DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SEC31A and sec31a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001387083.1 Gene:SEC31A / 22872 HGNCID:17052 Length:1251 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_012816255.1 Gene:sec31a / 496576 XenbaseID:XB-GENE-5955093 Length:1261 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1312 Identity:891/1312 - (67%)
Similarity:1020/1312 - (77%) Gaps:112/1312 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSS 65
            |||||:|||||||||.:|.|||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||||||||||
 Frog     1 MKLKEIDRTAMQAWSHSQYHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLADPSMDMKSCATFSS 65

Human    66 SHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDV 130
            :||||||||||::..|.|..||||||||||||:|||||:|||.||:||||||.||||||||||||
 Frog    66 THRYHKLIWGPHRTASNGSASGVLIAGGENGNVILYDPAKIIEGDREVVIAQQDKHTGPVRALDV 130

Human   131 NIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATV 195
            |.||||||||||||||||||||||||.|||||||:||.|||.|||||||||||||||||||||||
 Frog   131 NSFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFAVPMTPGAKSQPLEDIGCIAWNRQVQHILASASPSGRATV 195

Human   196 WDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFASSPLRVLENHA 260
            |||||||||:|||||||||||||:||||||||||||:|||||||||||||||||||||||:|:|.
 Frog   196 WDLRKNEPILKVSDHSNRMHCSGMAWHPDVATQMVLSSEDDRLPVIQMWDLRFASSPLRVIESHT 260

Human   261 RGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFD 325
            |||||||||:||||||||.|||::||||||||||||||||||.|||||:||||||||||||||||
 Frog   261 RGILAIAWSLADPELLLSSGKDSRILCSNPNTGEVLYELPTNMQWCFDMQWCPRNPAVLSAASFD 325

Human   326 GRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWI 390
            ||||:||||||:.|.|.|||.||||||||||||||||.||||||:|||..|.:.::||||||||:
 Frog   326 GRISIYSIMGGNNDSLSQKQADKLSSSFGNLDPFGTGHPLPPLQLPQQPTQQNTIVPLKKPPKWM 390

Human   391 RRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAEQQQQQH--------HVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQ 447
            |.||||||||||||||||.|...:     .|||||        ||::||||||||||:||:|||.
 Frog   391 RCPVGASFSFGGKLVTFETVNTQT-----AQQQQHPEAEPHHFHVYVSQVVTEKEFLTRSNQLQD 450

Human   448 AVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNK-- 510
            .|.:..||:|||||::.::|:|||:||||||||||:|:|||||||||:||:||..|||..:..  
 Frog   451 VVSTGTFIDYCQKKVEDAKTDFEKDVWSFLKVNFEEDTRGKYLELLGFRKDDLSSKIASVMGNEY 515

Human   511 -VDGANVALKDSDQVAQSDGEESPAAEEQLLGEHIKEEKEESEFLPSSGGTFNISVSGDIDGLIT 574
             .||.:.|.|||||...||.||...:|:..|.|..|::|.:|....|.|.:.||.||||:|||||
 Frog   516 ATDGDHEAEKDSDQAIASDEEERQHSEDNFLAEVSKDDKRQSSGSNSPGESLNILVSGDVDGLIT 580

Human   575 QALLTGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKE 639
            ||||||||||||:|||||||||||:|||||||.||||:||:||||||||||||||||||.|||.|
 Frog   581 QALLTGNFESAVNLCLHDNRMADAVILAIAGGPELLAKTQRKYFAKSQSKITRLITAVVTKNWNE 645

Human   640 IVESCDLKNWREALAAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVAC 704
            ||:|||||||||||||||||.||||||:||||||:|||||||..|||||||||||||||||||:|
 Frog   646 IVQSCDLKNWREALAAVLTYTKPDEFSSLCDLLGSRLENEGDIALQTQACLCYICAGNVEKLVSC 710

Human   705 WTKAQDGSHPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAF 769
            ||||.|.:..|:|||||||||||||||      :|:.:|.:|:.|||||||:||||||:|||:||
 Frog   711 WTKAHDSNCSLALQDLIEKVVILRKAV------ETNDMGTILSQKMSQYANVLAAQGSLAAAMAF 769

Human   770 LPDNTNQPNIMQLRDRLCRAQGE-----PVAGHESPKIPYEKQQLPKGRPGPVAGHHQMPRVQ-- 827
            ||.:.:|.:::|||:|||||||:     |.||              ..|.|....|...| ||  
 Frog   770 LPTDAHQGDVVQLRERLCRAQGQVNIIAPAAG--------------VTRSGSTQQHGAKP-VQPG 819

Human   828 -TQQYYPHVRIAPTVTTWSNKTPTALPSHPPAASPSDTQGENPPPPGFIMHGNVNPNAAGQL--- 888
             ..||||..|||||||:||||.||||||..||||..|||..:..|.||.:.|:.  ..:|.|   
 Frog   820 TDMQYYPQARIAPTVTSWSNKNPTALPSFAPAASSFDTQRNSALPLGFNIPGST--YTSGSLASV 882

Human   889 ----PTSPGH-MHTQVPP-YPQPQPYQPAQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYISSA 947
                .::|.: :::|:.| .|..|||..:|.|.:|.||.|:|:||.|...|::..|.|:.|.|::
 Frog   883 ASADSSAPSYNINSQITPRLPYSQPYLQSQQYSYGMGGPAVYQPQPPSTVPSATPYHNSSYTSAS 947

Human   948 SS-----YTGQSQLYAAQHQASSPTSSPATSFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYAL-PPGTTG 1006
            .:     |.|.:.|        ||.||.::|.  ||||||||||||||||.:::..|| |||:||
 Frog   948 QTTTQPLYPGPALL--------SPASSASSSL--PPSSGASFQHGGPGAPANTAHCALPPPGSTG 1002

Human  1007 TLPAASELPASQRT------------GPQNGWNDPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPL 1059
            ||||.|||||||||            ||.|||||||||:|:.|||.: ||::||.|||:|||||:
 Frog  1003 TLPATSELPASQRTEYQSAQDTTYIQGPLNGWNDPPALSRISKKKVL-ENYVPPPPITAPIMNPV 1066

Human  1060 GDPQSQMLQ------QQPSAPVPLS--------SQSSFPQPHLPGGQPFHGVQQPL-GQTGMPPS 1109
            .||.||..|      |.||.|...|        :|:|||            :.||. .|.|:|..
 Frog  1067 TDPSSQQQQIPASGTQMPSIPFQPSTMLVAQPGTQTSFP------------ISQPCNSQPGLPLE 1119

Human  1110 FSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQSLPTKKITKKPIPDEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKL 1174
            .|||::|||||||||||.|.:.:||.:||.|.|||.||||||||||.||||||.||.||||||||
 Frog  1120 SSKPSMEGAPGAPIGNTIQAIHTLPAEKIVKNPIPGEHLILKTTFEALIQRCLCSANDPQTKRKL 1184

Human  1175 DDASKRLEFLYDKLREQTLSPTITSGLHNIARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVL 1239
            |||:||||:||||||||||||.|.:||||||||||:|||:|||.:||||||||||||||||||||
 Frog  1185 DDANKRLEYLYDKLREQTLSPAIIAGLHNIARSIESRNYTEGLNIHTHIVSTSNFSETSAFMPVL 1249

Human  1240 KVVLTQANKLGV 1251
            ||||||||||||
 Frog  1250 KVVLTQANKLGV 1261

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SEC31ANP_001387083.1 WD40 13..332 CDD:475233 282/318 (89%)
WD40 repeat 13..65 CDD:293791 46/51 (90%)
WD40 repeat 70..119 CDD:293791 37/48 (77%)
WD40 repeat 125..162 CDD:293791 34/36 (94%)
WD40 repeat 172..208 CDD:293791 33/35 (94%)
WD40 repeat 214..257 CDD:293791 40/42 (95%)
WD40 repeat 263..302 CDD:293791 34/38 (89%)
WD40 repeat 306..331 CDD:293791 23/24 (96%)
ACE1-Sec16-like <573..>696 CDD:449359 109/122 (89%)
Atrophin-1 776..>1129 CDD:460830 180/402 (45%)
sec31aXP_012816255.1 WD40 repeat 13..65 CDD:293791 46/51 (90%)
WD40 repeat 70..119 CDD:293791 37/48 (77%)
WD40 121..336 CDD:475233 196/214 (92%)
WD40 repeat 125..162 CDD:293791 34/36 (94%)
WD40 repeat 172..208 CDD:293791 33/35 (94%)
WD40 repeat 214..257 CDD:293791 40/42 (95%)
WD40 repeat 263..302 CDD:293791 34/38 (89%)
WD40 repeat 306..331 CDD:293791 23/24 (96%)
ACE1-Sec16-like <579..>702 CDD:449359 109/122 (89%)
Atrophin-1 807..>1153 CDD:460830 170/371 (46%)

Return to query results.
Submit another query.