DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GSE1 and Gse1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_005255916.3 Gene:GSE1 / 23199 HGNCID:28979 Length:1925 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006531208.3 Gene:Gse1 / 382034 MGIID:1098275 Length:1923 Species:Mus musculus


Alignment Length:1935 Identity:1550/1935 - (80%)
Similarity:1629/1935 - (84%) Gaps:122/1935 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MYWLKRPHQCDAGAGGRRGGAGAPREWNVAYALGSATGDDDEDDGGGPRLRGAAEETRDSDLSEL 65
            :|||||||||||.|.||||.    ||||                         .|:.|||:||||
Mouse   101 VYWLKRPHQCDASAAGRRGA----REWN-------------------------TEDARDSELSEL 136

Human    66 SDTDPLSEPDPPARDAASPHQDGAPGPGPRGGRGQEWRPAPGPAPGQGAEASAQGRAEEEGLPAK 130
            ||.|.|.||:|                          .|.|.|.|            |.|..|..
Mouse   137 SDADALPEPEP--------------------------EPEPEPEP------------EPEPEPED 163

Human   131 AHADGEPKSGVRRRRKGVGRHWVPEARASVLRSIQDPWQGPLVQEAPADGMKGPPSGRATKTLES 195
            ||  ...|||.||||.|.|.||.||.||||||.||:||.||    |..||..|..|        |
Mouse   164 AH--DSSKSGARRRRTGPGAHWAPEPRASVLRGIQEPWPGP----AAPDGTDGAAS--------S 214

Human   196 RPLGETLRGFCTSEDSDINITSGEEDHKEQPFPGVCNPKEKNSGRVPRALQDSRAAPAEGLCCYI 260
            ||.....|. .|.|.:|:..:.|:|..:..|             |:|        |.::..|||:
Mouse   215 RPAAPPERS-STPEGNDVAGSLGDEGLERPP-------------RIP--------ADSQARCCYV 257

Human   261 CGAPLSPASHHQVHVQKQEKLAQAPFFPFLWLHSPPPGAQPISEGGSTLVCASCFSSLTQQWQSF 325
            ||:.|||||..|:||||||..|||||||||||||||||||||:|.||||||..||||||.|||||
Mouse   258 CGSALSPASQQQIHVQKQETPAQAPFFPFLWLHSPPPGAQPITEAGSTLVCPCCFSSLTHQWQSF 322

Human   326 ELANVPVLQRLYVVPLDSHAPGMASKGRRLPREEGLP---SGALREACYLCGEDCTPDARAVPSR 387
            ||||||||||||||||:|||||||||.||||||| :|   :|.|||||||||||||.||||||||
Mouse   323 ELANVPVLQRLYVVPLNSHAPGMASKARRLPREE-VPAPTAGLLREACYLCGEDCTRDARAVPSR 386

Human   388 ILNGNARSAMHFPFLSLLPCPPNAQGPNKRCEVRSCPKCFSVLEDVWALYRACQNEELITSVQGF 452
            ::|||:..:|||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||..|.|||:|||||
Mouse   387 LVNGNSGGSMHFPFLSLLPCPPNARPPNKRCEVRSCPKCFSVLEDVWALYRASHNRELISSVQGF 451

Human   453 LGRYHQAFSASDPALSELPASAQGGPVSICYICGAELGPGKEFQLNVNPASRLGEKEPFFPFLTV 517
            |||||||||||||.||||||||||||.::||||||||||||||||::||||.|||||||||||||
Mouse   452 LGRYHQAFSASDPTLSELPASAQGGPPAVCYICGAELGPGKEFQLSMNPASHLGEKEPFFPFLTV 516

Human   518 YPPAPRARPVDSTGLVATCVLCYHDLLAQWLQHEARSSHHAVSAWSRQYQVETFVCFFCQQEKKR 582
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||::|..||||||||||:|||||||||||||
Mouse   517 YPPAPRARPADSTGLVATCVLCYHDLLGQWLQHEARAAHQPVSAWSRQYQVDTFVCFFCQQEKKR 581

Human   583 CLGLKSVRVARLPLFLYTLRASHSLLVDDGQQLIIGACVECGTLVCAGQGLTRQGPMSWSSPVAA 647
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:..|||:.||||.|.
Mouse   582 CLGLKSVRVARLPLFLYTLRASHSLLVDDGRQLIIGACVECGTLVCAGQGVASQGPIGWSSPTAG 646

Human   648 ATKPVCGSLEASAASHPPTRESETRPRAPTETLPRGPRMAQELRPAQCLQSSREE---DGPDLTG 709
            .||.....|||.|..|.|..|.|.:|..||::|.||.|..||..|....||||:.   ||.|||.
Mouse   647 VTKVTSAPLEAPAIVHAPASEPELQPVPPTDSLSRGIRTTQEPLPVSSQQSSRDSWDGDGVDLTA 711

Human   710 AGMSHEPKSPSLGMLSTATRTTATVNPLTPSPLNGALVPSGSPATSSALSAQAAPSSSFAAALRK 774
            .||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||:|||||||.|||||||||||||||||
Mouse   712 TGMSHEPKSPSIGMLSTATRTTATVNPLTPSPLNGALVPTGSPATSSTLSAQAAPSSSFAAALRK 776

Human   775 LAKQAEEPRGSSLSSESSPVSSPATNHSSPASTPKRVPMGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKT 839
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   777 LAKQAEEPRGSSLSSESSPVSSPATNHSSPASTPKRVPMGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKT 841

Human   840 VNGVWRSESRQDAGSRSSSGGRERLIVEPPLPQEKAGGPAIPSHLLSTPYPFGLSPSSVVQDSRF 904
            ||||||||||||:|||.||.|||||:|||||.||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Mouse   842 VNGVWRSESRQDSGSRGSSSGRERLLVEPPLAQEKAAGPAIPSHLLSTPYPFGLSPGSVVQDSRF 906

Human   905 PPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRSFRPYHTTDDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFP 969
            .||||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   907 QPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRSFRPYHTAEDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFP 971

Human   970 HPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTPGSLPPLHPSAMHLHLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSGL 1034
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Mouse   972 HPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTPGSLPPLHPSAMHLHLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSSL 1036

Human  1035 SAERLQMDEELRREREREREREREREADREREKERERE-REKEREQEKEREREKERERELERQRE 1098
            ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||:|.|||||||||||||||||
Mouse  1037 SAERLQMDEELR--REREREREREREADREREKEREREQREKEREKELEREREKERERELERQRE 1099

Human  1099 QRAREKELLAAKALEP-SFLPVAELHGLRGHATEERGKPSEQLTPTRAEKLKDAGLQAPKPVQHP 1162
            |||||||||||||||| :|||||||||||||:||||.||||||||||||||||.|||||||||||
Mouse  1100 QRAREKELLAAKALEPTTFLPVAELHGLRGHSTEERPKPSEQLTPTRAEKLKDVGLQAPKPVQHP 1164

Human  1163 LHPVPTPHHTVPSLISNHGIFSLPSSSAATALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQEKEDRQSQVSEFR 1227
            |||||.||||||||||:|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1165 LHPVPAPHHTVPSLISSHGIFSLPGSSATTALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQEKEDRQSQVSEFR 1229

Human  1228 QQVLEQHLDMGRPPVPAEAEHRPESTTRPGPNRHEPGGRDPPQHFGGPPPLISPKPQLHAAPTAL 1292
            |||||||||:|||.||.|||||||| ||||.||||.|.|:|||||||||||||||||.|..||||
Mouse  1230 QQVLEQHLDLGRPLVPTEAEHRPES-TRPGTNRHEQGSREPPQHFGGPPPLISPKPQQHTVPTAL 1293

Human  1293 WNPVSLMDNTLETRRAESHSLHSHPAAFEPSRQAAVPLVKVERVFCPEKAEEGPRKREPAPLDKY 1357
            |||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||:|.||||| |||||..|||||
Mouse  1294 WNPVSLMDNALETRRAESHSLHSHPTAFEPSRQAAVPLVKVERVYCSEKAEE-PRKREATPLDKY 1357

Human  1358 Q--PPPPPPREGGSLEHQPFLPGPGPFLAELEKSTQTILGQQRASLPQAATFGELSGPLKPGSPY 1420
            |  ||||||||.||||.|.|..||||||.||||||||||||||.||.||.:||||||||||||||
Mouse  1358 QPPPPPPPPREAGSLEPQTFPHGPGPFLTELEKSTQTILGQQRPSLSQATSFGELSGPLKPGSPY 1422

Human  1421 RPPVPRAPDPAYIYDEFLQQRRRLVSKLDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRC 1485
            ..|..|.|||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1423 CHPTARGPDPAYIYDEFLQQRRKLVSKLDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRC 1487

Human  1486 VAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFGLTTQQQKEELVAQKRRKRRRMLRERSPSPPTIQSKRQTPSPR 1550
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|.||||||||
Mouse  1488 VAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFGLTTQQQKEELVAQKRRKRRRMLRERSPSPPAVQCKRQTPSPR 1552

Human  1551 LALSTRYSPDEMNNSPNFEEKKKFLTIFNLTHISAEKRKDKERLVEMLRAMKQKALSAAVADSLT 1615
            |||||||||||||||||||||:||||.||||||||||||||||||||||||||:||||  |||:|
Mouse  1553 LALSTRYSPDEMNNSPNFEEKRKFLTFFNLTHISAEKRKDKERLVEMLRAMKQRALSA--ADSVT 1615

Human  1616 NSPRDSPAVSLSEPATQQASLDVEKPVGVAASLSDIPKAAEPGKLEQVRPQELSRVQELAPASGE 1680
            ||.||||.|||||||||.|.|:.::||||.|||||:||..|.|:|||:|||||.||||.||.|||
Mouse  1616 NSSRDSPPVSLSEPATQPAPLETDQPVGVPASLSDVPKTTETGRLEQLRPQELLRVQEPAPPSGE 1680

Human  1681 KARLSEAPGGKKSLSMLHYIRGAAPKDIPVPLSHSTNGKSKPWEPFVAEEFAHQFHESVLQSTQK 1745
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1681 KARLSEAPGGKKSLSMLHYLRGAAPKDIPVPLSHSINGKSKPWEPFVAEEFAHQFHESVLQSTQK 1745

Human  1746 ALQKHKGSVAVLSAEQNHKVDTSVHYNIPELQSSSRAPPPQHNGQQEPPTARKGPPTQELDRDSE 1810
            |||||||:.|:|||||:|||||::||||||||||||.|.||||||||||..|||||.||.|:|||
Mouse  1746 ALQKHKGNSALLSAEQSHKVDTAIHYNIPELQSSSRVPLPQHNGQQEPPMGRKGPPMQEADQDSE 1810

Human  1811 EEEEEDDEDGEDEEEVPKRKWQGIEAVFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEARHYSLSLTAEQ 1875
            |:.|||.|  |:.||.|:|:||||||:|||||||||||||||||||||||||||::|||||||||
Mouse  1811 EDSEEDSE--EEAEEAPRRQWQGIEAIFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEAQNYSLSLTAEQ 1873

Human  1876 LSHSVAELRSQKQKMVSERERLQAELDHLRKCLALPAMHWPRGYLKGYPR 1925
            ||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Mouse  1874 LSHSMAELRSQKQKMVSERERLQAELDHLRKCLALPTMHWPRGYFKGYPR 1923

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GSE1XP_005255916.3 None
Gse1XP_006531208.3 DUF3736 <803..907 CDD:372175 96/103 (93%)
DUF3736 1442..1582 CDD:372175 133/139 (96%)
BST2 <1848..1906 CDD:374748 54/57 (95%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83963035
Domainoid 1 1.000 970 1.000 Domainoid score I1819
eggNOG 1 0.900 - - E1_28IPN
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H40964
Inparanoid 1 1.050 2183 1.000 Inparanoid score I1300
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG43749
OrthoDB 1 1.010 - - D113937at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0009241
OrthoInspector 1 1.000 - - oto114834
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_111282
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR17608
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R6081
SonicParanoid 1 1.000 - - X6300
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1919.300

Return to query results.
Submit another query.