DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NUP160 and Nup160

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_056046.2 Gene:NUP160 / 23279 HGNCID:18017 Length:1402 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_067487.1 Gene:Nup160 / 59015 MGIID:1926227 Length:1402 Species:Mus musculus


Alignment Length:1402 Identity:1300/1402 - (92%)
Similarity:1354/1402 - (96%) Gaps:0/1402 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAAGALERSFVELSGAERERPRHFREFTVCSIGTANAVAGAVKYSESAGGFYYVESGKLFSVTR 65
            |||||:|||||||||||||||||||||||||.||||:|..|.||||||||||||||||||||:||
Mouse     1 MAAAGSLERSFVELSGAERERPRHFREFTVCDIGTASAAFGTVKYSESAGGFYYVESGKLFSITR 65

Human    66 NRFIHWKTSGDTLELMEESLDINLLNNAIRLKFQNCSVLPGGVYVSETQNRVIILMLTNQTVHRL 130
            |||||||||||||||:|||||:||||||:||||||.::|||||:||||||.||||:|||||||||
Mouse    66 NRFIHWKTSGDTLELVEESLDLNLLNNAVRLKFQNYNILPGGVHVSETQNHVIILILTNQTVHRL 130

Human   131 LLPHPSRMYRSELVVDSQMQSIFTDIGKVDFTDPCNYQLIPAVPGISPNSTASTAWLSSDGEALF 195
            :|||||||||||||.:|||||||||||||||.||||.||||:|||:||.||.|.|||||||||||
Mouse   131 ILPHPSRMYRSELVTESQMQSIFTDIGKVDFRDPCNSQLIPSVPGLSPGSTTSAAWLSSDGEALF 195

Human   196 ALPCASGGIFVLKLPPYDIPGMVSVVELKQSSVMQRLLTGWMPTAIRGDQSPSDRPLSLAVHCVE 260
            |||.||||||||||||||:||:.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||
Mouse   196 ALPSASGGIFVLKLPPYDVPGIASVVELKQSSVMQRLLTGWMPTAIRGDHGPSDRALSLAVHCVE 260

Human   261 HDAFIFALCQDHKLRMWSYKEQMCLMVADMLEYVPVKKDLRLTAGTGHKLRLAYSPTMGLYLGIY 325
            ||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||:||||||||
Mouse   261 HDAFIFALCQDHKLRMWSYKDQMCLMVADMLEYVPVNKDLRLTAGTGHKLRLAYSPSMGLYLGIY 325

Human   326 MHAPKRGQFCIFQLVSTESNRYSLDHISSLFTSQETLIDFALTSTDIWALWHDAENQTVVKYINF 390
            ||||||||||:|||||||:||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:||||||
Mouse   326 MHAPKRGQFCVFQLVSTENNRYSLDHISSLFTSQETLVDFALTSTDIWALWHDAENQTIVKYINF 390

Human   391 EHNVAGQWNPVFMQPLPEEEIVIRDDQDPREMYLQSLFTPGQFTNEALCKALQIFCRGTERNLDL 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|.|.|||||||||||||||||||
Mouse   391 EHNVAGQWNPVFMQPLPEEEIVIRDDQDPREMYLRSLFTPGHFINAALCKALQIFCRGTERNLDL 455

Human   456 SWSELKKEVTLAVENELQGSVTEYEFSQEEFRNLQQEFWCKFYACCLQYQEALSHPLALHLNPHT 520
            ||:|||||:|||||||||||||||||||:|||.||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Mouse   456 SWNELKKEITLAVENELQGSVTEYEFSQDEFRTLQQEFWCKFYACVLQYQEALSHPLALHLNPVT 520

Human   521 NMVCLLKKGYLSFLIPSSLVDHLYLLPYENLLTEDETTISDDVDIARDVICLIKCLRLIEESVTV 585
            ||||||||||||||:||||||||||||.|:||||||||||||.|:||||:|||||||:|.||||:
Mouse   521 NMVCLLKKGYLSFLVPSSLVDHLYLLPDEHLLTEDETTISDDADVARDVLCLIKCLRMIGESVTM 585

Human   586 DMSVIMEMSCYNLQSPEKAAEQILEDMITIDVENVMEDICSKLQEIRNPIHAIGLLIREMDYETE 650
            ||:|:||.|||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
Mouse   586 DMAVLMETSCYNLQSPEKAAEHILEDLITIDVENVMEDICSKLQEIRNPVHAIGLLIREMDYETE 650

Human   651 VEMEKGFNPAQPLNIRMNLTQLYGSNTAGYIVCRGVHKIASTRFLICRDLLILQQLLMRLGDAVI 715
            |||||||:||||||:||||:|||||:||||||||||:||||||||||||||||||||.|||||||
Mouse   651 VEMEKGFDPAQPLNVRMNLSQLYGSSTAGYIVCRGVYKIASTRFLICRDLLILQQLLTRLGDAVI 715

Human   716 WGTGQLFQAQQDLLHRTAPLLLSYYLIKWGSECLATDVPLDTLESNLQHLSVLELTDSGALMANR 780
            .|.||||||||||||||||||||||||||.|:|||||||:||||||||||||||||||||||||:
Mouse   716 LGAGQLFQAQQDLLHRTAPLLLSYYLIKWASQCLATDVPVDTLESNLQHLSVLELTDSGALMANK 780

Human   781 FVSSPQTIVELFFQEVARKHIISHLFSQPKAPLSQTGLNWPEMITAITSYLLQLLWPSNPGCLFL 845
            .|||||||:||||||||||.||||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||
Mouse   781 LVSSPQTIMELFFQEVARKQIISHLFSQPKAPLSQTGLNWPEMITAVTGYLLQLLWPSNPGCLFL 845

Human   846 ECLMGNCQYVQLQDYIQLLHPWCQVNVGSCRFMLGRCYLVTGEGQKALECFCQAASEVGKEEFLD 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Mouse   846 ECLMGNCQYVQLQDYIQLLHPWCQVNVGSCRFMLGRCYLVTGEVQKALECFCQAASEVGKEEFLD 910

Human   911 RLIRSEDGEIVSTPRLQYYDKVLRLLDVIGLPELVIQLATSAITEAGDDWKSQATLRTCIFKHHL 975
            ||||||||||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   911 RLIRSEDGEIVSTPKLQYYDKVLRLLDVVGLPELVIQLATSAITEAGDDWKSQATLRTCIFKHHL 975

Human   976 DLGHNSQAYEALTQIPDSSRQLDCLRQLVVVLCERSQLQDLVEFPYVNLHNEVVGIIESRARAVD 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   976 DLGHNSQAYEALTQIPDSSRQLDCLRQLVVVLCERSQLQDLVEFPYVNLHNEVVGIIESRARAVD 1040

Human  1041 LMTHNYYELLYAFHIYRHNYRKAGTVMFEYGMRLGREVRTLRGLEKQGNCYLAALNCLRLIRPEY 1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
Mouse  1041 LMTHNYYELLYAFHIYRHNYRKAGTVMFEYGMRLGREVRTLRGLEKQGNCYLAAINCLRLIRPEY 1105

Human  1106 AWIVQPVSGAVYDRPGASPKRNHDGECTAAPTNRQIEILELEDLEKECSLARIRLTLAQHDPSAV 1170
            ||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||:||||.:
Mouse  1106 AWIVQPASGAVSDRPGASPKRNHDGECTAAPTNRQIEILELEDLEKEYSLARIRLTLARHDPSVI 1170

Human  1171 AVAGSSSAEEMVTLLVQAGLFDTAISLCQTFKLPLTPVFEGLAFKCIKLQFGGEAAQAEAWAWLA 1235
            |:||||||:||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||:|||
Mouse  1171 AIAGSSSAKEMSALLVQAGLFDTAISLCQTFTLPLTPVFEGLAFKCIKLQFGGEAAQGEAWSWLA 1235

Human  1236 ANQLSSVITTKESSATDEAWRLLSTYLERYKVQNNLYHHCVINKLLSHGVPLPNWLINSYKKVDA 1300
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1236 TNQLSSVITTKESSATDEAWRLLSTYLERYKVQNNLYHHCVINKLLSHGVPLPNWLINSYKKVDA 1300

Human  1301 AELLRLYLNYDLLEEAVDLVSEYVDAVLGKGHQYFGIEFPLSATAPMVWLPYSSIDQLLQALGEN 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1301 AELLRLYLNYDLLEEAVDLVSEYVDAVLGKGHQYFGIEFPLSATAPMVWLPYSSIDQLLQALGEN 1365

Human  1366 SANSHNIALSQKILDKLEDYQQKVDKATRDLLYRRTL 1402
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|
Mouse  1366 SANSHNIILSQKILDKLEDYQQKVDKATRDLLYRRDL 1402

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NUP160NP_056046.2 Nup160 28..543 CDD:432020 464/514 (90%)
Nup160NP_067487.1 Nup160 28..543 CDD:432020 464/514 (90%)

Return to query results.
Submit another query.