DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ARHGAP26 and Arhgap26

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047272926.1 Gene:ARHGAP26 / 23092 HGNCID:17073 Length:816 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_036017177.1 Gene:Arhgap26 / 71302 MGIID:1918552 Length:823 Species:Mus musculus


Alignment Length:739 Identity:710/739 - (96%)
Similarity:724/739 - (97%) Gaps:1/739 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    52 NLSSAKRKFADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPL 116
            :|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Mouse    61 DLSSAKRKFADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFAAVLRNLEDERSRMIENASEVLITPL 125

Human   117 EKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEY 181
            |||||||||||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   126 EKFRKEQIGAAREAKKKYDKETEKYCGTLEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEY 190

Human   182 VFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEV 246
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   191 VFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEV 255

Human   247 ESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKG 311
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   256 ESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKG 320

Human   312 GEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKD 376
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   321 GEDESVTLKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNRD 385

Human   377 SQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDIC 441
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Mouse   386 SQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKAASETETDIC 450

Human   442 AEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQL 506
            |||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
Mouse   451 AEWEIKTVTSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQETRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQL 515

Human   507 LMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTV 571
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   516 LMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTV 580

Human   572 PDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILN 636
            ||:|||||||||||||||||||||||:|||||||.|.|||||||||||||||||||||:.|||||
Mouse   581 PDVPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSKRPLTLFHAVPSTEKQEQRNSIINSSLESVSSSANSILN 645

Human   637 SSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRPNSLPPNPSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPVRS 701
            ||||||||:||||.:|.||||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Mouse   646 SSSSLQPNLNSSDSNLDVVKPSRPSSLPPNPSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPIRS 710

Human   702 VAGFVWFSVAAVVLSLARSSLHAVFSLLVNFVPCHPNLHLLFDRPEEAVHEDSSTPFRKAKALYA 766
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse   711 VAGFVWFSVAAVVLSLAWSSLHAVFSLLVNFVPCHPNLHLLFDRPEEAVREDSSTPFRKAKALYA 775

Human   767 CKAEHDSELSFTAGTVFDNAECPS 790
            |:|||||||||||||||||.. ||
Mouse   776 CQAEHDSELSFTAGTVFDNVH-PS 798

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ARHGAP26XP_047272926.1 BAR_GRAF 19..225 CDD:153320 167/172 (97%)
BAR-PH_GRAF_family 267..371 CDD:269953 102/103 (99%)
RhoGAP_Graf 364..563 CDD:239839 194/198 (98%)
SH3 759..>790 CDD:473055 26/30 (87%)
Arhgap26XP_036017177.1 BAR 61..234 CDD:472257 167/172 (97%)
BAR-PH_GRAF_family 276..380 CDD:269953 102/103 (99%)
RhoGAP_Graf 373..572 CDD:239839 194/198 (98%)
SH3_GRAF 768..823 CDD:212997 28/32 (88%)

Return to query results.
Submit another query.