DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CUX2 and Cux2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_056082.2 Gene:CUX2 / 23316 HGNCID:19347 Length:1486 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_011246473.2 Gene:Cux2 / 13048 MGIID:107321 Length:1595 Species:Mus musculus


Alignment Length:1502 Identity:1234/1502 - (82%)
Similarity:1292/1502 - (86%) Gaps:53/1502 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    18 RRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEIREMVAPVLKSFQAEVVALSKRS 82
            |.|:|||:||||||||.||||..|.||.|||||||||:|||.||.||||||||||||||||||||
Mouse   114 RSLRKELSSVASELSAPQEESGLSPKHFIELRREFKKDVPEGIRAMVAPVLKSFQAEVVALSKRS 178

Human    83 QEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPSFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQ 147
            :|||||||||||||||||||||.||.||:||||||.||||||||..:|:|.:|||.||..|.:||
Mouse   179 REAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPSFEVARTLDDRLQRPSFDPSGQRLQDVHIAWKRCPEPPSAREQ 243

Human   148 REGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHS 212
            .|||.|.|.|...|:.||| |...|:|:||||:||||:|||||||.|||||||||||||||||||
Mouse   244 NEGTCPTGHTPANGNHLPG-PEDTLVTDTLLQKNEAERQKGLQEVHITLAARLGEAEEKIKVLHS 307

Human   213 ALKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLA 277
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   308 ALKATQTELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLA 372

Human   278 CCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQL 342
            |||||||||:||:|.||||||||||||||||||||||||.|.|:.|||||||.||||||||||||
Mouse   373 CCSPQGPSGEKVSFALCSGPRLEAALASKDREILRLLKDAQQLRHSLQELEEVSANQIADLERQL 437

Human   343 TAKSEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQK 407
            .|||||||||:|||:||:||||||||||||:|||||||||||||.:|||:|.||:||:.||||||
Mouse   438 AAKSEAIEKLQEKLEAQADYEEIKTELSILRAMKLASSTCSLPQTLAKPDDPLLVAKDVFFPTQK 502

Human   408 FLLEKPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDG 472
            ||||||:||||||||||||||||.|||||..|  |.||||||||||||||||.||||||||||||
Mouse   503 FLLEKPALLASPEEDPSEDDSIKGSLGTEPPY--PPQLPPPPGPEDPLSPSPAQPLLGPSLGPDG 565

Human   473 TRTFSLSPFPSLASGERL---------MMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFY-GAKPPTAPATPAPGP 527
            .||||||||||||.||||         ||.|||||||.|.||.|||.|| |||||:|||...|.|
Mouse   566 PRTFSLSPFPSLAPGERLAGDSLLSKHMMGPAAFKGETGNLLAFPPTFYGGAKPPSAPAASVPCP 630

Human   528 EPLGGPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLGLSQGSVSEIL 592
            ||.|.||..||     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   631 EPTGAPEAVDG-----AGP--EEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLGLSQGSVSEIL 688

Human   593 ARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR-----------GSITPRIRTPETG 646
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||
Mouse   689 ARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQRGPTAATFVPLPGSITPRIRTPETG 753

Human   647 SDDAIKSILEQAKKEIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAIKSILEQARREMQAQQQAL 711
            |||||||||||||||||||||||.|.|.|.:||.|||..:||||||||:||||||||||||||||
Mouse   754 SDDAIKSILEQAKKEIESQKGGESKNSPASVSIPNGTASSSTSEDAIKNILEQARREMQAQQQAL 818

Human   712 LEMEVAPRGRSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGG-----PAQAPLPVLSPAAFVQSI 771
            ||||..|||||||||||||||.||||||||...||||:|.||     ..||||.|||||||||.|
Mouse   819 LEMESGPRGRSVPPSPPERPSPATASQNGALTCVKQEDGGGGSGSSSTVQAPLAVLSPAAFVQRI 883

Human   772 IRKVKSEIGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSSGYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPED 836
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||.:.|||
Mouse   884 IRKVKSEIGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSS--YSGQPNGRAWPRGDEATIAPED 946

Human   837 EAAAGAEDEPPRTGELKAE-GATAEAGARLPYYPAYVPRTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLE 900
            |||.| |||.||.|||||| ||....|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   947 EAAMG-EDEAPRVGELKAEAGAPEVGGGRLPYYPAYVPRTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLE 1010

Human   901 LTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLSDQLGQ 965
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1011 LTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLSDQLGQ 1075

Human   966 AVG----QQPGASQASPTEPRSSPSPPPSPTEPEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSSSSLSGK 1026
            ..|    |||.|||||||||.||||||||||||||:|||||.|||||||||||||||:||||.||
Mouse  1076 GQGQAPTQQPSASQASPTEPTSSPSPPPSPTEPEKTSQEPLGLSLESSKENQQPEGRASSSLGGK 1140

Human  1027 MYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKP 1091
            .:|.|||.|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1141 PFSSSQAAGGIQEMVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKP 1205

Human  1092 WHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLISTGSDSESPATRSECPSP 1156
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||
Mouse  1206 WHKLSLKGREPFVRMQLWLSDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLIGTGSDSESPAAHSECPSP 1270

Human  1157 CLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRS 1221
            |||||:|||:|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1271 CLQPQELSLMQAKKPRVVLAPAEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRS 1335

Human  1222 RMRREMLVEGTQDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKPTVKELELQ--EGPEEN 1284
            |||||||||||||:||.||||||.:|.|||:|.:|||||||||||||||.:|.||||  |||.:.
Mouse  1336 RMRREMLVEGTQDDPDFDPSGGPNVLTPGHTHREPTPQSPDSETEDQKPPMKSLELQEPEGPLQR 1400

Human  1285 STPLTTQDKAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPL 1349
            :.|    |:|.|:|||   ||..|.:..|||||.|:.|:||..|||||..|.||..|.::||||.
Mouse  1401 AAP----DRALVKIKQ---EEGLEVDGDSQPQDVGDPDRGQDGPKEEHTHPLGNSDLSELAPGPF 1458

Human  1350 LPGGSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVP 1414
            |.|...|||||||..||...||::|.:||||||.||||.||||...||||..|||.|...|||.|
Mouse  1459 LSGTPNPDCPSLHNPQEKGTGEQVHSEPLSFKSTSESSCCSLEGPPNSPSVISSPDLTTCVSPAP 1523

Human  1415 SSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRVERAANRE 1479
            |||||||||.||||||||||.|||.|.|.|||||.|||||||||||||||||:||||:|||||||
Mouse  1524 SSSAPISPSLPGAPPAKVPSTSPTGDTAAALHPSTKVNPNLQRRHEKMANLNSIIYRLERAANRE 1588

Human  1480 EALEWEF 1486
            |.|||||
Mouse  1589 EVLEWEF 1595

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CUX2NP_056082.2 PRK03918 <17..>269 CDD:235175 204/250 (82%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 114..167 31/52 (60%)
Smc <179..>379 CDD:440809 182/199 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 415..481 57/65 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 517..549 16/31 (52%)
CUT 553..625 CDD:460543 71/71 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 661..690 19/28 (68%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 716..758 31/46 (67%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 800..858 48/58 (83%)
CUT 892..965 CDD:460543 72/72 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 964..1032 56/71 (79%)
CUT 1043..1119 CDD:460543 74/75 (99%)
Homeodomain 1169..1225 CDD:459649 54/55 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1231..1453 143/223 (64%)
Cux2XP_011246473.2 Smc <274..>474 CDD:440809 182/199 (91%)
CUT 645..721 CDD:460543 75/75 (100%)
CUT 1002..1075 CDD:460543 72/72 (100%)
CUT 1157..1233 CDD:460543 74/75 (99%)
Homeodomain 1283..1339 CDD:459649 54/55 (98%)

Return to query results.
Submit another query.