Protein Alignment ABCA5 and ldd

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_061142.2
• Gene: ABCA5 / 23461
• HGNCID: 35
• Length: 1642
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001285513.1
• Gene: ldd / 318066
• FlyBaseID: FBgn0083956
• Length: 1998
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1529
• Identity: 352/1529 - (23%)
• Similarity: 624/1529 - (40%)
• Gaps: 308/1529 - (20%)

Human   214 DTFPRGV---------ILIYLVIAFSPFGYFLAIHI---VAEKEKKIKEFLKIMGLHDTAFWLSW 266
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  Fly   621 DVFKRGLYLAQGVQVAYLLGLVV-------FVALSVRERIWMRESRNSMLMRSMGLKAHSELVAW 678

Human   267 VLL-YTSLIFLMSLLMAVIATASLLFPQSSSIVIFLLFFL--YGLSSVFFALMLTPLFKKSKHVG 328
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  Fly   679 ALMSFLELCVIFALISGVLYSGGIL---GYTNWFFMMFYCLSFGLCLISFCYMCTNFF-NSANIG 739

Human   329 IVE----FFVTVAFGFIGLM----IILIESFPKSLVWLFSPFCHCTFVIGIAQVMHLEDFNEGAS 385
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  Fly   740 AVASALLFFISLCPFIIVLMFDAKLSVFESFLVDLSFT------TAFAKGWGELIRMELQQEGLT 798

Human   386 FSNL-TAGP--YPLIITIIMLTLNSIFYVLLAVYLDQVIPGEFGLRRSSLYFLKPSYWSKSKRNY 447
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  Fly   799 VRHLIQVGPARSECAMALLMFLLDLLLYAVIGL---------------------------AYQRY 836

Human   448 EELSEGNVNGNISFSEIIEPVSSEFVGKEAIRISGIQKTYRKKGENVEALRNLSFDIYEGQITAL 512
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  Fly   837 KK------TDNYSFVKVSR---SQLDGKLGASLVNVSKLYGSKC----AVSNLSLDFARNQVSCL 888

Human   513 LGHSGTGKSTLMNILCGLCPPSDGFASIYGHRVSEIDEMFEARKMIGICPQLDIHFDVLTVEENL 577
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  Fly   889 LGRNGAGKSTLIKLLTGQIRQSSGKVLLAGEH------------QVGVCWQDNILIPTLTAREHL 941

Human   578 SILASIKGIPANN-----IIQEVQKVLLDLDMQTIKDNQAKKLSGGQKRKLSLGIAVLGNPKILL 637
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  Fly   942 QLYAQIKIPPGGSGGVEEIRSEVAQTLQSLNFGKHESYPSWQLSGGYRRRLCVAIAFIASPSVVI 1006

Human   638 LDEPTAGMDPCSRHIVWNLLKYRKANRVTVFSTHFMDEADILADRKAVISQGMLKCVGSSMFLK- 701
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  Fly  1007 LDEPCNGVDAKARKDIWQLIERLRQGRAVIFATHFMDEAKYLSDSLVIMRNGRIIAQHSRDSLQR 1071

Human   702 ---SKWGIGYRLSMYIDKYCATESLSSLVKQHIPGATLLQQNDQQLVYSLPFKDMDKFSGLFSAL 763
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  Fly  1072 LCTSNYSIRLR--------CADAT----------GVTFVIQKAQQL---LP-QTQVTHSG---AA 1111

Human   764 DSHSNLGV-ISYGVSMTTLEDVFLKLEVEAEIDQ---ADYSVFTQQPLEEEMDSKSFDEMEQSLL 824
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  Fly  1112 DYPHSLTINASYAEHLTPGAVEFLEL-LQSQVTAGSISDVELTTSSSLEQEFEQLNRNGEDAGPR 1175

Human   825 ILSETKAALVSTMSLWKQQMYTIAK-FHFFTLKRESKSVRSVLLLLLIFFTVQIF----MFLVHH 884
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  Fly  1176 RPASDRSGVVAGPAMITDEPPTACKQFRLLMGKRLRHLSRNYRLLLYVLLLPALFELCAMWFVSY 1240

Human   885 SFK---NAVVPI--KLVPD-LYFLKPGDKPHKYKTSL------LLQNSADSDISDLISFFTSQNI 937
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  Fly  1241 RLEDDFDTVLPLSRSLYPQTAQFLS-----HERATSFSEKLYPQLRTSCD-HLGECRVFNTSQQS 1299

Human   938 MVTMIN------DSDYVSVAPHSAALNVMHSEKDYVFAAVFNSTMVYSLPILVNIISNYYLYHLN 996
            ...::|      :..|.....:.:...|.::.|.|      :|.|.:    |.::.|......:|
  Fly  1300 YDWVLNSWGEYSERRYGGYGLNGSGATVWYNNKGY------HSMMAW----LNDLNSELLRTTMN 1354

Human   997 VTETI-----QIWSTPFFQEIT----------DIVFKIELYFQAALLGIIVTAMPPYFAMENAEN 1046
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  Fly  1355 DSESSILTLNEPWKLGFAELSTSSILRQAGDGSMVFILLIAF-----GLVVASGSVYLVNERVNG 1414

Human  1047 HKIKAYTQLKLSGLLPSAYWIGQAVVDIPLFFIILILMLGSLLAFHYGLYFYTVKFLAVVFCLIG 1111
            .|:    |.:|.|:....||:...|.|..:..:.||:.|..:|.|...::....:.:.::...:.
  Fly  1415 EKL----QQRLCGVSAVTYWLVALVWDYLVMVLGLIVCLVVILMFGMPVFVDRQQLVGIIGLSLA 1475

Human  1112 Y----VPSVILFTYIASFTFKKILNTKEFWSFIYSVAALACIAITEITFFMGYTIAT-------- 1164
            :    ||||    ::|    :||.:....     ::.::.|..:......||..:..
  Fly  1476 FSFACVPSV----HVA----EKIFSDSSI-----AIVSIFCANLIVPLVTMGIILILGVVGDGPA 1527

Human  1165 ------ILHYAFCIIIPIYPLLGCLISFIK---ISWKNVRKNVDTY-NPWDR----------LSV 1209
                  .|:.|| :|.||:.|....:...|   ::....|.::|:| :|...          |.|
  Fly  1528 WDDWRHALNQAF-LIFPIHALGDGFLELCKNYMVALVFRRYDIDSYKHPLASDLLGRHFTALLLV 1591

Human  1210 AVISPYLQCVL-WIFLLQYYEKKYGGRSIRKDPFFRNLSTKSKNRKLPEPPDNEDEDEDVKAERL 1273
            .|.:..:..:: |..|.:.:::            ...|...:..|:|.            |..:|
  Fly  1592 GVAALIINVLIEWHLLRRLWQR------------VERLLDCTYRRELD------------KLGQL 1632

Human  1274 KVKELMGC--QCCEEKPSIMVSNLHKEYDDKKDFLLSRKVKKVATKYISFCVKKGEILGLLGPNG 1336
            |:..:...  .|.:...::...||...|          :....|.:.::|.|::||..||||.||
  Fly  1633 KLVNIQSIFKSCVDTGEAVRAENLWLAY----------RRGHYAVRNVNFSVQRGECFGLLGKNG 1687

Human  1337 AGKSTIINILVGDIEPTSGQVFLGDYSSETSEDDDSLKCMGYCPQINPLWPDTTLQEHFEIYGAV 1401
            ||||||..:|.|.::|..||::.....            :.||||.|||.|..|..|....||.:
  Fly  1688 AGKSTIFKLLTGQLQPDVGQIYFEQPG------------ISYCPQSNPLDPLLTTTECIRFYGRL 1740

Human  1402 KGMSASDMKEVISRITHALDLKEHLQKTVKKLPAGIKRKLCFALSMLGNPQITLLDEPSTGMDPK 1466
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  Fly  1741 RGI--RDLDQFLDRVLDTYELRPYKDVQVRNLSGGNRRKLTVAVTCCGCTPTVLMDEPTSDMDPV 1803

Human  1467 AKQHMWRAIRTAFKNRKRAAILTTHYMEEAEAVCDRVAIMVSGQLRCIGTVQHLKSKFGKGYFLE 1531
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  Fly  1804 TRDMVYATIEQLLLAR-RAVVLTSHSVSEIEHLCQRVAVLRAGQVIASDSPQRLKSEHG-GYY-- 1864

Human  1532 IKLKDWIENLEVDRLQREIQYIFPNASRQESFSSILAYKIPKE------DVQSLSQSFFKLEEAK 1590
             .:..:....:...|.|.:....|.|...:.::..|.:.:...      |...||:.|..|.:.
  Fly  1865 -AVTCFCGPAQQAILSRSLNQRLPGARDLQHYAHSLRFLVRVRSPGSLGDAPLLSELFAILCDV- 1927

Human  1591 HAFAIEEYSFSQATLEQVFVELTKEQEEEDNSCG 1624
             ...:..:|.|:...|.|| |...:..|.:.|.|
  Fly  1928 -CVNVARFSLSRCRFETVF-ERILDSSESNGSNG 1959

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ABCA5	NP_061142.2	rim_protein	<84..1618	CDD:130324	349/1521 (23%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1249..1268		2/18 (11%)
ldd	NP_001285513.1	rim_protein	179..1867	CDD:130324	333/1432 (23%)