DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Atp1a1 and Atpalpha

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_036636.1 Gene:Atp1a1 / 24211 RGDID:2167 Length:1023 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:NP_732572.1 Gene:Atpalpha / 48971 FlyBaseID:FBgn0002921 Length:1041 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1032 Identity:766/1032 - (74%)
Similarity:893/1032 - (86%) Gaps:14/1032 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat     6 GR-DKYEPAAV--------SEHGDKKSK-----KAKKERDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYG 56
            || |.|..|.|        :..|..||:     |..|:.::|:||:|:.:|.||:|.:||::::.
  Fly    10 GRADSYRVATVIATDDDNRTADGQYKSRRKMPAKVNKKENLDDLKQELDIDFHKISPEELYQRFQ 74

  Rat    57 TDLSRGLTPARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYGIRSAT 121
            |....||:.|:|.|.|.||||||||||..||||||||:.|||||:|||||||||||:||.|:::|
  Fly    75 THPENGLSHAKAKENLERDGPNALTPPKQTPEWVKFCKNLFGGFAMLLWIGAILCFVAYSIQAST 139

  Rat   122 EEEPPNDDLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSINAEDVV 186
            .|||.:|:||||:|||||||:||.||||||:|||||||||||||||.|.|||.|||:::.|||:|
  Fly   140 SEEPADDNLYLGIVLSAVVIVTGIFSYYQESKSSKIMESFKNMVPQFATVIREGEKLTLRAEDLV 204

  Rat   187 VGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVE 251
            :||:||||.|||||||:|||.|...||||||||||||||:|..:||:||||||:|:||||||.||
  Fly   205 LGDVVEVKFGDRIPADIRIIEARNFKVDNSSLTGESEPQSRGAEFTHENPLETKNLAFFSTNAVE 269

  Rat   252 GTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAEEIEHFIHLITGVAVFLGVSFFILSLILEYT 316
            |||:|:|:..||.|||||||.|||||:.|:||||:||.|||||||||||||||:||:::.||.|.
  Fly   270 GTAKGVVISCGDHTVMGRIAGLASGLDTGETPIAKEIHHFIHLITGVAVFLGVTFFVIAFILGYH 334

  Rat   317 WLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTL 381
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   335 WLDAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTL 399

  Rat   382 TQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWFALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRA 446
            ||||||||||||||||.||||||:||||.:|:||..:.||||||.|||||.|:..|:.:||||:.
  Fly   400 TQNRMTVAHMWFDNQIIEADTTEDQSGVQYDRTSPGFKALSRIATLCNRAEFKGGQDGVPILKKE 464

  Rat   447 VAGDASESALLKCIEVCCGSVMEMREKYTKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNASEPKHLLVMKGAP 511
            |:|||||:|||||:|:..|.||.:|::..||.|:|||||||||:|||:..:.::|::||||||||
  Fly   465 VSGDASEAALLKCMELALGDVMNIRKRNKKIAEVPFNSTNKYQVSIHETEDTNDPRYLLVMKGAP 529

  Rat   512 ERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLLLPDEQFPEGFQFDTDEV 576
            ||||:|||:|.::|||:.||||:|:||.|||:|||||||||||||..:||.:::|.||:|:||::
  Fly   530 ERILERCSTIFINGKEKVLDEEMKEAFNNAYMELGGLGERVLGFCDFMLPSDKYPNGFKFNTDDI 594

  Rat   577 NFPVDNLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETV 641
            |||:|||.||||:||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
  Fly   595 NFPIDNLRFVGLMSMIDPPRAAVPDAVAKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKSVGIISEGNETV 659

  Rat   642 EDIAARLNIPVNQVNPRDAKACVVHGSDLKDMTSEELDDILRYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQ 706
            ||||.||||||::||||:|||.||||::|:|::|::||:||||||||||||||||||||||||||
  Fly   660 EDIAQRLNIPVSEVNPREAKAAVVHGAELRDVSSDQLDEILRYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQ 724

  Rat   707 RQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIVGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDN 771
            |.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   725 RMGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDN 789

  Rat   772 LKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQP 836
            ||||||||||||||||:|||.||:.:||||||||||||||||||||||||||||.||:|||||.|
  Fly   790 LKKSIAYTLTSNIPEISPFLAFILCDIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEHAEADIMKRPP 854

  Rat   837 RNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPFHLLGIRETWDDRWINDVEDS 901
            |:|..|||||.|||||||||||||||..|||.||||:|||||||..|.|||:.||.:.:||:.||
  Fly   855 RDPFNDKLVNSRLISMAYGQIGMIQAAAGFFVYFVIMAENGFLPKKLFGIRKMWDSKAVNDLTDS 919

  Rat   902 YGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAA 966
            |||:|||..||.:|:|||||||:||||||||||:||||||||:|||||:|..|.|||..||.|||
  Fly   920 YGQEWTYRDRKTLEYTCHTAFFISIVVVQWADLIICKTRRNSIFQQGMRNWALNFGLVFETVLAA 984

  Rat   967 FLSYCPGMGAALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY 1023
            ||||||||...|||||||..|||.|.|::|.||:|||.|:..:||.||||:|:||||
  Fly   985 FLSYCPGMEKGLRMYPLKLVWWFPAIPFALAIFIYDETRRFYLRRNPGGWLEQETYY 1041

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Atp1a1NP_036636.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..38 14/45 (31%)
ATPase-IIC_X-K 29..1023 CDD:273445 753/993 (76%)
Phosphoinositide-3 kinase binding 82..84 1/1 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 216..235 13/18 (72%)
Mediates interaction with SCN7A. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q8VDN2 596..717 104/120 (87%)
AtpalphaNP_732572.1 ATPase-IIC_X-K 45..1041 CDD:273445 754/995 (76%)

Return to query results.
Submit another query.