DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NUP160 and Nup160

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_056046.2 Gene:NUP160 / 23279 HGNCID:18017 Length:1402 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038960817.1 Gene:Nup160 / 311182 RGDID:1311052 Length:1402 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1402 Identity:1310/1402 - (93%)
Similarity:1361/1402 - (97%) Gaps:0/1402 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAAGALERSFVELSGAERERPRHFREFTVCSIGTANAVAGAVKYSESAGGFYYVESGKLFSVTR 65
            |||||:|||||||||||||||||||||||||.:|||||..||||||||||||||||||||||:||
  Rat     1 MAAAGSLERSFVELSGAERERPRHFREFTVCDLGTANAAFGAVKYSESAGGFYYVESGKLFSITR 65

Human    66 NRFIHWKTSGDTLELMEESLDINLLNNAIRLKFQNCSVLPGGVYVSETQNRVIILMLTNQTVHRL 130
            |||||||||||||||:|||||:||||||:||||||.|:|||||:||||||.||||:|||.|||||
  Rat    66 NRFIHWKTSGDTLELVEESLDLNLLNNAVRLKFQNYSLLPGGVHVSETQNHVIILILTNHTVHRL 130

Human   131 LLPHPSRMYRSELVVDSQMQSIFTDIGKVDFTDPCNYQLIPAVPGISPNSTASTAWLSSDGEALF 195
            :|||||||||||||.:|||||||||||||||.|||||||||.|||:||:||.|.|||||||||||
  Rat   131 ILPHPSRMYRSELVTESQMQSIFTDIGKVDFKDPCNYQLIPTVPGLSPSSTTSAAWLSSDGEALF 195

Human   196 ALPCASGGIFVLKLPPYDIPGMVSVVELKQSSVMQRLLTGWMPTAIRGDQSPSDRPLSLAVHCVE 260
            |||.|||||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||
  Rat   196 ALPSASGGIFVLKLPPYDIPGIASVVELKQSSVMQRLLTGWMPTAIRGDHGPSDRALSLAVHCVE 260

Human   261 HDAFIFALCQDHKLRMWSYKEQMCLMVADMLEYVPVKKDLRLTAGTGHKLRLAYSPTMGLYLGIY 325
            ||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||:||||||||
  Rat   261 HDAFIFALCQDHKLRMWSYKDQMCLMVADMLEYVPVNKDLRLTAGTGHKLRLAYSPSMGLYLGIY 325

Human   326 MHAPKRGQFCIFQLVSTESNRYSLDHISSLFTSQETLIDFALTSTDIWALWHDAENQTVVKYINF 390
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:||||||
  Rat   326 MHAPKRGQFCIFQLVSTESSRYSLDHISSLFTSQETLVDFALTSTDIWALWHDAENQTIVKYINF 390

Human   391 EHNVAGQWNPVFMQPLPEEEIVIRDDQDPREMYLQSLFTPGQFTNEALCKALQIFCRGTERNLDL 455
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||:||||||||.|.|||||||||||||||||||
  Rat   391 EHNVAGQWNPVFMQSLPEEEIVIRDDQDPREMYLRSLFTPGQFINAALCKALQIFCRGTERNLDL 455

Human   456 SWSELKKEVTLAVENELQGSVTEYEFSQEEFRNLQQEFWCKFYACCLQYQEALSHPLALHLNPHT 520
            ||||||||:|||||||||||||||||||:|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat   456 SWSELKKEITLAVENELQGSVTEYEFSQDEFRTLQQEFWCKFYACCLQYQEALSHPLALHLNPLT 520

Human   521 NMVCLLKKGYLSFLIPSSLVDHLYLLPYENLLTEDETTISDDVDIARDVICLIKCLRLIEESVTV 585
            ||||||||||||||:||||||||||||.|:||||||||||||.|:||||:|||||||:|.||||:
  Rat   521 NMVCLLKKGYLSFLVPSSLVDHLYLLPDEHLLTEDETTISDDADVARDVLCLIKCLRMIGESVTM 585

Human   586 DMSVIMEMSCYNLQSPEKAAEQILEDMITIDVENVMEDICSKLQEIRNPIHAIGLLIREMDYETE 650
            ||:|:||.|||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat   586 DMAVLMETSCYNLQSPEKAAEHILEDLITIDVENVMEDICSKLQEIRNPVHAIGLLIREMDYETE 650

Human   651 VEMEKGFNPAQPLNIRMNLTQLYGSNTAGYIVCRGVHKIASTRFLICRDLLILQQLLMRLGDAVI 715
            |||||||:||||||:||||:|||||:||||||||||:||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat   651 VEMEKGFDPAQPLNVRMNLSQLYGSSTAGYIVCRGVYKIASTRFLICRDLLILQQLLTRLGDAVI 715

Human   716 WGTGQLFQAQQDLLHRTAPLLLSYYLIKWGSECLATDVPLDTLESNLQHLSVLELTDSGALMANR 780
            .|.||||||||||||||||||||||||||.|:|||||||:||||||||||||||||||||||||:
  Rat   716 LGAGQLFQAQQDLLHRTAPLLLSYYLIKWSSQCLATDVPVDTLESNLQHLSVLELTDSGALMANK 780

Human   781 FVSSPQTIVELFFQEVARKHIISHLFSQPKAPLSQTGLNWPEMITAITSYLLQLLWPSNPGCLFL 845
            .|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|.||||||||||||||||
  Rat   781 LVSSPQTIMELFFQEVARKHIISHLFSQPKAPLSQTGLNWPEMVTAVTGYLLQLLWPSNPGCLFL 845

Human   846 ECLMGNCQYVQLQDYIQLLHPWCQVNVGSCRFMLGRCYLVTGEGQKALECFCQAASEVGKEEFLD 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
  Rat   846 ECLMGNCQYVQLQDYIQLLHPWCQVNVGSCRFMLGRCYLVTGEVQKALECFCQAASEVGKEEFLD 910

Human   911 RLIRSEDGEIVSTPRLQYYDKVLRLLDVIGLPELVIQLATSAITEAGDDWKSQATLRTCIFKHHL 975
            ||||:|||||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 RLIRTEDGEIVSTPKLQYYDKVLRLLDVVGLPELVIQLATSAITEAGDDWKSQATLRTCIFKHHL 975

Human   976 DLGHNSQAYEALTQIPDSSRQLDCLRQLVVVLCERSQLQDLVEFPYVNLHNEVVGIIESRARAVD 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 DLGHNSQAYEALTQIPDSSRQLDCLRQLVVVLCERSQLQDLVEFPYVNLHNEVVGIIESRARAVD 1040

Human  1041 LMTHNYYELLYAFHIYRHNYRKAGTVMFEYGMRLGREVRTLRGLEKQGNCYLAALNCLRLIRPEY 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||:||||||||||
  Rat  1041 LMTHNYYELLYAFHIYRHNYRKAGTVMFEYGMRLGREVRTLGGLEKQGNCYLAAINCLRLIRPEY 1105

Human  1106 AWIVQPVSGAVYDRPGASPKRNHDGECTAAPTNRQIEILELEDLEKECSLARIRLTLAQHDPSAV 1170
            ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:
  Rat  1106 AWIVQPASGAVSDRPGASPKRNHDGECTAAPTNRQIEILELEDLEKECSLARIRLTLARHDPSAI 1170

Human  1171 AVAGSSSAEEMVTLLVQAGLFDTAISLCQTFKLPLTPVFEGLAFKCIKLQFGGEAAQAEAWAWLA 1235
            |:||||||:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat  1171 AIAGSSSAKEMSTLLVQAGLFDTAISLCQTFKLPLTPVFEGLAFKCIKLQFGGEAAQGEAWAWLA 1235

Human  1236 ANQLSSVITTKESSATDEAWRLLSTYLERYKVQNNLYHHCVINKLLSHGVPLPNWLINSYKKVDA 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1236 ANQLSSVITTKESSATDEAWRLLSTYLERYKVQNNLYHHCVINKLLSHGVPLPNWLINSYKKVDA 1300

Human  1301 AELLRLYLNYDLLEEAVDLVSEYVDAVLGKGHQYFGIEFPLSATAPMVWLPYSSIDQLLQALGEN 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1301 AELLRLYLNYDLLEEAVDLVSEYVDAVLGKGHQYFGIEFPLSATAPMVWLPYSSIDQLLQALGEN 1365

Human  1366 SANSHNIALSQKILDKLEDYQQKVDKATRDLLYRRTL 1402
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat  1366 SANSHNIILSQKILDKLEDYQQKVDKATRDLLYRRDL 1402

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NUP160NP_056046.2 Nup160 28..543 CDD:432020 470/514 (91%)
Nup160XP_038960817.1 Nup160 28..543 CDD:432020 470/514 (91%)

Return to query results.
Submit another query.