DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF1B and kif1b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001352880.1 Gene:KIF1B / 23095 HGNCID:16636 Length:1816 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_068072796.1 Gene:kif1b / 369190 ZFINID:ZDB-GENE-030820-1 Length:1927 Species:Danio rerio


Alignment Length:1934 Identity:1587/1934 - (82%)
Similarity:1699/1934 - (87%) Gaps:139/1934 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHTSPEDP 65
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||:|:||||||| ||:|||||||||||||:||
Zfish     1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETGKESKCIIQMQGNSTTILNPKNPKE-PKTFSFDYSYWSHTSPDDP 64

Human    66 CFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIPQLCEELFEKI 130
            .|||||:||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Zfish    65 SFASQNQVYNDIGKEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEEGQEGIIPQLCEELFEKI 129

Human   131 NDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYTDIADL 195
            |||.|||:||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   130 NDNNNEEISYSVEVAYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYTDIADL 194

Human   196 MDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|:||:|||||||||||||||||||||||||
Zfish   195 MDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRKYDSETDLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 259

Human   261 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRT 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   260 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRT 324

Human   326 AMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGD 390
            ||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||:|||||||||
Zfish   325 AMVAALSPADINFDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNAKLVRELKDEVSRLKELLRAQGLGD 389

Human   391 IIDIDPLIDDYSGSGSKYLKDFQNNKHRYLLASENQRPGHFSTASMGSLTSSPSSCSLSSQVGLT 455
            |:||:|:.||..|||||||||..|||||||||||||||||||||.||.||:||||.||.||.||.
Zfish   390 ILDIEPMGDDCLGSGSKYLKDIHNNKHRYLLASENQRPGHFSTAPMGCLTASPSSGSLCSQAGLQ 454

Human   456 SVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDG 520
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   455 SVSSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDG 519

Human   521 GTL------------------------------------------GVFSPKKTPHLVNLNEDPLM 543
            |||                                          ||||||||||||||||||||
Zfish   520 GTLGVFSPKKFGPDRPTSLSIEDFSVYSSNQLFVERPCEVYTDFNGVFSPKKTPHLVNLNEDPLM 584

Human   544 SECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVN 608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.:|.|||||||||.||||||
Zfish   585 SECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERNANGHVIVTLEPCEGSETYVN 649

Human   609 GKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGID 673
            ||||:..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Zfish   650 GKRVNSAVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPVEPVDWTFAQRELLEKQGID 714

Human   674 MKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVETRSLAAET---TEEEEEEE 735
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||||   .||||||:
Zfish   715 MKQEMEKRLTEMEILYKKEKEEADQLLEQQRLVYESKLQELQKQVETRSLAAETPDEEEEEEEED 779

Human   736 EVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYS 800
            |||||||::||||||||||:.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   780 EVPWTQHKYELAQWAFRKWRYHQFTSLRDQLWGNAVYLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYS 844

Human   801 PLPPELLPTEMEKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYWSLEKLKQRLDLMREMYDRAGEMASS 865
            ||||||||.|.||..:.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Zfish   845 PLPPELLPPEPEKERDARPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYWSLEKLKQRLDQMREMYDRAGEMASS 909

Human   866 AQ-DESETTVTGSDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCVNERLADRTPSPTFSTADSDITELADEQQD 929
            .| |:.|..:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:|||||||:|.
Zfish   910 NQGDDGEGALTGSDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCVNERLADRTPSPTFSTTDSEITELADERQS 974

Human   930 EMEDF-DDEAFVDDAGSDAGTEEGSDLFSDGHDPFYDRSPWFILVGRAFVYLSNLLYPVPLIHRV 993
            ||||| ||||||||..||||||||||:||||.|||||||||||||||||||||||||||||:|||
Zfish   975 EMEDFMDDEAFVDDTSSDAGTEEGSDIFSDGQDPFYDRSPWFILVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRV 1039

Human   994 AIVSEKGEVRGFLRVAVQAIAADEEAPDYGSGIRQSGTAKISFDNEYFNQSDFSSVAMTRSGLSL 1058
            |:|:|||:|||||||.||||||||||||||||:|||||||||||||||.::||:|||||||||||
Zfish  1040 AVVTEKGDVRGFLRVGVQAIAADEEAPDYGSGVRQSGTAKISFDNEYFKKNDFTSVAMTRSGLSL 1104

Human  1059 EELRIVEGQGQSSEVITPPEEISRINDLDLKSSTLLDGKMVMEGFSEEIGNHLKLGSAFTFRVTV 1123
            ||||||||||||||||||.||::|||::|||... :|.|:     .:.:..||::||.|||||||
Zfish  1105 EELRIVEGQGQSSEVITPSEEMNRINEMDLKLGN-VDTKL-----GDGLAEHLEVGSIFTFRVTV 1163

Human  1124 LQASGILPEYADIFCQFNFLHRHDEAFSTEPLKNNGRGSPLAFYHVQNIAVEITESFVDYIKTKP 1188
            ||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||:||.|||||||:||:||||::||||||
Zfish  1164 LQASGIPAEYADIFCQFNFLHRHDEAFSTEPLKNTGRGAPLGFYHVQNISVEVTESFIEYIKTKP 1228

Human  1189 IVFEVFGHYQQHPLHLQGQELNSPPQPCRRFFPPPMPLSKP------------------------ 1229
            |||||||||||||||:.||::.||.||.|:::|||||||||                        
Zfish  1229 IVFEVFGHYQQHPLHIHGQDVVSPSQPSRKYYPPPMPLSKPDHARKIELIRYLMSGYVHGQVLDT 1293

Human  1230 -------------------------------------------VPATKLNTMSKTSLGQSMSKYD 1251
                                                       ||||||||::|::|||.:||||
Zfish  1294 LSEHANALASTAVASLEEGAYELCHFPFLPIPNCPVFRVPRHDVPATKLNTITKSNLGQCVSKYD 1358

Human  1252 LLVWFEISELEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIHEKGSELHWKDVRELVV 1316
            ||.|||||||||||||||||||||.||||.||:|||||||||||||:||||||||||||||||||
Zfish  1359 LLAWFEISELEPTGEYIPAVVDHTGGLPCHGTYLLHQGIQRRITVTLIHEKGSELHWKDVRELVV 1423

Human  1317 GRIRNKPEVDEAAVDAILSLNIISAKYLKSSHNS---------SRTFYRFEAVWDSSLHNSLLLN 1372
            ||||||||||::|.||:|||||||||.|||||||         ||||||||||||||||||||||
Zfish  1424 GRIRNKPEVDDSAADAVLSLNIISAKNLKSSHNSSSLCIDSDISRTFYRFEAVWDSSLHNSLLLN 1488

Human  1373 RVTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSLRSLFGSGYSKSPDSNR 1437
            ||||||||||||||||||||||||||:||||:||||||||||||||||||:||||||||:||.|:
Zfish  1489 RVTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAIITKDICMVFYSRDAKISPPRSLRNLFGSGYSKTPDCNK 1553

Human  1438 VTGIYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLAGWRPRGDSLILEHQWELEKLELL 1502
            |||:|||||||::|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|.|
Zfish  1554 VTGVYELSLCKIADTGSPGMQRRRRKVLDTSVAYVRGEENLAGWRPRGDSLILEHQWELDKMEQL 1618

Human  1503 HEVEKTRHFLLLRERLGDS-IPKSLSDSLSPSLSSGTLSTSTSISSQISTTTFESAITPSESSGY 1566
            ||||||||.|||||:||:: .|||||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
Zfish  1619 HEVEKTRHLLLLREKLGETPPPKSLSESLSPSLSSGTLSTSTSISSQISSTTFESAITPSESSGY 1683

Human  1567 DSGDIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVHGSVSDCKLSDISPIGRDPSESSFSSATLTP 1631
            ||.|||||||||||||||||:|||||||.|::|:..|:||||.|||||:|||||.||||||||||
Zfish  1684 DSTDIESLVDREKELATKCLRLLTHTFNSEYNQMCNSISDCKFSDISPMGRDPSVSSFSSATLTP 1748

Human  1632 SSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSRASSPC-PEFEQFQIVPAVETPYLARAGKNEFLNLVPDIEE 1695
            |||||||.|||       ||||||||:||. .::|.|.:||.:||.|||||||:|||||||:|||
Zfish  1749 SSTCPSLSDSR-------TPEANSRATSPSGSDYENFPMVPILETSYLARAGKHEFLNLVPNIEE 1806

Human  1696 IRPSSVVSKKGYLHFKEPLYSNWAKHFVVVRRPYVFIYNSDKDPVERGIINLSTAQVEYSEDQQA 1760
            :||.|||||||.|:|.||..:.|.|||||||||||||||:||||||||::|||||||||||||||
Zfish  1807 MRPGSVVSKKGILNFMEPRSNTWVKHFVVVRRPYVFIYNNDKDPVERGVLNLSTAQVEYSEDQQA 1871

Human  1761 MVKTPNTFAVCTKHRGVLLQALNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRR 1809
            |:|||:|||:||||||:||||.||||||||||||||||||||||||:||
Zfish  1872 MLKTPHTFAMCTKHRGILLQANNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKLARR 1920

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF1BNP_001352880.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..361 CDD:276816 337/356 (95%)
Interaction with KIFBP. /evidence=ECO:0000269|PubMed:16225668 270..350 78/79 (99%)
Kinesin_assoc 358..555 CDD:465047 177/238 (74%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 431..450 14/18 (78%)
FHA_KIF1B 530..639 CDD:438779 100/108 (93%)
GimC 662..>719 CDD:440992 52/56 (93%)
KIF1B 845..892 CDD:463574 39/47 (83%)
KIF1B <956..975 CDD:463574 17/18 (94%)
DUF3694 1266..1413 CDD:463599 135/155 (87%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1550..1570 18/19 (95%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1617..1660 32/42 (76%)
PH_KIFIA_KIFIB 1697..1799 CDD:269939 84/101 (83%)
kif1bXP_068072796.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..360 CDD:276816 337/356 (95%)
Kinesin_assoc 357..596 CDD:465047 177/238 (74%)
FHA_KIF1B 571..680 CDD:438779 100/108 (93%)
GBP_C <680..754 CDD:293879 69/73 (95%)
KIF1B 889..937 CDD:463574 39/47 (83%)
KIF1B <999..1021 CDD:463574 19/21 (90%)
DUF3694 1373..1529 CDD:463599 135/155 (87%)
PH_KIFIA_KIFIB 1808..1910 CDD:269939 84/101 (83%)

Return to query results.
Submit another query.