DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF13B and Kif13b

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011542759.1 Gene:KIF13B / 23303 HGNCID:14405 Length:1847 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001398965.1 Gene:Kif13b / 305967 RGDID:1303307 Length:1843 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1884 Identity:1613/1884 - (85%)
Similarity:1686/1884 - (89%) Gaps:78/1884 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGDSKVKVAVRIRPMNRRETDLHTKCVVDVDANKVILNPVNTNLSKGDARGQPKVFAYDHCFWSM 65
            |||||||||||:|||||||.||||||||||:||||||||:||||||||||||||:||||||||||
  Rat     1 MGDSKVKVAVRVRPMNRREIDLHTKCVVDVEANKVILNPINTNLSKGDARGQPKIFAYDHCFWSM 65

Human    66 DESVKEKYAGQDIVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGL 130
            ||||:|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 DESVREKYAGQDDVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGL 130

Human   131 FERTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYK 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 FERTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYK 195

Human   196 DIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERA 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 DIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERA 260

Human   261 TKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTA 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 TKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQGAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTA 325

Human   326 MVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKHIVNHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKS 390
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 MVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKHIINHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKS 390

Human   391 PELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQSSGIKVGDDKCFLVNLNA 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   391 PELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQTSGIKVGDDKCFLVNLNA 455

Human   456 DPALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHCIIDITSEGQVMLTPQKNTRTFVNGSSV 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||
  Rat   456 DPALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHGIIDIMPEGQVMLTPQKNTRTFVNGSSV 520

Human   521 SSPIQLHHGDRILWGNNHFFRLNLPKKKKKAEREDEDQDPSMKNENSSEQLDVDGDSSSEVSSEV 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:::.|:||::||||||.|||||||||||:
  Rat   521 SSPIQLHHGDRILWGNNHFFRLNLPKKKKKAEREDEEREASLKNDSSSEQLDADGDSSSEVSSEI 585

Human   586 NFNYEYAQMEVTMKALGSNDPMQSILNSLEQQHEEEKRSALERQRLMYEHELEQLRRRLSPEKQN 650
            |||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   586 NFNFEYAQMEVTMKALGSNDPMQSILSSLEQQHEEEKRSALERQRLMYEHELEQLRRRLSPERQN 650

Human   651 CRSMDRFSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVKANLLVREANYIAEELDKRTEYKV 715
            ||.:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat   651 CRGVDRLSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVKANLLVREASYIAEELDKRTEYKV 715

Human   716 TLQIPASSLDANRKRGSLLSEPAIQVRRKGKGKQIWSLEKLDNRLLDMRDLYQEWKECEEDNPVI 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:||.
  Rat   716 TLQIPASSLDANRKRGSLLSEPAIQVRRKGKGKQIWSLEKLENRLLDMRDLYQEWKECEEDSPVS 780

Human   781 RSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLESLFYDVKLQYAVPIINQKGEVAGRLHVEVMRLSGDVG 845
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.:|
  Rat   781 RSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLETLFYDVKLQYAVPIINQKGEVAGRLHVEVMRLSGAIG 845

Human   846 ERIAGGDEVAEVSFEKETQENKLVCMVKILQATGLPQHLSHFVFCKYSFWDQQEPVIVAPEVDTS 910
            |||||||:..|||.|||.|||:|||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||
  Rat   846 ERIAGGDDPTEVSSEKEVQENRLVCMVKILQATGLPQHLCHFVFCKYDFWDQQEPVTVAPEVDTS 910

Human   911 SSSVSKEPHCMVVFDHCNEFSVNITEDFIEHLSEGALAIEVYGHKINDPRKNPALWDLGIIQAKT 975
            ||..||||.||||||||:||||||||||||:||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   911 SSPTSKEPQCMVVFDHCSEFSVNITEDFIEYLSEGALAIEVYGHKMNDPRKNPALWDLGIIQAKT 975

Human   976 RSLRDRWSEVTRKLEFWVQILEQNENGEYCPVEVISAKDVPTGGIFQLRQGQSRRVQVEVKSVQE 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 RSLRDRWSEVTRKLEFWVQILEQNENGEYCPVEVIAAKDVPTGGIFQLRQGQSRRVQVEVKSVQE 1040

Human  1041 SGTLPLMEECILSVGIGCVKVRPLRAPRTHETFHEEEEDMDSYQDRDLERLRRKWLNALTKRQEY 1105
            |||||||||||||||||||||||||:|:|||..||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 SGTLPLMEECILSVGIGCVKVRPLRSPKTHENIHEEEEDMDSYQDRDLERLRRKWLNALTKRQEY 1105

Human  1106 LDQQLQKLVSKRDKTEDDADREAQLLEMRLTLTEERNAVMVPSAGSGIPGAPAEWTPVPGMETHI 1170
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat  1106 LDQQLQKLVSKHDKTEDDADREAQLLEMRLTLTEERNAVMVPSAGSGIPGAPAEWTPVPGMEAHI 1170

Human  1171 PVIFLDLNADDFSSQDNLDDPEAGGWDATLTGEEEEEFFELQIVKQHDGEVKAEASWDSAVHGCP 1235
            ||:|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||
  Rat  1171 PVVFLDLNADDFSSQDNLDDPEA-GWDATLTGEEEEEFFELQIVKHHDGEVKAEASWDSAVHNCP 1234

Human  1236 QLSRGTPVDERLFLIVRVTVQLSHPADMQLVLRKRICVNVHGRQGFAQSLLKKMSHRSSIPGCGV 1300
            |||:|||.|||:|||:||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||||:||||||||||
  Rat  1235 QLSKGTPADERVFLILRVAVQLSHPADMQLVLRKRICVHVHGRQGFAQSLLKKMTHRSSIPGCGV 1299

Human  1301 TFEIVSNIPEDAQGVEEREALARMAANVENPASADSEAYIEKYLRSVLAVENLLTLDRLRQEVAV 1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1300 TFEIVSNIPEDAQGVEEREALARMAANVENAASADSEACIEKYLRSVLAVENLLTLDRLRQEVAV 1364

Human  1366 KEQLTGKGKLSRRSISSPNVNRVSVWNQALCCAWDFSPLLFSWLSGSRQDLIPSYSLGSNKGRWE 1430
            ||||||||||:|||||||::||                     ||||||:|.||:||.|||||||
  Rat  1365 KEQLTGKGKLNRRSISSPSMNR---------------------LSGSRQELSPSHSLSSNKGRWE 1408

Human  1431 SQQDVSQTTVSRGIAPA-PALSVSPQNNHSPDPGLSNLAASYLNPVKSFVPQMPKLLKSLFPVRD 1494
            ||||||||.||||||.. ||||||||||.||||||:  .|||||||||.|||||||||||||   
  Rat  1409 SQQDVSQTLVSRGIASGPPALSVSPQNNQSPDPGLN--PASYLNPVKSLVPQMPKLLKSLFP--- 1468

Human  1495 EKRGKRPSPLAHQPVPRIMVQSASPDIRVTRMEEAQP-EMGPDVLVQT---MGAPALKICDKPAK 1555
            ::||:..|||..||||||:||....|.|.||.||||. ..||...:::   |.||.:||||||.:
  Rat  1469 DRRGRHSSPLVQQPVPRILVQPTFSDARATRTEEAQQGSPGPSGALESMVKMAAPTVKICDKPVR 1533

Human  1556 VPSPPPVIAVTAVTPAPEAQDGPPSPLSEASSGYFSHSVSTATLSDALGPGLD----AAAPPGSM 1616
            |.|||   :...||...|.||||||||||||||||||||||||||:.|..|||    .:..|||.
  Rat  1534 VSSPP---STMVVTQPQEGQDGPPSPLSEASSGYFSHSVSTATLSETLTLGLDTTGLGSQTPGSP 1595

Human  1617 PT------APE-----------AEPEAPISHPPPPTAVPAEEPPGPQQLVSPGRERPDLEAPA-P 1663
            |.      .||           .:||.|...|..||.....|.|.|..|..|        .|| |
  Rat  1596 PALCQVTQEPELAFLSCTQSHPTDPEEPHIPPATPTQSTELEVPRPPLLSDP--------TPAVP 1652

Human  1664 GSPFRVRRVRASELRSFSRMLAGDPGCSPGAEGN---APAPG-AGGQAL-----ASDSEEADEVP 1719
            .||||:|:||.|||.||:.||.   |.|.||:.:   :..|. |.||.|     .||||:|.|||
  Rat  1653 TSPFRIRKVRPSELTSFTGMLG---GASSGAQEDPVVSEDPSHARGQTLGRLEVTSDSEDASEVP 1714

Human  1720 EWLREGEFVTVGAHKTGVVRYVGPADFQEGTWVGVELDLPSGKNDGSIGGKQYFRCNPGYGLLVR 1784
            |||||||:|.||.:|||:|||:||.|||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat  1715 EWLREGEYVVVGTNKTGIVRYIGPTDFQEGTWIGVELDLPAGKNDGSIGGKQYFRCNPGYGLLVR 1779

Human  1785 PSRVRRATGPVRRRSTGLR-LGAPEARRSATLSGSATNLASLTAALAKADRSHKNPENRKSWAS 1847
            |.|||||.|..||||:||: .||||||||||:||||||||||||||||.|||:|||||||||||
  Rat  1780 PGRVRRAAGTGRRRSSGLQPQGAPEARRSATISGSATNLASLTAALAKGDRSYKNPENRKSWAS 1843

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF13BXP_011542759.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..360 CDD:276816 346/355 (97%)
Kinesin_assoc 357..469 CDD:465047 110/111 (99%)
FHA_KIF13B 447..545 CDD:438782 94/97 (97%)
COG4913 <611..>760 CDD:443941 141/148 (95%)
KIF1B 756..802 CDD:463574 42/45 (93%)
bMERB_dom <1099..1143 CDD:463467 42/43 (98%)
DUF3694 <1221..1278 CDD:463599 49/56 (88%)
PHA03247 <1445..1704 CDD:223021 147/289 (51%)
CAP_GLY 1725..1788 CDD:460154 52/62 (84%)
Kif13bNP_001398965.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..360 CDD:276816 346/355 (97%)
Kinesin_assoc 357..469 CDD:465047 110/111 (99%)
FHA_KIF13B 447..545 CDD:438782 94/97 (97%)
COG4913 <614..>760 CDD:443941 139/145 (96%)
KIF1B 756..802 CDD:463574 42/45 (93%)
C2-C2_1 <888..>952 CDD:463310 56/63 (89%)
bMERB_dom <1073..1143 CDD:463467 67/69 (97%)
DUF3694 <1214..1277 CDD:463599 54/62 (87%)
PHA03247 <1377..1715 CDD:223021 197/377 (52%)
CAP_GLY 1720..1783 CDD:460154 52/62 (84%)

Return to query results.
Submit another query.