DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment UBR2 and ubr2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011512740.2 Gene:UBR2 / 23304 HGNCID:21289 Length:1782 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017214413.2 Gene:ubr2 / 559136 ZFINID:ZDB-GENE-081107-29 Length:1771 Species:Danio rerio


Alignment Length:1774 Identity:1282/1774 - (72%)
Similarity:1483/1774 - (83%) Gaps:35/1774 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    37 QPDPDLGKQLC-------RPSPCGKWLQATDLTREVYQHLAHYVPKIYCRGPNPFPQKEDMLAQH 94
            :.|.|....||       ......||||.::|.:|||||||.|||||||.|||..||.||:|||.
Zfish     5 ETDRDAPSALCSEFLNFSAKDTAAKWLQVSNLPKEVYQHLACYVPKIYCLGPNLNPQNEDLLAQL 69

Human    95 VLLGPMEWYLCGEDPAFGFPKLEQANKPSHLCGRVFKVGEPTYSCRDCAVDPTCVLCMECFLGSI 159
            :|.||:|||||||:|:.|..||||.|:||.|||.||||||||||||:||.||||||||:|||||:
Zfish    70 LLQGPLEWYLCGEEPSVGLSKLEQNNQPSQLCGHVFKVGEPTYSCRECAADPTCVLCMQCFLGSV 134

Human   160 HRDHRYRMTTSGGGGFCDCGDTEAWKEGPYCQKHELNTSEIEEEEDPLVHLSEDVIARTYNIFAI 224
            |::|||||||||||||||||||||||:||||||||.|.|: ..::|||.:||.::||||||:|:|
Zfish   135 HKEHRYRMTTSGGGGFCDCGDTEAWKKGPYCQKHEPNISD-SSQKDPLANLSAEMIARTYNVFSI 198

Human   225 TFRYAVEILTWEKESELPADLEMVEKSDTYYCMLFNDEVHTYEQVIYTLQKAVNCTQKEAIGFAT 289
            ..:|||::|||:||.|||..||...:.|.|||||||||||||||||||||||||||||||:.|||
Zfish   199 ILKYAVDMLTWDKEDELPEGLEPPARGDMYYCMLFNDEVHTYEQVIYTLQKAVNCTQKEAVSFAT 263

Human   290 TVDRDGRRSVRYGDFQYCEQAKSVIV--------------RNTSRQTKPLKVQVMHSSIVAHQNF 340
            |||||||:|||:||||:|||||||||              ||||||||||:|||||||:||||.|
Zfish   264 TVDRDGRKSVRFGDFQFCEQAKSVIVVNTLQSTSTKPLAWRNTSRQTKPLRVQVMHSSVVAHQCF 328

Human   341 GLKLLSWLGSIIGYS-DGLRRILCQVGLQEGPDGENSSLVDRLMLSDSKLWKGARSVYHQLFMSS 404
            .||.|:|||..|.|| |.|||||||||||.||:||||||||:|||.|||:|||||:|||||||||
Zfish   329 ALKALNWLGQTIRYSADALRRILCQVGLQRGPEGENSSLVDKLMLCDSKMWKGARNVYHQLFMSS 393

Human   405 LLMDLKYKKLFAVRFAKNYERLQSDYVTDDHDREFSVADLSVQIFTVPSLARMLITEENLMSIII 469
            ||||.|||||||::||:||||||||||.|||||||||.|||||:||||||||||||:||||:.||
Zfish   394 LLMDPKYKKLFAIQFARNYERLQSDYVKDDHDREFSVTDLSVQMFTVPSLARMLITDENLMTTII 458

Human   470 KTFMDHLRHRDAQGRFQFERYTALQAFKFRRVQSLILDLKYVLISKPTEWSDELRQKFLEGFDAF 534
            :||:|||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||:||||:|:||:|:|||||||
Zfish   459 RTFVDHLRHRDLQGRFQFERYTAQQAFKFRRVQSLIGDLKYVLISRPTEWTDQLREKYLEGFDAF 523

Human   535 LELLKCMQGMDPITRQVGQHIEMEPEWEAAFTLQMKLTHVISMMQDWCASDEKVLIEAYKKCLAV 599
            ||||||||||||:.|||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||:||||||||.|:.
Zfish   524 LELLKCMQGMDPVVRQVGQHIEMEPEWEAAFTLQMKLTHIISMMQEWCASDERVLIEAYKKSLSA 588

Human   600 LMQCHGGYTDGEQPITLSICGHSVETIRYCVSQEKVSIHLPVSRLLAGLHVLLSKSEVAYKFPEL 664
            |..||.|:||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||||.||||.||||:|||.
Zfish   589 LTHCHSGFTDGEQPITLSMCGHSVDTIRYCVSQEKVSIHLPVSRLLAGLHALLSKIEVAYRFPEQ 653

Human   665 LPLSELSPPMLIEHPLRCLVLCAQVHAGMWRRNGFSLVNQIYYYHNVKCRREMFDKDVVMLQTGV 729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||::|||.|.
Zfish   654 LPLSELSPPMLIEHPLRCLVLCAQVHAGMWRRNGFSLVNQIYYYHNVKCRVEMFDKDLIMLQAGA 718

Human   730 SMMDPNHFLMIMLSRFELYQIFSTPDYGKRFSSEITHKDVVQQNNTLIEEMLYLIIMLVGERFSP 794
            |||||||||||||||||||.|||:.|..||:|.|..:|||||||||||||||:||||:||||::.
Zfish   719 SMMDPNHFLMIMLSRFELYHIFSSADCRKRYSRENANKDVVQQNNTLIEEMLHLIIMIVGERYTA 783

Human   795 GVGQVNATDEIKREIIHQLSIKPMAHSELVKSLPEDENKETGMESVIEAVAHFKKPGLTGRGMYE 859
            |||||..||||:|||:|||.|:|||||||||:|||:||||||||.||::||.|||||:||||:|:
Zfish   784 GVGQVEITDEIRREIVHQLCIRPMAHSELVKALPENENKETGMERVIDSVALFKKPGVTGRGLYK 848

Human   860 LKPECAKEFNLYFYHFSRAEQSKAEEAQRKLKRQNREDTALPPPVLPPFCPLFASLVNILQSDVM 924
            |:|||||.|||||:|:|||:||||||||||:||||.||:.|||||||.|||||||||||||.||:
Zfish   849 LRPECAKMFNLYFHHYSRADQSKAEEAQRKIKRQNGEDSVLPPPVLPRFCPLFASLVNILQCDVL 913

Human   925 LCIMGTILQWAVEHNGYAWSESMLQRVLHLIGMALQEEKQHLENVTEEHVVT-FTFTQKISKPGE 988
            |.|:|.:||||:|.:|..|||||||||||||||.|.||:|||.:..|::..| |.||.|||:|||
Zfish   914 LGILGAVLQWAMEPSGGHWSESMLQRVLHLIGMGLVEEQQHLISSAEDYNDTNFNFTLKISRPGE 978

Human   989 APKNSPSILAMLETLQNAPYLEVHKDMIRWILKTFNAVKKMRESSPTSPVAETEGTIMEESSRDK 1053
            ||.|:.||||:||||||||:||||||||||||||...:|..||.:.:||.:::.|...||:.|||
Zfish   979 APANTASILALLETLQNAPHLEVHKDMIRWILKTVAYIKTTRECTASSPPSDSSGHSQEETVRDK 1043

Human  1054 DKAERKRKAEIARLRREKIMAQMSEMQRHFIDENKELFQQTLE-LDASTSAVLDHSPVASDMTLT 1117
            :|||||||||:||||||||||||||||||||:||||||||:|| ||.|||:.|:|||.:.|..|.
Zfish  1044 EKAERKRKAEMARLRREKIMAQMSEMQRHFINENKELFQQSLEDLDPSTSSTLEHSPSSCDSALV 1108

Human  1118 ALGPAQTQV--PEQRQFVTCILCQEEQEVKVESRAMVLAAFVQRSTVLSKNRSKFIQDPEKYDPL 1180
            .:||.:.:.  .::||.|||||||||||::.:.:|||||||||||||:||||.:...:|:|||||
Zfish  1109 CVGPRRWRAGGSDRRQVVTCILCQEEQEIRSDGKAMVLAAFVQRSTVMSKNRKRPPHNPDKYDPL 1173

Human  1181 FMHPDLSCGTHTSSCGHIMHAHCWQRYFDSVQAKEQRRQQRLRLHTSYDVENGEFLCPLCECLSN 1245
            |||||||.||||.|||||||:|||||||::|||||||||||||:|||||||||||||||||||||
Zfish  1174 FMHPDLSFGTHTGSCGHIMHSHCWQRYFEAVQAKEQRRQQRLRVHTSYDVENGEFLCPLCECLSN 1238

Human  1246 TVIPLLLPPRNIFNNRLNFSDQPNLTQWIRTISQQIKALQFLRKEESTPNNASTKNSENVDELQL 1310
            ||||||...:...:     |:||:|:||:...|.|:|||....::....:..:...::.|::...
Zfish  1239 TVIPLLPLTKTCCS-----SEQPDLSQWLNITSHQMKALISAHRKSKASSAEAADETDGVNDCPP 1298

Human  1311 PEGFRPDFRPKIPYSESIKEMLTTFGTATYKVGLKVHPNEEDPRVPIMCWGSCAYTIQSIERILS 1375
            |:|||.|..||.|||.:|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:|.
Zfish  1299 PDGFRLDHTPKNPYSSTIKEMLTTFGTATYKVGLKVHPNEQDPRVPIMCWGSCAYTIQSIERLLV 1363

Human  1376 DEDKPLFGPLPCRLDDCLRSLTRFAAAHWTVASVSVVQGHFCKLFASLVPNDSHEELPCILDIDM 1440
            ||:|||||.||||.||||.|||||.:|.|||:|.:.||.||.:|.|:|||:...|..|||||:||
Zfish  1364 DEEKPLFGSLPCRQDDCLSSLTRFGSACWTVSSHTTVQNHFIRLLAALVPDPRVENSPCILDVDM 1428

Human  1441 FHLLVGLVLAFPALQCQDFSGISLGTGDLHIFHLVTMAHIIQILLTSCTEENGMDQENPPC--EE 1503
            |||||.|||:.||:.|.|.||:|.....||..||:|:||::||||||..||..|:||....  ||
Zfish  1429 FHLLVSLVLSHPAVLCLDSSGLSADAAQLHFLHLITVAHVVQILLTSLPEEVRMEQETGGAEREE 1493

Human  1504 ESAVLALYKTLHQYTGSALKEIPSGWHLWRSVRAGIMPFLKCSALFFHYLNGVPSPPDIQVPGTS 1568
            |.:|..||.||....|..|:|:.||||||..|:|||:|:|:.:|||||||||.|:||::...|..
Zfish  1494 EESVCLLYNTLRSLLGRGLREVSSGWHLWLCVKAGILPYLRAAALFFHYLNGAPAPPELHALGAG 1558

Human  1569 HFEHLCSYLSLPNNLICLFQENSEIMNSLIESWCRNSEVKRYLEGERDAIRYPRESNKLINLPED 1633
            .:|.||.||.||:||:.|:..|.:||..|:..||.:..::. |:.....||:|||||.||:||.|
Zfish  1559 EWEALCGYLCLPSNLLQLYFNNLDIMEPLLHGWCSHPALQA-LQSSVTLIRFPRESNHLIDLPGD 1622

Human  1634 YSSLINQASNFSCPKSGGDKSRAPTLCLVCGSLLCSQSYCCQTELEGEDVGACTAHTYSCGSGVG 1698
            ||:||||||:|:||||||||||.||||||||::||||||||||||||||||||||||::||:|||
Zfish  1623 YSALINQASSFTCPKSGGDKSRVPTLCLVCGAMLCSQSYCCQTELEGEDVGACTAHTFTCGAGVG 1687

Human  1699 IFLRVRECQVLFLAGKTKGCFYSPPYLDDYGETDQGLRRGNPLHLCKERFKKIQKLWHQHSVTEE 1763
            |||||||.||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||.||::||||||.|||:|||
Zfish  1688 IFLRVRESQVLFLAGKTKGCFYAPPYLDDYGETDQGLRRGNPLHLCHERYRKIQKLWRQHSITEE 1752

Human  1764 IGHAQEANQTLVGIDWQHL 1782
            |||||||||||||||||||
Zfish  1753 IGHAQEANQTLVGIDWQHL 1771

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
UBR2XP_011512740.2 UBR-box_UBR2 125..194 CDD:439077 60/68 (88%)
ClpS 249..327 CDD:460621 68/91 (75%)
RING-H2_UBR2 1134..1249 CDD:438347 94/114 (82%)
PRT6_C 1337..1755 CDD:465944 282/419 (67%)
ubr2XP_017214413.2 None

Return to query results.
Submit another query.