DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SPEN and Spen

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_055816.2 Gene:SPEN / 23013 HGNCID:17575 Length:3664 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038966732.1 Gene:Spen / 690911 RGDID:1589867 Length:3632 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3696 Identity:2969/3696 - (80%)
Similarity:3172/3696 - (85%) Gaps:96/3696 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNS 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNS 65

Human    66 VNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDDTVSIASRSREVSGFRGGGGGPAYGPPPSLHAREGRYE 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
  Rat    66 VNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDDTVSIASRSREVSGFRGSGGGPAYGPPPSLHAREGRYE 130

Human   131 RRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGGFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFD 195
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat   131 RRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGAFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYTSRSRSPNRFD 195

Human   196 AHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDITREVRGRRPERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLAS 260
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 AHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDLTREVRGRRPERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLAS 260

Human   261 QASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSISSSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSS 325
            |||||||||||||||||||||||||||||:|:|||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 QASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSISSSSSSSTDSSDSSSTSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSS 325

Human   326 LEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQE 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
  Rat   326 LEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGASEERYGLVFFRQQEDQE 390

Human   391 KALTASKGKLFFGMQIEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLR 455
            |||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 KALTASKGKLFFGMQIEVTAWVGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLR 455

Human   456 NIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVW 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 NIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVW 520

Human   521 LDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVD 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||:|||||||||||||||
  Rat   521 LDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGLALVLYSEIEYAQAAVRETKGRKIGGNKIKVD 585

Human   586 FANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAERREERRASYDYNQDRTYYESVRTPGTYPEDSRRDY 650
            ||||||||||||||||||||:|||||||.|||||||.||||:|||||||:|||||.|||||||||
  Rat   586 FANRESQLAFYHCMEKSGQDMRDFYEMLTERREERRGSYDYSQDRTYYENVRTPGAYPEDSRRDY 650

Human   651 PARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQDIREYSYRQRERERERERFESDRDR 715
            ||||||.|||||||||:||||||||||||||:||:||||||||||||||||||||||||||  ||
  Rat   651 PARGRELYSEWETYQGEYYESRYYDDPREYREYRSDPYEQDIREYSYRQRERERERERFES--DR 713

Human   716 DHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERLPSDSERRLYSRSSDRSGSCSSLSPPRYEKLDKS 780
            |||||||||||||||||||||||.||:.:||||||||||||.|||:|||||||:|||||:||:|:
  Rat   714 DHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGVSPAHSERLPSDSERRLYRRSSERSGSCSSVSPPRYDKLEKA 778

Human   781 RLERYTKNEKTDKERTFDPERVERERRLIRKEKVEKDKTDKQKRKGKVHSPSSQSSETDQENERE 845
            |||||||||||||||.||.||||||||:||||||||||.::|||||||||||||||||:|||:|:
  Rat   779 RLERYTKNEKTDKERIFDAERVERERRVIRKEKVEKDKPERQKRKGKVHSPSSQSSETEQENDRD 843

Human   846 QSPEKPRSCNKLSREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKEKEGKVIDHTPVEKLKAKLDNDTVKS 910
            |||||||:..||||::.||||.|||||||:||||||||||||||||||.|.|||||:|.:||.||
  Rat   844 QSPEKPRASTKLSRDRTDKEGPAKNRLELVPCVVLTRVKEKEGKVIDHPPPEKLKARLAHDTAKS 908

Human   911 SALDQKLQVSQTEPAKSDLSKLESVRMKVPKEKGLSSHVEVVEKEGRLKARKHLKPEQPADGVSA 975
            |.||||.|.||.||.|:|.||:::.|.|..:||..|||.|||:||||.|.|||||||| |..:||
  Rat   909 SVLDQKSQASQVEPPKADSSKVDAARGKALREKAFSSHAEVVDKEGRPKLRKHLKPEQ-APELSA 972

Human   976 VDLEKLEARKRRFADSNLKAEKQKPEVKKSSPEMEDARVLSKKQPDVSSREVILLREGEAERKPV 1040
            :|||||||||||||||:||.||.:|||:|:|||.||.|.|.||||| :.|:.|||||||:|||||
  Rat   973 LDLEKLEARKRRFADSSLKVEKPRPEVRKTSPEAEDTRALLKKQPD-TPRDGILLREGESERKPV 1036

Human  1041 RKEILKRESKKIKLDRLNTVASPKDCQELASISVGSGSRPSSDLQARLGELAGESVENQEVQSKK 1105
            |||||||||||.||:|||:..|||||||.|::|.|||||||||:.|.|||....|||.||.|.||
  Rat  1037 RKEILKRESKKTKLERLNSTLSPKDCQEPAAVSAGSGSRPSSDVHAALGEPVHGSVETQEAQPKK 1101

Human  1106 PIPSKPQLKQLQVLDDQGPEREDVRKNYCSLRDETPERKSGQEKSHSVNTEEKIGIDIDHTQSYR 1170
            .:||||:|||||:||.||||:|:||||||.||::..|.|:||||.|.||.|||:|||||||||||
  Rat  1102 VMPSKPRLKQLQLLDSQGPEKEEVRKNYCRLREDPVEHKAGQEKPHGVNAEEKLGIDIDHTQSYR 1166

Human  1171 KQMEQSRRKQQMEMEIAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKKRMDHVDF 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||
  Rat  1167 KQMEQSRRKQQMEMEIAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKRRTDHVDF 1231

Human  1236 DICTKRERNYRSSRQISEDSERTGGSPSVRHGSFHEDEDPIGSPRLLSVKGSPKVDEKVLPYSNI 1300
            |||||||||||||||||||||||..||.|.|||||||:||||||||:||||||:||:|.|||||:
  Rat  1232 DICTKRERNYRSSRQISEDSERTSCSPGVHHGSFHEDDDPIGSPRLMSVKGSPRVDDKGLPYSNV 1296

Human  1301 TVREESLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDELNRWDSQMKQDAGRFDVSFPNSIIKRDSL 1365
            .|||:..:..||||.:|||.|||||||||||:||.|.||||.|||||..||||||||||||||||
  Rat  1297 AVREDPFRCTPYDSGKREQAADMAKIKLSVLSSEGEPNRWDPQMKQDPSRFDVSFPNSIIKRDSL 1361

Human  1366 RKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLSFLLRDREDKLRERDERLSSSLERNK 1430
            |||.||||||||||||||||.||::.|||||:.|:|.|||||||||:.|||:||:||||||||||
  Rat  1362 RKRCVRDLEPGEVPSDSDEDAEHRAQSPRASSFYDSPRLSFLLRDRDHKLRDRDDRLSSSLERNK 1426

Human  1431 FYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDSAPRPIPSWYM 1495
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||:|||||||||||||||||||
  Rat  1427 FYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWGSRFANFRDNKDKEKVDSAPRPIPSWYM 1491

Human  1496 KKKKIRTDSEGKMDDKKEDHKEEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQHLERKEEDSDFISGRI 1560
            ||||||||||||:||||::|:||||||||||||||||||||||||:||||||||.|:|||..||:
  Rat  1492 KKKKIRTDSEGKLDDKKDEHREEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSRRLQHLERKSEESDFPPGRL 1556

Human  1561 YGKQTSEGANSTTDSIQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPKEVEKQEDTENHPKTPESAPE 1625
            ||:|.|||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|. |||||...|
  Rat  1557 YGRQASEGANSTSDSVQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPKETEKQEGPET-PKTPEPTTE 1620

Human  1626 NKDSELKTPPSVGPPSVTVVTLESAPSALEKTTGDKTVEAPLVTEEKTVEPATVSEEAKPASEPA 1690
            .|:.|.|.|.||..|::|.||.|..|.|......::|.|||.:..|:..||..|.||.|..|||.
  Rat  1621 TKEPEPKAPVSVALPAITAVTPEPPPPAAAAEKAEETSEAPSLAGERPEEPTPVLEETKLVSEPP 1685

Human  1691 PAPVEQLEQVDLPPGADPDKEAAMMPAGVEEGSSGDQPPYLDAKPPTPGASFSQAESNVDPEPDS 1755
            ...|||.:||||.||.|.....|::.:...|.::.|..|.:||:|.|||.:.||.||:.||:|.|
  Rat  1686 SESVEQRKQVDLSPGKDSHDSTAVVASTPPESTTTDTVPCVDAEPLTPGTTVSQVESSADPKPSS 1750

Human  1756 TQPLSKPAQKSEEANEPKAEKPDATADAEPDANQKAEAAPESQPPASEDLEVDPPVAAKDKKPNK 1820
            .||.||..|:.|||.|||.|:|:.||..||||.:|||..||.|||||||:|..|||.|||:|..|
  Rat  1751 PQPPSKLTQRCEEAEEPKVERPETTASIEPDATEKAEVVPEVQPPASEDVEASPPVTAKDRKTTK 1815

Human  1821 SKRSKTPVQAAAVSIVEKPVTRKSERIDREKLKRSNSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKNSAA 1885
            ||||||.|.|||.||||||||||||||||||:|||:||||||||||||||||:|:||||||:|..
  Rat  1816 SKRSKTSVPAAAASIVEKPVTRKSERIDREKMKRSSSPRGEAQKLLELKMEADKVTRTASKSSGG 1880

Human  1886 DLEHPEPSLPLSRTRRRNVRSVYATMGDHENRSPVKEPVEQPRVTRKRLERELQEAAAVPTTPRR 1950
            |.||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||.|||||||||||||||||..||.||||
  Rat  1881 DTEHPEPSLPLSRTRRRNVRSVYATMGDHESRSPAKEPTEQPRVTRKRLERELQEAVVVPATPRR 1945

Human  1951 GRPPKTRRRADEEEENEAKEPAETLKPPEGWRSPRSQKTAAGGGPQGKKGKNEPKVDATRPEATT 2015
            |||||||||.:|..|.|.||||:|.:|.||.|||||||.||.||||||:|:||.:.:|.  |||.
  Rat  1946 GRPPKTRRRVEEGGEQERKEPADTPRPAEGRRSPRSQKLAATGGPQGKRGRNEHRAEAA--EATA 2008

Human  2016 EVGPQIGVKESSMEPKAAEEEAGSEQKRDRKDAGTDKNPPETAPVEVVEKKPAPEKNSKSKRGRS 2080
                |:..:|.:.:.: .:.||.||.:|||||..|||:.|:..||| ||:|| |||..||||||:
  Rat  2009 ----QVSAREGNAKAR-GDREAASETRRDRKDPSTDKDGPDIFPVE-VERKP-PEKTYKSKRGRA 2066

Human  2081 RNSRLAVDKSASLKNVDAAVSPRGAAAQAGERESGVVAVSPEKSESPQKEDGLSSQLKSDPVDPD 2145
            |::|..:|::|.||:::       .|.||.::|:..||.||||:|||.:..|:|.||..:|.|||
  Rat  2067 RSTRSGMDRAAHLKSLE-------MARQAADKEAEPVAASPEKNESPLEGSGVSPQLADNPADPD 2124

Human  2146 KEPEKEDVSASGPSPEATQLAKQMELEQAVEHIAKLAEASASAAYKADA---PEGLAPEDRDKPA 2207
            ||.|||.||||..||||.||.|||||:||||:||||||.||:||.|..|   .|..|.||..|||
  Rat  2125 KEAEKESVSASTVSPEARQLTKQMELQQAVENIAKLAEPSAAAADKGTATATSEEPAAEDGHKPA 2189

Human  2208 HQASETELAAAIGSIINDISGEPENFPAPPPYPGESQTDLQPPAGAQALQPSEEGME--TDEAVS 2270
            ||||||||||||||||:|.|||||||.|.|..|..|||.||            ||||  ..||..
  Rat  2190 HQASETELAAAIGSIISDSSGEPENFSASPSVPPGSQTHLQ------------EGMEPGPHEATP 2242

Human  2271 GILETEAATESSRPPVNAPDPSAGPTDTKEARGNSSETSHSVPEAKGSKEVEVTLVRKDKGRQKT 2335
            ||||||||||||....:|.||.||..||||||||||:   ||.:||.:| |.||..|||||||||
  Rat  2243 GILETEAATESSAQQASASDPPAGSADTKEARGNSSD---SVQQAKEAK-VAVTPPRKDKGRQKT 2303

Human  2336 TRSRRKRNTNKKVVAPVESHVPESNQAQGESPAANEG-------------------TTVQHPEAP 2381
            ||||||||.||||.|..|:...|:.|.|.|||||...                   .....||.|
  Rat  2304 TRSRRKRNVNKKVAAATETRASEAEQPQSESPAAAAAAAAAAAAAAAAAAAEAEVVVAAAPPEEP 2368

Human  2382 QEEKQSEKPHSTPPQSCTSDLSKIPSTENSSQEISVEERTPTKASVPPDLPPPPQPAPVDEEPQA 2446
            ||||||||||| |.:.||||.||.|..|:.|||.||||:||.|...||||||..|||.||:||||
  Rat  2369 QEEKQSEKPHS-PLRECTSDPSKTPPAESLSQENSVEEKTPCKTPAPPDLPPLSQPALVDDEPQA 2432

Human  2447 RFRVHSIIESDPVTPPSDPSIPIPTLPSVTAAKLSPPVASGGIPHQSPPTKVTEWITRQEEPRAQ 2511
            ||:|||||||||||||||.|||.||:|.||.|||.|||..||:||||||.|||||||||||||||
  Rat  2433 RFKVHSIIESDPVTPPSDSSIPPPTIPLVTIAKLPPPVIPGGVPHQSPPPKVTEWITRQEEPRAQ 2497

Human  2512 STPSPALPPDTKASDVDTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPVSAAPCLHEAPPPPV 2576
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||| ||.|.|||.||.
  Rat  2498 SAPSPALPPDTKASDVDTSSSTLRKILMDPKYVSATGVTSTSVTAAIAEPVS-APRLQEAPAPPC 2561

Human  2577 DSKKPLEEKTAPPVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVIAPKITSVISRMPVSIDLENSQKITLAK 2641
            :.|:|..|:.......:::.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2562 EPKRPSSEEKVAAAVPHADTQASEVPVAADKEKVAPVIAPKITSVISRMPVSIDLENSQKITLAK 2626

Human  2642 PAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVTTLKSLVSTPAGPVNVLKGPVNVLTGPVNV 2706
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||:||||||||||||||
  Rat  2627 PAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVATLKGLVSTPAGPVNLLKGPVNVLTGPVNV 2691

Human  2707 LTTPVNATVGTVNAAPGTVNAAASAVNATASAVTVTAGAVTAASGGVTATTGTVTMAGAVIAPST 2771
            |||||:||||||:||||||.||.                      ||||||||..|:|||.||:.
  Rat  2692 LTTPVSATVGTVSAAPGTVTAAC----------------------GVTATTGTAAMSGAVPAPAA 2734

Human  2772 KCKQRASANENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQ 2836
            |.|||:|:|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2735 KGKQRSSSNENSRFHPGSMSVIDDRPADTGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQ 2799

Human  2837 IPPASAMDIEFQQSVSKSQVKPDSVTASQPPSKGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISS 2901
            |||||||||||||||||||||.||||.:|...||||.|:.:||||.|||||||||||||||||||
  Rat  2800 IPPASAMDIEFQQSVSKSQVKADSVTPTQAAPKGPQTPSAFANVAAHSTLVLTAQTYNASPVISS 2864

Human  2902 VKADRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTL 2966
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2865 VKTDRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTL 2929

Human  2967 KIETKVLQPANLGSTLTPHHPPALPSKLPTEVNHVPSGPSIPADRTVSHLAAAKLDAHSPRPSGP 3031
            |||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||::|||..|.|.|||||:||
  Rat  2930 KIETKVLQPANLGPTLTPHHPPALPSKLPAEVNHVPSGPSNPADRTIAHLATTKPDTHSPRPTGP 2994

Human  3032 GPSSFPRASHPSSTASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQG 3096
            .|..||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat  2995 TPGPFPRACHPSSTTSTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLGHLSQG 3059

Human  3097 EVRMNTPTLPSITYSIRPEALHSPRAPLQPQQIEVRAPQRASTPQPAPAGVPALASQHPPEEEVH 3161
            ||||:||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||...|||||:|||||||||
  Rat  3060 EVRMSTPTLPSITYSIRPETLHSPRAPLQPQQIEARAPQRVSTPQPATTAVPALATQHPPEEEVH 3124

Human  3162 YHLPVARATAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRAADGVVKVPPASKAP 3226
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||
  Rat  3125 YHLPVARAAAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRATEGVVKVPPASKAP 3189

Human  3227 QQPGKEAAKTPDAKAAPTPTPAPVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVTPSNQLQGLPLTPPVVVTH 3291
            ||..||..||.||||  .|.|||||||||:|.|||.|||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat  3190 QQLVKEVVKTSDAKA--VPAPAPVPVPVPVPTPAPPPHGEARILTVTPSSQLQGLPLTPPVVVTH 3252

Human  3292 GVQIVHSSGELFQEYRYGDIRTYHPPAQLTHTQFPAASSVGLPSRTKTAAQGPPPEGEPLQPPQP 3356
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||:.|||||||:||| |||.||||..||
  Rat  3253 GVQIVHSSGELFQEYRYGDIRTYHAPAQLTHTQFPVASSINLPSRTKTSAQG-PPESEPLQSTQP 3316

Human  3357 ------VQSTQPAQPAPPCPPSQLGQPGQPPSSKMPQVSQEAKGTQT-GVEQPRLPAGPANRPPE 3414
                  .|||||..|||||.||||.||.||||.|:|||||||||||| |:||.||||.|.|||.|
  Rat  3317 AQPAPSTQSTQPVPPAPPCQPSQLSQPAQPPSGKIPQVSQEAKGTQTGGIEQTRLPAMPTNRPSE 3381

Human  3415 PHTQVQRAQAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAPKQPLFVPTTSGPSTPPGLVLPHTEFQ 3479
            ||.|.|||..||...:.||||||:||||||..|.:|.|||||||||..||.||||||.|||.|.|
  Rat  3382 PHAQAQRAPGETPQPAHPSPVSVAMKPDLPTPLASQAAPKQPLFVPVNSGTSTPPGLALPHAEAQ 3446

Human  3480 PAPKQDSSPHLTSQRPVDMVQLLK-KYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEG 3543
            |||||||:||.|.||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3447 PAPKQDSAPHGTPQRPVDMVQLLKQKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEG 3511

Human  3544 GPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTESLKAAFITYLQAKQA 3608
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3512 GPPLRIAQRMRLEASQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTESLKAAFITYLQAKQA 3576

Human  3609 AGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIASV 3664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3577 AGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIASV 3632

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SPENNP_055816.2 RRM1_SHARP 7..81 CDD:409784 73/73 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 70..89 18/18 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 103..164 58/60 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 183..209 24/25 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 225..330 101/104 (97%)
RRM2_SHARP 336..409 CDD:409785 71/72 (99%)
RRM3_SHARP 436..509 CDD:409786 72/72 (100%)
RRM4_SHARP 510..586 CDD:409787 72/75 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 678..871 162/192 (84%)
PTZ00121 <776..1630 CDD:173412 682/853 (80%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 918..941 11/22 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 957..1020 45/62 (73%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1070..1287 177/216 (82%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1366..1397 25/30 (83%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1497..1524 22/26 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1588..2171 356/582 (61%)
PRK10263 <1657..>2249 CDD:236669 369/594 (62%)
PHA03307 1989..>2371 CDD:223039 220/386 (57%)
Interaction with MSX2. /evidence=ECO:0000250 2130..2464 218/357 (61%)
PHA03247 <2183..2588 CDD:223021 280/428 (65%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2185..2532 237/370 (64%)
DUF5585 2564..2954 CDD:465521 314/389 (81%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2566..2590 10/23 (43%)
Collagen_mid <2645..>2723 CDD:435053 72/77 (94%)
Interaction with RBPSUH. /evidence=ECO:0000250 2709..2870 117/160 (73%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2775..2806 26/30 (87%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2847..2875 20/27 (74%)
PHA03247 <2948..3488 CDD:223021 456/546 (84%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2978..3010 28/31 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3022..3047 18/24 (75%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3135..3156 15/20 (75%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3208..3265 42/56 (75%)
SID/RD 3417..3664 221/247 (89%)
SPOC_SHARP 3504..3664 CDD:439206 158/159 (99%)
SpenXP_038966732.1 RRM1_SHARP 7..81 CDD:409784 73/73 (100%)
RRM2_SHARP 336..409 CDD:409785 71/72 (99%)
RRM3_SHARP 436..509 CDD:409786 72/72 (100%)
RRM4_SHARP 510..586 CDD:409787 72/75 (96%)
PTZ00121 <773..1252 CDD:173412 373/480 (78%)
PTZ00449 <1529..1983 CDD:185628 308/454 (68%)
PTZ00121 <1760..>2333 CDD:173412 390/604 (65%)
DUF5585 2515..2917 CDD:465521 347/424 (82%)
PHA03247 <3081..3468 CDD:223021 314/389 (81%)
SPOC_SHARP 3472..3632 CDD:439206 158/159 (99%)

Return to query results.
Submit another query.