Protein Alignment NUP160 and npp-6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_056046.2
• Gene: NUP160 / 23279
• HGNCID: 18017
• Length: 1402
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001367609.1
• Gene: npp-6 / 172156
• WormBaseID: WBGene00003792
• Length: 1525
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1622
• Identity: 301/1622 - (18%)
• Similarity: 546/1622 - (33%)
• Gaps: 448/1622 - (27%)

Human    66 NRFIHWKTSGDTLELMEESLDINLLNNAIRLKFQNCSVLPGGVYVSETQNRVIILMLTNQTVHRL 130
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 Worm    55 DRIFLWRAIGQKLFIEERSLLYSITDGSLCIDFTRTPIIPGTSITIFEEGVLCIVVPTASAIHRF 119

Human   131 LLPHPSRMYRSELVVDSQMQSIFTDIGKVDFTDP-----CNYQLIPAVPGISPNSTASTAWLSSD 190
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 Worm   120 Y----ARLH-------SKGHDTFSILARIKEDDDFRRFRTSHSL--STPG-RPIRASVTHHPSRN 170

Human   191 GEALFALPCASGGIFVLKLPPY-DIPGMVSVVELKQSSVMQRLLTGWMPTAIRGDQSPSD----- 249
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 Worm   171 ---TISYCTAEGQLVIVTLGSYTESSDKHEEFTMGEVGLLGKLLGG-------TDKRVSDACVMK 225

Human   250 --RPLSLAVH----CVEHDAFIFALCQDHKLRMWSY--KEQMCLMVADMLEYV-----PVKKDLR 301
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 Worm   226 NLRPTSGVTRERKISVQSD-IVFAVTRDGWVQAWNVETKKQLPSTI-DLNNYFASDGKSLNRDLE 288

Human   302 LT-----------AGTGHKLRLAYS-------------PTMGLYLGIYMHAPKRGQFCIFQL--- 339
            ..           ..|.:.:| |||             ...|..:|:.:|..|.....|..|
 Worm   289 SADFEEEKSPMEPTETVYSIR-AYSFDVDILLIVGCDLAVSGKSVGMRVHILKVSNDQIQHLQMF 352

Human   340 ---VSTESNRYSLDHISSLFTSQETLIDFALTSTDIWALWH----------------DAENQTVV 385
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 Worm   353 ETSMSVDERLVDLELIQNYFPSKES---ESLDETQDGELYNPLTAALFSLSALFKSSSAKKTYSM 414

Human   386 KYINFEHNVAGQWNP-------------VFMQP--LPEEEIVIRDDQDPR-------------EM 422
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 Worm   415 KRISF----AIQWKKGRVFTDFDWHSVRQFTSPATTKEEPIGNTDEVEPAIERPYNLSADSSIET 475

Human   423 YLQSLFTPGQFTNEALCKALQIFC---RGT---ERNLDLSWSELKKEVTLAVENELQGSVTEYEF 481
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 Worm   476 LIDVVFDTDIYPFDIVFRAVQIVSDNFRGTLGQVRN--NNWPELSKLV--------DTYLTSVEF 530

Human   482 S------------------QEEFRNLQQEFWCKFYACCLQYQEALSHPLALHLNP-----HTNMV 523
            :                  ||..:...::||......|.:...|...  |:.|.|     ...::
 Worm   531 NRKFQQKTDRSIRLRLNAPQESQKTALKDFWWALLRACEELDFAARG--AISLAPIQFCGDLRIM 593

Human   524 CLLKKGYLSFLIPSSLVDHLYLLPYENLLTEDETTISDDVDIARDVICLIKCLRLIEESVTVDMS 588
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 Worm   594 AVVHRDRMTFLGDNN-TEFLEIISSENIPKQGNVEEKFRKLPNKHFIDLIE-----EASKFADRR 652

Human   589 V-IMEMSCYNLQSPEKAAEQILEDMITIDVENVME-DICSKLQEIR----NPIHAIGLLIREMDY 647
            | :|......|.:.:.....:.:|    :|||..: |...:...|:    .||..:.....|
 Worm   653 VFLMNRERARLTNAKNGVAVVEDD----NVENAYDYDSDGRFINIKTALEGPIVKLAAAFVE--- 710

Human   648 ETEVEMEKGFNPAQPLNIRMNLTQLYGSNTAGYIVCRGVHKIASTRFLICRDLLILQQLLMRLGD 712
            .:..:..|.|....|        |::|.:....:|...:.....:|....   |.||.||..:.:
 Worm   711 ASTFDNSKPFEDPHP--------QIFGGSFTQSVVSANIRVSVESRVHFA---LTLQTLLNAITE 764

Human   713 AVIWGTGQLFQAQQDLLHRTAPLLLSYYLIKWGS-ECLATDV-PLDTLESNLQHLSVLELTDSGA 775
            .:           |......||        .:|. |.|:.:: .:..:...|.....:::..:||
 Worm   765 KL-----------QKKSRAGAP--------SFGDVEALSCELREIIRVYRELNEQLDIKIVQNGA 810

Human   776 LMA-NRFVSSPQTIVELFFQEVARKHIISHLFSQPKAPLSQTGLNWPEMITAITSYLLQLLWPSN 839
            .|: ..:::|....:.:..:|....   .|.:.:    :.:...||  .:...|...::.|..|:
 Worm   811 KMSIGTWLTSDAEGLSMMKKEGGYG---PHGYDE----IRENDFNW--FVGVTTEAAIRALLSSS 866

Human   840 PGCLFLECLMGNCQY----VQLQDYI---QLLHPWCQVNVGSCRFMLGRCYLVTGEGQKALECF- 896
            ...:....|:...||    ..|..||   :.|.|       ...|..|..|..|....|||..|
 Worm   867 EILVLPRRLVLQKQYKVLLTILNSYISETRALKP-------VITFYRGIAYSGTDHPVKALNSFQ 924

Human   897 -CQAASEVGKEE-------FLDRLIRSEDGE--IVSTPRLQYYDKVLRLLDVIGLPELVIQLATS 951
             |..|...|...       .|.:......|:  :......:|:..|:|.|......|.|..:|..
 Worm   925 SCLDAFSEGNNALRKAVYFLLPKRFDVAQGKDPVEELTASEYFLTVVRFLQEHNHAEEVCSVAVK 989

Human   952 AITEAGDDWKSQATLRTCIFKHHLDLGHNSQAYEAL-----TQIPDSSRQLDCLRQLVVVLCERS 1011
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 Worm   990 AIENLPIENESVQLISNTLFNH---LTNRREWFQSLKLILRTTLRSETRRAS-IRELLSLMLACG 1050

Human  1012 QLQDLVEFPYVNLHNEVVG--IIESRARAVDLMTHNYYELLYAFHIYRHNYRKAGTVMFEYGMRL 1074
            :.:.:....: ..|.:||.  :.::..|.......:|:|||:||::.|.::||....|:||...:
 Worm  1051 EWEAIATMKF-GEHEQVVEDFLRDAACRQSPSEKKHYFELLFAFYVARKDFRKGACAMYEYARHI 1114

Human  1075 -GREVRTLRGLEKQGNCYLAALNCLRLIRPEYAWIVQPVSG-------AVYD------------- 1118
             .....|...|.::.:|....||            :|.|.|       |:||
 Worm  1115 ESTTCMTPELLRRKRDCLAVVLN------------LQSVLGMEPDDDRAIYDDATDTNLVFPEPS 1167

Human  1119 --------------RPGASPKRNHD-GECT---AAPTN--------------------------- 1138
                          ..|..|..|.| |..|   ::|.|
 Worm  1168 DDEDELITESDSSGENGKLPSGNKDSGSGTGNNSSPDNSNGTSSSGTGVDLVALKARQMAYALGS 1232

Human  1139 ----------------------RQIEILELEDLEKECSLARIRLTLAQHD-----PSAVAVAGSS 1176
                                  |::.:|..:|:..|..|...|:.|...|     |       .:
 Worm  1233 DDMDTDDTEDDMKGGSIPLFKRRKLLVLSEKDIRDELVLCSARVGLLSSDQFKGVP-------PT 1290

Human  1177 SAEEMVTLLVQAGLFDTAISLCQTFKLPLTPVF-----EGLAFKCIKLQFGGEAAQAEAWAWLAA 1236
            ...|:.:|||....||.|..:.:.|.|....:|     |.:....::.....|.|......|:..
 Worm  1291 DLNELFSLLVDNQHFDEAFDIARQFNLDSHRLFFTMTREAIMIDALRDDLNIEMAATHQAGWVRL 1355

Human  1237 NQ--LSSVITTKES--------SATDEAW----RLLSTYLERYKVQNNLYHHCVINKLLSHGVPL 1287
            |:  .::|.|.:|.        .|....|    |.|....|.:               ||..:.:
 Worm  1356 NRRHCAAVATAEEHWSVVRGLVDAAQAEWPGDSRPLRGSTEAF---------------LSFKLNV 1405

Human  1288 PNWLINSYKKVDAAELLRLYLNYDLLEEAVDLVSEYVDAVLGKGHQYFGIEFPLSATAPMVWLPY 1352
            |.||.:.::..||.:.||..::|:....|:.::|:.|:..          ....|.:....||||
 Worm  1406 PVWLHSVFENNDANDYLRCLVDYESYSIALQVLSDIVEQE----------TLQASQSNARTWLPY 1460

Human  1353 SSIDQLL-----------------QALGENSANSHNIALSQKIL---DKLEDYQQKVDKATR 1394
            ..||:|:                 |.:....||....| .||:|   .|:.|::|....::|
 Worm  1461 GIIDELMIRSADYIRKMSLKSPEDQVVAAEVANLRKSA-DQKMLIYFRKVADFEQAQKMSSR 1521

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
NUP160	NP_056046.2	Nup160	28..543	CDD:432020	112/603 (19%)
npp-6	NP_001367609.1	Nup160	3..615	CDD:432020	113/606 (19%)