DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SPEN and spen

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_055816.2 Gene:SPEN / 23013 HGNCID:17575 Length:3664 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_004919955.2 Gene:spen / 549816 XenbaseID:XB-GENE-493786 Length:3488 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:3772 Identity:2201/3772 - (58%)
Similarity:2644/3772 - (70%) Gaps:392/3772 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNS 65
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:
 Frog     1 MVRETRHLWVGNLPENVRDEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSDGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNA 65

Human    66 VNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDDTVSIASRSREVSGFRGGGGGPAYGPPPSLHAREGRYE 130
            ||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||..|||.||||.|:||||||||
 Frog    66 VNKMGDRDLRTDYNEPGTIPGAARVLDDTVSITSRSREVSGFRGSTGGPTYGPPQSIHAREGRYE 130

Human   131 RRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGGFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFD 195
            |||||||:.|||:||||||||||||| ||||||||||||||:.||||||||:||.|| |||.|||
 Frog   131 RRLDGASETRERSYEHSAYGHHERGT-GFDRTRHYDQDYYREARERTLQHGIYYNSR-RSPTRFD 193

Human   196 AHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDITREVRGRRPERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLAS 260
            .||.|||.||||||||||||||||:|.:::|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
 Frog   194 THDTRYETRAREQFTLPSVVHRDIFRSELSREVRGRRAERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLAS 258

Human   261 QASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSISSSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSS 325
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||:|||||||:||||||||||||||.:|.|.|
 Frog   259 QASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSLSSSSSTSSDSSESSSSSSDESPARSVQSAAVPAPPAQPLLS 323

Human   326 LEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQE 390
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||.|||||||||||||||||
 Frog   324 LDKDEPRKSFGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKYGKVTSVQIHGVSEERYGLVFFRQQEDQE 388

Human   391 KALTASKGKLFFGMQIEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLR 455
            |||.|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||.
 Frog   389 KALNASKGKLFFGMQIEVTAWVGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTHLDLH 453

Human   456 NIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVW 520
            |:|||||||||||:||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   454 NLFQRFGEIVDIDVKKVNGVPQYAFLQYSDIGSVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVW 518

Human   521 LDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVD 585
            :||||||:::||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.:|||
 Frog   519 IDGLSSNITEQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRFKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNDVKVD 583

Human   586 FANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAERR--EERRASYD--YNQDRTYYESVRTPGTYPEDS 646
            |||:|||||||..||.|||||||||::::|||  |.||.||.  .:.:|||||:|||||||.|:|
 Frog   584 FANQESQLAFYGSMESSGQDIRDFYDIISERRTDESRRGSYHEFTSAERTYYETVRTPGTYQEES 648

Human   647 RRDYPARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQDIREYSYRQRERERERERFES 711
            ||:||.|.||.|::|||||||:||.|||||.||||:|| |||||||||||||||||||||||||:
 Frog   649 RREYPTRSRELYTDWETYQGDFYEQRYYDDAREYREYR-DPYEQDIREYSYRQRERERERERFET 712

Human   712 DRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERLPSDSERRLYSRSSDRSGSCSSLSPPRYEK 776
            :||||||||..||||||.|.||||||..||||:||:.||.||::||||||||||||||||.|::|
 Frog   713 ERDRDHERRQTERSQSPTHTRRPQSPAGSPSQSERVASDPERKIYSRSSDRSGSCSSLSPSRFDK 777

Human   777 LDKSRLERYTKNEKTDKERTFDPERVE-RERRLIRKEKVEKDKTDKQKRKGKVHSPSSQSSETDQ 840
            |||:|.|||.|.|||:|:|:|:.||.: |..|..:.:|.||||.::.|||.|.||||||||||||
 Frog   778 LDKARAERYGKGEKTEKDRSFESERADKRPPRKEKSDKTEKDKPERTKRKSKNHSPSSQSSETDQ 842

Human   841 ENEREQSPEKPRSCNKL-SREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKEKEGKVIDHTPVEK-LKAKL 903
            |||:|.|.||.||..|. ::||.||:..:||||:||||||||||.||||||.|...:|| :|:|.
 Frog   843 ENEKEASLEKQRSNTKQPAKEKNDKDATSKNRLDLMPCVVLTRVNEKEGKVFDSPVLEKAVKSKP 907

Human   904 DNDTVKSSALDQKLQVSQTEPAKSDLSKLESVRMKVPKEKGLSSHVEVVEKEGRLKARKHLKPEQ 968
            :|::|||..:|||..:.:.:..|:|..|.|:||.||||||.|:||||||:|:|:.|.:||||.||
 Frog   908 ENESVKSPPVDQKALIPRLDQLKTDQVKSETVRNKVPKEKVLASHVEVVDKDGKQKVKKHLKVEQ 972

Human   969 PADGVSAVDLEKLEARKRRFADSNLKAEKQKPEVKKSSPEMEDARVLSKKQPDVSSREVILLREG 1033
            ||:|.|:.||||||||||||||:|||.::.|.|.::|..|.|||||.|||...||||:|.:|::|
 Frog   973 PAEGASSADLEKLEARKRRFADANLKCDRPKFETRRSIQEEEDARVCSKKLDAVSSRDVTVLKDG 1037

Human  1034 EAERKPVRKEILKRESKKIKLDRLNTVASPKDCQELASISVGSGSRPSSDLQARLGELAGESVEN 1098
            |:|||..|||:.||:.:|||.:|..||.||||.||  |:.:|:|.||:.|:|:||.|...|..|:
 Frog  1038 ESERKGSRKELSKRDIRKIKTERPFTVNSPKDGQE--SLPLGAGIRPNLDVQSRLVEPVDEQFES 1100

Human  1099 QEVQSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPE--REDVRKNYCSLRDETPERKS-GQEKSHSVNTEEKIG 1160
            .|..:||  .|..:.:.:|:.:|...|  ::|.||.||......|.|:. |.|:|   .||||:.
 Frog  1101 SETSTKK--ASVVKQRHMQLSEDADKELLKDDNRKMYCPPPPPPPPREMIGMERS---ETEEKLA 1160

Human  1161 IDIDHTQSYRKQMEQSRRKQQMEMEIAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPS 1225
            ||||:||||||||||:|:|||||:||.||||||||.|:.||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1161 IDIDYTQSYRKQMEQNRKKQQMELEILKSEKFGSPNKETDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPS 1225

Human  1226 KKKRMDHVDFDICTKRERNYRSSRQISEDSERTGGSPSVRHGSFHEDEDPIGSPRLLS---VKGS 1287
            |||:.|.|:|:|.||||||||||||||.:||||..|||||...|||||: .|.|::::   :|.|
 Frog  1226 KKKKTDLVEFEINTKRERNYRSSRQISNESERTPCSPSVRPFPFHEDEE-AGFPQVITMKEIKES 1289

Human  1288 PKVDEKVLPYSNITVREESLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDELNRWDSQMKQDAGRFD 1352
            .|||||. .:.:..::||..|..|.:|.::||||:..|.|:.|::.|:|. :||||:||:..|.|
 Frog  1290 AKVDEKT-TFPHPPIKEEPFKLIPSESIKKEQMAEPNKCKMPVMSPEEEY-KWDSQVKQECNRVD 1352

Human  1353 VSFPNSIIKRDSLRKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLSFLLRDREDKLRE 1417
            :.||::::||:|:|||| ||||||||.||||::.:|||:||:.:::.||||.|||||..|:||||
 Frog  1353 IGFPSNLVKRESIRKRS-RDLEPGEVQSDSDDESDHKSNSPKHASILESSRFSFLLRGSEEKLRE 1416

Human  1418 RDERLSSSLERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEK 1482
            |:||:|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||:.|||.|
 Frog  1417 REERISSSLEKNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDQRFANFRSTKDKVK 1481

Human  1483 VDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKMDDKKEDHKEEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQHLE 1547
            ||||||||||||||||||||||:||.||||| |||||||:|||||||||||||||||||||||||
 Frog  1482 VDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSDGKSDDKKE-HKEEEQEKQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQHLE 1545

Human  1548 RKEEDSDFISGRIYGKQTS-EGANSTTDSIQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPKEVEKQE 1611
            :|::|:|....|.:.:|.| :|.:|..|.:|||||||||||:|||||||||||:::.|||.||||
 Frog  1546 KKDDDTDISLVRPHWRQFSFDGTSSAPDLVQEPVVLFHSRFIELTRMQQKEKEREESPKETEKQE 1610

Human  1612 DTENHPKTPESAPENKDSELKTP----PSVGPPSVTVVTLESAPSALEKTTGDKT-VEAPLVTEE 1671
            :.|..||:|:..|||||.|||:|    |:..||: .|...|..|.|::|...||. .:.|.|.||
 Frog  1611 EKEVQPKSPDPVPENKDHELKSPLTSVPTPAPPA-PVSQPEPLPPAVDKLVPDKAPPDVPTVKEE 1674

Human  1672 KTVEPA-TVSEEAKPASEPA---------PAPVEQLEQVDLPPGADPDKEAAMMPAGVEEGSSGD 1726
            |..||. ...||.|||..||         |.||:.:|:|.:.|.          |:..|:....:
 Frog  1675 KPAEPVEPAPEEPKPAPVPASVSLDQPVPPEPVQVVEEVSVLPA----------PSAPEDVVPEE 1729

Human  1727 QPPYLDAKPPTPGASFSQAESNVDPEPDSTQPLSKPAQKSEEANEPKAEKPDATADAEPDANQKA 1791
            .|.|||.||||||||||:..||...|.:|:   :|||:..|| .:.:.:||......: ...|..
 Frog  1730 LPSYLDTKPPTPGASFSETPSNSITEMESS---TKPAKMVEE-TDLQEDKPSPVVSTD-IVCQTP 1789

Human  1792 EAAPESQPPASE-DLEVDPPVAAKDKKPNKSKRSKTPVQAAAVSIVEKPVTRKSERIDREKLKRS 1855
            :..|::||..|| |.|.:.....||||..||:|:         :..:||.||||.||||||..||
 Frog  1790 DVVPDAQPLGSENDTEAENSTPVKDKKTYKSRRA---------NAADKPATRKSVRIDREKRNRS 1845

Human  1856 NSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASK--NSAADLEHPEPSLPLSRTRRRNVRSVYATMGDHENRS 1918
            .|||||..|.||:|.|.|:.:|.|:|  :|.|:.|..||||||:|||||||||:|||.||::.::
 Frog  1846 TSPRGETPKHLEVKSEPERGSRNAAKSPSSVAEPESSEPSLPLARTRRRNVRSIYATTGDNDTQA 1910

Human  1919 PVKEPVEQPRVTRKRLERELQEA-AAVPTTPRRGRPPKTRRRADEE-------------EENEAK 1969
            .|||| |.||.||||||:|..|. |.||.  :||||||.||:..||             |:.|:|
 Frog  1911 AVKEP-ETPRSTRKRLEKEPTETPAVVPN--KRGRPPKVRRKTGEEVSPIKAEALKQEPEDTESK 1972

Human  1970 EPAETLKPPEGWRSPRSQKTA---AGGGPQGKKGKNEPK--VDAT--RPEATTEVGPQIGVKESS 2027
            :..|::||.|||||||:||.|   ...|.|||||||||:  .||:  ..|.:.|:...|   |..
 Frog  1973 DSTESIKPTEGWRSPRTQKLAHSPVSSGQQGKKGKNEPRPLQDASGESNEDSNEISEPI---EDC 2034

Human  2028 MEPKAAEEEAGSEQKRDRKDAGTDKNPPETAPVEVVEKKPAPEKNSKSKRGRSRNSRLAVD-KSA 2091
            .:.:..:||...|:|.::|:...|..|.|...|::.|||...|||||.|.||.:|::..|. |..
 Frog  2035 NKQRLGKEETFVEEKHEQKEEVADGCPAENTTVDISEKKNRLEKNSKPKGGRPKNAKPVVRLKGI 2099

Human  2092 SLK-NVDAAVSPRGAAAQAGERESGVVAVSPEKSESPQKEDGLSSQLKSD-----PVDPDKEPEK 2150
            .:: |||..   :||...|.:.|..|  |||.|.:||||:|..:....:.     |.:|||:   
 Frog  2100 EIRLNVDEV---KGAMRPAEDPEPTV--VSPVKIKSPQKDDAAAPTFPNQSETTFPENPDKD--- 2156

Human  2151 EDVSASGP--SPEATQLAKQMELEQAVEHIAKLAEASASAAYK----ADAPEGLAPEDRDKPAHQ 2209
               :.:||  ||||.|||:|||||||||:|.|:.|.:|..|||    ::.||..:.||.||||||
 Frog  2157 ---NPAGPKLSPEAAQLARQMELEQAVENIEKITETTAVPAYKDAQGSEVPETRSEEDGDKPAHQ 2218

Human  2210 ASETELAAAIGSIINDISGEPENFPAPPPYPGESQTDLQPPAGAQAL----QPSEEGMETDEAVS 2270
            ||||||||||||||.|||.:.|:|||.|.||.|.:|.:...:.|.|:    ||.:...|||:||:
 Frog  2219 ASETELAAAIGSIIYDISTDAESFPAAPTYPPERETTVPTDSAAAAVPNAAQPEQMEPETDQAVN 2283

Human  2271 GILETEA--ATESSRPPVNAPDPSA-GPTDTKEARGNSSETSHSVPEAKGSKEVEVTLVRKDKGR 2332
            .||.|.|  .|||:......|:|.| ..||:|||..:.||:|:|..||:.|:|.|.  :.|...|
 Frog  2284 IILGTNATPGTESTASTTLTPNPLAPESTDSKEADISFSESSNSAQEAEPSREAET--LPKHTPR 2346

Human  2333 QKTTRSRRKRN-TNKKVVAPVESHVPESNQAQGESPAANEGTTVQHPEAPQEEKQSEKPHSTPPQ 2396
            :|..|.|.:|. .:||......|.:.:.||:|  ||...|  .|:..|. |:||.||...:..|:
 Frog  2347 KKMPRHRSRRGPPSKKAEVVGTSSLEQDNQSQ--SPVKEE--KVKLAEG-QKEKTSEPTAALNPE 2406

Human  2397 SCTSDLSKIPSTENSSQEISVEERTPTKASVPPDLPPPPQPAPVDEEPQARFRVHSIIESDPVTP 2461
            ....:.....|::::..|.. |:|:|    |..:....|||..:|:..|..|::.|..|:.||:|
 Frog  2407 QQPLEPGLSSSSQDNDPEFK-EDRSP----VLKNAIQSPQPLLIDDVSQTSFKLRSSTENPPVSP 2466

Human  2462 PSDPSIPIPTLPSVTAAKLSPPVASGGIPHQSPPTKVTEWITRQEEPRAQSTPSPALPPDTKASD 2526
            |    :..|.|...|..||...|.:..:.|.| .:.:.||::|.|:....|||.|||||:|||||
 Frog  2467 P----VSSPPLQPGTPGKLPTSVLTSTLSHSS-TSIMPEWMSRHEDSNTISTPPPALPPNTKASD 2526

Human  2527 VDTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPVSAAPCLHEAPP-PPVDSKKPL-EEKTAPP 2589
            |||||||||||||:|||:|::| |.|.||:||:|||||:  |.|.|. ||:::.||: |||:|.|
 Frog  2527 VDTSSSTLRKILMEPKYISSSS-TPTIVTSAISEPVSAS--LAEEPTHPPLEAIKPVSEEKSAVP 2588

Human  2590 VTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVIAPKITSVISRMPVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSAL 2654
            :.|.....|:|..|.  :|||. ::|||.||||||||:|.|.|...:|||||..||         
 Frog  2589 LINAVVPPAAEAPVF--QEKVT-IVAPKATSVISRMPLSFDPEEMPRITLAKHPPQ--------- 2641

Human  2655 TGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVTTLKSLVSTPAGPVNVLKGPVNVLTGPVNVLTTPVNATVGTVN 2719
                    :|                                                      :
 Frog  2642 --------IP------------------------------------------------------S 2644

Human  2720 AAPGTVNAAASAVNATASAVTVTAGAVTAASGGVTATTGTVTMAGAVIAPSTKCKQRASANENSR 2784
            |||                                            ..||.|.|||.:.|::..
 Frog  2645 AAP--------------------------------------------CIPSQKIKQRQNINDSRT 2665

Human  2785 FHPGSMPVIDDRPADAGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQ 2849
            ....:|.:|:|||::.|...||||.||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||.||
 Frog  2666 CMKPAMSIIEDRPSETGPSPGLRVQTSQGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAVDIEIQQ 2730

Human  2850 SVSKSQVKPDSVTASQPPSKGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISSVKADRPSLEKPEP 2914
            ||||:|:|.:.||.||...||||.|.|:   :.|| ||..:|.:||||||||:|.:|.|:||.|.
 Frog  2731 SVSKTQIKQEPVTPSQILPKGPQTPGGF---SAHS-LVAGSQPFNASPVISSIKQERSSMEKAES 2791

Human  2915 IHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLG 2979
            .|  ||...:|.|.||||||  ..||||:|:|:      ||::||:.|   .|.|:|||||.||.
 Frog  2792 SH--VSNASSQLGAVKVLTQ--TNPPVLMHSQM------VTSSKKITD---AKAESKVLQPTNLS 2843

Human  2980 STLTPHHPPALPSKLPTEVNHVPSGPSIP-ADRTVSHLAAAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPS 3043
            ..|:||| .:...||.:|.|||.||.|.| |||.:.||:..|.:.|||..:|..||.|.|..|||
 Frog  2844 PGLSPHH-SSFSGKLQSEPNHVGSGASTPSADRGLPHLSIVKQEPHSPSVAGHSPSPFGRPCHPS 2907

Human  3044 STASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTLPSI 3108
            .|||.||:.||:||||||:|||.::||:||||:|||||||:||.|||.|||||:||:|||.||::
 Frog  2908 VTASPALTNNASVMLAAGMPVPPYMSSMHPEQTVIMPPHSVTQPVSLGHLSQGDVRINTPPLPAM 2972

Human  3109 TYSIRPEALHSPRAPLQPQQIEVRAPQRASTPQPA---PAGVPALASQHPPEEEVHYHLPVARAT 3170
            .|:|||||||||||.:|| |::.| |||::|||||   ...:|.::||||.:|:||||.|:.|.:
 Frog  2973 QYAIRPEALHSPRAAMQP-QLDAR-PQRSTTPQPAANREMVLPTMSSQHPQDEDVHYHHPIPRGS 3035

Human  3171 APVQSEVLVMQSEY-------RLHPY-----TVPRDVRIMVHPHVTAVSE------QPRAADGVV 3217
            |.||.::||||:||       ||.||     .:|||||:::|.|:|||.|      |.|..:|:|
 Frog  3036 AHVQPDMLVMQTEYRIPASGMRLDPYVPQDVVLPRDVRMIMHSHMTAVGEHHPEPRQSRTPEGLV 3100

Human  3218 KVPPASKAPQQPGKEAAKTPDAKAAPTPTPAPVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVTPSNQLQGLP 3282
            |.||.||.| ||.|:.||.||.|.                  :.:||.:||||.|.||    ||.
 Frog  3101 KTPPTSKTP-QPVKDLAKQPDVKR------------------SHSPHNDARILGVPPS----GLN 3142

Human  3283 LTPPVVVTHGVQIVHSSGELFQEYR--YGDIRTYHPPAQLTHTQFPAASSVGLPSRTKTAAQGPP 3345
            ::|.|||.|||.::|..|..|::||  |.|||.|| ||.|.|.|:.:|||:||.:|:.|      
 Frog  3143 MSPSVVVPHGVPLIHPPGSSFRDYRPVYSDIRNYH-PAPLPHPQYSSASSIGLHTRSLT------ 3200

Human  3346 PEGEPLQPPQPVQSTQPAQPAPPCPPSQLGQPG------QPPSSKMPQVSQEAKGTQTGV-EQPR 3403
                                     |||:|..|      |...||.|||||:.|...|.| ||..
 Frog  3201 -------------------------PSQVGGEGEHTHANQTGRSKTPQVSQDPKVPPTSVNEQTH 3240

Human  3404 LPAGPANR-PPEPHTQVQRAQAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAPKQPLFVPTTSGPST 3467
            .||...:. ..|.|.|    ...|...|:|||.::|||.:||.|..:|...||.:.:.:.:..||
 Frog  3241 HPAIKRHSGQMESHIQ----HLPTSQASYPSPSAISMKAELPSSHQSQALQKQAMCLSSPAISST 3301

Human  3468 PPGLVLPHTEFQPAPKQDSSPHLTSQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNV 3532
                 |..||.|..|||: .||    |.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  3302 -----LSRTELQSPPKQE-PPH----RSVDMVQLLTKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNV 3356

Human  3533 LAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVSQTESLKA 3597
            |||||||..|||||||||||||||||||:||||||.||:||||||||||||||||||:|||||||
 Frog  3357 LAHRSLPAPEGGPPLRIAQRMRLEATQLDGVARRMMVESDYCLLLALPCGRDQEDVVNQTESLKA 3421

Human  3598 AFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIA 3662
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  3422 AFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIA 3486

Human  3663 SV 3664
            ||
 Frog  3487 SV 3488

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SPENNP_055816.2 RRM1_SHARP 7..81 CDD:409784 70/73 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 70..89 17/18 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 103..164 51/60 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 183..209 19/25 (76%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 225..330 94/104 (90%)
RRM2_SHARP 336..409 CDD:409785 69/72 (96%)
RRM3_SHARP 436..509 CDD:409786 65/72 (90%)
RRM4_SHARP 510..586 CDD:409787 68/75 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 678..871 134/194 (69%)
PTZ00121 <776..1630 CDD:173412 537/863 (62%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 918..941 8/22 (36%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 957..1020 40/62 (65%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1070..1287 128/222 (58%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1366..1397 21/30 (70%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1497..1524 22/26 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1588..2171 269/630 (43%)
PRK10263 <1657..>2249 CDD:236669 280/639 (44%)
PHA03307 1989..>2371 CDD:223039 169/409 (41%)
Interaction with MSX2. /evidence=ECO:0000250 2130..2464 140/352 (40%)
PHA03247 <2183..2588 CDD:223021 179/418 (43%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2185..2532 143/358 (40%)
DUF5585 2564..2954 CDD:465521 151/391 (39%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2566..2590 11/25 (44%)
Collagen_mid <2645..>2723 CDD:435053 4/77 (5%)
Interaction with RBPSUH. /evidence=ECO:0000250 2709..2870 67/160 (42%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2775..2806 9/30 (30%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2847..2875 16/27 (59%)
PHA03247 <2948..3488 CDD:223021 256/571 (45%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2978..3010 15/32 (47%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3022..3047 12/24 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3135..3156 11/23 (48%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3208..3265 20/62 (32%)
SID/RD 3417..3664 187/246 (76%)
SPOC_SHARP 3504..3664 CDD:439206 153/159 (96%)
spenXP_004919955.2 RRM1_SHARP 7..81 CDD:409784 70/73 (96%)
RRM2_SHARP 334..407 CDD:409785 69/72 (96%)
RRM3_SHARP 434..507 CDD:409786 65/72 (90%)
RRM4_SHARP 508..584 CDD:409787 68/75 (91%)
PTZ00121 <614..1243 CDD:173412 397/636 (62%)
PTZ00449 <1727..2092 CDD:185628 172/384 (45%)
Herpes_BLLF1 <2511..3021 CDD:282904 311/650 (48%)
Atrophin-1 2906..>3319 CDD:460830 215/483 (45%)
SPOC_SHARP 3328..3488 CDD:439206 153/159 (96%)

Return to query results.
Submit another query.