DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment HECW1 and Hecw1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_016867371.1 Gene:HECW1 / 23072 HGNCID:22195 Length:1639 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017455974.1 Gene:Hecw1 / 291209 RGDID:1561038 Length:1603 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1607 Identity:1413/1607 - (87%)
Similarity:1474/1607 - (91%) Gaps:17/1607 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    39 AITNLYQNRFLGLAAMASPSRNSQSRRRCKEPLRYSYNPDQFHNMDLRGGPHDGVTIPRSTSDTD 103
            |..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|.|.|||:||||||||||
  Rat     8 AAKNLYQNRFLGLAAMASPSRNSQSRRRCKEPLRYSYNPDQFHNIDIRNGAHDGITIPRSTSDTD 72

Human   104 LVTSDSRSTLMVSSSYYSIGHSQDLVIHWDIKEEVDAGDWIGMYLIDEVLSENFLDYKNRGVNGS 168
            ||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
  Rat    73 LVTSDSRSTLMVSSSYYSIGYSQDLVIHWDIKEEVDAGDWIGMYLIGEVSSENFLDYKNRGVNGS 137

Human   169 HRGQIIWKIDASSYFVEPETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTVKNSAAPIFKSIGADETVQGQGS 233
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||::||||.||:
  Rat   138 HRGQIIWKIDASSYFVESETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTVKNSAAPIFKGIGSEETVQSQGN 202

Human   234 RRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLKISIQPGKHSIFPALPHHGQERRSKIIGNTVNPIWQA 298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
  Rat   203 RRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLKISIQPGKHSIFPALPHHGQERRSTIIGNTVNPIWQA 267

Human   299 EQFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKSRPIIKRFLGKLSMPVQRLLERHAIGDRVVSYTLGRRLPTDH 363
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   268 EHFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKSRPIIKRFLGKLSMPVQRLLERHAIGDRVVSYTLGRRLPTDH 332

Human   364 VSGQLQFRFEITSSIHPADDEEISLSTEPESAQIQDSPMNNLMESGSGEPRSEAPESSESWKPEQ 428
            |||.|||||||||||| ||||||||:.|||||::|||.||:::|:.||||..:|.|..:..|||.
  Rat   333 VSGHLQFRFEITSSIH-ADDEEISLNAEPESAEVQDSVMNSVVENSSGEPPGDAAEFLKDLKPEA 396

Human   429 LGEGSVPDGPGNQSIELSRPAEEAAVITEAGDQGMVSVGPEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAE 493
            ..|.....|..|::.|.:||.||||...|..|....|.|||..|||....|.|.||..||||:||
  Rat   397 PSEEDGVRGSENENREHARPVEEAAGAMETRDDSKFSEGPEEVGELQDPEQHDTQPTLSAEEVAE 461

Human   494 QLDLGEEASALLLEDGEAPASTKEEPLEEEATTQSRAGREEEE---KEQEEEGDVSTLEQGEGRL 555
            :|.|||.....||.:......:|   .||||..::.||.||.:   |::|||..||.|||||..|
  Rat   462 RLPLGEGCPPSLLPEESTALGSK---AEEEAIPENGAGEEEMQEKGKDEEEEEGVSALEQGEPGL 523

Human   556 QLRASVKRKSRPCSLPVSELETVIASACGDPETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQGGSAAEEEDGAEE 620
            :|||||::|||||||||||||||||||||:.|||||||||||||||||||||.||..||||..||
  Rat   524 ELRASVRKKSRPCSLPVSELETVIASACGEAETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQRGSTTEEEDAMEE 588

Human   621 ESTLKDSSEKDGLSEVDTVAADPSALEEDREEPEGATPGTAHPGHSGGHFPSLAN--GAAQDGDT 683
            |||||:||||||||||||:||||.::|:.  |..|||...|....|||||.:|:.  ||.|||:.
  Rat   589 ESTLKESSEKDGLSEVDTIAADPQSMEDG--ENNGATLCMASSDCSGGHFSNLSKSIGAGQDGEA 651

Human   684 HPSTGSESDSSPRQGGDHSCEGCDASCCSPSCYSSSCYSTSCYSSSCYSASCYSPSCYNG-NRFA 747
            ||||||||||||:||.||||||||||||||     ||||||||||||||:||||.||||| ||||
  Rat   652 HPSTGSESDSSPQQGADHSCEGCDASCCSP-----SCYSTSCYSSSCYSSSCYSSSCYNGNNRFA 711

Human   748 SHTRFSSVDSAKISESTVFSSQDDEEEENSAFESVPDSMQSPELDPESTNGAGPWQDELAAPSGH 812
            ||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||.|:
  Rat   712 SHTRFSSVDSAKISESTVFSSQEDEEEENSAFESVPDSVQSPELDPESTNGAGPWQDELAAPGGN 776

Human   813 VERSPEGLESPVAGPSNRREGECPILHNSQPVSQLPSLRPEHHHYPTIDEPLPPNWEARIDSHGR 877
            ..|:.|||:||:|||||||||:||:||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   777 AARTTEGLDSPMAGPSNRREGDCPMLHNSQPISQLPSLRPEHHHYPTIDEPLPPNWEARIDSHGR 841

Human   878 VFYVDHVNRTTTWQRPTAAATPDGMRRSGSIQQMEQLNRRYQNIQRTIATERSEEDSGSQSCEQA 942
            ||||||||||||||||:.|.|||||.||||:.||||||||||||||||||||||||||:|||||.
  Rat   842 VFYVDHVNRTTTWQRPSMAPTPDGMIRSGSVHQMEQLNRRYQNIQRTIATERSEEDSGNQSCEQI 906

Human   943 PAGGGGGGGSDSEAESSQSSLDLRREGSLSPVNSQKITLLLQSPAVKFITNPEFFTVLHANYSAY 1007
            |.||.||||||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   907 PDGGAGGGGSDSEAESSQSNLDLRREGSLSPVNSQKVTLLLQSPAVKFITNPEFFTVLHANYSAY 971

Human  1008 RVFTSSTCLKHMILKVRRDARNFERYQHNRDLVNFINMFADTRLELPRGWEIKTDQQGKSFFVDH 1072
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   972 RVFTSSTCLKHMILKVRRDARNFERYQHNRDLVNFINMFADTRLELPRGWEIKTDHQGKSFFVDH 1036

Human  1073 NSRATTFIDPRIPLQNGRLPNHLTHRQHLQRLRSYSAGEASEVSRNRGASLLARPGHSLVAAIRS 1137
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat  1037 NSRATTFIDPRIPLQNGRLPNHLTHRQHLQRLRSYSAGEASEVSRNRGASLLARPGHSLIAAIRS 1101

Human  1138 QHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLREKIHYIRTEGNHGLEKLSCDADL 1202
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1102 QHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLREKIHYIRTEGNHGLEKLSCDADL 1166

Human  1203 VILLSLFEEEIMSYVPLQAAFHPGYSFSPRCSPCSSPQNSPGLQRASARAPSPYRRDFEAKLRNF 1267
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1167 VILLSLFEEEIMSYVPLQSAFHPGYSFSPRCSPCSSPQNSPGLQRASARAPSPYRRDFEAKLRNF 1231

Human  1268 YRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREF 1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat  1232 YRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLYITFVGEEGLDYSGPSREF 1296

Human  1333 FFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVENHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTR 1397
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1297 FFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVENYLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTR 1361

Human  1398 PFYKALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANT 1462
            ||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1362 PFYKGLLKLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANT 1426

Human  1463 QVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLND 1527
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1427 QVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLND 1491

Human  1528 WRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCI 1592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1492 WRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCI 1556

Human  1593 EKWGKITSLPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE 1639
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat  1557 EKWGKITSLPRAHTCFNRLDLPPYPSYSTLYEKLLTAVEETSTFGLE 1603

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
HECW1XP_016867371.1 None
Hecw1XP_017455974.1 HECW_N 66..185 CDD:293170 114/118 (97%)
C2_NEDL1-like 206..342 CDD:176073 132/135 (98%)
WW 827..857 CDD:197736 29/29 (100%)
WW 1017..1048 CDD:197736 29/30 (97%)
HECTc 1247..1601 CDD:238033 348/353 (99%)
HECTc 1271..1600 CDD:214523 323/328 (98%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83691687
Domainoid 1 1.000 703 1.000 Domainoid score I3546
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5021
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H9004
Inparanoid 1 1.050 2822 1.000 Inparanoid score I612
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG47150
OrthoDB 1 1.010 - - D117748at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000080
OrthoInspector 1 1.000 - - oto129102
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_105324
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR11254
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1661
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.