DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF13B and Kif13b

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_011542759.1 Gene:KIF13B / 23303 HGNCID:14405 Length:1847 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_998791.1 Gene:Kif13b / 305967 RGDID:1303307 Length:1767 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1884 Identity:1551/1884 - (82%)
Similarity:1620/1884 - (85%) Gaps:154/1884 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGDSKVKVAVRIRPMNRRETDLHTKCVVDVDANKVILNPVNTNLSKGDARGQPKVFAYDHCFWSM 65
            |||||||||||:|||||||.||||||||||:||||||||:||||||||||||||:||||||||||
  Rat     1 MGDSKVKVAVRVRPMNRREIDLHTKCVVDVEANKVILNPINTNLSKGDARGQPKIFAYDHCFWSM 65

Human    66 DESVKEKYAGQDIVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGL 130
            ||||:|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 DESVREKYAGQDDVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGL 130

Human   131 FERTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYK 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 FERTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYK 195

Human   196 DIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERA 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 DIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERA 260

Human   261 TKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTA 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 TKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQGAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTA 325

Human   326 MVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKHIVNHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKS 390
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 MVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKHIINHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKS 390

Human   391 PELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQSSGIKVGDDKCFLVNLNA 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   391 PELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQTSGIKVGDDKCFLVNLNA 455

Human   456 DPALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHCIIDITSEGQVMLTPQKNTRTFVNGSSV 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||
  Rat   456 DPALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHGIIDIMPEGQVMLTPQKNTRTFVNGSSV 520

Human   521 SSPIQLHHGDRILWGNNHFFRLNLPKKKKKAEREDEDQDPSMKNENSSEQLDVDGDSSSEVSSEV 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:::.|:||::||||||.|||||||||||:
  Rat   521 SSPIQLHHGDRILWGNNHFFRLNLPKKKKKAEREDEEREASLKNDSSSEQLDADGDSSSEVSSEI 585

Human   586 NFNYEYAQMEVTMKALGSNDPMQSILNSLEQQHEEEKRSALERQRLMYEHELEQLRRRLSPEKQN 650
            |||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   586 NFNFEYAQMEVTMKALGSNDPMQSILSSLEQQHEEEKRSALERQRLMYEHELEQLRRRLSPERQN 650

Human   651 CRSMDRFSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVKANLLVREANYIAEELDKRTEYKV 715
            ||.:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat   651 CRGVDRLSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVKANLLVREASYIAEELDKRTEYKV 715

Human   716 TLQIPASSLDANRKRGSLLSEPAIQVRRKGKGKQIWSLEKLDNRLLDMRDLYQEWKECEEDNPVI 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:||.
  Rat   716 TLQIPASSLDANRKRGSLLSEPAIQVRRKGKGKQIWSLEKLENRLLDMRDLYQEWKECEEDSPVS 780

Human   781 RSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLESLFYDVKLQYAVPIINQKGEVAGRLHVEVMRLSGDVG 845
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.:|
  Rat   781 RSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLETLFYDVKLQYAVPIINQKGEVAGRLHVEVMRLSGAIG 845

Human   846 ERIAGGDEVAEVSFEKETQENKLVCMVKILQATGLPQHLSHFVFCKYSFWDQQEPVIVAPEVDTS 910
            |||||||:..|||.|||.|||:|||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||
  Rat   846 ERIAGGDDPTEVSSEKEVQENRLVCMVKILQATGLPQHLCHFVFCKYDFWDQQEPVTVAPEVDTS 910

Human   911 SSSVSKEPHCMVVFDHCNEFSVNITEDFIEHLSEGALAIEVYGHKINDPRKNPALWDLGIIQAKT 975
            ||..||||.||||||||:||||||||||||:||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   911 SSPTSKEPQCMVVFDHCSEFSVNITEDFIEYLSEGALAIEVYGHKMNDPRKNPALWDLGIIQAKT 975

Human   976 RSLRDRWSEVTRKLEFWVQILEQNENGEYCPVEVISAKDVPTGGIFQLRQGQSRRVQVEVKSVQE 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 RSLRDRWSEVTRKLEFWVQILEQNENGEYCPVEVIAAKDVPTGGIFQLRQGQSRRVQVEVKSVQE 1040

Human  1041 SGTLPLMEECILSVGIGCVKVRPLRAPRTHETFHEEEEDMDSYQDRDLERLRRKWLNALTKRQEY 1105
            |||||||||||||||||||||||||:|:|||..||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 SGTLPLMEECILSVGIGCVKVRPLRSPKTHENIHEEEEDMDSYQDRDLERLRRKWLNALTKRQEY 1105

Human  1106 LDQQLQKLVSKRDKTEDDADREAQLLEMRLTLTEERNAVMVPSAGSGIPGAPAEWTPVPGMETHI 1170
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat  1106 LDQQLQKLVSKHDKTEDDADREAQLLEMRLTLTEERNAVMVPSAGSGIPGAPAEWTPVPGMEAHI 1170

Human  1171 PVIFLDLNADDFSSQDNLDDPEAGGWDATLTGEEEEEFFELQIVKQHDGEVKAEASWDSAVHGCP 1235
            ||:|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||
  Rat  1171 PVVFLDLNADDFSSQDNLDDPEA-GWDATLTGEEEEEFFELQIVKHHDGEVKAEASWDSAVHNCP 1234

Human  1236 QLSRGTPVDERLFLIVRVTVQLSHPADMQLVLRKRICVNVHGRQGFAQSLLKKMSHRSSIPGCGV 1300
            |||:|||.|||:|||:||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||||:||||||||||
  Rat  1235 QLSKGTPADERVFLILRVAVQLSHPADMQLVLRKRICVHVHGRQGFAQSLLKKMTHRSSIPGCGV 1299

Human  1301 TFEIVSNIPE-DAQGVEEREALARMAANVENPASADSEAYIEKYLRSVLAVENLLTLDRLRQEVA 1364
            |||||||||| ||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1300 TFEIVSNIPEVDAQGVEEREALARMAANVENAASADSEACIEKYLRSVLAVENLLTLDRLRQEVA 1364

Human  1365 VKEQLTGKGKLSRRSISSPNVNRVSVWNQALCCAWDFSPLLFSWLSGSRQDLIPSYSLGSNKGRW 1429
            |||||||||||:|||||||::||                     ||||||:|.||:||.|||   
  Rat  1365 VKEQLTGKGKLNRRSISSPSMNR---------------------LSGSRQELSPSHSLSSNK--- 1405

Human  1430 ESQQDVSQTTVSRGIAPAPALSVSPQNNHSPDPGLSNLAASYLNPVKSFVPQMPKLLKSLFPVRD 1494
                                                                             
  Rat  1406 ----------------------------------------------------------------- 1405

Human  1495 EKRGKRPSPLAHQPVPRIMVQSASPDIRVTRMEEAQP-EMGPDVLVQT---MGAPALKICDKPAK 1555
                         |||||:||....|.|.||.||||. ..||...:::   |.||.:||||||.:
  Rat  1406 -------------PVPRILVQPTFSDARATRTEEAQQGSPGPSGALESMVKMAAPTVKICDKPVR 1457

Human  1556 VPSPPPVIAVTAVTPAPEAQDGPPSPLSEASSGYFSHSVSTATLSDALGPGLD----AAAPPGSM 1616
            |.|||   :...||...|.||||||||||||||||||||||||||:.|..|||    .:..|||.
  Rat  1458 VSSPP---STMVVTQPQEGQDGPPSPLSEASSGYFSHSVSTATLSETLTLGLDTTGLGSQTPGSP 1519

Human  1617 PT------APE-----------AEPEAPISHPPPPTAVPAEEPPGPQQLVSPGRERPDLEAPA-P 1663
            |.      .||           .:||.|...|..||.....|.|.|..|..|        .|| |
  Rat  1520 PALCQVTQEPELAFLSCTQSHPTDPEEPHIPPATPTQSTELEVPRPPLLSDP--------TPAVP 1576

Human  1664 GSPFRVRRVRASELRSFSRMLAGDPGCSPGAEGN---APAPG-AGGQAL-----ASDSEEADEVP 1719
            .||||:|:||.|||.||:.||.   |.|.||:.:   :..|. |.||.|     .||||:|.|||
  Rat  1577 TSPFRIRKVRPSELTSFTGMLG---GASSGAQEDPVVSEDPSHARGQTLGRLEVTSDSEDASEVP 1638

Human  1720 EWLREGEFVTVGAHKTGVVRYVGPADFQEGTWVGVELDLPSGKNDGSIGGKQYFRCNPGYGLLVR 1784
            |||||||:|.||.:|||:|||:||.|||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat  1639 EWLREGEYVVVGTNKTGIVRYIGPTDFQEGTWIGVELDLPAGKNDGSIGGKQYFRCNPGYGLLVR 1703

Human  1785 PSRVRRATGPVRRRSTGLR-LGAPEARRSATLSGSATNLASLTAALAKADRSHKNPENRKSWAS 1847
            |.|||||.|..||||:||: .||||||||||:||||||||||||||||.|||:|||||||||||
  Rat  1704 PGRVRRAAGTGRRRSSGLQPQGAPEARRSATISGSATNLASLTAALAKGDRSYKNPENRKSWAS 1767

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF13BXP_011542759.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..360 CDD:276816 346/355 (97%)
KISc 6..360 CDD:214526 344/353 (97%)
Kinesin_assoc 357..469 CDD:292801 110/111 (99%)
FHA 447..544 CDD:238017 93/96 (97%)
RILP-like <610..710 CDD:304877 93/99 (94%)
KIF1B 756..802 CDD:289208 42/45 (93%)
DUF3585 <1099..1143 CDD:304905 42/43 (98%)
DUF3694 <1221..1279 CDD:289256 50/57 (88%)
Jun <1560..1664 CDD:281890 53/125 (42%)
CAP_GLY 1725..1788 CDD:279625 52/62 (84%)
Kif13bNP_998791.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..360 CDD:276816 346/355 (97%)
KISc 6..360 CDD:214526 344/353 (97%)
Kinesin_assoc 357..469 CDD:292801 110/111 (99%)
FHA 447..544 CDD:238017 93/96 (97%)
KIF1B 756..802 CDD:289208 42/45 (93%)
C2 <888..>952 CDD:301316 56/63 (89%)
DUF3585 <1073..1143 CDD:304905 67/69 (97%)
DUF3694 <1211..1278 CDD:289256 58/66 (88%)
CAP_GLY 1644..1707 CDD:279625 52/62 (84%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83697008
Domainoid 1 1.000 673 1.000 Domainoid score I3832
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0241
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H9073
Inparanoid 1 1.050 3128 1.000 Inparanoid score I468
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG48008
OrthoDB 1 1.010 - - D12822at7742
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0002517
OrthoInspector 1 1.000 - - oto136281
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100247
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24115
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1652
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1717.310

Return to query results.
Submit another query.