DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ZMYND8 and Zmynd8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001350643.1 Gene:ZMYND8 / 23613 HGNCID:9397 Length:1241 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006499441.1 Gene:Zmynd8 / 228880 MGIID:1918025 Length:1266 Species:Mus musculus


Alignment Length:1250 Identity:1124/1250 - (89%)
Similarity:1168/1250 - (93%) Gaps:21/1250 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    13 LAEEEIKTEQEVVEGMDISTRSK----DPGSAERTAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKK 73
            |||||||||||||||||||||||    ||.|.|:||.||:|||||||||||||||:|||||||||
Mouse    17 LAEEEIKTEQEVVEGMDISTRSKEPKEDPVSTEKTAPKRRFPSPPHSSNGHSPQDSSTSPIKKKK 81

Human    74 KPGLLNSNNKEQSELRHGPFYYMKQPLTTDPVDVVPQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYH 138
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    82 KPGLLNSSNKEQSELRHGPFYYMKQPLTTDPVDVVPQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYH 146

Human   139 AKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKP 203
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   147 AKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKP 211

Human   204 VPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEKNAKKKMYGCTEAFLADAKWILHNCIIYNGGNHKLTQIAKVV 268
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   212 VPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEKNAKKKMYGCTEAFLADAKWILHNCIIYNGGNHKLTQIAKVV 276

Human   269 IKICEHEMNEIEVCPECYLAACQKRDNWFCEPCSNPHPLVWAKLKGFPFWPAKALRDKDGQVDAR 333
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   277 IKICEHEMNEIEVCPECYLAACQKRDNWFCEPCSNPHPLVWAKLKGFPFWPAKALRDKDGQVDAR 341

Human   334 FFGQHDRAWVPINNCYLMSKEIPFSVKKTKSIFNSAMQEMEVYVENIRRKFGVFNYSPFRTPYTP 398
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   342 FFGQHDRAWVPVNNCYLMSKEIPFSVKKTKSIFNSAMQEMEVYVENIRRKFGVFNYSPFRTPYTP 406

Human   399 NSQYQMLLDPTNPSAGTAKIDKQEKVKLNFDMTASPKILMSKPVLSGGTGRRISLSDMPRSPMST 463
            |:||||||||:||||||||.|||||||||||||||||||:|||:||||.|||||||||||||.||
Mouse   407 NNQYQMLLDPSNPSAGTAKTDKQEKVKLNFDMTASPKILLSKPLLSGGAGRRISLSDMPRSPTST 471

Human   464 NSSVHTGSDVEQDAEKKATSSHFSASEESMDFLDKSTASPASTKTGQAGSLSGSPKPFSPQLSAP 528
            |||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|
Mouse   472 NSSVHTGSDVEQDPEKKAPSSHFSASEESMDFLDKSTASPASTKTGQAGSLSGSPKPFSPQAPTP 536

Human   529 ITTKTDK--TSTTGSILNLNLDRSKAEMDLKELSESVQQQSTPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTI 591
            |.||.||  ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Mouse   537 IMTKPDKTSTSTTGSILNLNLDRSKAEMDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTI 601

Human   592 ESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDTEDKEGCQMDKEP 656
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:||:|||.||||||.|||||.::|||.
Mouse   602 ESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSESSDSEYVSDEEQKPKNEPEDPEDKEGSRVDKEA 666

Human   657 SAVKKKPKPTNPVEIKEELKSTSPASEKADPGAVKDKASPEPEKDFSEKAKPSPHPIKDKLKGKD 721
            .|:|:||||||.||:|||.||.||.|||.||...||||||||||||.|||||||||.||||||||
Mouse   667 PAIKRKPKPTNQVEVKEEAKSNSPVSEKPDPTPAKDKASPEPEKDFVEKAKPSPHPTKDKLKGKD 731

Human   722 ETDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDVVGKTPP-STTVGSHSPP 785
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||:||.||||||.:||.|| ||:.|:.|||
Mouse   732 ETDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDPSGREGRKNKKDPKVPSPKQDAIGKPPPSSTSAGNQSPP 796

Human   786 ETPVLTRSSAQTSAAGAT---ATTSTSSTVTVTAPAPAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWN 847
            ||||||||:.|..|||.|   |||||.|||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||
Mouse   797 ETPVLTRSATQAPAAGVTVAAATTSTMSTVTVTAPATAVTGSPVKKQRPLLPKETVPAVQRVVWN 861

Human   848 SSSKFQTSSQKWHMQKMQRQQQQQ------QQQNQQQQPQSSQGTRYQTRQAVKAVQQKEITQSP 906
            :|||||||||||||||:|||||||      |||:||||||||||||||||||||||||||:||||
Mouse   862 ASSKFQTSSQKWHMQKIQRQQQQQQQQQQSQQQSQQQQPQSSQGTRYQTRQAVKAVQQKEVTQSP 926

Human   907 STSTITLVTSTQSSPLVTSSGSMSTLVSSVNADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEI 971
            ||||||||||||.:.||:||||.|||.|::|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   927 STSTITLVTSTQPAALVSSSGSASTLASAINADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEI 991

Human   972 YNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKK 1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   992 YNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELAEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKK 1056

Human  1037 QLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEAD 1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1057 QLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEAD 1121

Human  1102 AEVNTETLNKSSQGSSSSTQSAPSETASASKEKETSAEKSKE-SGSTLDLSGSRETPSSILLGSN 1165
            ||.:|||.||||||:||:|||||||.|||.||||..|||||: |.||||||||||||||:|||||
Mouse  1122 AEASTETGNKSSQGNSSNTQSAPSEPASAPKEKEAPAEKSKDSSNSTLDLSGSRETPSSMLLGSN 1186

Human  1166 QGSVSKRCDKQPAYAPTTTDHQPHPNYPAQKYHSRSNKSS-WSSSDEKRGSTRSDHNTSTSTKSL 1229
            |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||:|:. ||||:|||.|:||:|:..||||:|
Mouse  1187 QSSVSKRCDKQPAYTPTTTDHQPHPNYPAQKYHSRSSKAGLWSSSEEKRASSRSEHSGGTSTKNL 1251

Human  1230 LPK---ESRLDTFWD 1241
            :||   |||||.|||
Mouse  1252 MPKESRESRLDAFWD 1266

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ZMYND8NP_001350643.1 TNG2 <31..160 CDD:227367 121/132 (92%)
PHD_PRKCBP1 117..157 CDD:277013 39/39 (100%)
Bromo_RACK7 178..276 CDD:99940 97/97 (100%)
PWWP_PRKCBP1 299..389 CDD:438988 88/89 (99%)
DUF3544 449..647 CDD:463452 183/199 (92%)
TFIIF_alpha <629..>787 CDD:310411 125/158 (79%)
AtpF <984..>1051 CDD:440475 65/66 (98%)
zf-MYND 1055..1089 CDD:460312 33/33 (100%)
Zmynd8XP_006499441.1 TNG2 <30..168 CDD:227367 126/137 (92%)
PHD_PRKCBP1 125..165 CDD:277013 39/39 (100%)
Bromo_RACK7 186..284 CDD:99940 97/97 (100%)
PWWP_PRKCBP1 307..397 CDD:438988 88/89 (99%)
DUF3544 457..657 CDD:463452 183/199 (92%)
PTZ00449 <645..800 CDD:185628 123/154 (80%)
AtpF <1004..>1071 CDD:440475 65/66 (98%)
zf-MYND 1075..1109 CDD:460312 33/33 (100%)

Return to query results.
Submit another query.