DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PLXND1 and plxnd1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_055918.3 Gene:PLXND1 / 23129 HGNCID:9107 Length:1925 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_991260.3 Gene:plxnd1 / 402998 ZFINID:ZDB-GENE-040426-1828 Length:1880 Species:Danio rerio


Alignment Length:1925 Identity:1133/1925 - (58%)
Similarity:1390/1925 - (72%) Gaps:66/1925 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    21 PPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAAR---AGALEIQRRFPSPTPTNNFALDGAAGTVYLAAVNRLYQL 82
            ||.....|..:.||..|||.|.:   ||||.:|:.|.:|..|||||||.|:|.|||||||.||||
Zfish     2 PPSAADRRSALALLSALLLAALQTRSAGALHVQQAFATPGRTNNFALDAASGRVYLAAVNNLYQL 66

Human    83 SGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRLTDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGF 147
            : |.|:||.|...|||.|:|||||||||||:|||.:.||||:||:|.||..|.:::.|||:||||
Zfish    67 N-ATLALEVEMRTGPVLDNPLCHAPQLPQATCEHQKTLTDNHNKLLALDRAQDVLLACGSVYQGF 130

Human   148 CQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSMLNVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGAT 212
            |:|||..|:|.:||:|     |.:..||||||||:||||.||||||||.  ....|..|||||||
Zfish   131 CELRRLENVSRLAVQF-----PQDGATVFPSMLNIAANHENASTVGLVF--RTHGGSPRLLVGAT 188

Human   213 YTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIAIRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKL 277
            |||.|:.:||:|.|.||.|||||||||||:|||| :|.:|||:|:|||:||:.||||..|:::||
Zfish   189 YTGMGTEYFPKNHSKEDLRFENTPEIAIRALDTR-ELGRLFTYDINPSEDNVFKIKQEVKQKNKL 252

Human   278 GFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLALNSEARAGDKESQARSLLARICLPHGA---GGDAKKLTESYI 339
            .||.||        ...:|:|:|.|::|.:|.||||..|:||||||...|   ..:::||||||.
Zfish   253 SFVHAF--------ALGNYSYIAFNNDANSGLKESQPNSVLARICLDTDAPRRAAESRKLTESYA 309

Human   340 QLGLQCAGGAGRGDLYSRLVSVFPARER----LFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAI 400
            |:||:|  ||     |:||:||.||..|    |||||.|..|.       ||:|.||.|:|...|
Zfish   310 QMGLRC--GA-----YTRLLSVSPAELRAETFLFAVFGRAGGR-------AAVCVFRVAEVEEMI 360

Human   401 RAARTACFVEPAPDVVAVLDSVVQGTGPACERK--LNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKAT 463
            |..|..|...|..| |.|||||:||:|..||.|  :.:|||.:||:||||||||||::.:||:|.
Zfish   361 RQGRRNCSHGPNSD-VQVLDSVIQGSGAECEGKGSIMLQLQADQLNCGAAHLQHPLALRRPLRAR 424

Human   464 PVFRAPGLTSVAVASVNNYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEPVHHVMQFDPA 528
            |::.|.||:||||.|.:|:|.:|||: .|||.|::|:.:..|..:..:.:...|||||:|.|||:
Zfish   425 PLYEAQGLSSVAVDSAHNHTLMFLGS-RGRLHKVSLHSNFSVSQQWSLRLPANEPVHHIMTFDPS 488

Human   529 DSGYLYLMTSHQMARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSA 593
            |..|||:||||.:.||:|::|..:|:||||:.|.|.:||||.||.||::||||::.|....|.|.
Zfish   489 DRTYLYVMTSHHLLRVRVSSCEQYSSCGDCLSAGDPHCGWCTLERRCSVQQDCSSVSLSRSWISI 553

Human   594 SEGPSRCPAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQI 658
            |||..:||:||:.|:||....|...:.:.::||:|.|.|:.:.||||..|.|.|.|........|
Zfish   554 SEGVQQCPSMTITPAEISRSAEMRDVGILVAGSVPDLQGLRVECDYGMGISTNATVHLDYGTSHI 618

Human   659 AYCNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWP 723
            ..|.|.|....|..|...|||||.:|:..||.::|...|.||||.||.|::..||||||||:.|.
Zfish   619 QTCPLPPAHTLPTIPSGTDHVTVPVSINANGVSVVSGRFIIYDCERTGQIHSTTACTSCLSSAWR 683

Human   724 CFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQGAALEC 788
            |||..|.|.|||:::..:.....:|  .||..:...:.|:|||.|....:.|.|.|  .|.||||
Zfish   684 CFWDPQLHQCVSSKNNTQQLLQNSS--SCPSMVAYEVPPLPTGSSPVFSLELKNVA--HGTALEC 744

Human   789 SFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMTVMVYNCAMGS 853
            .:...:.:.|.|::...|.|....|.||:.|:.|.|:|:..| .|.::|:|:.|||.||:|:.|.
Zfish   745 VYSDGQQYRAQWLDGPWVNCSGATLKTTQWSESFSLNLRRAG-DATYIDNPQRMTVEVYSCSAGV 808

Human   854 PDCSQCLGREDLGHLCMWSD-GCR--LRGPLQPMAGTCPAPEIHAIEPLSGPLDGGTLLTIRGRN 915
            .||||||||..||..|:|.: .||  ::.|....| .||||.||.||||||||.||||||:.|:|
Zfish   809 SDCSQCLGRAALGQECVWCEHSCRQQVQCPTTSSA-RCPAPLIHKIEPLSGPLTGGTLLTVTGKN 872

Human   916 LGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVTVNASKE--GKSRDRFSY 978
            ||.|...::  |.||||.|..||.:||||..:||.||.:...:||.|||..:::  |.|:::||:
Zfish   873 LGHRADQLS--VSIGGVTCHTLPQQYTVSIRLVCETGASLEQMSGQVTVGVAEDAVGVSKEQFSF 935

Human   979 VLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCTELMRTDTSIACTMPEGALPA 1043
            |.|.:....|..||.||||.:||.|..|..||...:.:|:|..|:...|:...|.|.||..|...
Zfish   936 VEPRLLRFSPAQGPLAGGTTLTIQGQFLDAGSTTDIQINNTHTCSIRTRSSEIIRCVMPAAARAE 1000

Human  1044 PVPVCVRFERRGCVHG--NLTFWYMQNPVITAISPRRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHH 1106
            .|.|||.|:.|.||..  |.||.|.:||.|:.|.|.||.:||||:|:|:|..|.:||:|.|.|..
Zfish  1001 NVSVCVVFDGRPCVSASPNFTFSYQKNPTISHIWPSRSYISGGRSISVSGVGFDLVQSVVMEVPG 1065

Human  1107 IGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLD 1171
            :|:  |.|..::||||.|.||.|.......|.|.:||..|.|..:..   |:..|.....|:...
Zfish  1066 VGQ--TNCSCVSSTLILCQSPAADQAQQTAVLFSLNGVQYRDAASAG---LEEGEQPHTQRYSFQ 1125

Human  1172 YLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKEQDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSV 1236
            |:.:|||.||.:||.|||||||||.|:|:|....|.|...||.|.||...|||...:.::.|||:
Zfish  1126 YVEDPQFYTANKEKLIKHHPGEPLILIINKGPSDLDLTLDEYSVTIGSDLCDITFHNQQLFHCSI 1190

Human  1237 NESLGAAVGQLPITIQVGNFNQTIATLQL-GGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRA 1300
            |.||.|:.|:||:|::||:|.:.||.:|: ||||.||:||||:|.|||||..|||.|:|||||||
Zfish  1191 NRSLSASTGELPVTVRVGHFQKVIAMVQMGGGSELAIVVSIVVCCVLLLLCTVALVVYCTKSRRA 1255

Human  1301 ERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSS 1365
            ||||||||:||||||||||:||||||||||||||||||||:|:|||||||||.|||||||||...
Zfish  1256 ERYWQKTLVQMEEMESQIRDEIRKGFAELQTDMTDLTKELSRTQGIPFLEYKQFVTRTFFPKMCC 1320

Human  1366 LYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHAL 1430
            .||.|.|.|....:..|.....||||||.:|:...|.|||:||||:|||:||||||||:.|||||
Zfish  1321 DYERRLVQPVYENDPLGPRAHSETHPLLQDWQPAGSVRPNLEEGITLFSTLLNNKHFLVTFVHAL 1385

Human  1431 EQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKMLT 1495
            |||:||||||||:|||||||||||||||||||||:||||||||||.|||||||||||||||||||
Zfish  1386 EQQRDFAVRDRCNLASLLTIALHGKLEYYTSIMKDLLVDLIDASATKNPKLMLRRTESVVEKMLT 1450

Human  1496 NWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNV 1560
            |||||||||.|:||||||||||||||||||||||||.:||||||||:|||||||||||||:|:.|
Zfish  1451 NWMSICMYSYLKETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDVLTGKARYTLNEEWLLRENIEAKPQNVMV 1515

Human  1561 SFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDD 1625
            ||||.||||:.||.|::||:.||||||||||.||:|||||||.|||:||||.....|.||:||||
Zfish  1516 SFQGLGMDSVCVRVMNSDTICQVKEKILEAFYKNLPYSQWPREEDVELEWFPEGRSSRILQDLDD 1580

Human  1626 TSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELAEPKKSH 1690
            :||:|||||||||:.||:||:||||||||.||::||||||||||||||.|||||.|||.|.:|:|
Zfish  1581 SSVMEDGRKKLNTVFHYQIPDGASLAMSLKDKRENTLGRVKDLDTEKYVHLVLPHDELMESRKTH 1645

Human  1691 RQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISD 1755
            |||.||||||||||||||||||||||||||||:||||:..:.||||:|||||||||||:||||:|
Zfish  1646 RQSQRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFQAILSVPAENPPLAIKYFFDFLEEQADKRGITD 1710

Human  1756 PDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTN 1820
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||:||||||||||||||||:||||||||||||
Zfish  1711 PDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIEKTDHMDACLSVIAQAFIDACSLSDLQLGKDSPTN 1775

Human  1821 KLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYR 1885
            |||||||||||:|.||.:|:|||::..|||||||.||||||||::|||||.:|:.|:||||||||
Zfish  1776 KLLYAKEIPEYKKRVQSFYRQIQELPALSEQEMNTHLAEESRKHRNEFNTTLALTEVYKYAKRYR 1840

Human  1886 PQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA 1925
            .|:.:||::||||||||||||||||:||:|||||||.|||
Zfish  1841 AQVASALDSNPTARRTQLQHKFEQVIALVEDNIYECSSEA 1880

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PLXND1NP_055918.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..23 1/1 (100%)
Sema_plexin_D1 49..547 CDD:200508 274/506 (54%)
PSI 549..601 CDD:396154 26/51 (51%)
TIG_plexin <627..700 CDD:465588 27/72 (38%)
PSI 711..753 CDD:214655 18/41 (44%)
IPT_plexin_repeat1 891..979 CDD:238585 47/89 (53%)
IPT_plexin_repeat2 981..1067 CDD:238584 35/87 (40%)
IPT_plexin_repeat3 1069..1174 CDD:238586 40/104 (38%)
Plexin_cytopl 1345..1883 CDD:462434 429/537 (80%)
plxnd1NP_991260.3 None

Return to query results.
Submit another query.