DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SPEN and Spen

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_055816.2 Gene:SPEN / 23013 HGNCID:17575 Length:3664 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006539132.1 Gene:Spen / 56381 MGIID:1891706 Length:3644 Species:Mus musculus


Alignment Length:3711 Identity:2978/3711 - (80%)
Similarity:3177/3711 - (85%) Gaps:114/3711 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNS 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNS 65

Human    66 VNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDDTVSIASRSREVSGFRGGGGGPAYGPPPSLHAREGRYE 130
            |||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Mouse    66 VNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDETVSIASRSREVSGFRGSAGGPAYGPPPSLHAREGRYE 130

Human   131 RRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGGFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFD 195
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Mouse   131 RRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGAFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYTSRSRSPNRFD 195

Human   196 AHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDITREVRGRRPERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLAS 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 AHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDITREVRGRRPERSYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLAS 260

Human   261 QASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSISSSSSTSS--DSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLL 323
            |||||||||||||||||||||||||||||:||  |||||||::||||||||||||||||||||||
Mouse   261 QASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSISSSSSSSSNTDSSDSSSTASDDSPARSVQSAAVPAPTSQLL 325

Human   324 SSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQED 388
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse   326 SSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGASEERYGLVFFRQQED 390

Human   389 QEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHD 453
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 QEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWVGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHD 455

Human   454 LRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNC 518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   456 LRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNC 520

Human   519 VWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIK 583
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||||
Mouse   521 VWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYSEIEDAQAAVKETKGRKIGGNKIK 585

Human   584 VDFANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAER-----------------------REERRASYD 625
            ||||||||||||||||||||||:|||||||.||                       |||||.||:
Mouse   586 VDFANRESQLAFYHCMEKSGQDMRDFYEMLTERRAGQMAQSKHEDWSADAQSPHKCREERRGSYE 650

Human   626 YNQDRTYYESVRTPGTYPEDSRRDYPARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQ 690
            |:|:|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||||:|||||:||:|||||
Mouse   651 YSQERTYYENVRTPGTYPEDSRRDYPARGREFYSEWETYQGEYYDSRYYDEPREYREYRSDPYEQ 715

Human   691 DIREYSYRQRERERERERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERLPSDSERRL 755
            |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||.||:.:|||||||||||
Mouse   716 DIREYSYRQRERERERERFES--DRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGVSPAHSERLPSDSERRL 778

Human   756 YSRSSDRSGSCSSLSPPRYEKLDKSRLERYTKNEKTDKERTFDPERVERERRLIRKEKVEKDKTD 820
            |.|||:|||||||:|||||:||:|:||||||||||.||||||||||||||||::||||.||||.:
Mouse   779 YRRSSERSGSCSSVSPPRYDKLEKARLERYTKNEKADKERTFDPERVERERRIVRKEKGEKDKAE 843

Human   821 KQKRKGKVHSPSSQSSETDQENEREQSPEKPRSCNKLSREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKE 885
            :||||||.||||||.|||:|||:|||||||||...||||::|||||.|||||||:||||||||||
Mouse   844 RQKRKGKAHSPSSQPSETEQENDREQSPEKPRGSTKLSRDRADKEGPAKNRLELVPCVVLTRVKE 908

Human   886 KEGKVIDHTPVEKLKAKLDNDTVKSSALDQKLQVSQTEPAKSDLSKLESVRMKVPKEKGLSSHVE 950
            ||||||:|.|.|||||:|..||.|:||||||.|.:|.||||||     ..|.|..:||.|.||.|
Mouse   909 KEGKVIEHPPPEKLKARLGRDTTKASALDQKPQAAQGEPAKSD-----PARGKALREKVLPSHAE 968

Human   951 VVEKEGRLKARKHLKPEQPADGVSAVDLEKLEARKRRFADSNLKAEKQKPEVKKSSPEMEDARVL 1015
            |.|||||.|.|||||.||..: :||:|||||||||||||||.||.||||||:||:|||.||.|:|
Mouse   969 VGEKEGRTKLRKHLKAEQTPE-LSALDLEKLEARKRRFADSGLKIEKQKPEIKKTSPETEDTRIL 1032

Human  1016 SKKQPDVSSREVILLREGEAERKPVRKEILKRESKKIKLDRLNTVASPKDCQELASISVGSGSRP 1080
            .||||| :||:.:||||||:||||||||||||||||.||:|||:..||||||:.|::|.||||||
Mouse  1033 LKKQPD-TSRDGVLLREGESERKPVRKEILKRESKKTKLERLNSALSPKDCQDPAAVSAGSGSRP 1096

Human  1081 SSDLQARLGELAGESVENQEVQSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPEREDVRKNYCSLRDETPERKS 1145
            |||:.|.||||...|||.||.|.||.||||||.||||:|::||||:|:||||||..|:|..|.::
Mouse  1097 SSDVHAGLGELTHGSVETQETQPKKAIPSKPQPKQLQLLENQGPEKEEVRKNYCRPREEPAEHRA 1161

Human  1146 GQEKSHSVNTEEKIGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQQMEMEIAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHE 1210
            ||||.|..|.|||:|||||||||||||||||||||:|||||||:|||||||||||:|||||||||
Mouse  1162 GQEKPHGGNAEEKLGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQRMEMEIAKAEKFGSPKKDVDDYERRSLVHE 1226

Human  1211 VGKPPQDVTDDSPPSKKKRMDHVDFDICTKRERNYRSSRQISEDSERTGGSPSVRHGSFHEDEDP 1275
            |||||||||||||||||:|.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||:|:||
Mouse  1227 VGKPPQDVTDDSPPSKKRRTDHVDFDICTKRERNYRSSRQISEDSERTSCSPSVRHGSFHDDDDP 1291

Human  1276 IGSPRLLSVKGSPKVDEKVLPYSNITVREESLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDELNRW 1340
            .|||||:|||||||.|||.|||.|..||::.||.|||||.:|||.||.|||||||||||.|.:||
Mouse  1292 RGSPRLVSVKGSPKGDEKGLPYPNAAVRDDPLKCNPYDSGKREQTADTAKIKLSVLNSEGEPSRW 1356

Human  1341 DSQMKQDAGRFDVSFPNSIIKRDSLRKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLS 1405
            |..||||..|||||||||:||||||||||||||||||||||||||.||:|.|||||:.|:|.|||
Mouse  1357 DPPMKQDPSRFDVSFPNSVIKRDSLRKRSVRDLEPGEVPSDSDEDAEHRSQSPRASSFYDSPRLS 1421

Human  1406 FLLRDREDKLRERDERLSSSLERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSR 1470
            ||||||:.|||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1422 FLLRDRDQKLRERDERLASSLERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSR 1486

Human  1471 FANFRNNKDKEKVDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKMDDKKEDHKEEEQERQELFASRFLHSSI 1535
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||::.:|||||||||||||||||||
Mouse  1487 FANFRNNKDKEKVDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKLADKKDERREEEQERQELFASRFLHSSI 1551

Human  1536 FEQDSKRLQHLERKEEDSDFISGRIYGKQTSEGANSTTDSIQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEK 1600
            ||||||||||||||.|:.|...|.:||:|.|||||||:||:||||||||||||||||||||||||
Mouse  1552 FEQDSKRLQHLERKSEEPDLPPGGLYGRQASEGANSTSDSVQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEK 1616

Human  1601 DQKPKEVEKQEDTENHPKTPESAPENKDSELKTPPSVGPP--SVTVVTLESAPSALEKTTGDKTV 1663
            ||||||.||||:.|.||||||.|.|.|:.|.|.|.|.|.|  :|||||.|.|.||.||  .::..
Mouse  1617 DQKPKEAEKQEEPETHPKTPEPAAETKEPEPKAPVSAGLPAVTVTVVTPEPASSAPEK--AEEAA 1679

Human  1664 EAPLVTEEKTVEPATVSEEAKPASEPAPAPVEQLEQVDLPPG---ADPDKEAAMMPAGVEEGSSG 1725
            |||....||..|||.||||.|..||||..||||..|.|:|||   .|....||:.|:..:|.::.
Mouse  1680 EAPSPAGEKPAEPAPVSEETKLVSEPASVPVEQPRQSDVPPGEDSRDSQDSAALAPSAPQESAAT 1744

Human  1726 DQPPYLDAKPPTPGASFSQAESNVDPEPDSTQPLSKPAQKSEEANEPKAEKPDATADAEPDANQK 1790
            |..|.::|:|.|||.:.||.||:|||:|.|.|||||..|:||||.|.|.||||.|...||||.|.
Mouse  1745 DAVPCVNAEPLTPGTTVSQVESSVDPKPSSPQPLSKLTQRSEEAEEGKVEKPDTTPSTEPDATQN 1809

Human  1791 AEAAPESQPPASEDLEVDPPVAAKDKKPNKSKRSKTPVQAAAVSIVEKPVTRKSERIDREKLKRS 1855
            |..|.|:|||||||:|.:|||||||:|.||||||||.|||||.|:||||||||||||||||||||
Mouse  1810 AGVASEAQPPASEDVEANPPVAAKDRKTNKSKRSKTSVQAAAASVVEKPVTRKSERIDREKLKRS 1874

Human  1856 NSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKNSAADLEHPEPSLPLSRTRRRNVRSVYATMGDHENRSPV 1920
            :|||||||||||||||||||||||||:|..|.|||||||||||:||||||||||||.|||:|||.
Mouse  1875 SSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKSSGGDTEHPEPSLPLSRSRRRNVRSVYATMTDHESRSPA 1939

Human  1921 KEPVEQPRVTRKRLERELQEAAAVPTTPRRGRPPKTRRRADEEEENEAKEPAETLKPPEGWRSPR 1985
            |||||||||||||||||||||...||||||||||||||||:|:.|:|.||||||.:|.|||||||
Mouse  1940 KEPVEQPRVTRKRLERELQEAVVPPTTPRRGRPPKTRRRAEEDGEHERKEPAETPRPAEGWRSPR 2004

Human  1986 SQKTAAGGGPQGKKGKNEPKVDATRPEATTEVGPQIGVKESSMEPKA-AEEEAGSEQKRDRKDAG 2049
            |||:||..|||||:|:||.||     ||..|.|.|...:|.:  ||: .|.||.||.||||:|..
Mouse  2005 SQKSAAAAGPQGKRGRNEQKV-----EAAAEAGAQASTREGN--PKSRGEREAASEPKRDRRDPS 2062

Human  2050 TDKNPPETAPVEVVEKKPAPEKNSKSKRGRSRNSRLAVDKSASLKNVDAAVSPRGAAAQAGERES 2114
            ||||.|:|.||||:|:|| |||..||||||:|::|.|:|::|..::::.|..   ||.||.::|:
Mouse  2063 TDKNGPDTFPVEVLERKP-PEKTYKSKRGRARSTRSAMDRAAHQRSLEMAAR---AAGQAADKEA 2123

Human  2115 GVVAVSPEKSESPQKEDGLSSQLKSDPVDPDKEPEKEDVSASGPSPEATQLAKQMELEQAVEHIA 2179
            |..|.||::||||||..|.|.||.::|.|||:|.|:|..|||...||.||||:|:||||||::||
Mouse  2124 GPAAASPQESESPQKGSGSSPQLANNPADPDREAEEESASASTAPPEGTQLARQIELEQAVQNIA 2188

Human  2180 KLAEASASAAYKAD-----APEGLAPEDRDKPAHQASETELAAAIGSIINDISGEPENFPAPPPY 2239
            ||.|.||:||.|..     |.|..|||...|||||||||||||||||||:|.|||||||.|||..
Mouse  2189 KLPEPSAAAASKGTATATAASEEPAPEHGHKPAHQASETELAAAIGSIISDASGEPENFSAPPSV 2253

Human  2240 PGESQTDLQPPAGAQALQPSEEGME--TDEAVSGILETEAATESSRPPVNAPDPSAGPTDTKEAR 2302
            |..|||.            ..||||  ..||.||||||..|||||.|.|:|.||..|..||||.|
Mouse  2254 PPGSQTH------------PREGMEPGLHEAESGILETGTATESSAPQVSALDPPEGSADTKETR 2306

Human  2303 GNSSETSHSVPEAKGSKEVEVTLVRKDKGRQKTTRSRRKRNTNKKVVAPVESHVPESNQAQGESP 2367
            |||.:   ||.|||||| ||||..||||||||||| |||||.||||||..|:...|:.|.|.|||
Mouse  2307 GNSGD---SVQEAKGSK-VEVTPPRKDKGRQKTTR-RRKRNANKKVVAITETRASEAEQTQSESP 2366

Human  2368 AANEGTTVQHPEAPQEEKQSEKPHSTPPQSCTSDLSKIPSTENSSQEISVEERTPTKASVPPDLP 2432
            ||.|.|... |||||||||||||.| ||..||.|.||.|..|:.|||.|..|:||.||.|.|.||
Mouse  2367 AAEEATAAT-PEAPQEEKQSEKPPS-PPAECTFDPSKTPPAESLSQENSAAEKTPCKAPVLPALP 2429

Human  2433 PPPQPAPVDEEPQARFRVHSIIESDPVTPPSDPSIPIPTLPSVTAAKLSPPVASGGIPHQSPPTK 2497
            |..|||.:|:.|||||:|||||||||||||||..||.||:|.||.|||.|||..||:||||||.|
Mouse  2430 PLSQPALMDDGPQARFKVHSIIESDPVTPPSDSGIPPPTIPLVTIAKLPPPVIPGGVPHQSPPPK 2494

Human  2498 VTEWITRQEEPRAQSTPSPALPPDTKASDVDTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPV 2562
            |||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.|||||||:||||||
Mouse  2495 VTEWITRQEEPRAQSTPSPALPPDTKASDMDTSSSTLRKILMDPKYVSATGVTSTSVTSAIAEPV 2559

Human  2563 SAAPCLHEAPPPPVDSKKPLEEKTAPPVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVIAPKITSVISRMPV 2627
            | ||||.|||.||.|.|.|..|..:.....|::.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Mouse  2560 S-APCLQEAPAPPCDPKHPPLEGVSAAAVPNADTQASEVPVAADKEKVAPVIAPKITSVISRMPV 2623

Human  2628 SIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVTTLKSLVSTPAGPVNV 2692
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||:
Mouse  2624 SIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVATLKGLVSTPAGPVNL 2688

Human  2693 LKGPVNVLTGPVNVLTTPVNATVGTVNAAPGTVNAAASAVNATASAVTVTAGAVTAASGGVTATT 2757
            |||||||||||||||||||:|||||||||||.|.||.                      ||||||
Mouse  2689 LKGPVNVLTGPVNVLTTPVSATVGTVNAAPGPVTAAC----------------------GVTATT 2731

Human  2758 GTVTMAGAVIAPSTKCKQRASANENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQ 2822
            ||..:.|||.||:.|.|||||:|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Mouse  2732 GTAAVTGAVTAPAAKGKQRASSNENSRFHPGSMSVIDDRPADTGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQ 2796

Human  2823 KTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKPDSVTASQPPSKGPQAPAGYANVATHSTLV 2887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:|.:|...||||.|:.:||||.|||||
Mouse  2797 KTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKADSITPTQSAPKGPQTPSAFANVAAHSTLV 2861

Human  2888 LTAQTYNASPVISSVKADRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPS 2952
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2862 LTAQTYNASPVISSVKTDRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPS 2926

Human  2953 IVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPHHPPALPSKLPTEVNHVPSGPSIPADRTVSHLA 3017
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||::|||
Mouse  2927 IVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGPTLTPHHPPALPSKLPAEVNHVPSGPSTPADRTIAHLA 2991

Human  3018 AAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPSSTASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPH 3082
            ..|.|.|||||:||.|..|||..|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2992 TPKPDTHSPRPTGPTPGLFPRPCHPSSTTSTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPH 3056

Human  3083 SITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTLPSITYSIRPEALHSPRAPLQPQQIEVRAPQRASTPQPAPAGV 3147
            ||||||||.|||||||||:||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..|||||..||
Mouse  3057 SITQTVSLGHLSQGEVRMSTPTLPSITYSIRPETLHSPRAPLQPQQIEARAPQRVGTPQPATTGV 3121

Human  3148 PALASQHPPEEEVHYHLPVARATAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRA 3212
            ||||:|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  3122 PALATQHPPEEEVHYHLPVARAAAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRA 3186

Human  3213 ADGVVKVPPASKAPQQPGKEAAKTPDAKAAPTPTPAPVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVTPSNQ 3277
            .:||||||||:|||||..|||.||.||||  .|.|||||||||:|.|||.|||||||||||||:|
Mouse  3187 TEGVVKVPPANKAPQQLVKEAVKTSDAKA--VPAPAPVPVPVPVPTPAPPPHGEARILTVTPSSQ 3249

Human  3278 LQGLPLTPPVVVTHGVQIVHSSGELFQEYRYGDIRTYHPPA-QLTHTQFPAASSVGLPSRTKTAA 3341
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.|| ||||||||.|||:.|.|||||:|
Mouse  3250 LQGLPLTPPVVVTHGVQIVHSSGELFQEYRYGDVRTYHAPAQQLTHTQFPVASSISLASRTKTSA 3314

Human  3342 QGPPPEGEPL------QPPQPVQSTQPAQPAPPCPPSQLGQPGQPPSSKMPQVSQEAKGTQT-GV 3399
            | .|||||||      ||....|:|||..|||||.||||.||.||||.|:|||||||||||| ||
Mouse  3315 Q-VPPEGEPLQSTQSAQPAPSTQATQPIPPAPPCQPSQLSQPAQPPSGKIPQVSQEAKGTQTGGV 3378

Human  3400 EQPRLPAGPANRPPEPHTQVQRAQAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAPKQPLFVPTTSG 3464
            ||.||||.|.|||.|||.|:|||..||...:.|||||||||||||..|.:|.|||||||||..||
Mouse  3379 EQTRLPAIPTNRPSEPHAQLQRAPVETAQPAHPSPVSVSMKPDLPSPLSSQAAPKQPLFVPANSG 3443

Human  3465 PSTPPGLVLPHTEFQPAPKQDSSPHLTSQRPVDMVQLLK-KYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVS 3528
            |||||||.|||.|.||||||:||||.|.||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Mouse  3444 PSTPPGLALPHAEVQPAPKQESSPHGTPQRPVDMVQLLKQKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVS 3508

Human  3529 GNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTE 3593
            |||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  3509 GNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEASQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTE 3573

Human  3594 SLKAAFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLM 3658
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  3574 SLKAAFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLM 3638

Human  3659 IVIASV 3664
            ||||||
Mouse  3639 IVIASV 3644

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SPENNP_055816.2 RRM1_SHARP 7..81 CDD:409784 73/73 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 70..89 18/18 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 103..164 57/60 (95%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 183..209 24/25 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 225..330 100/106 (94%)
RRM2_SHARP 336..409 CDD:409785 71/72 (99%)
RRM3_SHARP 436..509 CDD:409786 72/72 (100%)
RRM4_SHARP 510..586 CDD:409787 73/75 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 678..871 161/192 (84%)
PTZ00121 <776..1630 CDD:173412 676/853 (79%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 918..941 10/22 (45%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 957..1020 45/62 (73%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1070..1287 173/216 (80%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1366..1397 27/30 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1497..1524 20/26 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1588..2171 379/588 (64%)
PRK10263 <1657..>2249 CDD:236669 384/600 (64%)
PHA03307 1989..>2371 CDD:223039 223/389 (57%)
Interaction with MSX2. /evidence=ECO:0000250 2130..2464 211/340 (62%)
PHA03247 <2183..2588 CDD:223021 280/411 (68%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2185..2532 235/353 (67%)
DUF5585 2564..2954 CDD:465521 316/389 (81%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2566..2590 12/23 (52%)
Collagen_mid <2645..>2723 CDD:435053 73/77 (95%)
Interaction with RBPSUH. /evidence=ECO:0000250 2709..2870 116/160 (73%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2775..2806 27/30 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2847..2875 19/27 (70%)
PHA03247 <2948..3488 CDD:223021 453/547 (83%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2978..3010 28/31 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3022..3047 17/24 (71%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3135..3156 15/20 (75%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3208..3265 42/56 (75%)
SID/RD 3417..3664 223/247 (90%)
SPOC_SHARP 3504..3664 CDD:439206 158/159 (99%)
SpenXP_006539132.1 RRM1_SHARP 7..81 CDD:409784 73/73 (100%)
U2AF_lg 128..596 CDD:273727 455/467 (97%)
RRM2_SHARP 338..411 CDD:409785 71/72 (99%)
RRM3_SHARP 438..511 CDD:409786 72/72 (100%)
RRM4_SHARP 512..588 CDD:409787 73/75 (97%)
PTZ00121 <635..1272 CDD:173412 504/645 (78%)
PHA03247 <1629..2063 CDD:223021 292/442 (66%)
PHA03247 <2122..2642 CDD:223021 370/539 (69%)
Collagen_mid <2641..>2719 CDD:435053 73/77 (95%)
PHA03247 <2949..3474 CDD:223021 431/527 (82%)
SPOC_SHARP 3484..3644 CDD:439206 158/159 (99%)

Return to query results.
Submit another query.