DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AFF2 and Aff2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002016.2 Gene:AFF2 / 2334 HGNCID:3776 Length:1311 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017457913.1 Gene:Aff2 / 293922 RGDID:1565592 Length:1287 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1318 Identity:1135/1318 - (86%)
Similarity:1192/1318 - (90%) Gaps:38/1318 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGD 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRSQEVQQEEDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGD 65

Human    66 ALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNT 130
            |||||||||||:|||||:||:|||:||||||||||||||.|.:|:|.|.:||||||:||.||:||
  Rat    66 ALANRVQNTLGSYDEMKDLLSNHSSQNHLVGIPKNSVPQTPISKSEASLYPEQKNRMIPSHQENT 130

Human   131 HPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLED 195
            |.|.|||||||||||||||:||||||.||.||:||.|...|.|||.||||:||.|||..|.:|||
  Rat   131 HSSVPMPPPSVVILNSTLINSNRKSKSEWPRDNHNTSPGQACQASSQPNKIQTSTQDPPQTRLED 195

Human   196 FFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLA 260
            ||||||||||||..|:||||||||:||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat   196 FFVYPAEQPQIGTAEKSNPSAKEDNNPNSGGEDAFKEIFQSNSPEESEFTVQAPGSPLVASSLLA 260

Human   261 PSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLD 325
            |||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   261 PSSGLSVPTFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQATDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGSLLD 325

Human   326 GKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILREMTHSWPTPLTSMHTAGHSEQSTFSIPG 390
            |||||||:|.|||||||||||||||.|:|||||||||                            
  Rat   326 GKPSAASTKNKLPKFTILQTSEVSLTSEPSCVEEILR---------------------------- 362

Human   391 QESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAV 455
             ||||||||||||||:||::|||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat   363 -ESQHLTPGFTLQKWSDPSSRASTKSVPLKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTANELYQAV 426

Human   456 EKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEP 520
            |||||:|||||..||||||..|.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   427 EKAKPKNNPVNSLLATPQPTSAAQASVGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEP 491

Human   521 EPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKE 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||:|||:|||.|.||..|.|||
  Rat   492 EPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPTETISLPPPIIQPVEVQVKVKPNPSQSVAVPKE 556

Human   586 RPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNI 650
            ||||||||||||||||||.||||||||||||:.::|||||||||||||||||||.:||.|||||.
  Rat   557 RPLLSLIREKARPRPTQKTPETKALKHKLSTSVDSVSQRTIGKKQPKKVEKNTSFEEFIWPKPNT 621

Human   651 TSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDS 715
            |||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||::|||.|||||||||||||||||||||||
  Rat   622 TSSTPKEKESVELPDPPRSRNKATAHKPVPRKEPRPHVPLATEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDS 686

Human   716 STSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSN--NNLSISNEEPTF 778
            |||||:||||||||||||||||..||||:||||...||||||||.||:.:|  ||||.||||..|
  Rat   687 STSDSSTDQEETLQIKVLPPCIAPGGNTSKSKETSNASLTLSTLTSSNSNNNSNNLSTSNEETAF 751

Human   779 SPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPD-HKETATKPKRQTAVT 842
            ||.|.||||:|:|:.|||..|||||||||||||||||.:|:.|||||.| |||||:|||||||..
  Rat   752 SPPPAMQTELLTPVHDHEIPKNLWVKIDLDLLSRVPGQNSVPAAPAKTDHHKETASKPKRQTAAI 816

Human   843 AVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRR 907
            .||||||||||||||.|.||||||||||||: ||||||||||||||||||||||| ||||||||:
  Rat   817 TVEKPAPKGKRKHKPAEAAEKIPEKKQRLED-TTICLLPPCISPAPPHKPPNTRE-NSSRRANRK 879

Human   908 KEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNE 972
            :|||||||.||||.||||||||||||||.|.|||||:|.||||||||||:||||||||||||::|
  Rat   880 REEKLFPPALSPLAEDPPRRRNVSGNNGFFSQDKNISMAGQITSTKPKRSEGKFCATFKGISISE 944

Human   973 GDTPKKASSATITVTNTAIATATVTAT--AIVTTTVTATA--TATATTTTTTTTISTITSTITTG 1033
            ||.|||.:|||:||.||||||||.|||  ||||.||||||  ||||||||||||||:||.|||:|
  Rat   945 GDAPKKPASATVTVANTAIATATATATAPAIVTATVTATATTTATATTTTTTTTISSITPTITSG 1009

Human  1034 LMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVN 1098
            ||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat  1010 LMDSSHLEMTSWAALPLLASSSTNVRRPKLTFDDSVHNADFYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVN 1074

Human  1099 YADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCL 1163
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1075 YADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCL 1139

Human  1164 SLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNC 1228
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||:||||
  Rat  1140 SLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVPQIPSPWVGNGKNTPSPVSLNNVSPINSMGNC 1204

Human  1229 NNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNL 1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat  1205 NNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRDNKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNL 1269

Human  1294 VRYVRQGLCWLRIDAHLL 1311
            ||||||||||||||||||
  Rat  1270 VRYVRQGLCWLRIDAHLL 1287

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AFF2NP_002016.2 AF-4 18..535 CDD:461550 426/516 (83%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 94..187 68/92 (74%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 204..229 19/24 (79%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 377..417 21/39 (54%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 457..530 65/72 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 574..726 130/151 (86%)
AF4_int 801..815 CDD:436798 13/13 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 818..867 39/49 (80%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 881..943 54/61 (89%)
AF-4_C 1056..1311 CDD:465894 249/254 (98%)
Aff2XP_017457913.1 AF-4 18..506 CDD:461550 426/516 (83%)
PTZ00449 <564..956 CDD:185628 325/393 (83%)
AF4_int 774..788 CDD:436798 13/13 (100%)
AF-4_C 1032..1287 CDD:465894 249/254 (98%)

Return to query results.
Submit another query.