DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ACAP2 and Acap2

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_016861535.1 Gene:ACAP2 / 23527 HGNCID:16469 Length:848 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017453554.1 Gene:Acap2 / 619382 RGDID:1562939 Length:816 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:852 Identity:780/852 - (91%)
Similarity:795/852 - (93%) Gaps:40/852 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRD 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
  Rat     1 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCAANKQFMNGIRD 65

Human    66 LAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTRQGLPLSLRLECRGMIIALLWESSHLRMILFDQTQ 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||                            |||||||
  Rat    66 LAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHT----------------------------ILFDQTQ 102

Human   131 RSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFR 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
  Rat   103 RSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEAANILTATRKCFR 167

Human   196 HIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAA 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   168 HIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAA 232

Human   261 KEKREMEQKHSTIQQK----DFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIR 321
            ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   233 KEKREMEQKHSTIQQKAALQDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIR 297

Human   322 RWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQA 386
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   298 RWFSIQNNQLVYQKKFKDSPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQA 362

Human   387 WIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCD 451
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||.||||
  Rat   363 WIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGSESKEKLLKGESALQRVQCIPGNTSCCD 427

Human   452 CGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEA 516
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   428 CGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEA 492

Human   517 NVEKMGIKKPQPGQRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRLSISKFGP 581
            .:||||:|||||||||||||||||||||||||||||..|||.||:|:.:|||.|::|||      
  Rat   493 KLEKMGVKKPQPGQRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSTLLSPSEQEKRIISKSCEDQRLS------ 551

Human   582 GDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSGIQQSSDDGRESL 646
              ..|.|..:.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.||||||||
  Rat   552 --HTRVSVHTPVAAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIKSNDSGIQQCSDDGRESL 614

Human   647 PSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENK 711
            |||||||||||||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:
  Rat   615 PSTVSANSLYEPEGERQESSVFLDSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALAHGADVNWANSDENQ 679

Human   712 ATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEE 776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   680 ATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEE 744

Human   777 GKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRF 841
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   745 GKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRF 809

Human   842 QQDSQKF 848
            |||||||
  Rat   810 QQDSQKF 816



Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83697163
Domainoid 1 1.000 455 1.000 Domainoid score I8806
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5347
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H8182
Inparanoid 1 1.050 1471 1.000 Inparanoid score I2834
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG55583
OrthoDB 1 1.010 - - D124295at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000653
OrthoInspector 1 1.000 - - oto135703
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101039
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR23180
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X412
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.