

  Rat   645 EDIAARLNIPVSQVNPRDAKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQ 709
            ||||.|||||||:||||:|||.|:||.:|:|.:|:|:||||:.||||||||||||||||||||||
  Fly   660 EDIAQRLNIPVSEVNPREAKAAVVHGAELRDVSSDQLDEILRYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQ 724

  Rat   710 RQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDN 774
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   725 RMGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDN 789

  Rat   775 LKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQP 839
            ||||||||||||||||:|||.||:.:|||||||:||||||||||||||||||||.||:|||||.|
  Fly   790 LKKSIAYTLTSNIPEISPFLAFILCDIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEHAEADIMKRPP 854

  Rat   840 RNPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDLEDS 904
            |:|..|||||.|||||||||||||||..|||.||||:|||||||..|.|||..||.:.||||.||
  Fly   855 RDPFNDKLVNSRLISMAYGQIGMIQAAAGFFVYFVIMAENGFLPKKLFGIRKMWDSKAVNDLTDS 919

  Rat   905 YGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAA 969
            |||:|||..||.:|:|||||||:|||||||||||||||||||:|||||:|..|.|||..||.|||
  Fly   920 YGQEWTYRDRKTLEYTCHTAFFISIVVVQWADLIICKTRRNSIFQQGMRNWALNFGLVFETVLAA 984

  Rat   970 FLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKETYY 1026
            ||||||||:..|||||||..|||.|.|::..||:|||.|:..||||||||:|:||||
  Fly   985 FLSYCPGMEKGLRMYPLKLVWWFPAIPFALAIFIYDETRRFYLRRNPGGWLEQETYY 1041

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Atp1a3XP_017444264.1 ATPase-IIC_X-K 31..1026 CDD:273445 768/994 (77%)
AtpalphaNP_732572.1 ATPase-IIC_X-K 45..1041 CDD:273445 768/995 (77%)
Cation_ATPase_N 58..132 CDD:214842 46/73 (63%)
E1-E2_ATPase 152..383 CDD:278548 178/230 (77%)
Cation_ATPase 445..539 CDD:289987 70/93 (75%)
COG4087 <695..770 CDD:226572 70/74 (95%)
Cation_ATPase_C 817..1025 CDD:279079 158/207 (76%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 472 1.000 Domainoid score I423
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0203
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H113729
Inparanoid 1 1.050 1566 1.000 Inparanoid score I82
OMA 1 1.010 - - QHG53587
OrthoDB 1 1.010 - - D388324at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000283
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45302
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100215
Panther 1 1.100 - - O PTHR43294
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X416
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1413.880

Return to query results.
Submit another query.