DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF1B and Kif1b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001352880.1 Gene:KIF1B / 23095 HGNCID:16636 Length:1816 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038965095.1 Gene:Kif1b / 117548 RGDID:621520 Length:1825 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1825 Identity:1758/1825 - (96%)
Similarity:1793/1825 - (98%) Gaps:9/1825 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHTSPEDP 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHTSPEDP 65

Human    66 CFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIPQLCEELFEKI 130
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 CFASQSRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIPQLCEELFEKI 130

Human   131 NDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYTDIADL 195
            ||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 NDNCNEDMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYTDIADL 195

Human   196 MDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 MDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKQDPETNLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGA 260

Human   261 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRT 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 KGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRT 325

Human   326 AMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGD 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 AMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGD 390

Human   391 IIDIDPLIDDYSGSGSKYLKDFQNNKHRYLLASENQRPGHFSTASMGSLTSSPSSCSLSSQVGLT 455
            |||||||:|||||||.|||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||:||.|||
  Rat   391 IIDIDPLMDDYSGSGGKYLKDFQNNKHRYLLASENQRPGNFSTASMGSLTSSPSSCSLNSQAGLT 455

Human   456 SVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDG 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 SVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDG 520

Human   521 GTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRS 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 GTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRS 585

Human   586 ERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSA 650
            ||:|:||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 ERNNTGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVAHPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSA 650

Human   651 ETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQ 715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 ETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKREKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQ 715

Human   716 KQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAIS 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 KQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAIS 780

Human   781 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPELLPTEMEKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYWSLEKL 845
            |||||||||||||||||||||:|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   781 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPVPPELLPTEMGKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYWSLDKL 845

Human   846 KQRLDLMREMYDRAGEMASSAQDESETTVTGSDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCVNERLADRTPS 910
            ||||||||||||||||:.|:|||:||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 KQRLDLMREMYDRAGEVGSNAQDDSETTMTGSDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCVNERLADRTPS 910

Human   911 PTFSTADSDITELADEQQDEMEDFDDEAFVDDAGSDAGTEEGSDLFSDGHDPFYDRSPWFILVGR 975
            |||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat   911 PTFSTADSDITELADEQQDAMEDFDDEAFVDDTGSDAGTEEGSELFSDGHDPFYDRSPWFILVGR 975

Human   976 AFVYLSNLLYPVPLIHRVAIVSEKGEVRGFLRVAVQAIAADEEAPDYGSGIRQSGTAKISFDNEY 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 AFVYLSNLLYPVPLIHRVAIVSEKGEVRGFLRVAVQAIAADEEAPDYGSGIRQSGTAKISFDNEY 1040

Human  1041 FNQSDFSSVAMTRSGLSLEELRIVEGQGQSSEVITPPEEISRINDLDLKSSTLLDGKMVMEGFSE 1105
            ||||||.|.|||||||||||||||||||||||||:||||::|:|||||||.||||||||||||||
  Rat  1041 FNQSDFPSAAMTRSGLSLEELRIVEGQGQSSEVISPPEEVNRMNDLDLKSGTLLDGKMVMEGFSE 1105

Human  1106 EIGNHLKLGSAFTFRVTVLQASGILPEYADIFCQFNFLHRHDEAFSTEPLKNNGRGSPLAFYHVQ 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat  1106 EIGNHLKLGSAFTFRVTVLQASGILPEYADIFCQFNFLHRHDEAFSTEPLKNNGRGSPLGFYHVQ 1170

Human  1171 NIAVEITESFVDYIKTKPIVFEVFGHYQQHPLHLQGQELNSPPQPCRRFFPPPMPLSKPVPATKL 1235
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||||||
  Rat  1171 NIAVEVTESFVDYIKTKPIVFEVFGHYQQHPLHLQGQELNSPPQPSRRFFPPPMPLSRPVPATKL 1235

Human  1236 NTMSKTSLGQSMSKYDLLVWFEISELEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIH 1300
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1236 NTMNKTSLGQSMSKYDLLVWFEISELEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIH 1300

Human  1301 EKGSELHWKDVRELVVGRIRNKPEVDEAAVDAILSLNIISAKYLKSSHNSS---------RTFYR 1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||:||         |||||
  Rat  1301 EKGSELHWKDVRELVVGRIRNKPEVDEAAVDAILSLNIISAKSLKSSHSSSRLFLDKDIPRTFYR 1365

Human  1357 FEAVWDSSLHNSLLLNRVTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSL 1421
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1366 FEAVWDSSLHNSLLLNRVTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSL 1430

Human  1422 RSLFGSGYSKSPDSNRVTGIYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLAGWRPRGD 1486
            |:||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat  1431 RNLFGSGYSKSPDSNRVTGIYELSLCKMADTGSPGMQRRRRKVLDTSVAYVRGEENLAGWRPRGD 1495

Human  1487 SLILEHQWELEKLELLHEVEKTRHFLLLRERLGDSIPKSLSDSLSPSLSSGTLSTSTSISSQIST 1551
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1496 SLILEHQWELEKLELLHEVEKTRHFLLLRERLGDSIPKSMSDSLSPSLSSGTLSTSTSISSQIST 1560

Human  1552 TTFESAITPSESSGYDSGDIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVHGSVSDCKLSDISPIG 1616
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat  1561 TTFESAITPSESSGYDSADIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVHGSISDCKLSDISPIG 1625

Human  1617 RDPSESSFSSATLTPSSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSRASSPCPEFEQFQIVPAVETPYLARA 1681
            ||||.|||||:||||||||||||||||:|:|||||||||||||||.|||||||:|.|||||||||
  Rat  1626 RDPSVSSFSSSTLTPSSTCPSLVDSRSSSMDQKTPEANSRASSPCQEFEQFQIIPTVETPYLARA 1690

Human  1682 GKNEFLNLVPDIEEIRPSSVVSKKGYLHFKEPLYSNWAKHFVVVRRPYVFIYNSDKDPVERGIIN 1746
            ||||||||||||||:|..|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1691 GKNEFLNLVPDIEEVRAGSVVSKKGYLHFKEPLSSNWAKHFVVVRRPYVFIYNSDKDPVERGIIN 1755

Human  1747 LSTAQVEYSEDQQAMVKTPNTFAVCTKHRGVLLQALNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRCP 1811
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1756 LSTAQVEYSEDQQAMLKTPNTFAVCTKHRGVLLQALNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRCP 1820

Human  1812 SQSKY 1816
            ||.||
  Rat  1821 SQPKY 1825

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF1BNP_001352880.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..361 CDD:276816 352/356 (99%)
Interaction with KIFBP. /evidence=ECO:0000269|PubMed:16225668 270..350 79/79 (100%)
Kinesin_assoc 358..555 CDD:465047 191/196 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 431..450 18/18 (100%)
FHA_KIF1B 530..639 CDD:438779 104/108 (96%)
GimC 662..>719 CDD:440992 55/56 (98%)
KIF1B 845..892 CDD:463574 41/46 (89%)
KIF1B <956..975 CDD:463574 18/18 (100%)
DUF3694 1266..1413 CDD:463599 144/155 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1550..1570 19/19 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1617..1660 38/42 (90%)
PH_KIFIA_KIFIB 1697..1799 CDD:269939 97/101 (96%)
Kif1bXP_038965095.1 KISc_KIF1A_KIF1B 4..361 CDD:276816 352/356 (99%)
Kinesin_assoc 358..555 CDD:465047 191/196 (97%)
FHA_KIF1B 530..639 CDD:438779 104/108 (96%)
GimC 662..>719 CDD:440992 55/56 (98%)
KIF1B 845..892 CDD:463574 41/46 (89%)
KIF1B <956..975 CDD:463574 18/18 (100%)
DUF3694 1266..1422 CDD:463599 144/155 (93%)
PH_KIFIA_KIFIB 1710..1808 CDD:269939 95/97 (98%)

Return to query results.
Submit another query.