DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment POGZ and Pogz

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001397789.1 Gene:POGZ / 23126 HGNCID:18801 Length:1417 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_008759517.1 Gene:Pogz / 310658 RGDID:1309980 Length:1410 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1414 Identity:1319/1414 - (93%)
Similarity:1354/1414 - (95%) Gaps:8/1414 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     8 MADTDLFMECEEEELEPWQKISDVIEDSVVEDYNSVDKTTTVSVSQQPVSAPVPIAAHASVAGHL 72
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MADTDLFMECEEEELEPWQKISDVIEDSVVEDYNSVDKTTPVSVSQQPVSAPVPIAAHASVAGHL 65

Human    73 STSTTVSSSGAQNSDSTKKTLVTLIANNNAGNPLVQQGGQPLILTQNPAPGLGTMVTQPVLRPVQ 137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat    66 STSTTVSSSGAQNSDSTKKTLVTLIANNNAGNTLVQQGGQPLILTQNPTPGLGTMVTQPVLRPVQ 130

Human   138 VMQNANHVTSSPVASQPIFITTQGFPVRNVRPVQNAMNQVGIVLNVQQGQTVRPITLVPAPGTQF 202
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 VMQNANHVTSSPVASQPIFITTQGFPVRNVRPVQNAMNQVGIVLNVQQGQTVRPITLVPAPGTQF 195

Human   203 VKPTVGVPQVFSQMTPVRPGSTMPVRPTTNTFTTVIPATLTIRSTVPQSQSQQTKSTPSTSTTPT 267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   196 VKPTVGVPQVFSQMTPVRPGSTMPVRPTTNTFTTVIPATLTIRSTVPQSQSQQTKSTPSTSTTPI 260

Human   268 ATQPTSLGQLAVQSPGQSNQTTNPKLAPSFPSPPAVSIASFVTVKRPGVTGENSNEVAKLVNTLN 332
            |||||:|||||.|.|||.|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 ATQPTALGQLAGQPPGQPNQTSNPKLAPSFPSPPAVSIASFVTVKRPGVTGENSNEVAKLVNTLN 325

Human   333 TIPSLGQSPGPVVVSNNSSAHGSQRTSGPESSMKVTSSIPVFDLQDGGRKICPRCNAQFRVTEAL 397
            ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 TIPSLGQSPGPVVVSNNSSA---QRTSGPESSMKVTSSIPVFDLQDGGRKICPRCNAQFRVTEAL 387

Human   398 RGHMCYCCPEMVEYQKKGKSLDSEPSVPSAAKPPSPEKTAPVASTPSSTPIPALSPPTKVPEPNE 462
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||:|
  Rat   388 RGHMCYCCPEMVEYQKKGKSLDAEPSVPSAAKPASPEKTAPVTSTPSSTPIPALSPPTKVPEPSE 452

Human   463 NVGDAVQTKLIMLVDDFYYGRDGGKVAQLTNFPKVATSFRCPHCTKRLKNNIRFMNHMKHHVELD 527
            :.||.||||||||||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   453 SAGDTVQTKLIMLVDDFYYGRDGGKAAQLTSFPKVATSFRCPHCTKRLKNNIRFMNHMKHHVELD 517

Human   528 QQNGEVDGHTICQHCYRQFSTPFQLQCHLENVHSPYESTTKCKICEWAFESEPLFLQHMKDTHKP 592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   518 QQNGEVDGHTICQHCYRQFSTPFQLQCHLENVHSPYESTTKCKICEWAFESEPLFLQHMKDTHKP 582

Human   593 GEMPYVCQVCQYRSSLYSEVDVHFRMIHEDTRHLLCPYCLKVFKNGNAFQQHYMRHQKRNVYHCN 657
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   583 GEMPYVCQVCQYRSSLYSEVDVHFRMIHEDTRHLLCPYCLKVFKNGNAFQQHYMRHQKRNVYHCN 647

Human   658 KCRLQFLFAKDKIEHKLQHHKTFRKPKQLEGLKPGTKVTIRASRGQPRTVPVSSNDTPPSALQEA 722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||
  Rat   648 KCRLQFLFAKDKIEHKLQHHKTFRKPKQLEGLKPGTKVTIRASRGQPRTVPVSSNDAPSGALQEA 712

Human   723 APLTSSMDPLPVFLYPPVQRSIQKRAVRKMSVMGRQTCLECSFEIPDFPNHFPTYVHCSLCRYST 787
            |||||: |||||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   713 APLTSA-DPLPVFLYPPVQRNVQKRAVRKMSVMGRQTCLECSFEIPDFPNHFPTYVHCSLCRYST 776

Human   788 CCSRAYANHMINNHVPRKSPKYLALFKNSVSGIKLACTSCTFVTSVGDAMAKHLVFNPSHRSSSI 852
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||:|
  Rat   777 CCSRAYANHMINNHVPRKSPKYLALFKNFVSGIKLACTSCTFATSVGDAMAKHLVFNPSHRSSNI 841

Human   853 LPRGLTWIAHSRHGQTRDRVHDRNVKNMYPPPSFPTNKAATVKSAGATPAEPEELLTPLAPALPS 917
            |||||:|:::||.|||.:||.||::||.|.||....|||||||..|||.|||:||..|:..||||
  Rat   842 LPRGLSWMSYSRLGQTPERVLDRSMKNTYLPPPLLPNKAATVKPVGATSAEPQELAGPVLQALPS 906

Human   918 PASTATPPPTPTHPQALALPPLATEGAECLNVDDQDEGSPVTQEPELASG-GGGSGGVGKKEQLS 981
            ||||||||.||||||..|||||||||.|||||::|:||||||||||.||| |.|..|||||||||
  Rat   907 PASTATPPATPTHPQPSALPPLATEGTECLNVNEQEEGSPVTQEPEPASGAGSGGSGVGKKEQLS 971

Human   982 VKKLRVVLFALCCNTEQAAEHFRNPQRRIRRWLRRFQASQGENLEGKYLSFEAEEKLAEWVLTQR 1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   972 VKKLRVVLFALCCNTEQAAEHFRNPQRRIRRWLRRFQASQGENLEGKYLSFEAEEKLAEWVLIQR 1036

Human  1047 EQQLPVNEETLFQKATKIGRSLEGGFKISYEWAVRFMLRHHLTPHARRAVAHTLPKDVAENAGLF 1111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
  Rat  1037 EQQLPVNEETLFQKATKIGRSLEGGFKISYEWAVRFMLRHHLTPHARRAVAHTLPKHVAENAGLF 1101

Human  1112 IDFVQRQIHNQDLPLSMIVAIDEISLFLDTEVLSSDDRKENALQTVGTGEPWCDVVLAILADGTV 1176
            |:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1102 IEFVQRQIHNQDLPLSMIVAIDEISLFLDTEVLSSDDRKENALQTVGTGEPWCDVVLAILADGTV 1166

Human  1177 LPTLVFYRGQMDQPANMPDSILLEAKESGYSDDEIMELWSTRVWQKHTACQRSKGMLVMDCHRTH 1241
            ||||||:|||.::.||:|||||||||:|||||||||||||||||:||||||.||.||||||||||
  Rat  1167 LPTLVFFRGQANRLANVPDSILLEAKDSGYSDDEIMELWSTRVWKKHTACQHSKSMLVMDCHRTH 1231

Human  1242 LSEEVLAMLSASSTLPAVVPAGCSSKIQPLDVCIKRTVKNFLHKKWKEQAREMADTACDSDVLLQ 1306
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat  1232 LSEEVLALLSASSTLPAVVPAGCSSKIQPLDVCIKRTVKNFLHKKWKEQAREMADAACDSDVLLQ 1296

Human  1307 LVLVWLGEVLGVIGDCPELVQRSFLVASVLPGPDGNINSPTRNADMQEELIASLEEQLKLSGEHS 1371
            ||||||||||.||||.|:||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||:||.|
  Rat  1297 LVLVWLGEVLSVIGDSPDLVQRSFLVASVLPGPDGNVNSPTRNADMQEELIASLEEQLKLNGEQS 1361

Human  1372 E---SSTPRPRSSPEETIEPESLHQLFEGESETESFYGFEEADLDLMEI 1417
            |   :|.||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1362 EEHSASAPRPRSSPEETVEPESLHQLFEGESETESFYGFEEADLDLMEI 1410

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
POGZNP_001397789.1 PLN02983 278..469 CDD:215533 176/190 (93%)
C2H2 Zn finger 503..536 CDD:275371 32/32 (100%)
C2H2 Zn finger 539..560 CDD:275368 20/20 (100%)
C2H2 Zn finger 569..590 CDD:275368 20/20 (100%)
C2H2 Zn finger 599..620 CDD:275368 20/20 (100%)
C2H2 Zn finger 628..648 CDD:275368 19/19 (100%)
CENPB 1028..1089 CDD:197828 59/60 (98%)
DDE_3 1169..>1280 CDD:481203 99/110 (90%)
PogzXP_008759517.1 PHA03247 264..>458 CDD:223021 182/196 (93%)
C2H2 Zn finger 493..526 CDD:275371 32/32 (100%)
C2H2 Zn finger 529..550 CDD:275368 20/20 (100%)
C2H2 Zn finger 559..580 CDD:275368 20/20 (100%)
C2H2 Zn finger 589..610 CDD:275368 20/20 (100%)
C2H2 Zn finger 618..638 CDD:275368 19/19 (100%)
CENPB 1018..1079 CDD:197828 59/60 (98%)
DDE_3 1159..>1270 CDD:481203 99/110 (90%)

Return to query results.
Submit another query.