DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ARHGAP26 and Arhgap26

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047272926.1 Gene:ARHGAP26 / 23092 HGNCID:17073 Length:816 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006254722.1 Gene:Arhgap26 / 307459 RGDID:1310923 Length:814 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:790 Identity:769/790 - (97%)
Similarity:775/790 - (98%) Gaps:1/790 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKFADSLN 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKFADSLN 65

Human    66 EFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEA 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||:||
  Rat    66 EFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERSRMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAREA 130

Human   131 KKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFE 195
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 KKKYDKETEKYCGTLEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFE 195

Human   196 FVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEH 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 FVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEH 260

Human   261 KTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRR 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat   261 KTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVTLKSCTRR 325

Human   326 KTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGF 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 KTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGF 390

Human   391 SIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKT 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||:||||||
  Rat   391 SIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKAASETETDICAEWEIKTVTSALKT 455

Human   456 YLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQ 520
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 YLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQETRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQ 520

Human   521 NLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSR 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   521 NLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDVPLTNAQLHLSR 585

Human   586 KKSSDSKPPSCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDP 650
            ||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||:.|||||||||||||||.|||
  Rat   586 KKSSDSKPPSCSERPLTLFHAVPSTEKQEQRNSIINSSLESVSSSANSILNSSSSLQPNMNFSDP 650

Human   651 DLAVVKPTRPNSLPPNPSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPVRSVAGFVWFSVAAVVL 715
            .|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat   651 SLDVVKPTRPNSLPPNPSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPIRSVAGFVWFSVAAVVL 715

Human   716 SLARSSLHAVFSLLVNFVPCHPNLHLLFDRPEEAVHEDSSTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAG 780
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 SLAWSSLHAVFSLLVNFVPCHPNLHLLFDRPEEVVHEDSSTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAG 780

Human   781 TVFDNAECPS 790
            |||||.. ||
  Rat   781 TVFDNVH-PS 789

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ARHGAP26XP_047272926.1 BAR_GRAF 19..225 CDD:153320 202/205 (99%)
BAR-PH_GRAF_family 267..371 CDD:269953 102/103 (99%)
RhoGAP_Graf 364..563 CDD:239839 195/198 (98%)
SH3 759..>790 CDD:473055 27/30 (90%)
Arhgap26XP_006254722.1 BAR_GRAF 19..225 CDD:153320 202/205 (99%)
BAR-PH_GRAF_family 267..371 CDD:269953 102/103 (99%)
RhoGAP_Graf 364..563 CDD:239839 195/198 (98%)
SH3_GRAF 759..814 CDD:212997 29/32 (91%)

Return to query results.
Submit another query.