DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment EMC1 and Emc1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001362749.1 Gene:EMC1 / 23065 HGNCID:28957 Length:996 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001102160.1 Gene:Emc1 / 362643 RGDID:1310427 Length:993 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:996 Identity:925/996 - (92%)
Similarity:955/996 - (95%) Gaps:3/996 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAEWASRFWLWATLLIPAAAVYEDQVGKFDWRQQYVGKVKFASLEFSPGSKKLVVATEKNVIAA 65
            |||...|.|.|.|.||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAAAVESWFCLCAVLLVPAAAVYEDQVGKFDWRQQYVGKLKFASLEFSPGSKKLVVATEKNVIAA 65

Human    66 LNSRTGEILWRHVDKGTAEGAVDAMLLHGQDVITVSNGGRIMRSWETNIGGLNWEITLDSGSFQA 130
            ||||||||||||||||||||||||||:||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 LNSRTGEILWRHVDKGTAEGAVDAMLVHGQDAITVSNGGRIMRSWETNIGGLNWEITLDSGSFQA 130

Human   131 LGLVGLQESVRYIAVLKKTTLALHHLSSGHLKWVEHLPESDSIHYQMVYSYGSGVVWALGVVPFS 195
            ||||||||:|||:||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||:||||
  Rat   131 LGLVGLQETVRYVAVLKKTTLTLHHLSSGHLKWVEHLPESDSILYQMVYSYGSGVVWALGIVPFS 195

Human   196 HVNIVKFNVEDGEIVQQVRVSTPWLQHLSGACGVVDEAVLVCPDPSSRSLQTLALETEWELRQIP 260
            ||||||||||||||||||||.|||||||:||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
  Rat   196 HVNIVKFNVEDGEIVQQVRVWTPWLQHLTGACGVVDEAVLVCPDPSSHSLHTLALETEWELRQIP 260

Human   261 LQSLDLEFGSGFQPRVLPTQPNPVDASRAQFFLHLSPSHYALLQYHYGTLSLLKNFPQTALVSFA 325
            |||.||||||||||:||||||:||..|||||||.|||.|||||.||:|.::|||||||..|||||
  Rat   261 LQSPDLEFGSGFQPQVLPTQPSPVAPSRAQFFLQLSPGHYALLHYHHGAVTLLKNFPQATLVSFA 325

Human   326 TTGEKTVAAVMACRNEVQKSSSSEDGSMGSFSEKSSSKDSLACFNQTYTINLYLVETGRRLLDTT 390
            |||||||||||.||.||||..|:.|||:.||.|.|.::||||||||||||||||||||||||||:
  Rat   326 TTGEKTVAAVMTCRTEVQKPGSAGDGSVASFPETSGAQDSLACFNQTYTINLYLVETGRRLLDTS 390

Human   391 ITFSLEQSGTRPERLYIQVFLKKDDSVGYRALVQTEDHLLLFLQQLAGKVVLWSREESLAEVVCL 455
            |:|||||.|||||:||:||||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 ISFSLEQKGTRPEQLYVQVFLKKDDSVGYRALVQTQDHLQLFLQQLAGKVVLWSREESLAEVVCL 455

Human   456 EMVDLPLTGAQAELEGEFGKKAAIQDGLLGMFLKRLSSQLILLQAWTSHLWKMFYDARKPRSQIK 520
            ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 EMVDLPLTGAQAELEGEFGKKA---DGLLGMFLKRLSSQLILLQAWTSHLWKMFYDARKPRSQIK 517

Human   521 NEINIDTLARDEFNLQKMMVMVTASGKLFGIESSSGTILWKQYLPNVKPDSSFKLMVQRTTAHFP 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   518 NEINIDTLARDEFNLQKMMVMVTASGKLFGIESSSGTILWKQYLPNVKPDSSFKLMVQRTTAHFP 582

Human   586 HPPQCTLLVKDKESGMSSLYVFNPIFGKWSQVAPPVLKRPILQSLLLPVMDQDYAKVLLLIDDEY 650
            |||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat   583 HPPQCTLLVKDKETGMSSLFVFNPIFGKWSQVAPPVLKRPILQSLLLPVMDQDYAKVLLLVDDEY 647

Human   651 KVTAFPATRNVLRQLHELAPSIFFYLVDAEQGRLCGYRLRKDLTTELSWELTIPPEVQRIVKVKG 715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||:|:|||
  Rat   648 KVTAFPATRNVLRQLHELAPSIFFYLVDAEQGRLSGYRLRKDLTTELSWELIIPPEVQRVVQVKG 712

Human   716 KRSSEHVHSQGRVMGDRSVLYKSLNPNLLAVVTESTDAHHERTFIGIFLIDGVTGRIIHSSVQKK 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   713 KRSSEHVHSQGRVMGDRSVLYKSLNPNLLAVVTESTDVHHERTFIGIFLIDGVTGRIIHSSVQKK 777

Human   781 AKGPVHIVHSENWVVYQYWNTKARRNEFTVLELYEGTEQYNATAFSSLDRPQLPQVLQQSYIFPS 845
            |:||||:|||||||||||||:||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   778 ARGPVHLVHSENWVVYQYWNSKARRNELTALELYEGTEQYNATAFSSLDRPQLPQVLQQSYIFPS 842

Human   846 SISAMEATITERGITSRHLLIGLPSGAILSLPKALLDPRRPEIPTEQSREENLIPYSPDVQIHAE 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   843 SISAMEATITERGITSRHLLIGLPSGAILSLPKALLDPRRPEIPTEQSREENLIPYSPDVQVHAE 907

Human   911 RFINYNQTVSRMRGIYTAPSGLESTCLVVAYGLDIYQTRVYPSKQFDVLKDDYDYVLISSVLFGL 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   908 RFINYNQTVSRMRGIYTAPSGLESTCLVVAYGLDIYQTRVYPSKQFDVLKDDYDYVLISSVLFGL 972

Human   976 VFATMITKRLAQVKLLNRAWR 996
            |||||||||||||||||||||
  Rat   973 VFATMITKRLAQVKLLNRAWR 993

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
EMC1NP_001362749.1 PQQ_2 59..>218 CDD:433144 150/158 (95%)
EMC1_C 790..995 CDD:462261 200/204 (98%)
Emc1NP_001102160.1 PQQ_2 59..>212 CDD:433144 145/152 (95%)
EMC1_C 787..992 CDD:462261 200/204 (98%)

Return to query results.
Submit another query.