DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ADGRL2 and Adgrl2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001352934.1 Gene:ADGRL2 / 23266 HGNCID:18582 Length:1469 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_599235.3 Gene:Adgrl2 / 171447 RGDID:620835 Length:1487 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1493 Identity:1388/1493 - (92%)
Similarity:1424/1493 - (95%) Gaps:30/1493 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVSSGCRMRSLWFIIVISFLPNTEGFSRAALPFGLVRRELSCEGYSIDLRCPGSDVIMIESANYG 65
            ||||||||||||||::|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MVSSGCRMRSLWFIMIISFSPNTEGFSRAALPFGLVRRELSCEGYSIDLRCPGSDVIMIESANYG 65

Human    66 RTDDKICDADPFQMENTDCYLPDAFKIMTQRCNNRTQCIVVTGSDVFPDPCPGTYKYLEVQYECV 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 RTDDKICDADPFQMENTDCYLPDAFKIMTQRCNNRTQCVVVTGSDVFPDPCPGTYKYLEVQYECV 130

Human   131 PYMEQKVFVCPGTLKAIVDSPCIYEAEQKAGAWCKDPLQAADKIYFMPWTPYRTDTLIEYASLED 195
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 PYMEQKVFVCPGTLKAIVDSPSIYEAEQKAGAWCKDPLQAADKIYFMPWTPYRTDTLIEYASLED 195

Human   196 FQNSRQTTTYKLPNRVDGTGFVVYDGAVFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIINYANYHDTSPY 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 FQNSRQTTTYKLPNRVDGTGFVVYDGAVFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIINYANYHDTSPY 260

Human   261 RWGGKTDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGMIVISQLNPYTLRFEATWETVYDKRAASNAFMICGVL 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat   261 RWGGKTDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGMIVISQLNPYTLRFEATWETTYDKRAASNAFMICGVL 325

Human   326 YVVRSVYQDNESETGKNSIDYIYNTRLNRGEYVDVPFPNQYQYIAAVDYNPRDNQLYVWNNNFIL 390
            |||||||||||||.|||.|||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 YVVRSVYQDNESEAGKNVIDYIYNTRLSRGEHVDVPFPNQYQYIAAVDYNPRDNQLYVWNNNFIL 390

Human   391 RYSLEFGPPDPAQVPTTAVTITSSAELFKTIISTTSTTSQKGPMSTTVAGSQEGSKGTKPPPAVS 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||.:||||:|||:||:|:||||.||||:|||||||||
  Rat   391 RYSLEFGPPDPAQVPTTAVTITSSAELFKTTVSTTSSTSQRGPVSSTVAGPQEGSRGTKPPPAVS 455

Human   456 TTKIPPITNIFPLPERFCEALDSKGIKWPQTQRGMMVERPCPKGTRGTASYLCMISTGTWNPKGP 520
            ||||||:||||||||||||||:.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat   456 TTKIPPVTNIFPLPERFCEALEMKGIKWPQTQRGMMVERPCPKGTRGTASYLCMASTGTWNPKGP 520

Human   521 DLSNCTSHWVNQLAQKIRSGENAASLANELAKHTKGPVFAGDVSSSVRLMEQLVDILDAQLQELK 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 DLSNCTSHWVNQLAQKIRSGENAASLANELAKHTKGTVFAGDVSSSVRLMEQLVDILDAQLQELK 585

Human   586 PSEKDSAGRSYNKLQKREKTCRAYLKAIVDTVDNLLRPEALESWKHMNSSEQAHTATMLLDTLEE 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|:.||||||||||||||||||||||
  Rat   586 PSEKDSAGRSYNKLQKREKTCRAYLKAIVDTVDNLLRAETLDCWKHMNSSEQAHTATMLLDTLEE 650

Human   651 GAFVLADNLLEPTRVSMPTENIVLEVAVLSTEGQIQDFKFPLGIKGAGSSIQLSANTVKQNSRNG 715
            |||||||||||||||||||:||||||||||||||:|||.|.||.|||.|||||||||||||||||
  Rat   651 GAFVLADNLLEPTRVSMPTDNIVLEVAVLSTEGQVQDFTFHLGFKGAFSSIQLSANTVKQNSRNG 715

Human   716 LAKLVFIIYRSLGQFLSTENATIKLGADFIGRNSTIAVNSHVISVSINKESSRVYLTDPVLFTLP 780
            |||:|||||||||.||||||||:|||||.:||||||||||||:|||||||||||||||||||::|
  Rat   716 LAKVVFIIYRSLGPFLSTENATVKLGADLLGRNSTIAVNSHVLSVSINKESSRVYLTDPVLFSMP 780

Human   781 HIDPDNYFNANCSFWNYSERTMMGYWSTQGCKLVDTNKTRTTCACSHLTNFAILMAHREIAYKDG 845
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
  Rat   781 HIDSDNYFNANCSFWNYSERTMMGYWSTQGCKLVDTNKTRTTCACSHLTNFAILMAHREIVYKDG 845

Human   846 VHELLLTVITWVGIVISLVCLAICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCINLFIAEFIFLIGIDKTKY 910
            ||:||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   846 VHKLLLTVITWVGIVVSLVCLAICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCINLFIAEFIFLIGIDKTQY 910

Human   911 AIACPIFAGLLHFFFLAAFAWMCLEGVQLYLMLVEVFESEYSRKKYYYVAGYLFPATVVGVSAAI 975
            .||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 TIACPVFAGLLHFFFLAAFSWMCLEGVQLYLMLVEVFESEYSRKKYYYVAGYLFPATVVGVSAAI 975

Human   976 DYKSYGTEKACWLHVDNYFIWSFIGPVTFIILLNIIFLVITLCKMVKHSNTLKPDSSRLEN---- 1036
            |||||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
  Rat   976 DYKSYGTLEACWLHVDNYFIWSFIGPVTFIILLNIIFLVITLCKMVKHSNTLKPDSSRLENINNY 1040

Human  1037 --------------------IKSWVLGAFALLCLLGLTWSFGLLFINEETIVMAYLFTIFNAFQG 1081
                                |||||||||||||||||||||||||:||||:|||||||.||||||
  Rat  1041 RVCDGYYNTDLPGYEDNKPFIKSWVLGAFALLCLLGLTWSFGLLFVNEETVVMAYLFTAFNAFQG 1105

Human  1082 VFIFIFHCALQKKVRKEYGKCFRHSYCCGGLPTESPHSSVKASTTRTSARYSSGTQSRIRRMWND 1146
            :|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||
  Rat  1106 LFIFIFHCALQKKVRKEYAKCFRHWYCCGGLPTESPHSSVKASTSRTSARYSSGTQSRIRRMWND 1170

Human  1147 TVRKQSESSFISGDINSTSTLNQGMTGNYLLTNPLLRPHGTNNPYNTLLAETVVCNAPSAPVFNS 1211
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 TVRKQSESSFISGDINSTSTLNQGMTGNYLLTNPLLRPHGTNNPYNTLLAETVVCNAPSAPVFNS 1235

Human  1212 PATYRETRHSLNNARDTSAMDTLPLNGNFNNSYSLHKGDYNDSVQVVDCGLSLNDTAFEKMIISE 1276
            |.      |||||.|||||||||||||||||||||.|.||:|.||||||||||||||||||||||
  Rat  1236 PG------HSLNNTRDTSAMDTLPLNGNFNNSYSLRKADYHDGVQVVDCGLSLNDTAFEKMIISE 1294

Human  1277 LVHNNLRGSSKTHNLELTLPVKPVIGGSSSEDDAIVADASSLMHSDNPGLELHHKELEAPLIPQR 1341
            |||||||||:|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||..||||||||||||
  Rat  1295 LVHNNLRGSNKTHNLELKLPVKPVIGGSSSEDDAIVADASSLMHGDNPGLEFRHKELEAPLIPQR 1359

Human  1342 THSLLYQPQKKVKSEGTDSYVSQLTAEAEDHLQSPNRDSLYTSMPNLRDSPYPESSPDMEEDLSP 1406
            |||||||||||||.|.||||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat  1360 THSLLYQPQKKVKPEATDSYVSQLTAEADEHLQSPNRDSLYTSMPNLRDSPYPESSPDMAEDLSP 1424

Human  1407 SRRSENEDIYYKSMPNLGAGHQLQMCYQISRGNSDGYIIPINKEGCIPEGDVREGQMQLVTSL 1469
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1425 SRRSENEDIYYKSMPNLGAGRQLQMCYQISRGNSDGYIIPINKEGCIPEGDVREGQMQLVTSL 1487

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ADGRL2NP_001352934.1 Gal_Lectin 49..129 CDD:307994 78/79 (99%)
OLF 142..398 CDD:321983 249/255 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 426..460 27/33 (82%)
HormR 469..533 CDD:214468 60/63 (95%)
GAIN 542..764 CDD:318649 204/221 (92%)
GPS 788..840 CDD:197639 51/51 (100%)
7tmB2_Latrophilin-2 848..1105 CDD:320672 243/280 (87%)
TM helix 1 850..875 CDD:320672 23/24 (96%)
TM helix 2 884..906 CDD:320672 21/21 (100%)
TM helix 3 915..942 CDD:320672 24/26 (92%)
TM helix 4 954..974 CDD:320672 19/19 (100%)
TM helix 5 991..1020 CDD:320672 28/28 (100%)
TM helix 6 1036..1063 CDD:320672 26/50 (52%)
TM helix 7 1067..1092 CDD:320672 21/24 (88%)
Latrophilin 1104..1469 CDD:308136 339/364 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1368..1410 38/41 (93%)
Adgrl2NP_599235.3 Gal_Lectin 49..129 CDD:396628 78/79 (99%)
OLF 142..398 CDD:413369 249/255 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 422..462 32/39 (82%)
HormR 469..533 CDD:214468 60/63 (95%)
GAIN 542..764 CDD:406802 204/221 (92%)
GPS 788..840 CDD:197639 51/51 (100%)
7tm_GPCRs 848..1129 CDD:421689 243/280 (87%)
TM helix 1 850..875 CDD:410628 23/24 (96%)
TM helix 2 884..906 CDD:410628 21/21 (100%)
TM helix 3 915..942 CDD:410628 24/26 (92%)
TM helix 4 954..974 CDD:410628 19/19 (100%)
TM helix 5 991..1020 CDD:410628 28/28 (100%)
TM helix 6 1036..1087 CDD:410628 26/50 (52%)
TM helix 7 1091..1116 CDD:410628 21/24 (88%)
Latrophilin 1128..1487 CDD:396778 339/364 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1139..1160 19/20 (95%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1386..1428 38/41 (93%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83684134
Domainoid 1 1.000 697 1.000 Domainoid score I3604
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG3545
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H22712
Inparanoid 1 1.050 2826 1.000 Inparanoid score I609
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG43322
OrthoDB 1 1.010 - - D12115at32523
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000766
OrthoInspector 1 1.000 - - oto141865
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_102405
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR12011
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X858
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.