DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SDK1 and Sdk1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_689957.3 Gene:SDK1 / 221935 HGNCID:19307 Length:2213 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038945791.1 Gene:Sdk1 / 304297 RGDID:1560686 Length:2306 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2215 Identity:1983/2215 - (89%)
Similarity:2079/2215 - (93%) Gaps:24/2215 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MARGARPSAAGGGGGGAEPPERAGPGRPRGSPPGRARPSLAPRPGPEPSRP--RAAPETSGGDTA 63
            ||| ||||.|  |||||.|||||||||||.|..|.         ..:|.||  ||||.|.|   .
  Rat   114 MAR-ARPSVA--GGGGAAPPERAGPGRPRRSRTGH---------HCDPERPGLRAAPRTPG---P 163

Human    64 GAGRCGGRRAAKLGPGRRGWWALLALQLHLLRALAQDDVAPYFKTEPGLPQIHLEGNRLVLTCLA 128
            ||    |||:|||.|| |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   164 GA----GRRSAKLRPG-RGWWALLLLQLHLLRALAQDDVAPYFKTEPGLPQIHLEGNRLVLTCLA 223

Human   129 EGSWPLEFKWMRDDSELTTYSSEYKYIIPSLQKLDAGFYRCVVRNRMGALLQRKSEVQVAYMGSF 193
            ||||||||||:|:|||||.|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:|
  Rat   224 EGSWPLEFKWIRNDSELTAYSSEYRYIIPSLQKLDAGFYRCVVRNRMGALLQRKSEIQVAYMGNF 288

Human   194 MDTDQRKTVSQGRAAILNLLPITSYPRPQVTWFREGHKIIPSNRIAITLENQLVILATTTSDAGA 258
            ||.|||||||||.||:||||||||.|||||||||||||||||:||||||||||||||||.|||||
  Rat   289 MDADQRKTVSQGHAALLNLLPITSCPRPQVTWFREGHKIIPSSRIAITLENQLVILATTASDAGA 353

Human   259 YYVQAVNEKNGENKTSPFIHLSIARDVGTPETMAPTIVVPPGNRSVVAGSSETTLECIASARPVE 323
            ||||||||:|||||||||||||:|||.||.|.|||.|||.|||||||||||||||||||:|||||
  Rat   354 YYVQAVNERNGENKTSPFIHLSVARDTGTQEAMAPVIVVAPGNRSVVAGSSETTLECIANARPVE 418

Human   324 DLSVTWKRNGVRITSGLHSFGRRLTISNPTSADTGPYVCEAALPGSAFEPARATAFLFIIEPPYF 388
            :|||.|||||||:||||||:||||||.||||||||.|||||.|.|||||||||.|||.|||||||
  Rat   419 ELSVHWKRNGVRLTSGLHSYGRRLTIINPTSADTGMYVCEATLRGSAFEPARAKAFLSIIEPPYF 483

Human   389 TAEPESRISAEVEETVDIGCQAMGVPLPTLQWYKDAISISRLQNPRYKVLASGGLRIQKLRPEDS 453
            ||||||||..||||||||.|:|||||||||||||||:.:|:||||||:||.||||.||||.||||
  Rat   484 TAEPESRILGEVEETVDIPCRAMGVPLPTLQWYKDAVPLSKLQNPRYRVLPSGGLHIQKLSPEDS 548

Human   454 GIFQCFASNEGGEIQTHTYLDVTNIAPVFTQRPVDTTVTDGMTAILRCEVSGAPKPAITWKRENH 518
            |||||||:|||||||||||||||||||.||||||||||||||||:||||||||||||||||:.||
  Rat   549 GIFQCFANNEGGEIQTHTYLDVTNIAPAFTQRPVDTTVTDGMTAVLRCEVSGAPKPAITWKKGNH 613

Human   519 ILASGSVRIPRFMLLESGGLQIAPVFIQDAGNYTCYAANTEGSLNASATLTVWNRTSIVHPPEDH 583
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||.|||.|||.|:||||.|||||||||||||||.
  Rat   614 ILASGSVRIPRFMLLESGGLRIAPVFIQDAGNYACYATNTEASVNASAMLTVWNRTSIVHPPEDR 678

Human   584 VVIKGTTATLHCGATHDPRVSLRYVWKKDNVALTPSSTSRIVVEKDGSLLISQTWSGDIGDYSCE 648
            ||||||||||.||||||||.||||||||||..:||||:|||||||||||:||||||||||||:||
  Rat   679 VVIKGTTATLCCGATHDPRTSLRYVWKKDNAVITPSSSSRIVVEKDGSLVISQTWSGDIGDYTCE 743

Human   649 IVSEGGNDSRMARLEVIELPHSPQNLLVSPNSSHSHAVVLSWVRPFDGNSPILYYIVELSENNSP 713
            ||||||||||.||||||||||.|||||.|.:|:.||:|.||||||||||||:|||||::||||||
  Rat   744 IVSEGGNDSRTARLEVIELPHPPQNLLASLSSARSHSVTLSWVRPFDGNSPVLYYIVQVSENNSP 808

Human   714 WKVHLSNVGPEMTGVTVSGLTPARTYQFRVCAVNEVGRGQYSAETSRLMLPEEPPSAPPKNIVAS 778
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||:||:||||.||||||||||||||||||||||
  Rat   809 WKVHLSNVGPEMAGVTVSGLTPARTYQFRVCAVNQVGKGQYSTETSRLMLPEEPPSAPPKNIVAS 873

Human   779 GRTNQSIMVQWQPPPETEHNGVLRGYILRYRLAGLPGEYQQRNITSPEVNYCLVTDLIIWTQYEI 843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||
  Rat   874 GRTNQSIMVQWQPPPETEHNGVLRGYILRYRLAGLPGEHQQRNISSPEVNYCLVTDLIIWTQYEI 938

Human   844 QVAAYNGAGLGVFSRAVTEYTLQGVPTAPPQNVQTEAVNSTTIQFLWNPPPQQFINGINQGYKLL 908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||:.|||||||||||||||||||||
  Rat   939 QVAAYNGAGLGVFSRAVTEYTLQGVPTAPPQNVQAEAVNSTTVHFLWNPPPQQFINGINQGYKLL 1003

Human   909 AWPADAPEAVTVVTIAPDFHGVHHGHITNLKKFTAYFTSVLCFTTPGDGPPSTPQLVWTQEDKPG 973
            ||||||||.||.|||||||||.|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.||:||
  Rat  1004 AWPADAPETVTAVTIAPDFHGTHHGYITNLKKFTAYFTSVLCFTTPGDGPPSTPQLVWTHEDRPG 1068

Human   974 AVGHLSFTEILDTSLKVSWQEPLEKNGIITGYQISWEVYGRNDSRLTHTLNSTTHEYKIQGLSSL 1038
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1069 AVGHLSFTEILDTSLKVSWQEPLERNGIITGYQISWEVYGRNDSRLTHTLNSTTHEYKIQGLSSL 1133

Human  1039 TTYTIDVAAVTAVGTGLVTSSTISSGVPPDLPGAPSNLVISNISPRSATLQFRPGYDGKTSISRW 1103
            |||||||||:|..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||
  Rat  1134 TTYTIDVAAMTTAGVGLTTSSTISSGVPPDLPGAPSNLVISNISPRSATLQFRPGYDGKTAICRW 1198

Human  1104 IVEGQVGAIGDEEEWVTLYEEENEPDAQMLEIPNLTPYTHYRFRMKQVNIVGPSPYSPSSRVIQT 1168
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||
  Rat  1199 IVEGQVGAIGDEEEWVTLYEEENEPDAQMLEIPNLTPYTHYRFRMKQVNIVGPSPFSQSSRVIQT 1263

Human  1169 LQAPPDVAPTSVTVRTASETSLRLRWVPLPDSQYNGNPESVGYRIKYWRSDLQSSAVAQVVSDRL 1233
            |||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||..|||:||||:|||
  Rat  1264 LQAPPDVAPTSLTVRTASETSLRLRWVPLPDSQYNGNPESVGYRVKYWRSDQPSSALAQVVNDRL 1328

Human  1234 EREFTIEELEEWMEYELQMQAFNAVGAGPWSEVVRGRTRESVPSAAPENVSAEAVSSTQILLTWT 1298
            |||.||||||||.||||:||||||:|||||||:||||||||||||:||||||||||||||||||.
  Rat  1329 ERELTIEELEEWTEYELRMQAFNAIGAGPWSELVRGRTRESVPSASPENVSAEAVSSTQILLTWA 1393

Human  1299 SVPEQDQNGLILGYKILFRAKDLDPEPRSHIVRGNHTQSALLAGLRKFVLYELQVLAFTRIGNGV 1363
            |||||||||||||||:|:||||||||||||:||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat  1394 SVPEQDQNGLILGYKVLYRAKDLDPEPRSHVVRGNHTQSALLAGLRKFVVYELQVLAFTRIGNGV 1458

Human  1364 PSTPLILERTKDDAPGPPVRLVFPEVRLTSVRIVWQPPEEPNGIILGYQIAYRLASSSPHTFTTV 1428
            ||:||||||||||.|||||||||||||||:|||||||||||||:||||||||||||.||||||||
  Rat  1459 PSSPLILERTKDDTPGPPVRLVFPEVRLTAVRIVWQPPEEPNGVILGYQIAYRLASGSPHTFTTV 1523

Human  1429 EVGATVRQFTATDLAPESAYIFRLSAKTRQGWGEPLEATVITTEKRERPAPPRELLVPQAEVTAR 1493
            ||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1524 EVGATVRQFTATELAPESAYIFRLSAKTRQGWGEPLEATVITTEKRERPAPPRELLVPQAEVTAR 1588

Human  1494 SLRLQWVPGSDGASPIRYFTMQVRELPRGEWQTYSSSISHEATACVVDRLRPFTSYKLRLKATND 1558
            ||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||.|.|:|||||||||||||||||
  Rat  1589 SLRLQWVPGSDGASPIRYFTVQVRELPGGEWQTYSSSISHEATLCAVERLRPFTSYKLRLKATND 1653

Human  1559 IGDSDFSSETEAVTTLQDVPGEPPGSVSATPHTTSSVLIQWQPPRDESLNGLLQGYRIYYRELEY 1623
            |||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat  1654 IGDSDFSAETEAVTTLQDVPGEPPGSVSATPHTTSSVLIQWQPPRDESLNGLLQGYRIYYRELES 1718

Human  1624 EAGSGTEAKTLKNPIALHAELTAQSSFKTVNSSSTSTMCELTHLKKYRRYEVIMTAYNIIGESPA 1688
            |.|...|.||||:|.||.|||||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1719 ETGLSPEPKTLKSPSALRAELTAQSSFKTVNSSSTLTTYELTHLKKYRRYEVIMTAYNIIGESPA 1783

Human  1689 SAPVEVFVGEAAPAMAPQNVQVTPLTASQLEVTWDPPPPESQNGNIQGYKIYYWEADSQNETEKM 1753
            |.|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:||||||
  Rat  1784 SVPVEVFVGEAAPAMAPQNIQVTPLTASQLEVTWDPPPPESQNGNIQGYKVYYWEADSRNETEKM 1848

Human  1754 KVLFLPEPVVRLKNLTSHTKYLVSISAFNAAGDGPKSDPQQGRTHQAAPGAPSFLAFSEITSTTL 1818
            ||||||||||::|:|||||||||||||||||||||:|||.||||||||||.||||.|||||||||
  Rat  1849 KVLFLPEPVVKIKDLTSHTKYLVSISAFNAAGDGPRSDPCQGRTHQAAPGPPSFLEFSEITSTTL 1913

Human  1819 NVSWGEPAAANGILQGYRVVYEPLAPVQGVSKVVTVEVRGNWQRWLKVRDLTKGVTYFFRVQART 1883
            |||||||:||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1914 NVSWGEPSAANGILQGYRVVYEPLAPVQGVSKVVTVDVKGNWQRWLKVRDLTKGVTYFFRVQART 1978

Human  1884 ITYGPELQANITAGPAEGSPGSPRDVLVTKSASELTLQWTEGHSGDTPTTGYVIEARPSDEGLWD 1948
            |.||||||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||::|:|||||||||||||||||||
  Rat  1979 IAYGPELQANVTAGPAEGSPGSPRNVLVTKSASELTLQWTEGNTGNTPTTGYVIEARPSDEGLWD 2043

Human  1949 MFVKDIPRSATSYTLSLDKLRQGVTYEFRVVAVNEAGYGEPSNPSTAVSAQVEAPFYEEWWFLLV 2013
            ||.|||||||||||:.||||||||||||||||||:||:||||.||.|||||.|||||||||||||
  Rat  2044 MFAKDIPRSATSYTVGLDKLRQGVTYEFRVVAVNKAGFGEPSRPSIAVSAQAEAPFYEEWWFLLV 2108

Human  2014 MALSSLIVILLVVFALVLHGQNKKYKNCSTGKGISTMEESVTLDNGGFAALELSSRHLNVKSTFS 2078
            :|||||:::|||||.||||||:||||||.:|||||.|||:|||||||||||||:|||||||||||
  Rat  2109 IALSSLLLVLLVVFVLVLHGQSKKYKNCGSGKGISNMEETVTLDNGGFAALELNSRHLNVKSTFS 2173

Human  2079 KKNGTRSPPRPSPGGLHYSDEDICNKYNGAVLTESVSLKEKSADASESEATDSDYEDALPKHSFV 2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.|.|||||:|||||:||||||||
  Rat  2174 KKNGTRSPPRPSPGGLHYSDEDICNKYNGAVLTESVNLKEKSVDGSESEASDSDYEEALPKHSFV 2238

Human  2144 NHYMSDPTYYNSWKRRAQGRAPAPHRYEAVAGSEAGAQLHPVITTQSAGGVYTPAGPGARTPLTG 2208
            ||||||||||||||||..  |.||||||||||:|||..||.|||||||||||||||||||.||||
  Rat  2239 NHYMSDPTYYNSWKRRPP--AAAPHRYEAVAGAEAGPHLHTVITTQSAGGVYTPAGPGARAPLTG 2301

Human  2209 FSSFV 2213
            |||||
  Rat  2302 FSSFV 2306

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SDK1NP_689957.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..73 39/73 (53%)
PHA03247 <2..80 CDD:223021 43/79 (54%)
Ig_3 104..173 CDD:464046 64/68 (94%)
Ig 193..274 CDD:472250 73/80 (91%)
Ig strand B 208..212 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand C 222..226 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 245..248 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand F 258..263 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig_3 293..364 CDD:464046 61/70 (87%)
Ig 386..475 CDD:472250 75/88 (85%)
Ig strand B 404..408 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 417..421 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 441..445 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 455..460 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 468..471 CDD:409353 2/2 (100%)
I-set 480..570 CDD:400151 79/89 (89%)
Ig strand B 497..501 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand C 510..514 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 536..540 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 550..555 CDD:409353 3/4 (75%)
Ig strand G 563..566 CDD:409353 2/2 (100%)
FN3 <607..1053 CDD:442628 408/445 (92%)
FN3 668..759 CDD:238020 75/90 (83%)
FN3 <937..>1204 CDD:442628 253/266 (95%)
fn3 1176..1264 CDD:394996 77/87 (89%)
FN3 <1251..1595 CDD:442628 322/343 (94%)
FN3 1378..1471 CDD:238020 88/92 (96%)
FN3 <1522..1906 CDD:442628 351/383 (92%)
FN3 1903..1996 CDD:238020 81/92 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2075..2098 22/22 (100%)
PDZ-binding. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q6V4S5 2207..2213 5/5 (100%)
Sdk1XP_038945791.1 PHA03307 <38..>162 CDD:223039 34/59 (58%)
Ig_3 199..268 CDD:464046 64/68 (94%)
Ig 288..369 CDD:472250 73/80 (91%)
Ig strand B 303..307 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand C 317..321 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 340..343 CDD:409353 2/2 (100%)
Ig strand F 353..358 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig_3 388..460 CDD:464046 62/71 (87%)
Ig 481..570 CDD:472250 75/88 (85%)
Ig strand B 499..503 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand C 512..516 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 536..540 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 550..555 CDD:409353 4/4 (100%)
Ig strand G 563..566 CDD:409353 2/2 (100%)
I-set 575..665 CDD:400151 79/89 (89%)
Ig strand B 592..596 CDD:409353 2/3 (67%)
Ig strand C 605..609 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand E 631..635 CDD:409353 3/3 (100%)
Ig strand F 645..650 CDD:409353 3/4 (75%)
Ig strand G 658..661 CDD:409353 2/2 (100%)
FN3 <667..1142 CDD:442628 437/474 (92%)
fn3 765..850 CDD:394996 70/84 (83%)
fn3 866..952 CDD:394996 83/85 (98%)
FN3 1165..1261 CDD:238020 91/95 (96%)
FN3 1271..1366 CDD:238020 83/94 (88%)
FN3 <1346..1684 CDD:442628 316/337 (94%)
FN3 1473..1566 CDD:238020 88/92 (96%)
FN3 <1614..2036 CDD:442628 384/421 (91%)
FN3 1998..2091 CDD:238020 81/92 (88%)

Return to query results.
Submit another query.