DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SDK1 and sdk1a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_689957.3 Gene:SDK1 / 221935 HGNCID:19307 Length:2213 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_009297968.2 Gene:sdk1a / 558391 ZFINID:ZDB-GENE-081104-374 Length:2246 Species:Danio rerio


Alignment Length:2248 Identity:1495/2248 - (66%)
Similarity:1807/2248 - (80%) Gaps:54/2248 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    15 GGAEPPERAGPG-RPRGSPPGRARPSLAPR-------PGPEPSRPRAAPETSGG----------- 60
            ||.|..||..|| ..:..|.||...:|...       .|.:.||...|...|..           
Zfish     4 GGCEATERQFPGLSKKRRPAGRHNTALKEEEEEDSVYSGGDRSRKDTARSRSTALLTRVDKNAIM 68

Human    61 -DTAGAG--------RCGGRRAAKLGPGRR-------GWWALLALQLHLLRALAQDDVAPYFKTE 109
             |...|.        |..||..:  |.|:|       .|||...||:|:|.|:.|.|||||||||
Zfish    69 CDLKSASSSSSMIFTRFSGRNFS--GNGKRKFAVRTWSWWAFFCLQVHVLEAVTQGDVAPYFKTE 131

Human   110 PGLPQIHLEGNRLVLTCLAEGSWPLEFKWMRDDSELTTYSSEYKYIIPSLQKLDAGFYRCVVRNR 174
            ||.|:|||||||||:|||||||||||||||.:::::|.:|.||||.|.|||:.:.|.|:||||||
Zfish   132 PGPPEIHLEGNRLVMTCLAEGSWPLEFKWMLNNTDITAFSPEYKYTISSLQRSNMGVYQCVVRNR 196

Human   175 MGALLQRKSEVQVAYMGSFMDTDQRKTVSQGRAAILNLLPITSYPRPQVTWFREGHKIIPSNRIA 239
            ||||||:|:|:||||||.|:|.||||||:||||||||...::.:|||||||||:|:|||||||||
Zfish   197 MGALLQKKAEIQVAYMGDFIDNDQRKTVTQGRAAILNSPAVSCFPRPQVTWFRDGYKIIPSNRIA 261

Human   240 ITLENQLVILATTTSDAGAYYVQAVNEKNGENKTSPFIHLSIA--------RDVGTP-ETMAPTI 295
            ||||||||:|||..||||.|||||||||||||||||.|:|::|        .|...| :.:||.|
Zfish   262 ITLENQLVVLATAASDAGRYYVQAVNEKNGENKTSPSIYLNVAANKKYRGSHDSEAPADPVAPVI 326

Human   296 VVPPGNRSVVAGSSETTLECIASARPVEDLSVTWKRNGVRITSGLHSFGRRLTISNPTSADTGPY 360
            |:||.|.:||||.||.||||:|:|||||.||:.|:||||.:.||:.||.|||||.||||.|.|.|
Zfish   327 VIPPRNTTVVAGISEATLECVANARPVEKLSLVWRRNGVEVASGVGSFSRRLTIINPTSTDVGMY 391

Human   361 VCEAALPGSAFEPARATAFLFIIEPPYFTAEPESRISAEVEETVDIGCQAMGVPLPTLQWYKDAI 425
            ||||.|..|:.:||.|.|||.|.|.|||||||..::..|||::|||.|||.|||:|.|:|||||:
Zfish   392 VCEALLLDSSVKPAEARAFLSITEAPYFTAEPRRKMMGEVEKSVDIQCQARGVPMPKLEWYKDAV 456

Human   426 SISRLQNPRYKVLASGGLRIQKLRPEDSGIFQCFASNEGGEIQTHTYLDVTNIAPVFTQRPVDTT 490
            .:|:|.|||||:::|.||:::||:|.|:|||||||.|..||.|.|||||||::||.||..|:|.|
Zfish   457 PLSKLNNPRYKIISSMGLQVRKLQPSDAGIFQCFARNSAGEAQVHTYLDVTSMAPAFTAPPLDIT 521

Human   491 VTDGMTAILRCEVSGAPKPAITWKRENHILASGSVRIPRFMLLESGGLQIAPVFIQDAGNYTCYA 555
            ||||..|...|.|||||||||.|:|:..|||||||:||||.|||||||||.||.:||.|||||||
Zfish   522 VTDGAVAAFTCRVSGAPKPAIVWRRDTQILASGSVQIPRFTLLESGGLQIQPVVLQDTGNYTCYA 586

Human   556 ANTEGSLNASATLTVWNRTSIVHPPEDHVVIKGTTATLHCGATHDPRVSLRYVWKKDNVALTPSS 620
            ||:||::||||:||||:||||..||.|..|||||||.|.|||||||||.:|||||||...::.|.
Zfish   587 ANSEGAINASASLTVWSRTSISSPPTDRRVIKGTTAILECGATHDPRVGVRYVWKKDEELVSHSR 651

Human   621 TSRIVVEKDGSLLISQTWSGDIGDYSCEIVSEGGNDSRMARLEVIELPHSPQNLLVSPNSSHSHA 685
            ..||.:: :|||.||||||||||:|:|:::||.||:|:.||||||||||||:||..|.|::.|.:
Zfish   652 GGRISLQ-EGSLHISQTWSGDIGNYTCDVISEAGNESKEARLEVIELPHSPRNLQASLNANDSRS 715

Human   686 VVLSWVRPFDGNSPILYYIVELSENNSPWKVHLSNVGPEMTGVTVSGLTPARTYQFRVCAVNEVG 750
            |.|||:||||||||:|:|:||||||||||:|:||:|.|..||..|.||||||:|||||||||:||
Zfish   716 VDLSWMRPFDGNSPLLHYVVELSENNSPWRVYLSDVDPSGTGAMVKGLTPARSYQFRVCAVNQVG 780

Human   751 RGQYSAETSRLMLPEEPPSAPPKNIVASGRTNQSIMVQWQPPPETEHNGVLRGYILRYRLAGLPG 815
            |||||.||:||||.||||||||||||||||||||||||||||||.:.|||||||:||||||||||
Zfish   781 RGQYSTETNRLMLREEPPSAPPKNIVASGRTNQSIMVQWQPPPEPQLNGVLRGYVLRYRLAGLPG 845

Human   816 EYQQRNITSPEVNYCLVTDLIIWTQYEIQVAAYNGAGLGVFSRAVTEYTLQGVPTAPPQNVQTEA 880
            ||||:||:|||:||||:|:||||||||||||||.||||||||:.|||||||||||||||.|:.:|
Zfish   846 EYQQKNISSPEINYCLITELIIWTQYEIQVAAYTGAGLGVFSQPVTEYTLQGVPTAPPQGVEAKA 910

Human   881 VNSTTIQFLWNPPPQQFINGINQGYKLLAWPADAPEAVTVVTIAPDFHGVHH-GHITNLKKFTAY 944
            ||||||:|.||||||||||||||||||:|||..:||.|.||||.||:||..| |:|:.|:||:.|
Zfish   911 VNSTTIEFSWNPPPQQFINGINQGYKLMAWPERSPEEVIVVTITPDYHGTRHLGYISGLRKFSWY 975

Human   945 FTSVLCFTTPGDGPPSTPQLVWTQEDKPGAVGHLSFTEILDTSLKVSWQEPLEKNGIITGYQISW 1009
            .||||||||||:||.|.|:||.|.||.||.||.|||||||||||||||:||::||||||||.:||
Zfish   976 LTSVLCFTTPGNGPRSAPKLVQTFEDIPGPVGRLSFTEILDTSLKVSWEEPVDKNGIITGYLVSW 1040

Human  1010 EVYGRNDSRLTHTLNSTTHEYKIQGLSSLTTYTIDVAAVTAVGTGLVTSSTISSGVPPDLPGAPS 1074
            ||.|.|.||:...|.:||.:||:.||:||||||::|||:|..|.|.||||||||||||:|||.||
Zfish  1041 EVQGNNQSRVARNLANTTLDYKVTGLTSLTTYTLEVAAMTEAGVGTVTSSTISSGVPPELPGPPS 1105

Human  1075 NLVISNISPRSATLQFRPGYDGKTSISRWIVEGQVGAIGDEEEWVTLYEEENEPDAQMLEIPNLT 1139
            |||||.||.|||||:||.|.||||:||:||||||||:||::|||..|||:||:|:|||||:||||
Zfish  1106 NLVISKISSRSATLKFRAGDDGKTAISKWIVEGQVGSIGEDEEWKVLYEKENDPEAQMLEVPNLT 1170

Human  1140 PYTHYRFRMKQVNIVGPSPYSPSSRVIQTLQAPPDVAPTSVTVRTASETSLRLRWVPLPDSQYNG 1204
            |:|||||||:||||||||..|..|||||||||||||||:||||||||||||.|||||||:|:|||
Zfish  1171 PFTHYRFRMRQVNIVGPSAVSVPSRVIQTLQAPPDVAPSSVTVRTASETSLWLRWVPLPESEYNG 1235

Human  1205 NPESVGYRIKYWRSDLQSSAVAQVVSDRLEREFTIEELEEWMEYELQMQAFNAVGAGPWSEVVRG 1269
            ||||||||::..|:||:..|..::::||||||.|:|.||||.||:||:||||::|.|||||.|:|
Zfish  1236 NPESVGYRVRVMRADLRGEASTRLLNDRLEREITLEGLEEWTEYQLQIQAFNSIGPGPWSESVKG 1300

Human  1270 RTRESVPSAAPENVSAEAVSSTQILLTWTSVPEQDQNGLILGYKILFRAKDLDPEPRSHIVRGNH 1334
            ||||||||.|||||:|||:||::||:||..|||.:|||.|||||:||:.||.|.|.:.::|:||.
Zfish  1301 RTRESVPSGAPENVTAEAMSSSRILVTWGPVPEHEQNGNILGYKVLFKEKDSDSEAQVNVVKGNL 1365

Human  1335 TQSALLAGLRKFVLYELQVLAFTRIGNGVPSTPLILERTKDDAPGPPVRLVFPEVRLTSVRIVWQ 1399
            |||.||..|||:|.||:|||||||||:|..|.|.:|||||||.||||:||||||||||.||:|||
Zfish  1366 TQSVLLRNLRKYVQYEIQVLAFTRIGDGQLSNPPVLERTKDDVPGPPMRLVFPEVRLTEVRVVWQ 1430

Human  1400 PPEEPNGIILGYQIAYRLASSSPHTFTTVEVGATVRQFTATDLAPESAYIFRLSAKTRQGWGEPL 1464
            ||.:|||||:|||:||||.|..|:.|.|:|||...|||||:.|.||||||||:||||.||||.|.
Zfish  1431 PPVDPNGIIMGYQVAYRLDSGDPNQFITIEVGPDTRQFTASSLTPESAYIFRISAKTEQGWGSPA 1495

Human  1465 EATVITTEKRERPAPPRELLVPQAEVTARSLRLQWVPGSDGASPIRYFTMQVRELPRGEWQTYSS 1529
            :|.|||||.||||.|||:|.|||..|.:|.|.|.||||.||:||:||||:|.:|||.|||..:||
Zfish  1496 QAVVITTEIRERPQPPRQLRVPQDHVQSRKLLLNWVPGGDGSSPVRYFTLQTQELPSGEWIPHSS 1560

Human  1530 SISHEATACVVDRLRPFTSYKLRLKATNDIGDSDFSSETEAVTTLQDVPGEPPGSVSATPHTTSS 1594
            :|||..::..||||:||||||||:.||||:|||.:|.||:|:|||||||.|.|...|..|.||:|
Zfish  1561 AISHNYSSWEVDRLKPFTSYKLRMMATNDVGDSKYSQETDAITTLQDVPDEAPMIQSVKPSTTTS 1625

Human  1595 VLIQWQPPRDESLNGLLQGYRIYYRELEYEAGSGTEAKTLKNPIALHAELTAQSSFKTVNSSSTS 1659
            ||:|||.|::||:||:|.|||:|||||:|:: :..::|...|...|..||||:|:.|||::.|. 
Zfish  1626 VLVQWQTPKEESVNGVLVGYRLYYRELQYDS-TPQDSKRPVNSSQLRTELTAKSTVKTVSNPSL- 1688

Human  1660 TMCELTHLKKYRRYEVIMTAYNIIGESPASAPVEVFVGEAAPAMAPQNVQVTPLTASQLEVTWDP 1724
            |..|||.|:||||||::|||||:|||||.|||||||||||||::||||:|:..|:::||||.|:|
Zfish  1689 TEFELTQLQKYRRYEIVMTAYNVIGESPPSAPVEVFVGEAAPSVAPQNIQINTLSSTQLEVQWEP 1753

Human  1725 PPPESQNGNIQGYKIYYWEADSQNETEKMKVLFLPEPVVRLKNLTSHTKYLVSISAFNAAGDGPK 1789
            ||.|:|||.||||||.|||.|||||||::|:||.||..:|||||||:|.|:|.:.|||||||||.
Zfish  1754 PPAETQNGIIQGYKILYWEMDSQNETERVKILFRPETNMRLKNLTSYTYYMVKLLAFNAAGDGPF 1818

Human  1790 SDPQQGRTHQAAPGAPSFLAFSEITSTTLNVSWGEPAAANGILQGYRVVYEPLAPVQGVSKVVTV 1854
            |:|::|||.||||.||||::|||:||:|||||||.|.:.||:::||||||||.||:|||:|||||
Zfish  1819 SEPRRGRTLQAAPSAPSFISFSEVTSSTLNVSWGFPLSPNGVVEGYRVVYEPTAPIQGVTKVVTV 1883

Human  1855 EVRGNWQRWLKVRDLTKGVTYFFRVQARTITYGPELQANITAGPAEGSPGSPRDVLVTKSASELT 1919
            ::||:|||||||||||||:||.|||||:||.||||.:|||||||.:||||||.::.:||:.|.|.
Zfish  1884 DIRGSWQRWLKVRDLTKGMTYCFRVQAKTIAYGPEAEANITAGPVKGSPGSPVEMSITKTGSMLN 1948

Human  1920 LQWTEGHSGDTPTTGYVIEARPSDEGLWDMFVKDIPRSATSYTLSLDKLRQGVTYEFRVVAVNEA 1984
            :|||.|.:|....||||||||||||||||.||:.:|.::||:::|||:||||::|:|||:||||.
Zfish  1949 IQWTAGETGAGHVTGYVIEARPSDEGLWDTFVRHLPPTSTSHSVSLDRLRQGISYQFRVLAVNEF 2013

Human  1985 GYGEPSNPSTAVSAQVEAPFYEEWWFLLVMALSSLIVILLVVFALVLHGQNKKYKNCSTGKGIST 2049
            ||||||.||.|:||||:.|||||||||:|:||..||::|||||.|||||||:|||:|.|||.:||
Zfish  2014 GYGEPSAPSAAMSAQVDTPFYEEWWFLIVLALCGLILLLLVVFGLVLHGQNRKYKSCGTGKAVST 2078

Human  2050 MEESVTLDNGGFAALELSSRHLNVKSTFSKKNGTRSPPRPSPGGLHYSDEDICNKYNGAVLTESV 2114
            :||:||||||||.||||:||.::||..|.:||||||||||:|.||.|||||||:.|||.|.|||.
Zfish  2079 VEETVTLDNGGFTALELNSRPVHVKGVFLRKNGTRSPPRPNPAGLRYSDEDICSNYNGVVSTEST 2143

Human  2115 SLKEKSADASESEATDSDYEDALPKHSFVNHYMSDPTYYNSWKRRAQG-RAPAPHRYEAVAGSEA 2178
            :|.|:.|:.||||||||:.|:...||||||||||||:|:|||||:.:| :......||..|..:.
Zfish  2144 ALTERPAEMSESEATDSECEEEPIKHSFVNHYMSDPSYFNSWKRQQKGLKQTLACSYEECASGDN 2208

Human  2179 GAQLHPVITTQSAGGVYTPAG---PGARTPLTGFSSFV 2213
            .:....|:|..|.||||||||   ||:|||:|||||||
Zfish  2209 ESYYQTVVTQHSVGGVYTPAGQPAPGSRTPVTGFSSFV 2246

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SDK1NP_689957.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..73 21/85 (25%)
PHA03247 <2..80 CDD:223021 22/92 (24%)
Ig_3 104..173 CDD:464046 48/68 (71%)
Ig 193..274 CDD:472250 64/80 (80%)
Ig strand B 208..212 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 222..226 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 245..248 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand F 258..263 CDD:409353 3/4 (75%)
Ig_3 293..364 CDD:464046 47/70 (67%)
Ig 386..475 CDD:472250 55/88 (63%)
Ig strand B 404..408 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 417..421 CDD:409353 1/3 (33%)
Ig strand E 441..445 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand F 455..460 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 468..471 CDD:409353 1/2 (50%)
I-set 480..570 CDD:400151 63/89 (71%)
Ig strand B 497..501 CDD:409353 1/3 (33%)
Ig strand C 510..514 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand E 536..540 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 550..555 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 563..566 CDD:409353 2/2 (100%)
FN3 <607..1053 CDD:442628 325/446 (73%)
FN3 668..759 CDD:238020 64/90 (71%)
FN3 <937..>1204 CDD:442628 198/266 (74%)
fn3 1176..1264 CDD:394996 60/87 (69%)
FN3 <1251..1595 CDD:442628 229/343 (67%)
FN3 1378..1471 CDD:238020 66/92 (72%)
FN3 <1522..1906 CDD:442628 254/383 (66%)
FN3 1903..1996 CDD:238020 57/92 (62%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2075..2098 15/22 (68%)
PDZ-binding. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q6V4S5 2207..2213 5/5 (100%)
sdk1aXP_009297968.2 None

Return to query results.
Submit another query.