DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment EMC1 and emc1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001362749.1 Gene:EMC1 / 23065 HGNCID:28957 Length:996 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_021329317.2 Gene:emc1 / 565399 ZFINID:ZDB-GENE-060810-98 Length:964 Species:Danio rerio


Alignment Length:992 Identity:664/992 - (66%)
Similarity:796/992 - (80%) Gaps:37/992 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     8 RFWLWATLLIPAAAVYEDQVGKFDWRQQYVGKVKFASLE-FSPGSKKLVVATEKNVIAALNSRTG 71
            |..:..:||..|:||:|||||||||||||:|||:||..: .|..||||:|||:|||.|:||||||
Zfish     7 RLAISVSLLYTASAVFEDQVGKFDWRQQYIGKVRFALFDTHSQASKKLLVATDKNVFASLNSRTG 71

Human    72 EILWRHVDKGTAEGAVDAMLLHGQDVITVSNGGRIMRSWETNIGGLNWEITLDSGSFQALGLVGL 136
            ::.||||||...||.:||:|:||||.:.|...||::|||||.:|||.||..||||||||..|||:
Zfish    72 DLFWRHVDKTGPEGHIDALLMHGQDAVVVVGNGRLLRSWETTVGGLKWETVLDSGSFQAAALVGV 136

Human   137 QESVRYIAVLKKTTLALHHLSSGHLKWVEHLPESDSIHYQMVYSYGSGVVWALGVVPFSHVNIVK 201
            |:.|:|:|||||:|:|||.||||...|||:||:||::.||.:||.|:|:|:.|||:|.||:.||:
Zfish   137 QDYVKYVAVLKKSTIALHDLSSGSQTWVENLPDSDTVQYQTIYSGGNGLVFVLGVLPNSHIVIVE 201

Human   202 FNVEDGEIVQQVRVSTPWLQHLSGACGVVDEAVLVCPDPSSRSLQTLALET--EWELRQIPLQSL 264
            :.:|||||:.:..|...|:..|..:|.||...:|:|.|..::||.|..|.:  :.|:|||.||:|
Zfish   202 YKIEDGEIMNKKSVEAAWMSSLESSCVVVSSGILMCVDQITQSLYTQPLHSAEQTEMRQIHLQTL 266

Human   265 DLEFGSGFQPRVLPTQPNPVDASRAQFFLHLSPSHYALLQYHYGTLSLLKNFPQTALVSFATTGE 329
            |||..|||||.:..|||:|.....|:|.|.|||.|:.|||...|.::.|::|..:.|.:|||:||
Zfish   267 DLEVASGFQPVLTSTQPSPAHPPLAEFILQLSPEHHILLQLKDGLIAPLRDFSPSYLAAFATSGE 331

Human   330 KTVAAVMACRNEVQKSSSSEDGSMGSFSEKSSSKDSLACFNQTYTINLYLVETGRRLLDTTITFS 394
            |||.|||                        |.|:..||     :|||:..:||||.|||||.:.
Zfish   332 KTVVAVM------------------------SPKNDTAC-----SINLFSADTGRRHLDTTIIYH 367

Human   395 LEQSGTRPERLYIQVFLKKDDSVGYRALVQTEDHLLLFLQQLAGKVVLWSREESLAEVVCLEMVD 459
            .:..|.:|.:||:..|||||||||||.:|||||..|.|||| .|:|| |.|||:||:||.:||||
Zfish   368 TDPYGGKPNKLYVHAFLKKDDSVGYRVMVQTEDLTLTFLQQ-PGRVV-WMREEALADVVNMEMVD 430

Human   460 LPLTGAQAELEGEFGKKAAIQDGLLGMFLKRLSSQLILLQAWTSHLWKMFYDARKPRSQIKNEIN 524
            |||||.||||||||||||   ||||.|.|||||||.||||||.:||||:|||||||||.:||||.
Zfish   431 LPLTGTQAELEGEFGKKA---DGLLPMVLKRLSSQFILLQAWMAHLWKLFYDARKPRSSVKNEIT 492

Human   525 IDTLARDEFNLQKMMVMVTASGKLFGIESSSGTILWKQYLPNVKPDSSFKLMVQRTTAHFPHPPQ 589
            ||||:||||||||||||||||||||||:|.|||:||||||.|:||:|.|||:|||||||||||||
Zfish   493 IDTLSRDEFNLQKMMVMVTASGKLFGIDSRSGTVLWKQYLENIKPNSFFKLIVQRTTAHFPHPPQ 557

Human   590 CTLLVKDKESGMSSLYVFNPIFGKWSQVAPPVLKRPILQSLLLPVMDQDYAKVLLLIDDEYKVTA 654
            ||||:||:::|:.|||||||||||.||::.|.|.|||||||||||:||||:||||||||:.||||
Zfish   558 CTLLIKDQDTGLGSLYVFNPIFGKKSQISVPALPRPILQSLLLPVIDQDYSKVLLLIDDQNKVTA 622

Human   655 FPATRNVLRQLHELAPSIFFYLVDAEQGRLCGYRLRKDLTTELSWELTIPPEVQRIVKVKGKRSS 719
            ||:|:|:|:||.|.|.||||||||:.||:|.|:|||.||:|||.||:.||.|||:||.|||||::
Zfish   623 FPSTKNILQQLQETASSIFFYLVDSNQGKLSGFRLRTDLSTELIWEVVIPTEVQKIVAVKGKRAN 687

Human   720 EHVHSQGRVMGDRSVLYKSLNPNLLAVVTESTDAHHERTFIGIFLIDGVTGRIIHSSVQKKAKGP 784
            ||||||||||||||||||.||||||||:|||||.|.||:|:||||||||||||:|.:||:||:||
Zfish   688 EHVHSQGRVMGDRSVLYKYLNPNLLAVITESTDTHQERSFVGIFLIDGVTGRIVHEAVQRKARGP 752

Human   785 VHIVHSENWVVYQYWNTKARRNEFTVLELYEGTEQYNATAFSSLDRPQLPQVLQQSYIFPSSISA 849
            ||.|||||||:|.|||:|.|||||:||||:||.|.||:|.|||||||..|||||||||||:.||.
Zfish   753 VHCVHSENWVIYVYWNSKFRRNEFSVLELFEGAELYNSTVFSSLDRPHPPQVLQQSYIFPAPIST 817

Human   850 MEATITERGITSRHLLIGLPSGAILSLPKALLDPRRPEIPTEQSREENLIPYSPDVQIHAERFIN 914
            :|||:||:||||||||:|||||.||||||..|||||||:.:|||||||||||:|::.|..|.|||
Zfish   818 LEATLTEKGITSRHLLVGLPSGNILSLPKMFLDPRRPEVVSEQSREENLIPYAPEMPIRTEWFIN 882

Human   915 YNQTVSRMRGIYTAPSGLESTCLVVAYGLDIYQTRVYPSKQFDVLKDDYDYVLISSVLFGLVFAT 979
            |||||||:||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||.||.|||
Zfish   883 YNQTVSRVRGIYTAPSGLESTCLVVAYGLDIYQTRVFPSKQFDVLKDDYDYVLISSVLLGLFFAT 947

Human   980 MITKRLAQVKLLNRAWR 996
            ||:||||:|||||||||
Zfish   948 MISKRLAEVKLLNRAWR 964

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
EMC1NP_001362749.1 PQQ_2 59..>218 CDD:433144 93/158 (59%)
EMC1_C 790..995 CDD:462261 166/204 (81%)
emc1XP_021329317.2 None

Return to query results.
Submit another query.