DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TNPO3 and Tnpo3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001369145.1 Gene:TNPO3 / 23534 HGNCID:17103 Length:957 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001100057.1 Gene:Tnpo3 / 296954 RGDID:1308938 Length:923 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:957 Identity:916/957 - (95%)
Similarity:919/957 - (96%) Gaps:34/957 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEGAKPTLQLVYQAVQALYHDPDPSGKERASFWLGELQRSVHAWEISDQLLQIRQDVESCYFAAQ 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MEGAKPTLQLVYQAVQALYHDPDPSGKERASFWLGELQRSVHAWEISDQLLQIRQDVESCYFAAQ 65

Human    66 TMKMKIQTSFYELPTDSHASLRDSLLTHIQNLKDLSPVIVTQLALAIADLALQMPSWKGCVQTLV 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 TMKMKIQTSFYELPTDSHASLRDSLLTHIQNLKDLSPVIVTQLALAIADLALQMPSWKGCVQTLV 130

Human   131 EKYSNDVTSLPFLLEILTVLPEEVHSRSLRIGANRRTEIIEDLAFYSSTVVSLLMTCVEKAGTDE 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 EKYSNDVTSLPFLLEILTVLPEEVHSRSLRIGANRRTEIIEDLAFYSSTVVSLLMTCVEKAGTDE 195

Human   196 KMLMKVFRCLGSWFNLGVLDSNFMANNKLLALLFEVLQQDKTSSNLHEAASDCVCSALYAIENVE 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 KMLMKVFRCLGSWFNLGVLDSNFMANNKLLALLFEVLQQDKTSSNLHEAASDCVCSALYAIENVE 260

Human   261 TNLPLAMQLFQGVLTLETAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCETFLEKIVCTPGQGLGDLRTLE 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 TNLPLAMQLFQGVLTLETAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCETFLEKIVCTPGQGLGDLRTLE 325

Human   326 LLLICAGHPQYEVVEISFNFWYRLGEHLYKTNDEVIHGIFKAYIQRLLHALARHCQLEPDHEGVP 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 LLLICAGHPQYEVVEISFNFWYRLGEHLYKTNDEVIHSIFKAYIQRLLHALARHCQLEPDHEGVP 390

Human   391 EETDDFGEFRMRVSDLVKDLIFLIGSMECFAQLYSTLKEGNPPWEVTEAVLFIMAAIAKSVDPKK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
  Rat   391 EETDDFGEFRMRVSDLVKDLIFLIGSMECFAQLYSTLKEGNPPWEVTEAVLFIMAAIAKSVDP-- 453

Human   456 PFSNAVCRHSLLFGQNITSEISNCEYLPPVLRENNPTLVEVLEGVVRLPETVHTAVRYTSIELVG 520
                                            ||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat   454 --------------------------------ENNPTLVEVLEGVVHLPETVHTAVRYTSIELVG 486

Human   521 EMSEVVDRNPQFLDPVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIARSLDSF 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat   487 EMSEVVDRNPQFLDPVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIAHSLDSF 551

Human   586 LLSPEAAVGLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKLLSQEPSNGISSDPTVFLDRLA 650
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   552 MLSPEAAVGLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKLLSQEPSNGISSDPTVFLDRLA 616

Human   651 VIFRHTNPIVENGQTHPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRADNRIVERCCRCLRFAVRCVGKGSAALL 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   617 VIFRHTNPIVENGQTHPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRADNRIVERCCRCLRFAVRCVGKGSAALL 681

Human   716 QPLVTQMVNVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEEGCRQGLLDMLQALCIPTFQLLEQQNGLQNHP 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   682 QPLVTQMVNVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEEGCRQGLLDMLQALCIPTFQLLEQQNGLQNHP 746

Human   781 DTVDDLFRLATRFIQRSPVTLLRSQVVIPILQWAIASTTLDHRDANCSVMRFLRDLIHTGVANDH 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat   747 DTVDDLFRLATRFIQRSPVTLLRSQVVIPILQWAIASTTLDHRDANSSVMRFLRDLIHTGVANDH 811

Human   846 EEDFELRKELIGQVMNQLGQQLVSQLLHTCCFCLPPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWLENSL 910
            |||||:|||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   812 EEDFEVRKELIGQVMDQLGQQLVSQLLHTCCFCLPPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWLENSL 876

Human   911 KGLPKETTVGAVTVTHKQLTDFHKQVTSAEECKQVCWALRDFTRLFR 957
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   877 KGLPKETTVGAVTVTHKQLTDFHKQVTSAEECKQVCWALRDFTRLFR 923

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TNPO3NP_001369145.1 IBN_N 33..96 CDD:197981 62/62 (100%)
Xpo1 121..249 CDD:462459 127/127 (100%)
Tnpo3NP_001100057.1 IBN_N 33..96 CDD:197981 62/62 (100%)
Xpo1 121..249 CDD:462459 127/127 (100%)

Return to query results.
Submit another query.