DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KDM6B and Kdm6b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001073893.1 Gene:KDM6B / 23135 HGNCID:29012 Length:1682 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038942397.1 Gene:Kdm6b / 363630 RGDID:1307629 Length:1636 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1649 Identity:1502/1649 - (91%)
Similarity:1539/1649 - (93%) Gaps:19/1649 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MHRAVDPPGARAAREAFALGGLSCAGAWSSCPPHPPPRSAWLPGGRCSASIGQPPLPAPLPPSHG 65
            |||||||||||:||||||||||||||||||||||||||::||||||||||||||||.||||||||
  Rat     1 MHRAVDPPGARSAREAFALGGLSCAGAWSSCPPHPPPRNSWLPGGRCSASIGQPPLSAPLPPSHG 65

Human    66 SSSGHPSKPYYAPGAPTPRPLHGKLESLHGCVQALLREPAQPGLWEQLGQLYESEHDSEEATRCY 130
            :|||||:|||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||
  Rat    66 NSSGHPNKPYYASGTPTPRPLHGKLESLHGCVQALLREPAQPVLWEQLGQLYESEHDSEEAICCY 130

Human   131 HSALRYGGSFAELGPRIGRLQQAQLWNFHTGSCQHRAKVLPPLEQVWNLLHLEHKRNYGAKRGGP 195
            |.|||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 HRALRYGGSFAELGPRIGRLQQAQLWNLHAGSCQHRAKVLPPLEQVWNLLHLEHKRNYGAKRGGP 195

Human   196 PVKRAAEPPVVQPVPPAALSGPSGEEGLSPGGKRRRGCNSEQTGLPPGLPLPPPPLPPPPPPPPP 260
            ||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||:|||.||||||||||||.|||||||||
  Rat   196 PVKRSAEPPVVQPMPPAALSGPSGEEGLSPGGKRRRGCSSEQAGLPPGLPLPPPPPPPPPPPPPP 260

Human   261 PPPPLPGLATSPPFQLTKPGLWSTLHGDAWGPERKGSAPPERQEQRHSLPHPYPYPAPAYTAHPP 325
            |||||||||.||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   261 PPPPLPGLAISPPFQLTKPGLWNTLHGDAWGPERKGSAPPERQEQRHSLPHPHPYPAPAYTAHPP 325

Human   326 GHRLVPAAPPGPGPRPPGAESHGCLPATRPPGSDLRESRVQRSRMDSSVSPAATTACVPYAPSRP 390
            .|||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   326 SHRLGPATPLGPGPRPPGAESHGCLPATRPPGSDLRESRVQRSRMDSSVSPAASTACVPYAPSRP 390

Human   391 PGLPGTTTSSSSSSSSNTGLRGVEPNPGIPGADHYQTPALEVS-HHGRLGPSAHSSRKPFLGAPA 454
            |||||  ||||||||:|||||||||:||||||||||.||||:: |..||||||||||||||.|||
  Rat   391 PGLPG--TSSSSSSSNNTGLRGVEPSPGIPGADHYQNPALEIAPHQARLGPSAHSSRKPFLTAPA 453

Human   455 ATPHLSLPPGPSSPPPPPCPRLLRPPPPPAWLKGPACRAAREDGEILEELFFGTEGPPRPAPPPL 519
            |.||||||.|..|.|||||||||||||||||:||.|||:||||||||.|||||.||||||.||||
  Rat   454 AAPHLSLPSGTPSSPPPPCPRLLRPPPPPAWMKGSACRSAREDGEILGELFFGAEGPPRPPPPPL 518

Human   520 PHREGFLGPPASRFSVGTQDSHTPPTPPTPT-TSSSNSNSGSHSSSPAGPVSFPPPPYLARSIDP 583
            |||:||||||..|||||||||||||||||.| :|||:|:|.||||||.|||.|||||||||||||
  Rat   519 PHRDGFLGPPNPRFSVGTQDSHTPPTPPTTTSSSSSSSSSNSHSSSPTGPVPFPPPPYLARSIDP 583

Human   584 LPRPPSPAQNPQDPPLVPLTLALPPAPPSSCHQNTSGSFRRPESPRPRVSFPKTPEVGPGPPPGP 648
            ||||.||..:.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.
  Rat   584 LPRPSSPTLSSQDPPLPPLTLALPPAPPSSCHQNTSGSFRRSESPRPRVSFPKTPEVGQGPPPGS 648

Human   649 LSKAPQPVPPGVGELPARGPRLFDFPPTPLEDQFEEPAEFKILPDGLANIMKMLDESIRKEEEQQ 713
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   649 LSKAPQPVPPGVGELPARGPRLFDFPPTPLEDQFEEPAEFKILPDGLANIMKMLDESIRKEEEQQ 713

Human   714 QHEAGVAPQPPLKEPFASLQSPFPTDTAPTTTAPAVAVTTTTTTTTTTTATQEEEKKPPPALPPP 778
            |.|||..|.||||||||||:|..|:||||..|..|     .|.||||||.|||||||||||||||
  Rat   714 QQEAGAVPPPPLKEPFASLRSSLPSDTAPAATTAA-----ATPTTTTTTTTQEEEKKPPPALPPP 773

Human   779 PPLAKFPPPSQPQPPPPPPPSPASLLKSLASVLEGQKYCYRGTGAAVSTRPGPLPTTQYSPGPPS 843
            |||||||||  ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.:|.|||||.|.|
  Rat   774 PPLAKFPPP--PQPPPPPPASPASLLKSLASVLEGQKYCYRGTGAAVSTRPGSVPATQYSPSPAS 836

Human   844 GATALPPTSAAPSAQGSPQPSASSSSQFSTSGGPWARERRAGEEPVPGPMTPTQPPPPLSLPPAR 908
            ||||.||||.||||||||:||.|||||||||||||.|||||||||.|||:||.|.||||.|||||
  Rat   837 GATAPPPTSVAPSAQGSPKPSVSSSSQFSTSGGPWVRERRAGEEPAPGPVTPAQLPPPLPLPPAR 901

Human   909 SESEVLEEISRACETLVERVGRSATDPADPVDTAEPADSGTERLLPPAQAKEEAGGVAAVS---G 970
            ||||||||||||||||||||||||.:||||||.|:|.|||||...||||||||:||||..:   |
  Rat   902 SESEVLEEISRACETLVERVGRSAINPADPVDIADPVDSGTEPQPPPAQAKEESGGVAVAAAGPG 966

Human   971 SCKRRQKEHQKEHRRHRRACKDSVGRRPREGRAKAKAKVPKEKSRRVLGNLDLQSEEIQGREKSR 1035
            |.|||    |||||||||.|:|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   967 SGKRR----QKEHRRHRRTCRDSVGRRPREGRAKAKAKAPKEKSRRVLGNLDLQSEEIQGREKAR 1027

Human  1036 PDLGGASKAKPPTAPAPPSAPAPSAQPTPPSASVPGKKAREEAPGPPGVSRADMLKLRSLSEGPP 1100
            ||:|||||.|.||.||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1028 PDVGGASKVKTPTTPAPPPAPAPSAQPTPPSAPVPGKKTREEAPGPPGVSRADMLKLRSLSEGPP 1092

Human  1101 KELKIRLIKVESGDKETFIASEVEERRLRMADLTISHCAADVVRASRNAKVKGKFRESYLSPAQS 1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||||||||||||||||||
  Rat  1093 KELKIRLIKVESGDKETFIASEVEERRLRMADLTISHCAADVMRASKNAKVKGKFRESYLSPAQS 1157

Human  1166 VKPKINTEEKLPREKLNPPTPSIYLESKRDAFSPVLLQFCTDPRNPITVIRGLAGSLRLNLGLFS 1230
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1158 VKPKINTEEKLPREKLNPPTPSIYLESKRDAFSPVLLQFCTDPRNPITVIRGLAGSLRLNLGLFS 1222

Human  1231 TKTLVEASGEHTVEVRTQVQQPSDENWDLTGTRQIWPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEE 1295
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1223 TKTLVEASGEHTVEVRTQVQQPSDENWDLTGTRQIWPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEE 1287

Human  1296 KESEDEESEEPDSTTGT-PPSSAPDPKNHHIIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTST 1359
            ||||||||||||||||| |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1288 KESEDEESEEPDSTTGTSPSSSAPDPKNHHIIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTST 1352

Human  1360 GNMLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAF 1424
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1353 GNMLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAF 1417

Human  1425 CDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLT 1489
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1418 CDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLT 1482

Human  1490 AYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESL 1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1483 AYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESL 1547

Human  1555 VRAGKKIAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVL 1619
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1548 VRAGKKIAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVL 1612

Human  1620 EQYRTEELAQAYDAFTLVRARRAR 1643
            |||||||||||||||||..|..:|
  Rat  1613 EQYRTEELAQAYDAFTLAPASTSR 1636

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KDM6BNP_001073893.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 52..88 30/35 (86%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 190..680 436/491 (89%)
PRK12323 <572..718 CDD:481241 135/145 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 704..807 79/102 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 822..1096 230/276 (83%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1288..1325 35/37 (95%)
JmjC 1343..1407 CDD:214721 63/63 (100%)
JmjC 1377..1485 CDD:396791 107/107 (100%)
Kdm6bXP_038942397.1 BepA <90..154 CDD:443813 59/63 (94%)
TPR repeat 106..136 CDD:276809 25/29 (86%)
JmjC 1336..1400 CDD:214721 63/63 (100%)
JmjC 1370..1478 CDD:396791 107/107 (100%)

Return to query results.
Submit another query.