DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NUP188 and Nup188

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_056169.1 Gene:NUP188 / 23511 HGNCID:17859 Length:1749 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006233967.1 Gene:Nup188 / 366016 RGDID:1306022 Length:1754 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1754 Identity:1656/1754 - (94%)
Similarity:1708/1754 - (97%) Gaps:5/1754 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAAAGGPCVRSSRELWTILLGRSALRELSQIEAELNKHWRRLLEGLSYYKPPSPSSAEKVKANK 65
            |||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|||||||||:||||||||:|||||
  Rat     1 MAAAAGGPCVRSSRELWTILLGRSALRELNQIEAELNKHWQRLLEGLSYYRPPSPSSAERVKANK 65

Human    66 DVASPLKELGLRISKFLGLDEEQSVQLLQCYLQEDYRGTRDSVKTVLQDERQSQALILKIADYYY 130
            ||||||||||||:|||||||||||||||||||||.|||||||:|||||||||||||.||||||||
  Rat    66 DVASPLKELGLRVSKFLGLDEEQSVQLLQCYLQEAYRGTRDSLKTVLQDERQSQALTLKIADYYY 130

Human   131 EERTCILRCVLHLLTYFQDERHPYRVEYADCVDKLEKELVSKYRQQFEELYKTEAPTWETHGNLM 195
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||:|||||||||||||
  Rat   131 EERTCILRCVLHLLTYFQDERHPYRAEYADCVDKLEKELVLKYRQQFEELYRTEAPTWETHGNLM 195

Human   196 TERQVSRWFVQCLREQSMLLEIIFLYYAYFEMAPSDLLVLTKMFKEQGFGSRQTNRHLVDETMDP 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 TERQVSRWFVQCLREQSMLLEIIFLYYAYFEMAPSDLLVLTKMFKEQGFGSRQTNRHLVDETMDP 260

Human   261 FVDRIGYFSALILVEGMDIESLHKCALDDRRELHQFAQDGLICQDMDCLMLTFGDIPHHAPVLLA 325
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.:|||.||||||||||||
  Rat   261 FVDRIGYFSALILVEGMDIESLHKYALDDRRELHQFAQDGLICQDMDRIMLTLGDIPHHAPVLLA 325

Human   326 WALLRHTLNPEETSSVVRKIGGTAIQLNVFQYLTRLLQSLASGGNDCTTSTACMCVYGLLSFVLT 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   326 WALLRHTLNPEETSSVVRKIGGTAIQLNVFQYLTRLLRSLASGGNDCTTSTACMCVYGLLSFALT 390

Human   391 SLELHTLGNQQDIIDTACEVLADPSLPELFWGTEPTSGLGIILDSVCGMFPHLLSPLLQLLRALV 455
            ||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 SLELHTLGNQQDVIDTACEVLADPSLPELFWGTEPTSGLGIILDSVCGMFPHLLSPLLQLLRALV 455

Human   456 SGKSTAKKVYSFLDKMSFYNELYKHKPHDVISHEDGTLWRRQTPKLLYPLGGQTNLRIPQGTVGQ 520
            ||||||||||||||||||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 SGKSTAKKVYSFLDKMSFYNELHKHKPHDVLSHEDGTLWRRQTPKLLYPLGGQTNLRIPQGTVGQ 520

Human   521 VMLDDRAYLVRWEYSYSSWTLFTCEIEMLLHVVSTADVIQHCQRVKPIIDLVHKVISTDLSIADC 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 VMLDDRAYLVRWEYSYSSWTLFTCEIEMLLHVVSTADVIQHCQRVKPIIDLVHKVISTDLSIADC 585

Human   586 LLPITSRIYMLLQRLTTVISPPVDVIASCVNCLTVLAARNPAKVWTDLRHTGFLPFVAHPVSSLS 650
            |||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:::
  Rat   586 LLPITSRIYMLLQRLTTVISPPVNVIASCVNCLTVLAARNPAKVWTDLRHTGFLPFVAHPVSNMT 650

Human   651 QMISAEGMNAGGYGNLLMNSEQPQGEYGVTIAFLRLITTLVKGQLGSTQSQGLVPCVMFVLKEML 715
            ||||||||||||||:|||||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   651 QMISAEGMNAGGYGSLLMNSEQPQGEYGVTVAFLRLVTTLVKGQLGSTQSQGLVPCVMFVLKEVL 715

Human   716 PSYHKWRYNSHGVREQIGCLILELIHAILNLCHETDLHSSHTPSLQFLCICSLAYTEAGQTVINI 780
            ||||||||:||||||.||||||||||||||||.||:|||||||||..||||||||||||||||:|
  Rat   716 PSYHKWRYSSHGVRELIGCLILELIHAILNLCQETELHSSHTPSLPSLCICSLAYTEAGQTVISI 780

Human   781 MGIGVDTIDMVMAAQPRSDGAEGQGQGQLLIKTVKLAFSVTNNVIRLKPPSNVVSPLEQALSQHG 845
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   781 MGIGVDTIDMVMAAQPRSDGPEGQGQGQLLIKTVKLAFSVTNNVIRLKPPSNVVSPLEQALTQHG 845

Human   846 AHGNNLIAVLAKYIYHKHDPALPRLAIQLLKRLATVAPMSVYACLGNDAAAIRDAFLTRLQSKIE 910
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat   846 AHGNNLIAVLAKYIYHRHDPALPRLAIQLLKRLATVAPMSVYACLGSDAAAIRDAFLTRLQSKIE 910

Human   911 DMRIKVMILEFLTVAVETQPGLIELFLNLEVKDGSDGSKEFSLGMWSCLHAVLELIDSQQQDRYW 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||:|||||.||||||||||||||
  Rat   911 DMRIKVMILEFLTVAVETQPGLIELFLNLEVKDGSSGSKEFSLGVWSCLHVVLELIDSQQQDRYW 975

Human   976 CPPLLHRAAIAFLHALWQDRRDSAMLVLRTKPKFWENLTSPLFGTLSPPSETSEPSILETCALIM 1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 CPPLLHRAAIAFLHALWQDRRDSAMLVLRTKPRFWENLTSPLFGTLSPPSETSEPSILETCALIM 1040

Human  1041 KIICLEIYYVVKGSLDQSLKDTLKKFSIEKRFAYWSGYVKSLAVHVAETEGSSCTSLLEYQMLVS 1105
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||::|||||:|||||||||||||
  Rat  1041 KIICLEIYYVVKGSLDQSLKDTLKKFSSEKRFAYWSGYVKSLAVYMAETEGNSCTSLLEYQMLVS 1105

Human  1106 AWRMLLIIATTHADIMHLTDSVVRRQLFLDVLDGTKALLLVPASVNCLRLGSMKCTLLLILLRQW 1170
            |||.|||:||:|||||:|||..|||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||
  Rat  1106 AWRTLLIVATSHADIMNLTDVAVRRQLFLDVLDGTKALLLVATSVNCLRLGSMMCTLLLILLRQW 1170

Human  1171 KRELGSVDEILGPLTEILEGVLQADQQLMEKTKAKVFSAFITVLQMKEMKVSDIPQYSQLVLNVC 1235
            |||||:||:|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||::||:||||||||||||
  Rat  1171 KRELGAVDKILGPLTEVLEGVLQADQQLMEKTKAKVFSAFITVLQMKELRVSEIPQYSQLVLNVC 1235

Human  1236 ETLQEEVIALFDQTRHSLALGSATEDKDSMETDDCSRSRHRDQRDG-VCVLGLHLAKELCEVDED 1299
            |||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.|.||:||||| ||||||||||||||||||
  Rat  1236 ETLQEEVIALFDQTRHSLASGSAAEDKDSMETDDCPRPRHKDQRDGQVCVLGLHLAKELCEVDED 1300

Human  1300 GDSWLQVTRRLPILPTLLTTLEVSLRMKQNLHFTEATLHLLLTLARTQQGATAVAGAGITQSICL 1364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1301 GDSWLQVTRRLPILPTLLTTLEVSLRMKQNLHFTEAALHLLLTLARTQQGATAVAGAGITQSICL 1365

Human  1365 PLLSVYQLSTNGTAQTPSASRKSLDAPSWPGVYRLSMSLMEQLLKTLRYNFLPEALDFVGVHQER 1429
            |||||||||:|||.||||.||||||||||||||||||||||:||||||||||.||||||||||||
  Rat  1366 PLLSVYQLSSNGTGQTPSTSRKSLDAPSWPGVYRLSMSLMERLLKTLRYNFLTEALDFVGVHQER 1430

Human  1430 TLQCLNAVRTVQSLACLEEADHTVGFILQLSNFMKEWHFHLPQLMRDIQVNLGYLCQACTSLLHS 1494
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat  1431 TLQCLNAVRTVQSLACLEEADHTVGFILQLSHFRKEWHFHLPQLMRDVQVNLGYLCQACTSLLHS 1495

Human  1495 RKMLQHYLQNKNGDGLPSAVAQRVQRPPSAAS--AAPS--SSKQPAADTEASEQQALHTVQYGLL 1555
            ||||||||||||||||||||..||.||.:..:  |.||  |||||.||||||||:||||||||||
  Rat  1496 RKMLQHYLQNKNGDGLPSAVTPRVHRPSTTTTVLATPSGCSSKQPIADTEASEQRALHTVQYGLL 1560

Human  1556 KILSKTLAALRHFTPDVCQILLDQSLDLAEYNFLFALSFTTPTFDSEVAPSFGTLLATVNVALNM 1620
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1561 KILSRTLAALRHFTPDVCQILLDQSLDLAEYNFLFALSFTTPTFDSEVAPSFGTLLATVNVALNM 1625

Human  1621 LGELDKKKEPLTQAVGLSTQAEGTRTLKSLLMFTMENCFYLLISQAMRYLRDPAVHPRDKQRMKQ 1685
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat  1626 LGELDKKKESLTQAVGLSTQAEGTRTLKSLLMFTMENCFYLLISQAVRYLRDPAVHPRDKQRMKQ 1690

Human  1686 ELSSELSTLLSSLSRYFRRGAPSSPATGVLPSPQGKSTSLSKASPESQEPLIQLVQAFVRHMQR 1749
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:||||||||||||||||||||||||:||
  Rat  1691 ELSSELSTLLSSLSRYFRRGAPSSPAAGVLPSPQGKATSLSKASPESQEPLIQLVQAFVRHVQR 1754

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NUP188NP_056169.1 Nup188 31..941 CDD:463110 871/909 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1514..1542 17/31 (55%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1707..1733 23/25 (92%)
Nup188XP_006233967.1 Nup188 31..941 CDD:463110 871/909 (96%)

Return to query results.
Submit another query.