DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DIS3 and Dis3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_055768.3 Gene:DIS3 / 22894 HGNCID:20604 Length:958 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001120955.1 Gene:Dis3 / 306103 RGDID:1304646 Length:957 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:958 Identity:882/958 - (92%)
Similarity:926/958 - (96%) Gaps:1/958 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVCPQPHY 65
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||.|.|:|||.||.|||||.||:|.|||:||.|||
  Rat     1 MLKSKTFLKKTRAGGVVKIVREHYLRDDIGCGTPACSACGAAHAGPALELQPRDQASSLCPWPHY 65

Human    66 LLPDTNVLLHQIDVLEDPAIRNVIVLQTVLQEVRNRSAPVYKRIRDVTNNQEKHFYTFTNEHHRE 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||:|
  Rat    66 LLPDTNVLLHQIDVLEDPAIRNVIVLQTVLQEVRNRSAPIYKRIRDVTNNQEKHFYTFTNEHHKE 130

Human   131 TYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCE 195
            ||:||||||||||||||||||||||||||| ||||:||||||.||||::|||||.||||||||||
  Rat   131 TYIEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHL-KMSAENQLQVILITNDKKNKEKAAEEGIPAFTCE 194

Human   196 EYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLE 260
            ||||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat   195 EYVKSLTANPELIDRLACLSDEMNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGSYLQGTFRASRENYLE 259

Human   261 ATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEE 325
            ||||||||.|:.|||::|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||:||
  Rat   260 ATVWIHGDKEDEKEILIQGLKHLNRAIHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEDDVEKDEE 324

Human   326 TERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQA 390
            .|.:||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   325 RELLLKTAVSEKMLRPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQA 389

Human   391 STLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKM 455
            |.|||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   390 SALEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVKNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKM 454

Human   456 PWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALD 520
            ||||||:||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat   455 PWSITEEDMKNREDLRHLCVCSVDPPGCTDIDDALHCRELSNGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALD 519

Human   521 QESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSK 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||:.:|||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat   520 QESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLRSNVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTRFTKSVINSK 584

Human   586 ASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPID 650
            |||||||||:|||||.||||||||||||||||||||:.|||||||||||||:|||||||||||||
  Rat   585 ASLTYAEAQMRIDSAAMNDDITTSLRGLNKLAKILKRGRIEKGALTLSSPEIRFHMDSETHDPID 649

Human   651 LQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKT 715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|:||||:|
  Rat   650 LQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEVLVKAAKSKNLEIRT 714

Human   716 DTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIR 780
            |||||||:|||:||.|.|||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||
  Rat   715 DTAKSLADSLDRAECPDFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDSDFHHYGLASPIYTHFTSPIR 779

Human   781 RYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGI 845
            ||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   780 RYADIIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLSDICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGI 844

Human   846 VSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVK 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|.||||||||:||.||||||||||||
  Rat   845 VSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPKPRLTYDDEIPSLRIEGTVFHVFDKVKVK 909

Human   911 IMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK 958
            |.|||||||||||||:|||||||||::|.|.|:||||||..||.||.|
  Rat   910 ITLDSSNLQHQKIRMALVEPQIPGINMPPDVSDMDLNGPGGKKRKLEK 957

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DIS3NP_055768.3 PIN_Rrp44-like 9..197 CDD:350211 167/187 (89%)
VacB 206..929 CDD:440323 675/722 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 938..958 13/19 (68%)
Dis3NP_001120955.1 PIN_Rrp44-like 9..196 CDD:350211 167/187 (89%)
VacB 205..928 CDD:440323 675/722 (93%)

Return to query results.
Submit another query.