Protein Alignment PLXND1 and Plxnd1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_055918.3
• Gene: PLXND1 / 23129
• HGNCID: 9107
• Length: 1925
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001381981.2
• Gene: Plxnd1 / 312652
• RGDID: 1310796
• Length: 1925
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1927
• Identity: 1762/1927 - (91%)
• Similarity: 1825/1927 - (94%)
• Gaps: 4/1927 - (0%)

Human     1 MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCP--VPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTNNFA 63
            ||||||||||.|||||||.|.|.::..|||  :||.|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAPRAAGGAPPSARAAAAVPLPPRSHSRCPGLLPLPLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTNNFA 65

Human    64 LDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRLTDNYNKIL 128
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 LDGTAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEATVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRLTDNYNKIL 130

Human   129 QLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSMLNVAANHPNASTVG 193
            ||||||||||.|||||||.|||||||||||:||.||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 QLDPGQGLVVACGSIYQGLCQLRRRGNISALAVSFPPAAPTAEPVTVFPSMLNVAANHPNASTVG 195

Human   194 LVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIAIRSLDTRGDLAKLFTFDLN 258
            ||||||:|.||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:|||||.|||||||||||||
  Rat   196 LVLPPASGTGGSRLLVGATYTGYGSAFFPRNRSLEDHRFENTPEISIRSLDARGDLAKLFTFDLN 260

Human   259 PSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLALNSEARAGDKESQARSLLARICL 323
            ||||||||||||||||||||||.|||||:.||..|..|||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   261 PSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVRAFLHPAVPPHSAHPYAYLALNSEARAGDKDSQARSLLARICL 325

Human   324 PHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRGDLYSRLVSVFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPAAL 388
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||||||||:|.||.|||||
  Rat   326 PRGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRGDLYSRLVSVFPAREQFFAVFERPQGTPGARNAPAAL 390

Human   389 CAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLDSVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHP 453
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||
  Rat   391 CAFRFADVQAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLDSVVQGTGPACESKRNIQLQPEQLDCGAAHLQHP 455

Human   454 LSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVNNYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEP 518
            |:|||||:|:|||||||||:||||:.||||||||||..||||||:||||||||||||:|||||||
  Rat   456 LTILQPLRASPVFRAPGLTAVAVANANNYTAVFLGTATGRLLKISLNESMQVVSRRVLTVAYGEP 520

Human   519 VHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTN 583
            |||||||||.|.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.:|||.|
  Rat   521 VHHVMQFDPMDPGYLYLMTSHQMARVKVAACEVHSTCGDCVGAADAYCGWCTLETRCTFKQDCAN 585

Human   584 SSQQHFWTSASEGPSRCPAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVAR 648
            ||..|||||||||||||||||||||||||.::|.||||||||||||||||||||||||.:|||||
  Rat   586 SSLPHFWTSASEGPSRCPAMTVLPSEIDVHRDYTGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNGVRTVAR 650

Human   649 VPGPAFGHQIAYCNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTA 713
            |||||:||||||||||||.||||||..||||||||||||.|.|||.||||||||||..|||||||
  Rat   651 VPGPAYGHQIAYCNLLPRAQFPPFPAGQDHVTVEMSVRVKGHNIVSANFTIYDCSRIGQVYPHTA 715

Human   714 CTSCLSAQWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANT 778
            ||||||.||||.||.|.||||||||||:.|||||||||||:.:.||||||||||||:|||||...
  Rat   716 CTSCLSTQWPCSWCIQLHSCVSNQSRCQDSPNPTSPQDCPQIVPSPLAPVPTGGSQDILVPLTKA 780

Human   779 AFFQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMT 843
            |||.|.:|:|||||||.|||||.|:|:|||:|||||||:|||||||||:|||.|.||||||.|||
  Rat   781 AFFHGTSLQCSFGLEENFEAVWANDSLVRCNQVVLHTTQKSQVFPLSLKLKGPPDRFLDSPNPMT 845

Human   844 VMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIHAIEPLSGPLDGGTL 908
            |:||||||||||||||||||||||||:|:|||||||||||::||||||||.|||||||||:||||
  Rat   846 VVVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCVWNDGCRLRGPLQPLSGTCPAPEIRAIEPLSGPLNGGTL 910

Human   909 LTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVTVNASKEGKSR 973
            |||||:||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||..|.|||||.||||:||
  Rat   911 LTIRGKNLGRRLSDVAHGVWIGNVACEPLADRYTVSEEIVCATGPAPGAFSDVVTVNVSKEGRSR 975

Human   974 DRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCTELMRTDTSIACTMPE 1038
            ::||||||.||||||:||||||||||||||:||:|||.||||||||||||:|.||.|||.||:|.
  Rat   976 EQFSYVLPRVHSLEPSMGPKAGGTRITIHGSDLNVGSMLQVLVNDTDPCTDLTRTATSITCTVPR 1040

Human  1039 GALPAPVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVSMA 1103
            |.||:|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 GTLPSPVPVCVRFESRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPGRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVSMA 1105

Human  1104 VHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRF 1168
            |||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||  .|||||||.||||||||
  Rat  1106 VHHIGREPTFCKVLNSTLIICPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADE--AAEELLDPAEAQRGSRF 1168

Human  1169 RLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKEQDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIH 1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.:|||||||||||:|||:||
  Rat  1169 RLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKEQDSLGLESHEYHIKIGQVSCDIQIISDRVIH 1233

Human  1234 CSVNESLGAAVGQLPITIQVGNFNQTIATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSR 1298
            ||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1234 CSVNESLGTAEGQLPITIQVGNFNQTIATLQLGGSETAIVVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSR 1298

Human  1299 RAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKC 1363
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  Rat  1299 RAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKC 1363

Human  1364 SSLYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVH 1428
            ||||||||||||:||||||.|..||||||||||.|||.|||:|||||||||||||||||||||||
  Rat  1364 SSLYEERYVLPSKTLNSQGGSPPQETHPLLGEWNIPEHCRPSMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVH 1428

Human  1429 ALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKM 1493
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  Rat  1429 ALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKM 1493

Human  1494 LTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNL 1558
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  Rat  1494 LTNWMSICMYGCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLRENIEAKPRNL 1558

Human  1559 NVSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDL 1623
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  Rat  1559 NVSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYVLRDL 1623

Human  1624 DDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELAEPKK 1688
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  Rat  1624 DDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLTDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELVEPKK 1688

Human  1689 SHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGI 1753
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  Rat  1689 SHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGI 1753

Human  1754 SDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSP 1818
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  Rat  1754 SDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIEKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSP 1818

Human  1819 TNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKR 1883
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  Rat  1819 TNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKR 1883

Human  1884 YRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA 1925
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  Rat  1884 YRPQIMAALEANPTARRTQLQYKFEQVVALMENNIYECYSEA 1925

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
PLXND1	NP_055918.3	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..23		18/21 (86%)
		Sema_plexin_D1	49..547	CDD:200508	456/497 (92%)
		PSI	549..601	CDD:396154	44/51 (86%)
		TIG_plexin	<627..700	CDD:465588	63/72 (88%)
		PSI	711..753	CDD:214655	35/41 (85%)
		IPT_plexin_repeat1	891..979	CDD:238585	74/87 (85%)
		IPT_plexin_repeat2	981..1067	CDD:238584	71/85 (84%)
		IPT_plexin_repeat3	1069..1174	CDD:238586	97/104 (93%)
		Plexin_cytopl	1345..1883	CDD:462434	524/537 (98%)
Plxnd1	NP_001381981.2	Sema_plexin_D1	51..549	CDD:200508	456/497 (92%)
		PSI	551..603	CDD:396154	44/51 (86%)
		TIG_plexin	<629..702	CDD:465588	63/72 (88%)
		PSI	713..755	CDD:214655	35/41 (85%)
		IPT_plexin_repeat1	893..981	CDD:238585	74/87 (85%)
		IPT_plexin_repeat2	983..1069	CDD:238584	71/85 (84%)
		IPT_plexin_repeat3	1071..1174	CDD:238586	97/104 (93%)
		Plexin_cytopl	1345..1883	CDD:462434	524/537 (98%)