DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SEC31A and Sec31a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001387083.1 Gene:SEC31A / 22872 HGNCID:17052 Length:1251 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006535255.1 Gene:Sec31a / 69162 MGIID:1916412 Length:1261 Species:Mus musculus


Alignment Length:1264 Identity:1150/1264 - (90%)
Similarity:1198/1264 - (94%) Gaps:16/1264 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSS 65
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MKLKEIDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSS 65

Human    66 SHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDV 130
            |||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Mouse    66 SHRYHKLIWGPHKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQKDKHTGPVRALDV 130

Human   131 NIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATV 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 NIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATV 195

Human   196 WDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFASSPLRVLENHA 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 WDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFASSPLRVLENHA 260

Human   261 RGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFD 325
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 RGILAVAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFD 325

Human   326 GRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWI 390
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
Mouse   326 GRISVYSIMGGSIDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQSAQHSIVLPLKKPPKWI 390

Human   391 RRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAEQQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFI 455
            ||||||||||||||||||:|.:|..||||||::| .||||||||||:||:||.|||.||||||||
Mouse   391 RRPVGASFSFGGKLVTFESVAVPLQQGAEQQRRQ-PVFISQVVTEKDFLNRSAQLQHAVQSQGFI 454

Human   456 NYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKVDGANVALKD 520
            .||||||:|||||||||||||||||||:||||||||||||||||||:|||||||||||.:|||||
Mouse   455 GYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEEDSRGKYLELLGYRKEDLGQKIALALNKVDGPDVALKD 519

Human   521 SDQVAQSDGEESPAAEEQLLGEHIKEEKEESEFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESA 585
            ||||||||||||||||||||||.|||||:|.:||||:|||||||||||||||||:||||||||||
Mouse   520 SDQVAQSDGEESPAAEEQLLGERIKEEKQECDFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITRALLTGNFESA 584

Human   586 VDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWR 650
            ||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
Mouse   585 VDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLAQTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWREIVESCDLKNWR 649

Human   651 EALAAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSHPL 715
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||:||||||||||||||:||||||||||||.||
Mouse   650 EALAAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLEREGDSLLRTQACLCYICAGNVERLVACWTKAQDGSSPL 714

Human   716 SLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDNTNQPNIM 780
            |||||||||||||||||||||:||:|||.|||.||||||:||||||||||||||||||||||||:
Mouse   715 SLQDLIEKVVILRKAVQLTQALDTNTVGALLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPDNTNQPNIV 779

Human   781 QLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEKQQLPKGRPGPVAGHHQMPRVQTQQYYPHVRIAPTVTTWS 845
            |||||||:|||:||:|.||.:.|||:|.|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Mouse   780 QLRDRLCKAQGKPVSGQESSQSPYERQPLSKGRPGPVAGHSQMPRVQTQQYYPHVRIAPTVTTWS 844

Human   846 NKTPTALPSHPPAASPSDTQGENPPPPGFIMHGNVNPNAAGQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQP 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.|..|||:||||.:|:|||||||||||
Mouse   845 NKTPTALPSHPPAASPSDTQGENPPPPGFIMQGNVIPNPAAPLPTAPGHMPSQLPPYPQPQPYQP 909

Human   911 AQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYISSASSYTGQSQLYAAQHQASSPTSSPATSFP 975
            ||.|.|||||:|.||||||||||.|||||||||||..:||:||.|:|.|| ||||||||.|.|| 
Mouse   910 AQQYSFGTGGAAAYRPQQPVAPPASNAYPNTPYISPVASYSGQPQMYTAQ-QASSPTSSSAASF- 972

Human   976 PPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPAASELPASQRT-------------GPQNGWN 1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||             |||||||
Mouse   973 PPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTPPAASELPASQRTENQSFQDQASILEGPQNGWN 1037

Human  1028 DPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSSQSSFPQPHLPGGQ 1092
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||.|.||||.:||||.||.|||
Mouse  1038 DPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPSGDPQSQGLQQQPSTPGPLSSHASFPQQHLAGGQ 1102

Human  1093 PFHGVQQPLGQTGMPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQSLPTKKITKKPIPDEHLILKTTFEDL 1157
            |||||||||.||||||||||||.|||||||||||.||||:|||:||||||||:||||||||||||
Mouse  1103 PFHGVQQPLAQTGMPPSFSKPNTEGAPGAPIGNTIQHVQALPTEKITKKPIPEEHLILKTTFEDL 1167

Human  1158 IQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTITSGLHNIARSIETRNYSEGLTMHTH 1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||:||||||||||||||::|||
Mouse  1168 IQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHSIARSIETRNYSEGLSVHTH 1232

Human  1223 IVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV 1251
            |||||||||||||||||||||:||:||||
Mouse  1233 IVSTSNFSETSAFMPVLKVVLSQASKLGV 1261

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SEC31ANP_001387083.1 WD40 13..332 CDD:475233 315/318 (99%)
WD40 repeat 13..65 CDD:293791 51/51 (100%)
WD40 repeat 70..119 CDD:293791 47/48 (98%)
WD40 repeat 125..162 CDD:293791 36/36 (100%)
WD40 repeat 172..208 CDD:293791 35/35 (100%)
WD40 repeat 214..257 CDD:293791 42/42 (100%)
WD40 repeat 263..302 CDD:293791 37/38 (97%)
WD40 repeat 306..331 CDD:293791 24/24 (100%)
ACE1-Sec16-like <573..>696 CDD:449359 117/122 (96%)
Atrophin-1 776..>1129 CDD:460830 303/365 (83%)
Sec31aXP_006535255.1 WD40 13..332 CDD:475233 315/318 (99%)
WD40 repeat 13..65 CDD:293791 51/51 (100%)
WD40 repeat 70..119 CDD:293791 47/48 (98%)
WD40 repeat 125..162 CDD:293791 36/36 (100%)
WD40 repeat 172..208 CDD:293791 35/35 (100%)
WD40 repeat 214..257 CDD:293791 42/42 (100%)
WD40 repeat 263..302 CDD:293791 37/38 (97%)
WD40 repeat 306..331 CDD:293791 24/24 (100%)
ACE1-Sec16-like <572..766 CDD:449359 181/193 (94%)
PHA03247 <750..1132 CDD:223021 321/383 (84%)

Return to query results.
Submit another query.