Protein Alignment CNOT1 and Cnot1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_057368.3
• Gene: CNOT1 / 23019
• HGNCID: 7877
• Length: 2376
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_038953472.1
• Gene: Cnot1 / 291841
• RGDID: 1308009
• Length: 2383
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 2383
• Identity: 2360/2383 - (99%)
• Similarity: 2369/2383 - (99%)
• Gaps: 7/2383 - (0%)

Human     1 MNLDSLSLALSQISYLVDNLTKKNYRASQQEIQHIVNRHGPEADRHLLRCLFSHVDFSGDGKSSG 65
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  Rat     1 MNLDSLSLALSQISYLVDNLTKKNYRASQQEIQHIVNRHGPEADRHLLRCLFSHVDFSGDGKSSG 65

Human    66 KDFHQTQFLIQECALLITKPNFISTLSYAIDNPLHYQKSLKPAPHLFAQLSKVLKLSKVQEVIFG 130
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 KDFHQTQFLIQECASLITKPNFISTLSYAIDNPLHYQKSLKPAPHLFAQLSKVLKLSKVQEVIFG 130

Human   131 LALLNSSSSDLRGFAAQFIKQKLPDLLRSYIDADVSGNQEGGFQDIAIEVLHLLLSHLLFGQKGA 195
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 LALLNSSSPDLRGFAAQFIKQKLPDLLRSYIDADVSGNQEGGFQDIAIEVLHLLLSHLLFGQKGA 195

Human   196 FGVGQEQIDAFLKTLRRDFPQERCPVVLAPLLYPEKRDILMDRILPDSGGVAKTMMESSLADFMQ 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 FGVGQEQIDAFLKTLRRDFPQERCPVVLAPLLYPEKRDILMDRILPDSGGVAKTMMESSLADFMQ 260

Human   261 EVGYGFCASIEECRNIIVQFGVREVTAAQVARVLGMMARTHSGLTDGIPLQSISAPGSGIWSDGK 325
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 EVGYGFCASIEECRNIIMQFGVREVTAAQVARVLGMMARTHSGLTDGIPLQSISAPGSGIWSDGK 325

Human   326 DKSDGAQAHTWNVEVLIDVLKELNPSLNFKEVTYELDHPGFQIRDSKGLHNVVYGIQRGLGMEVF 390
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 DKSEGAQAHTWNVEVLIDVLKELNPSLNFKEVTYELDHPGFQIRDSKGLHNVVYGIQRGLGMEVF 390

Human   391 PVDLIYRPWKHAEGQLSFIQHSLINPEIFCFADYPCHTVATDILKAPPEDDNREIATWKSLDLIE 455
            |||.|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 PVDFIYRPWKHAEGQLSFIQHSLINPEVFCFADYPCHTVATDILKAPPEDDNREIATWKSLDLIE 455

Human   456 SLLRLAEVGQYEQVKQLFSFPIKHCPDMLVLALLQINTSWHTLRHELISTLMPIFLGNHPNSAII 520
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  Rat   456 SLLRLAEVGQYEQVKQLFSFPIKHCPDMLVLALLQINTSWHTLRHELISTLMPIFLGNHPNSAII 520

Human   521 LHYAWHGQGQSPSIRQLIMHAMAEWYMRGEQYDQAKLSRILDVAQDLKALSMLLNGTPFAFVIDL 585
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  Rat   521 LHYAWHGQGQSPSIRQLIMHAMAEWYMRGEQYDQAKLSRILDVAQDLKALSMLLNGTPFAFVIDL 585

Human   586 AALASRREYLKLDKWLTDKIREHGEPFIQACMTFLKRRCPSILGGLAPEKDQPKSAQLPPETLAT 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat   586 AALASRREYLKLDKWLTDKIREHGEPFIQACMTFLKRRCPSILGGLAPEKDQPKSAQLPAETLAT 650

Human   651 MLACLQACAGSVSQELSETILTMVANCSNVMNKARQPPPGVMPKGRPPSASSLDAISPVQIDPLA 715
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  Rat   651 MLACLQACAGSVSQELSETILTMVANCSNVMNKARQPPPGVMPKGRPPSASSLDAISPVQIDPLA 715

Human   716 GMTSLSIGGSAAPHTQSMQGFPPNLGSAFSTPQSPAKAFPPLSTPNQTTAFSGIGGLSSQLPVGG 780
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 GMASLSIGGSAAPHTQSMQGFPPNLGSAFSTPQSPAKAFPPLSTPNQTTAFSGIGGLSSQLPVGG 780

Human   781 LGTGSLTGIGTGALGLPAVNNDPFVQRKLGTSGLNQPTFQQSKMKPSDLSQVWPEANQHFSKEID 845
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 LGTGSLTGIGTGALGLPAVNSDPFVQRKLGTSGLNQPTFQQSKMKPSDLSQVWPEANQHFSKEID 845

Human   846 DEANSYFQRIYNHPPHPTMSVDEVLEMLQRFKDSTIKREREVFNCMLRNLFEEYRFFPQYPDKEL 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 DEANSYFQRIYNHPPHPTMSVDEVLEMLQRFKDSTIKREREVFNCMLRNLFEEYRFFPQYPDKEL 910

Human   911 HITACLFGGIIEKGLVTYMALGLALRYVLEALRKPFGSKMYYFGIAALDRFKNRLKDYPQYCQHL 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 HITACLFGGIIEKGLVTYMALGLALRYVLEALRKPFGSKMYYFGIAALDRFKNRLKDYPQYCQHL 975

Human   976 ASISHFMQFPHHLQEYIEYGQQSRDPPVKMQGSITTPGSIALAQAQAQAQVPAKAPLAGQVSTMV 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   976 ASISHFMQFPHHLQEYIEYGQQSRDPPVKMQGSITTPGSIALAQAQAQAQVPAKAPLAGQVNTMV 1040

Human  1041 TTSTTTTVAKTVTVTRPTGVSFKKDVPPSINTTNIDTLLVATDQTERIVEPPENIQEKIAFIFNN 1105
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 TTSTTTTVAKTVTVTKPTGVSFKKDVPPSINTTNIDTLLVATDQTERIVEPPENIQEKIAFIFNN 1105

Human  1106 LSQSNMTQKVEELKETVKEEFMPWVSQYLVMKRVSIEPNFHSLYSNFLDTLKNPEFNKMVLNETY 1170
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  Rat  1106 LSQSNMTQKVEELKETVKEEFMPWVSQYLVMKRVSIEPNFHSLYSNFLDTLKNPEFNKMVLNETY 1170

Human  1171 RNIKVLLTSDKAAANFSDRSLLKNLGHWLGMITLAKNKPILHTDLDVKSLLLEAYVKGQQELLYV 1235
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  Rat  1171 RNIKVLLTSDKAAANFSDRSLLKNLGHWLGMITLAKNKPILHTDLDVKSLLLEAYVKGQQELLYV 1235

Human  1236 VPFVAKVLESSIRSVVFRPPNPWTMAIMNVLAELHQEHDLKLNLKFEIEVLCKNLALDINELKPG 1300
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1236 VPFVAKVLESSIRSLVFRPPNPWTMAIMNVLAELHQEHDLKLNLKFEIEVLCKNLALDINELKPG 1300

Human  1301 NLLKDKDRLKNLDEQLSAPKKDVKQPEELPPITTTTTSTTPATNTTCTATVPPQPQYSYHDINVY 1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat  1301 NLLKDKDRLKNLDEQLSAPKKDVKQPEELPAITTTTTSTTPATSTTCTATVPPQPQYSYHDINVY 1365

Human  1366 SLAGLAPHITLNPTIPLFQAHPQLKQCVRQAIERAVQELVHPVVDRSIKIAMTTCEQIVRKDFAL 1430
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  Rat  1366 SLAGLAPHITLNPTIPLFQAHPQLKQCVRQAIERAVQELVHPVVDRSIKIAMTTCEQIVRKDFAL 1430

Human  1431 DSEESRMRIAAHHMMRNLTAGMAMITCREPLLMSISTNLKNSFASALRTASPQQREMMDQAAAQL 1495
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  Rat  1431 DSEESRMRIAAHHMMRNLTAGMAMITCREPLLMSISTNLKNSFASALRTASPQQREMMDQAAAQL 1495

Human  1496 AQDNCELACCFIQKTAVEKAGPEMDKRLATEFELRKHARQEGRRYCDPVVLTYQAERMPEQIRLK 1560
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  Rat  1496 AQDNCELACCFIQKTAVEKAGPEMDKRLATEFELRKHARQEGRRYCDPVVLTYQAERMPEQIRLK 1560

Human  1561 VGGVDPKQLAVYEEFARNVPGFLPTNDLSQPTGFLAQPMKQAWATDDVAQIYDKCITELEQHLHA 1625
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  Rat  1561 VGGVDPKQLAVYEEFARNVPGFLPTNDLSQPTGFLAQPMKQAWATDDVAQIYDKCITELEQHLHA 1625

Human  1626 IPPTLAMNPQAQALRSLLEVVVLSRNSRDAIAALGLLQKAVEGLLDATSGADADLLLRYRECHLL 1690
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  Rat  1626 IPPTLAMNPQAQALRSLLEVVVLSRNSRDAIAALGLLQKAVEGLLDATSGADADLLLRYRECHLL 1690

Human  1691 VLKALQDGRAYGSPWCNKQITRCLIECRDEYKYNVEAVELLIRNHLVNMQQYDLHLAQSMENGLN 1755
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1691 VLKGLQDGRAYGSPWCNKQITRCLIECRDEYKYNVEAVELLIRNHLVNMQQYDLHLAQSMENGLN 1755

Human  1756 YMAVAFAMQLVKILLVDERSVAHVTEADLFHTIETLMRINAHSRGNAPEGLPQLMEVVRSNYEAM 1820
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  Rat  1756 YMAVAFAMQLVKILLVDERSVAHITEADLFHTIETLMRINAHSRGNAPEGLPQLMEVVRSNYEAM 1820

Human  1821 IDRAHGGPNFMMHSGISQASEYDDPPGLREKAEYLLREWVNLYHSAAAGRDSTKAFSAFVGQ--- 1882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1821 IDRAHGGPNFMMHSGISQASEYDDPPGLREKAEYLLREWVNLYHSAAAGRDSTKAFSAFVGQVEL 1885

Human  1883 ----MHQQGILKTDDLITRFFRLCTEMCVEISYRAQAEQQHNPAANPTMIRAKCYHNLDAFVRLI 1943
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1886 LERKMHQQGILKTDDLITRFFRLCTEMCVEISYRAQAEQQHNPAANPTMIRAKCYHNLDAFVRLI 1950

Human  1944 ALLVKHSGEATNTVTKINLLNKVLGIVVGVLLQDHDVRQSEFQQLPYHRIFIMLLLELNAPEHVL 2008
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  Rat  1951 ALLVKHSGEATNTVTKINLLNKVLGIVVGVLLQDHDVRQSEFQQLPYHRIFIMLLLELNAPEHVL 2015

Human  2009 ETINFQTLTAFCNTFHILRPTKAPGFVYAWLELISHRIFIARMLAHTPQQKGWPMYAQLLIDLFK 2073
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  Rat  2016 ETINFQTLTAFCNTFHILRPTKAPGFVYAWLELISHRIFIARMLAHTPQQKGWPMYAQLLIDLFK 2080

Human  2074 YLAPFLRNVELTKPMQILYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHYGFCDVIPPNCIQLRNLILSAFPR 2138
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  Rat  2081 YLAPFLRNVELTKPMQILYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHYGFCDVIPPNCIQLRNLILSAFPR 2145

Human  2139 NMRLPDPFTPNLKVDMLSEINIAPRILTNFTGVMPPQFKKDLDSYLKTRSPVTFLSDLRSNLQVS 2203
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2146 NMRLPDPFTPNLKVDMLSEINIAPRILTNFTGVMPPQFKKDLDSYLKTRSPVTFLSDLRSNLQVS 2210

Human  2204 NEPGNRYNLQLINALVLYVGTQAIAHIHNKGSTPSMSTITHSAHMDIFQNLAVDLDTEGRYLFLN 2268
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2211 NEPGNRYNLQLINALVLYVGTQAIAHIHNKGSTPSMSTITHSAHMDIFQNLAVDLDTEGRYLFLN 2275

Human  2269 AIANQLRYPNSHTHYFSCTMLYLFAEANTEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNP 2333
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  Rat  2276 AIANQLRYPNSHTHYFSCTMLYLFAEANTEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNP 2340

Human  2334 AFKFWNHEFVHCAPEIEKLFQSVAQCCMGQKQAQQVMEGTGAS 2376
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2341 AFKFWNHEFVHCAPEIEKLFQSVAQCCMGQKQAQQVMEGTGAS 2383

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CNOT1	NP_057368.3	LXXLL	153..157		3/3 (100%)
		LXXLL	181..185		3/3 (100%)
		LXXLL	223..227		3/3 (100%)
		CNOT1_HEAT	500..656	CDD:465113	154/155 (99%)
		LXXLL	570..574		3/3 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	720..768		47/47 (100%)
		Interaction with ZFP36	800..1015		213/214 (100%)
		CDC39	<840..2369	CDD:227434	1521/1535 (99%)
		Interaction with CNOT6, CNOT6L, CNOT7 and CNOT8. /evidence=ECO:0000269|PubMed:22977175	1090..1605		511/514 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1315..1352		34/36 (94%)
		LXXLL	1639..1643		3/3 (100%)
		LXXLL	1942..1946		3/3 (100%)
		LXXLL	2096..2100		3/3 (100%)
Cnot1	XP_038953472.1	CNOT1_HEAT	500..656	CDD:465113	154/155 (99%)
		CDC39	<840..2376	CDD:227434	1521/1535 (99%)