DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PLXND1 and Plxnd1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_055918.3 Gene:PLXND1 / 23129 HGNCID:9107 Length:1925 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_080652.2 Gene:Plxnd1 / 67784 MGIID:2154244 Length:1925 Species:Mus musculus


Alignment Length:1929 Identity:1761/1929 - (91%)
Similarity:1817/1929 - (94%) Gaps:8/1929 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAPRAAGGAPLSARAAAASP----PPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTNN 61
            ||.|||||||.|||||||.|    |..:.|...|:|  |||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MARRAAGGAPPSARAAAAVPLRPRPHSRGPGLLPLP--LLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTNN 63

Human    62 FALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRLTDNYNK 126
            |||||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    64 FALDGTAGTVYLAAVNRLYQLSSANLSLEAEATVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRLTDNYNK 128

Human   127 ILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSMLNVAANHPNAST 191
            ||||||||||||.|||||||.|||||||||||:||.||||||.||||||||||||||||||||||
Mouse   129 ILQLDPGQGLVVACGSIYQGLCQLRRRGNISALAVSFPPAAPTAEPVTVFPSMLNVAANHPNAST 193

Human   192 VGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIAIRSLDTRGDLAKLFTFD 256
            |||||||.:|.|||||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Mouse   194 VGLVLPPTSGTGGSRLLVGATYTGFGSAFFPRNRSLEDHRFENTPEIAIRSLDARGDLAKLFTFD 258

Human   257 LNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLALNSEARAGDKESQARSLLARI 321
            ||||||||||||||||||||||||.|||||:.||..||.|||||||||||||||:||||||||||
Mouse   259 LNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVRAFLHPAVPPHSAQPYAYLALNSEARAGDKDSQARSLLARI 323

Human   322 CLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRGDLYSRLVSVFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPA 386
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||||||||:|.||.|||
Mouse   324 CLPRGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRGDLYSRLVSVFPAREQFFAVFERPQGAPGARNAPA 388

Human   387 ALCAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLDSVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQ 451
            |||||||.||:||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||
Mouse   389 ALCAFRFDDVQAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLDSVVQGTGPACESKRNIQLQPEQLDCGAAHLQ 453

Human   452 HPLSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVNNYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYG 516
            |||:|||||:|:|||||||||:|||||.||||||||||..||||||:||||||||||||:|||||
Mouse   454 HPLTILQPLRASPVFRAPGLTAVAVASANNYTAVFLGTATGRLLKISLNESMQVVSRRVLTVAYG 518

Human   517 EPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDC 581
            |||||||||||.|.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||
Mouse   519 EPVHHVMQFDPMDPGYLYLMTSHQMARVKVAACEVHSTCGDCVGAADAYCGWCTLETRCTLQQDC 583

Human   582 TNSSQQHFWTSASEGPSRCPAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTV 646
            |||||.|||||||||||||||||||||||||.::|.||||||||||||||||||||||||.:|||
Mouse   584 TNSSQPHFWTSASEGPSRCPAMTVLPSEIDVHRDYTGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNGVRTV 648

Human   647 ARVPGPAFGHQIAYCNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPH 711
            |||||||:.|||||||||||.|||.||..||||||||||||.|.|||.||||||||||..|||||
Mouse   649 ARVPGPAYDHQIAYCNLLPRAQFPSFPAGQDHVTVEMSVRVKGHNIVSANFTIYDCSRIGQVYPH 713

Human   712 TACTSCLSAQWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLA 776
            ||||||||.||||.||.|.||||||||:|:.|||||||||||:.|.||||||||||||:|||||.
Mouse   714 TACTSCLSTQWPCSWCIQLHSCVSNQSQCQDSPNPTSPQDCPQILPSPLAPVPTGGSQDILVPLT 778

Human   777 NTAFFQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEP 841
            ...||.|::|||||||||.|||||.|.|:|||:|||||||:|||||||||:|||.|.||||||.|
Mouse   779 KATFFHGSSLECSFGLEESFEAVWANNSLVRCNQVVLHTTQKSQVFPLSLKLKGPPDRFLDSPNP 843

Human   842 MTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIHAIEPLSGPLDGG 906
            |||:||||||||||||||||||||||||:|:|||||||||||:.||||||||.||||||||||||
Mouse   844 MTVVVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCVWNDGCRLRGPLQPLPGTCPAPEIRAIEPLSGPLDGG 908

Human   907 TLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVTVNASKEGK 971
            ||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||.|..|.|||||.||||:
Mouse   909 TLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGSVACEPLADRYTVSEEIVCATGPAAGAFSDVVTVNVSKEGR 973

Human   972 SRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCTELMRTDTSIACTM 1036
            ||::||||||.||||||:||||||||||||||:||:|||.||||||||||||:|.||.|||.||:
Mouse   974 SREQFSYVLPTVHSLEPSMGPKAGGTRITIHGSDLNVGSMLQVLVNDTDPCTDLTRTATSITCTV 1038

Human  1037 PEGALPAPVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVS 1101
            |.|.||:|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Mouse  1039 PGGTLPSPVPVCVRFESRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPGRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVS 1103

Human  1102 MAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGS 1166
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  .|||||||.||||||
Mouse  1104 MAVHHIGREPTFCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADE--AAEELLDPAEAQRGS 1166

Human  1167 RFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKEQDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRI 1231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.:|||||||||||:|||:
Mouse  1167 RFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKEQDSLGLESHEYHIKIGQVSCDIQIISDRV 1231

Human  1232 IHCSVNESLGAAVGQLPITIQVGNFNQTIATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTK 1296
            ||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
Mouse  1232 IHCSVNESLGTAEGQLPITIQVGNFNQTIATLQLGGSETAIVVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTK 1296

Human  1297 SRRAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFP 1361
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1297 SRRAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFP 1361

Human  1362 KCSSLYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVF 1426
            ||||||||||||||:||||||.|..||||||||||.|||.|||:|||||||||||||||||||||
Mouse  1362 KCSSLYEERYVLPSKTLNSQGGSPPQETHPLLGEWNIPEHCRPSMEEGISLFSSLLNNKHFLIVF 1426

Human  1427 VHALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVE 1491
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1427 VHALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVE 1491

Human  1492 KMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPR 1556
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
Mouse  1492 KMLTNWMSICMYGCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLRENIEAKPR 1556

Human  1557 NLNVSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILR 1621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Mouse  1557 NLNVSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYVLR 1621

Human  1622 DLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELAEP 1686
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||:|||||||||||||||||||||||.||
Mouse  1622 DLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLTDKKDSTLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELVEP 1686

Human  1687 KKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKR 1751
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1687 KKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKR 1751

Human  1752 GISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKD 1816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1752 GISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIEKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKD 1816

Human  1817 SPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYA 1881
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1817 SPTNKLLYAKEIPEYRKTVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYA 1881

Human  1882 KRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA 1925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
Mouse  1882 KRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMENNIYECYSEA 1925

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PLXND1NP_055918.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..23 18/25 (72%)
Sema_plexin_D1 49..547 CDD:200508 455/497 (92%)
PSI 549..601 CDD:396154 48/51 (94%)
TIG_plexin <627..700 CDD:465588 61/72 (85%)
PSI 711..753 CDD:214655 34/41 (83%)
IPT_plexin_repeat1 891..979 CDD:238585 75/87 (86%)
IPT_plexin_repeat2 981..1067 CDD:238584 71/85 (84%)
IPT_plexin_repeat3 1069..1174 CDD:238586 98/104 (94%)
Plexin_cytopl 1345..1883 CDD:462434 522/537 (97%)
Plxnd1NP_080652.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..26 17/24 (71%)
Sema_plexin_D1 51..549 CDD:200508 455/497 (92%)
PSI 551..603 CDD:396154 48/51 (94%)
TIG_plexin <629..702 CDD:465588 61/72 (85%)
PSI 713..755 CDD:214655 34/41 (83%)
IPT_plexin_repeat1 893..981 CDD:238585 75/87 (86%)
IPT_plexin_repeat2 983..1069 CDD:238584 71/85 (84%)
IPT_plexin_repeat3 1071..1174 CDD:238586 98/104 (94%)
Plexin_cytopl 1345..1883 CDD:462434 522/537 (97%)

Return to query results.
Submit another query.