DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NUP188 and Nup188

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_056169.1 Gene:NUP188 / 23511 HGNCID:17859 Length:1749 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_938046.2 Gene:Nup188 / 227699 MGIID:2446190 Length:1759 Species:Mus musculus


Alignment Length:1759 Identity:1653/1759 - (93%)
Similarity:1704/1759 - (96%) Gaps:10/1759 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAAAGGPCVRSSRELWTILLGRSALRELSQIEAELNKHWRRLLEGLSYYKPPSPSSAEKVKANK 65
            |||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|:||||||||||||||||||:|||||
Mouse     1 MAAAAGGPCVRSSRELWTILLGRSALRELNQIEAELNKYWQRLLEGLSYYKPPSPSSAERVKANK 65

Human    66 DVASPLKELGLRISKFLGLDEEQSVQLLQCYLQEDYRGTRDSVKTVLQDERQSQALILKIADYYY 130
            ||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||.||||||||
Mouse    66 DVASPLKELGLRVSKFLGLDEEQSVQLLQCYLQEDYRGTRDSLKTVLQDERQSQALTLKIADYYY 130

Human   131 EERTCILRCVLHLLTYFQDERHPYRVEYADCVDKLEKELVSKYRQQFEELYKTEAPTWETHGNLM 195
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||:|||||||||||||
Mouse   131 EERTCILRCVLHLLTYFQDERHPYRAEYADCVDKLEKELVLKYRQQFEELYRTEAPTWETHGNLM 195

Human   196 TERQVSRWFVQCLREQSMLLEIIFLYYAYFEMAPSDLLVLTKMFKEQGFGSRQTNRHLVDETMDP 260
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||..||||
Mouse   196 TERQVSRWLVQCLREQSMLLEIIFLYYAYFEMAPSDLLVLTKMFKEQGFGSRQTSRHLVGGTMDP 260

Human   261 FVDRIGYFSALILVEGMDIESLHKCALDDRRELHQFAQDGLICQDMDCLMLTFGDIPHHAPVLLA 325
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||
Mouse   261 FVDRIGYFSALILVEGMDIESLHKYALDDRRELHQFAQDGLICQDMDRAMLTLGDIPHHAPVLLA 325

Human   326 WALLRHTLNPEETSSVVRKIGGTAIQLNVFQYLTRLLQSLASGGNDCTTSTACMCVYGLLSFVLT 390
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||.||
Mouse   326 WALLRHTLSPEETSSVVRKIGGTAIQLNVFQYLTRLLRSLASGGNDCTTSTACMCVYGLLSFALT 390

Human   391 SLELHTLGNQQDIIDTACEVLADPSLPELFWGTEPTSGLGIILDSVCGMFPHLLSPLLQLLRALV 455
            ||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 SLELHTLGNQQDVIDTACEVLADPSLPELFWGTEPTSGLGIILDSVCGMFPHLLSPLLQLLRALV 455

Human   456 SGKSTAKKVYSFLDKMSFYNELYKHKPHDVISHEDGTLWRRQTPKLLYPLGGQTNLRIPQGTVGQ 520
            ||||||||||||||||||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   456 SGKSTAKKVYSFLDKMSFYNELHKHKPHDVLSHEDGTLWRRQTPKLLYPLGGQTNLRIPQGTVGQ 520

Human   521 VMLDDRAYLVRWEYSYSSWTLFTCEIEMLLHVVSTADVIQHCQRVKPIIDLVHKVISTDLSIADC 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   521 VMLDDRAYLVRWEYSYSSWTLFTCEIEMLLHVVSTADVIQHCQRVKPIIDLVHKVISTDLSIADC 585

Human   586 LLPITSRIYMLLQRLTTVISPPVDVIASCVNCLTVLAARNPAKVWTDLRHTGFLPFVAHPVSSLS 650
            |||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:::
Mouse   586 LLPITSRIYMLLQRLTTVISPPVNVIASCVNCLTVLAARNPAKVWTDLRHTGFLPFVAHPVSNMT 650

Human   651 QMISAEGMNAGGYGNLLMNSEQPQGEYGVTIAFLRLITTLVKGQLGSTQSQGLVPCVMFVLKEML 715
            ||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   651 QMISAEGMNAGGYGSLLMNSEQPQGEYGVTIAFLRLVTTLVKGQLGSTQSQGLVPCVMFVLKEML 715

Human   716 PSYHKWRYNSHGVREQIGCLILELIHAILNLCHETDLHSSHTPSLQFLCICSLAYTEAGQTVINI 780
            |||||||||||||||.||||||||||||||||.||:|||||||||..||||||||||||||||:|
Mouse   716 PSYHKWRYNSHGVRELIGCLILELIHAILNLCQETELHSSHTPSLPSLCICSLAYTEAGQTVISI 780

Human   781 MGIGVDTIDMVMAAQPRSDGAEGQGQGQLLIKTVKLAFSVTNNVIRLKPPSNVVSPLEQALSQHG 845
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
Mouse   781 MGIGVDTIDMVMAAQPRSDGPEGQGQGQLLIKTVKLAFSVTNNVIRLKPPSNVVSPLEQALTQHG 845

Human   846 AHGNNLIAVLAKYIYHKHDPALPRLAIQLLKRLATVAPMSVYACLGNDAAAIRDAFLTRLQSKIE 910
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse   846 AHGNNLIAVLAKYIYHRHDPALPRLAIQLLKRLATVAPMSVYACLGSDAAAIRDAFLTRLQSKIE 910

Human   911 DMRIKVMILEFLTVAVETQPGLIELFLNLEVKDGSDGSKEFSLGMWSCLHAVLELIDSQQQDRYW 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||||.||||||||||||||
Mouse   911 DMRIKVMILEFLTVAVETQPGLIELFLNLEVKDGSNGSKEFSLGVWSCLHVVLELIDSQQQDRYW 975

Human   976 CPPLLHRAAIAFLHALWQDRRDSAMLVLRTKPKFWENLTSPLFGTLSPPSETSEPSILETCALIM 1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
Mouse   976 CPPLLHRAAIAFLHALWQDRRDSAMLVLRTKPKFWENLTSPLFGTLSPPSETSEPSVLETCALIM 1040

Human  1041 KIICLEIYYVVKGSLDQSLKDTLKKFSIEKRFAYWSGYVKSLAVHVAETEGSSCTSLLEYQMLVS 1105
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||::|:|||||||||||||||||
Mouse  1041 KIICLEIYYVVKGSLDQSLKDTLKKFSSEKRFAYWSGYVKSLAVYMADTEGSSCTSLLEYQMLVS 1105

Human  1106 AWRMLLIIATTHADIMHLTDSVVRRQLFLDVLDGTKALLLVPASVNCLRLGSMKCTLLLILLRQW 1170
            |||:|||||.:|||:|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Mouse  1106 AWRILLIIAASHADVMHLTDMAVRRQLFLDVLDGTKALLLVAASVNCLRLGSMMCTLLLILLRQW 1170

Human  1171 KRELGSVDEILGPLTEILEGVLQADQQLMEKTKAKVFSAFITVLQMKEMKVSDIPQYSQLVLNVC 1235
            |||||:|::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|.|||||||||||||
Mouse  1171 KRELGAVEKILGPLTEILEGVLQADQQLMEKTKAKVFSAFITVLQMKELRVGDIPQYSQLVLNVC 1235

Human  1236 ETLQEEVIALFDQTRHSLALGSATEDKDSMETDDCSRSRHRDQRDGVCVLGLHLAKELCEVDEDG 1300
            |||||||||||||||||||..||.|||||||||||.|.||:||||||||||||||||||||||||
Mouse  1236 ETLQEEVIALFDQTRHSLASDSAAEDKDSMETDDCPRPRHKDQRDGVCVLGLHLAKELCEVDEDG 1300

Human  1301 DSWLQVTRRLPILPTLLTTLEVSLRMKQNLHFTEATLHLLLTLARTQQGATAVAGAGITQSICLP 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1301 DSWLQVTRRLPILPTLLTTLEVSLRMKQNLHFTEAALHLLLTLARTQQGATAVAGAGITQSICLP 1365

Human  1366 LLSVYQLSTNGTAQTPSASRKSLDAPSWPGVYRLSMSLMEQLLKTLRYNFLPEALDFVGVHQERT 1430
            ||||||||:|||.||||.||||||||||||||||||||||:||||||||||.|||||||||||||
Mouse  1366 LLSVYQLSSNGTGQTPSTSRKSLDAPSWPGVYRLSMSLMERLLKTLRYNFLTEALDFVGVHQERT 1430

Human  1431 LQCLNAVRTVQSLACLEEADHTVGFILQLSNFMKEWHFHLPQLMRDIQVNLGYLCQACTSLLHSR 1495
            |||||||:||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse  1431 LQCLNAVKTVQSLACLEEADHTVGFILQLSHFRKEWHFHLPQLMRDVQVNLGYLCQACTSLLHSR 1495

Human  1496 KMLQHYLQNKNGDGLPSAVAQRVQRPPSA----------ASAAPSSSKQPAADTEASEQQALHTV 1550
            |||||||||||||||||||..|.|||.:.          |:.|..|||||.||||||||:|||||
Mouse  1496 KMLQHYLQNKNGDGLPSAVTPRAQRPSTTTTTTTTTTALATPAGCSSKQPTADTEASEQRALHTV 1560

Human  1551 QYGLLKILSKTLAALRHFTPDVCQILLDQSLDLAEYNFLFALSFTTPTFDSEVAPSFGTLLATVN 1615
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1561 QYGLLKILSRTLAALRHFTPDVCQILLDQSLDLAEYNFLFALSFTTPTFDSEVAPSFGTLLATVN 1625

Human  1616 VALNMLGELDKKKEPLTQAVGLSTQAEGTRTLKSLLMFTMENCFYLLISQAMRYLRDPAVHPRDK 1680
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
Mouse  1626 VALNMLGELDKKKESLTQAVGLSTQAEGTRTLKSLLMFTMENCFYLLISQAVRYLRDPAVHPRDK 1690

Human  1681 QRMKQELSSELSTLLSSLSRYFRRGAPSSPATGVLPSPQGKSTSLSKASPESQEPLIQLVQAFVR 1745
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:|||||||||||||||||||||||
Mouse  1691 QRMKQELSSELSTLLSSLSRYFRRGAPSSPAAGVLPSPQGKATSLSKASPESQEPLIQLVQAFVR 1755

Human  1746 HMQR 1749
            |:||
Mouse  1756 HVQR 1759

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NUP188NP_056169.1 Nup188 31..941 CDD:463110 870/909 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1514..1542 16/37 (43%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1707..1733 23/25 (92%)
Nup188NP_938046.2 Nup188 31..941 CDD:463110 870/909 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1255..1277 16/21 (76%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1508..1552 22/43 (51%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1718..1743 22/24 (92%)

Return to query results.
Submit another query.