DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ADGRL3 and Adgrl3

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_016863418.1 Gene:ADGRL3 / 23284 HGNCID:20974 Length:1586 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_011247763.1 Gene:Adgrl3 / 319387 MGIID:2441950 Length:1586 Species:Mus musculus


Alignment Length:1586 Identity:1534/1586 - (96%)
Similarity:1554/1586 - (97%) Gaps:0/1586 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MWPSQLLIFMMLLAPIIHGGKHSERHPALAAPLRHAERSPGGALPPRHLLQQPAAERTAAHRGQG 65
            |||.||||..|||||::|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||||||
Mouse     1 MWPPQLLILTMLLAPVVHGGKHNERHPALAAPLRHAERSPGGALPPRHLLQQPAAERSTAHRGQG 65

Human    66 PRGATRGVRGPGAQGAQIAAQAFSRAPIPMAVVRRELSCESYPIELRCPGTDVIMIESANYGRTD 130
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 PRGAARGVRGPGAPGAQIAAQAFSRAPIPMAVVRRELSCESYPIELRCPGTDVIMIESANYGRTD 130

Human   131 DKICDSDPAQMENIRCYLPDAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYK 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 DKICDSDPAQMENIRCYLPDAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYK 195

Human   196 VEQKVFLCPGLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPLQASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFI 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 VEQKVFLCPGLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPLQASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFI 260

Human   261 AGRPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSPYRW 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 AGRPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSPYRW 325

Human   326 GGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAFMICGILYV 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 GGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAFMICGILYV 390

Human   391 VKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDNLLYVWNNYHVVKY 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 VKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDNLLYVWNNYHVVKY 455

Human   456 SLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLGMGSTTTSTTLRTTTLSPG 520
            ||||||||||||..|||||||||||||||||||||.|:.|||||.||||||||||||||||.:.|
Mouse   456 SLDFGPLDSRSGPVHHGQVSYISPPIHLDSELERPPVRGISTTGSLGMGSTTTSTTLRTTTWNIG 520

Human   521 RSTTPSVSGRRNRSTSTPSPAVEVLDDMTTHLPSASSQIPALEESCEAVEAREIMWFKTRQGQIA 585
            ||||.|:.|||||||||||||||||||:|||||||:|||||:|||||||||||||||||||||:|
Mouse   521 RSTTASLPGRRNRSTSTPSPAVEVLDDVTTHLPSAASQIPAMEESCEAVEAREIMWFKTRQGQVA 585

Human   586 KQPCPAGTIGVSTYLCLAPDGIWDPQGPDLSNCSSPWVNHITQKLKSGETAANIARELAEQTRNH 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   586 KQPCPAGTIGVSTYLCLAPDGIWDPQGPDLSNCSSPWVNHITQKLKSGETAANIARELAEQTRNH 650

Human   651 LNAGDITYSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKLQKRERSCRAYVQAMVETVNNLLQ 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   651 LNAGDITYSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKLQKRERSCRAYVQAMVETVNNLLQ 715

Human   716 PQALNAWRDLTTSDQLRAATMLLHTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIKLEVARLSTEGNLED 780
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
Mouse   716 PQALNAWRDLTTSDQLRAATMLLDTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIQLEVARLSTEGNLED 780

Human   781 LKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLSTENASMKLGTEALSTNHSVIV 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
Mouse   781 LKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLSTENASMKLGTEAMSTNHSVIV 845

Human   846 NSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLTT 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 NSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLTT 910

Human   911 NKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDVITWVGILLSLVCLLICIFTFCFFRGLQS 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   911 NKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDVITWVGILLSLVCLLICIFTFCFFRGLQS 975

Human   976 DRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLEGVQLYIMLVEV 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   976 DRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLEGVQLYIMLVEV 1040

Human  1041 FESEHSRRKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVI 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1041 FESEHSRRKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVI 1105

Human  1106 FLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNINYEDNRPFIKSWVIGAIALLCLLGLTWAFGLMYINESTV 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1106 FLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNINYEDNRPFIKSWVIGAIALLCLLGLTWAFGLMYINESTV 1170

Human  1171 IMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRTHCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYS 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1171 IMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRTHCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYS 1235

Human  1236 TGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNRGAMANHLISNALLRPHGTNNPYNTLLGEP 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1236 TGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNRGAMANHLISNALLRPHGTNNPYNTLLGEP 1300

Human  1301 AVCNNPSVSMYNAQEPYRETKGLLNNARDTSVMDTLPLNGNHGNSYSIASGEYLSNCVQIIDRGY 1365
            |||||||:||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse  1301 AVCNNPSISMYNTQEPYRETKGLLNNARDTSVMDTLPLNGNHGNSYSIAGGEYLSNCVQIIDRGY 1365

Human  1366 NHNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSSEQNRNLMNKLVNNLGSGREDDAIVLDDATSFNHE 1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||.||||||||||.|||||
Mouse  1366 NHNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSSEQNRNMMNKLVNNLGSGSEDDAIVLDDAASFNHE 1430

Human  1431 ESLGLELIHEESDAPLLPPRVYSTENHQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSL 1495
            ||||||||||||||||||||||||:|||||||:|||.|||||||||||||:||||||||||||||
Mouse  1431 ESLGLELIHEESDAPLLPPRVYSTDNHQPHHYSRRRFPQDHSESFFPLLTDEHTEDLQSPHRDSL 1495

Human  1496 YTSMPTLAGVAATESVTTSTQTEPPPAKCGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHQLHTYYQLGRGSSDG 1560
            |||||.||||.|.:|||||||||...||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Mouse  1496 YTSMPALAGVPAADSVTTSTQTEAAAAKGGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHPLHAYYQLGRGSSDG 1560

Human  1561 FIVPPNKDGTPPEGSSKGPAHLVTSL 1586
            |||||||||..|||:|||||||||||
Mouse  1561 FIVPPNKDGASPEGTSKGPAHLVTSL 1586

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ADGRL3XP_016863418.1 None
Adgrl3XP_011247763.1 Gal_Lectin 111..191 CDD:366935 79/79 (100%)
OLF 205..461 CDD:128580 255/255 (100%)
HormR 563..627 CDD:214468 62/63 (98%)
GAIN 636..856 CDD:374574 216/219 (99%)
GPS 882..934 CDD:197639 51/51 (100%)
7tmB2_Latrophilin-3 942..1208 CDD:320671 265/265 (100%)
TM helix 1 945..969 CDD:320671 23/23 (100%)
TM helix 2 978..999 CDD:320671 20/20 (100%)
TM helix 3 1009..1031 CDD:320671 21/21 (100%)
TM helix 4 1050..1066 CDD:320671 15/15 (100%)
TM helix 5 1085..1108 CDD:320671 22/22 (100%)
TM helix 6 1141..1166 CDD:320671 24/24 (100%)
TM helix 7 1170..1195 CDD:320671 24/24 (100%)
Latrophilin 1208..1586 CDD:367050 354/377 (94%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83969044
Domainoid 1 1.000 527 1.000 Domainoid score I6788
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG3545
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H22878
Inparanoid 1 1.050 2853 1.000 Inparanoid score I694
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG43322
OrthoDB 1 1.010 - - D12115at32523
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000766
OrthoInspector 1 1.000 - - oto121895
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_102405
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR12011
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R14391
SonicParanoid 1 1.000 - - X858
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1919.300

Return to query results.
Submit another query.