DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DNMBP and Dnmbp

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_056036.1 Gene:DNMBP / 23268 HGNCID:30373 Length:1577 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_008758708.1 Gene:Dnmbp / 309362 RGDID:1583840 Length:1589 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1586 Identity:1192/1586 - (75%)
Similarity:1319/1586 - (83%) Gaps:18/1586 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEAGSVVRAIFDFCPSVSEELPLFVGDIIEVLAVVDEFWLLGKKEDVTGQFPSSFVEIVTIPSLK 65
            ||.||||||||||||||||||||||||:||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    13 MEPGSVVRAIFDFCPSVSEELPLFVGDVIEVLTVVDEFWLLGKKEDVTGQFPSSFVEIVTIPSLK 77

Human    66 EGERLFVCICEFTSQELDNLPLHRGDLVILDGIPTAGWLQGRSCWGARGFFPSSCVRELCLSSQS 130
            ||||||||.|:|.|:|.::|.||||||||:||.||||||||||..||||||||||:.||||||||
  Rat    78 EGERLFVCTCDFISREPNSLSLHRGDLVIIDGTPTAGWLQGRSSLGARGFFPSSCIHELCLSSQS 142

Human   131 RQWHSQSALFQIPEYSMGQARALMGLSAQLDEELDFREGDVITIIGVPEPGWFEGELEGRRGIFP 195
            ||||||:.|.|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   143 RQWHSQNMLLQVPEYSMGQARALMGLSAQLDEELDFREGDVITIIGVPEPGWFEGELEGRRGIFP 207

Human   196 EGFVELLGPLRTVDESVSSGNQDDCIVNGEVDTPVGEEEIGPDEDEEEPGTYGVALYRFQALEPN 260
            ||||||||||||.||||::|:.||..:|.|||....|.|...|||:::.||||:|||||||||.|
  Rat   208 EGFVELLGPLRTADESVNAGSGDDSTLNDEVDVSPEEVESEGDEDDQQAGTYGIALYRFQALESN 272

Human   261 ELDFEVGDKIRILATLEDGWLEGSLKGRTGIFPYRFVKLCPDTRVEETMALPQEGSLARIPETSL 325
            |||||||||||||.|||||||||.|||:|||||:|||||||..|.||||||||..|..:..|:|.
  Rat   273 ELDFEVGDKIRILGTLEDGWLEGRLKGKTGIFPHRFVKLCPSNRSEETMALPQGDSFPKNSESSA 337

Human   326 DCLENTLGVEEQRHETSDHEAEEPDCIISEAPT-SPLGHLTSEYDTDRNSYQDEDTAGGPPRSPG 389
            ..:.::: |||.|.:..:.|.|.||..:.|..: .||.|:..|...|:.|.||||.:|.   ||.
  Rat   338 GEMGDSV-VEEARQDPQECEEETPDSGLPEQTSEEPLDHVAPECVVDKISGQDEDASGS---SPD 398

Human   390 VEWEMPLATDSPTSDPTEVVNGISS-QPQVPFHPNLQKSQYYSTVGGSHPHSEQYPDLLPLEART 453
            |:.|.|.|.|..|.|.::.|||||| .||||..|..:|||:|.|.|||....:.:..|.||||:|
  Rat   399 VDLEGPRAEDPSTPDLSQEVNGISSLPPQVPLQPEEEKSQHYLTAGGSRQCPDTFSKLFPLEAKT 463

Human   454 RDYASLPPKRMYSQLKTLQKPVLPLYRGSSVSASRVVKPRQSSPQLHN-LASYTKKHHTSSVYSI 517
            |:|:||||:|.|:|..:||||...|:|.||::||||.:|...|   |. :||..:||.||:..:.
  Rat   464 RNYSSLPPRRTYTQGWSLQKPAPHLHRASSLTASRVNRPGHFS---HTAMASCAQKHQTSAENAA 525

Human   518 S-----ERLEMKPGPQAQGLVMEAATHSQGDGSTDLDSKLTQQLIEFEKSLAGPGTEPDKILRHF 577
            |     ||.:.:||...:....|....|||| :.|||||||||||||||||:||.|||.||:|.|
  Rat   526 SLCCAPERPKRRPGLPDKEPATEITPASQGD-NLDLDSKLTQQLIEFEKSLSGPSTEPKKIVRRF 589

Human   578 SIMDFNSEKDIVRGSSKLITEQELPERRKALRPPPPRPCTPVSTSPHLLVDQNLKPAPPLVVRPS 642
            |||||.||||||||||..:..:..||||||||||||||.||.||||||||||:.||.||||||||
  Rat   590 SIMDFYSEKDIVRGSSNSLPSRNFPERRKALRPPPPRPHTPTSTSPHLLVDQSPKPGPPLVVRPS 654

Human   643 RPAPLPPSAQQRTNAVSPKLLSRHRPTCETLEKEGPGHMGRSLDQTSPCPLVLVRIEEMERDLDM 707
            |||||||..|||.|..|||..|...|..|..||||..:..:|..|..|||.||.||:::|.||||
  Rat   655 RPAPLPPPTQQRLNTASPKPTSCALPGWEAPEKEGSEYTEKSPAQLFPCPSVLARIQDVEHDLDM 719

Human   708 YSRAQEELNLMLEEKQDESSRAETLEDLKFCESNIESLNMELQQLREMTLLSSQSSSLVAPSGSV 772
            ::||||||||:||||||||.||||||.||..||.|:|||:||||||||||||||||||.||||||
  Rat   720 HTRAQEELNLLLEEKQDESLRAETLETLKSYESTIQSLNLELQQLREMTLLSSQSSSLAAPSGSV 784

Human   773 SAENPEQRMLEKRAKVIEELLQTERDYIRDLEMCIERIMVPMQQAQVPNIDFEGLFGNMQMVIKV 837
            |.|.||||||||||||:.||||||:|||||||||:||:|||:||||||||||||||||||.||||
  Rat   785 STEKPEQRMLEKRAKVVAELLQTEKDYIRDLEMCVERVMVPLQQAQVPNIDFEGLFGNMQTVIKV 849

Human   838 SKQLLAALEISDAVGPVFLGHRDELEGTYKIYCQNHDEAIALLEIYEKDEKIQKHLQDSLADLKS 902
            ||||||||||:||||||||.|||||||||::|||||||||:||:||||||:|||||||.||||||
  Rat   850 SKQLLAALEITDAVGPVFLDHRDELEGTYRLYCQNHDEAISLLDIYEKDERIQKHLQDYLADLKS 914

Human   903 LYNEWGCTNYINLGSFLIKPVQRVMRYPLLLMELLNSTPESHPDKVPLTNAVLAVKEINVNINEY 967
            ||:||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||.|||:||||:||||.|||||
  Rat   915 LYHEWGCTNYINLGSFLIKPVQRIMRYPLLLMELLNSTPESHPDKAPLTSAVLAIKEINANINEY 979

Human   968 KRRKDLVLKYRKGDEDSLMEKISKLNIHSIIKKSNRVSSHLKHLTGFAPQIKDEVFEETEKNFRM 1032
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:|||.||||||||||
  Rat   980 KRRKDLVLKYRKADEDSLMEKISKLNIHSIIKKSSRVSSHLKHLTGFAPQLKDEAFEETEKNFRM 1044

Human  1033 QERLIKSFIRDLSLYLQHIRESACVKVVAAVSMWDVCMERGHRDLEQFERVHRYISDQLFTNFKE 1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|:||:||||||.||||||:|||||||||||.|||
  Rat  1045 QERLIKSFIRDLSLYLQHIRESACVKVVAAMSIWDLCMERGHHDLEQFEKVHRYISDQLFTRFKE 1109

Human  1098 RTERLVISPLNQLLSMFTGPHKLVQKRFDKLLDFYNCTERAEKLKDKKTLEELQSARNNYEALNA 1162
            |||||||:||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:
  Rat  1110 RTERLVINPLNQLLNMFTGPYKLVQKRFDKLLDFYNCTERAEKLKDKKTLEDLQSARNNYEALNS 1174

Human  1163 QLLDELPKFHQYAQGLFTNCVHGYAEAHCDFVHQALEQLKPLLSLLKVAGREGNLIAIFHEEHSR 1227
            |||||||||.||||.|||||:|||||||||||.:|||||:|||||||.:.|||||||||||||||
  Rat  1175 QLLDELPKFQQYAQSLFTNCIHGYAEAHCDFVQKALEQLQPLLSLLKASDREGNLIAIFHEEHSR 1239

Human  1228 VLQQLQVFTFFPESLPATKKPFERKTIDRQSARKPLLGLPSYMLQSEELRASLLARYPPEKLFQA 1292
            |||||||||||||:|||.:|||||||.||||:||.|||:|||||||||||:||||||||||||..
  Rat  1240 VLQQLQVFTFFPEALPAPRKPFERKTTDRQSSRKALLGMPSYMLQSEELRSSLLARYPPEKLFHV 1304

Human  1293 ERNFNAAQDLDVSLLEGDLVGVIKKKDPMGSQNRWLIDNGVTKGFVYSSFLKPYNPRRSHSDASV 1357
            :|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||:||
  Rat  1305 QRNFNAAQDLDVSLLEGDLVGVIKKKDPMGSQNRWLVDNGVTKGFVYSSFLKPYNPRCSHSDSSV 1369

Human  1358 GSHSSTESEHGSSSPRFPRQNSGSTLTFNPSSMAVSFTSGSCQKQPQDASPPPKECDQGTLSASL 1422
            .|||||||||..|||.|.||||.|.||||.:||.||||||..||||||.| |.:||...||..|.
  Rat  1370 VSHSSTESEHSGSSPSFHRQNSSSALTFNSNSMTVSFTSGLPQKQPQDTS-PLRECVPETLGVSS 1433

Human  1423 NPSNSESSPSRCPSDPDSTSQPRSGDSADVARDVKQPTATPRS-YRNFRHPEIVGYSVPGRNGQS 1486
            |..|.|:.||.|||||..:.|.|.|:.||..|::.||.:|.|. .|...|.|::||.||||:.|.
  Rat  1434 NTGNPETGPSPCPSDPGFSCQRRPGNPADGTREISQPASTLRGCQRRSLHSEVLGYPVPGRSDQG 1498

Human  1487 QDLVKGCARTAQAPEDRSTEPDGSEAEGNQVYFAVYTFKARNPNELSVSANQKLKILEFKDVTGN 1551
            .|.:||.:|..|...||......|||||||||||:|||||||||||:|.|||:|:||||||||||
  Rat  1499 SDSIKGTSRACQTAGDRDRGLGSSEAEGNQVYFAIYTFKARNPNELTVLANQRLRILEFKDVTGN 1563

Human  1552 TEWWLAEVNGKKGYVPSNYIRKTEYT 1577
            ||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1564 TEWWLAEVNGKKGYVPSNYIRKTEYT 1589

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DNMBPNP_056036.1 SH3_DNMBP_N1 6..56 CDD:212728 47/49 (96%)
SH3_DNMBP_N2 70..123 CDD:212729 39/52 (75%)
SH3_DNMBP_N3 149..199 CDD:212730 49/49 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 211..244 14/32 (44%)
SH3_DNMBP_N4 247..296 CDD:212731 42/48 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 335..395 23/60 (38%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 591..624 22/32 (69%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 639..659 15/19 (79%)
RhoGEF 785..965 CDD:238091 158/179 (88%)
BAR_DNMBP 1017..1208 CDD:153273 171/190 (90%)
SH3_DNMBP_C1 1289..1345 CDD:212732 51/55 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1348..1487 81/139 (58%)
SH3_DNMBP_C2 1517..1573 CDD:213017 50/55 (91%)
DnmbpXP_008758708.1 SH3_DNMBP_N1 18..68 CDD:212728 47/49 (96%)
SH3_DNMBP_N2 82..135 CDD:212729 39/52 (75%)
SH3_DNMBP_N3 161..211 CDD:212730 49/49 (100%)
SH3 259..308 CDD:473055 42/48 (88%)
RhoGEF 797..977 CDD:238091 158/179 (88%)
BAR_DNMBP 1029..1220 CDD:153273 171/190 (90%)
SH3_DNMBP_C1 1301..1357 CDD:212732 51/55 (93%)
SH3_DNMBP_C2 1529..1585 CDD:213017 50/55 (91%)

Return to query results.
Submit another query.