DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CYFIP1 and cyfip1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001311048.1 Gene:CYFIP1 / 23191 HGNCID:13759 Length:1287 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_997924.1 Gene:cyfip1 / 336613 ZFINID:ZDB-GENE-030131-8557 Length:1253 Species:Danio rerio


Alignment Length:1253 Identity:1160/1253 - (92%)
Similarity:1215/1253 - (96%) Gaps:0/1253 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    35 MAAQVTLEDALSNVDLLEELPLPDQQPCIEPPPSSLLYQPNFNTNFEDRNAFVTGIARYIEQATV 99
            ||:.|||||||||||||||||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||||||||||
Zfish     1 MASTVTLEDALSNVDLLEELPLPDQQPCIEPLPSSLIYQPNFNTNFEDRNAFVTGIARYIEQATV 65

Human   100 HSSMNEMLEEGQEYAVMLYTWRSCSRAIPQVKCNEQPNRVEIYEKTVEVLEPEVTKLMNFMYFQR 164
            |||||:||||||:|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Zfish    66 HSSMNDMLEEGQQYAVMLYTWRCCSRAIPQVKCNEQPNRVEIYEKTVEVLEPEVNKLMNFMYFQR 130

Human   165 NAIERFCGEVRRLCHAERRKDFVSEAYLITLGKFINMFAVLDELKNMKCSVKNDHSAYKRAAQFL 229
            .||:||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   131 TAIDRFCGEVRRLCHAERRKDFVSEAYLLTLGKFINMFAVLDELKNMKCSVKNDHSAYKRAAQFL 195

Human   230 RKMADPQSIQESQNLSMFLANHNKITQSLQQQLEVISGYEELLADIVNLCVDYYENRMYLTPSEK 294
            |||::|.|||||||||||||||||||||||||||||:||:||||||||||||||||:|||||||:
Zfish   196 RKMSEPSSIQESQNLSMFLANHNKITQSLQQQLEVINGYDELLADIVNLCVDYYENKMYLTPSER 260

Human   295 HMLLKVMGFGLYLMDGSVSNIYKLDAKKRINLSKIDKYFKQLQVVPLFGDMQIELARYIKTSAHY 359
            |||||||||||||||||.||||||:|||||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||
Zfish   261 HMLLKVMGFGLYLMDGSNSNIYKLEAKKRINLTKIDKFFKQLQVVPLFGDMQIELARYIKTSAHY 325

Human   360 EENKSRWTCTSSGSSPQYNICEQMIQIREDHMRFISELARYSNSEVVTGSGRQEAQKTDAEYRKL 424
            |||||||:|||:|||||||:|||||||||.|||||||||||||||||||||||:|||||:|||||
Zfish   326 EENKSRWSCTSTGSSPQYNVCEQMIQIREGHMRFISELARYSNSEVVTGSGRQDAQKTDSEYRKL 390

Human   425 FDLALQGLQLLSQWSAHVMEVYSWKLVHPTDKYSNKDCPDSAEEYERATRYNYTSEEKFALVEVI 489
            ||||||||||||||||.:||||||||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||:
Zfish   391 FDLALQGLQLLSQWSAQIMEVYSWKLVHPTDKYSNKECPDNAEEYERATRYNYTSEEKFALVEVL 455

Human   490 AMIKGLQVLMGRMESVFNHAIRHTVYAALQDFSQVTLREPLRQAIKKKKNVIQSVLQAIRKTVCD 554
            ||||||||||||||||||||||||:|:|||||:||||||||||||||||||:|||||||||||||
Zfish   456 AMIKGLQVLMGRMESVFNHAIRHTIYSALQDFAQVTLREPLRQAIKKKKNVVQSVLQAIRKTVCD 520

Human   555 WETGHEPFNDPALRGEKDPKSGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLE 619
            ||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
Zfish   521 WETGREPHNDPALRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLVADKSGSKKTLRSSLE 585

Human   620 GPTILDIEKFHRESFFYTHLINFSETLQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTD 684
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   586 GPTILDIEKFHRESFFYTHLLNFSETLQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTD 650

Human   685 HILETKEASMMEYVLYSLDLYNDSAHYALTRFNKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYK 749
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   651 HILETKEASMMEYVLYSLDLYNDSAHYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYK 715

Human   750 VMAGSLLLDKRLRSECKNQGATIHLPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRVSAAMYKSL 814
            |:|||||||||||:|||||||.|..|.|||||||||||||||||||||||||||||||:|:||||
Zfish   716 VIAGSLLLDKRLRAECKNQGANISWPSSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRVSSALYKSL 780

Human   815 ELAIGRFESEDLTSIVELDGLLEINRMTHKLLSRYLTLDGFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFW 879
            ||||.||||||||||:||:|||:||||||||||:|||||..||||||||||||||||||||||||
Zfish   781 ELAISRFESEDLTSIMELEGLLDINRMTHKLLSKYLTLDSIDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFW 845

Human   880 ELNYDFLPNYCYNGSTNRFVRTVLPFSQEFQRDKQPNAQPQYLHGSKALNLAYSSIYGSYRNFVG 944
            ||||||||||||||||||||||:|||||||||||.||||||||:|||||||||||||..||||||
Zfish   846 ELNYDFLPNYCYNGSTNRFVRTILPFSQEFQRDKPPNAQPQYLYGSKALNLAYSSIYSLYRNFVG 910

Human   945 PPHFQVICRLLGYQGIAVVMEELLKVVKSLLQGTILQYVKTLMEVMPKICRLPRHEYGSPGILEF 1009
            |||.:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   911 PPHIKAICRLLGYQGIAVVMEELLKVVKSLLQGTILQYVKTLMEVMPKICRLPRHEYGSPGILEF 975

Human  1010 FHHQLKDIVEYAELKTVCFQNLREVGNAILFCLLIEQSLSLEEVCDLLHAAPFQNILPRVHVKEG 1074
            |||||||||||||||:||||||||||||:|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Zfish   976 FHHQLKDIVEYAELKSVCFQNLREVGNALLFCLLTEQSLSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVHVKEG 1040

Human  1075 ERLDAKMKRLESKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSFLD 1139
            |||||||||||:||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:|::||
Zfish  1041 ERLDAKMKRLEAKYTALHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSIFEVILTRVRAYLD 1105

Human  1140 DPIWRGPLPSNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTHEFTVEQCFGDGLHWAGCMIIVLLGQ 1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||:|||||||.||||
Zfish  1106 DPIWRGPLPSNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGAHEFTVEQCFGDGLNWAGCMIITLLGQ 1170

Human  1205 QRRFAVLDFCYHLLKVQKHDGKDEIIKNVPLKKMVERIRKFQILNDEIITILDKYLKSGDGEGTP 1269
            .|||.:|||.|||||||||||||||||:|||||||:||||||||||||..||:|||||||||..|
Zfish  1171 HRRFDILDFSYHLLKVQKHDGKDEIIKSVPLKKMVDRIRKFQILNDEIFAILNKYLKSGDGENMP 1235

Human  1270 VEHVRCFQPPIHQSLASS 1287
            |||||||||||||||||:
Zfish  1236 VEHVRCFQPPIHQSLASN 1253

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CYFIP1NP_001311048.1 FragX_IP 423..1256 CDD:461799 771/832 (93%)
cyfip1NP_997924.1 FragX_IP 389..1222 CDD:461799 771/832 (93%)

Return to query results.
Submit another query.