Protein Alignment FANCD2 and Fancd2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_149075.2
• Gene: FANCD2 / 2177
• HGNCID: 3585
• Length: 1471
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001001719.1
• Gene: Fancd2 / 312641
• RGDID: 1303172
• Length: 1454
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1443
• Identity: 1089/1443 - (75%)
• Similarity: 1224/1443 - (84%)
• Gaps: 8/1443 - (0%)

Human     1 MVSKRRLSKSEDKESLTEDASKTRKQPLSKKTKKSHIANEVEENDSIFVKLLKISGIILKTGESQ 65
            |||||.....||||:|.|||||..||||||..|||..::|||||.|:||:|||.||:.||||::|
  Rat     4 MVSKRSRLDFEDKETLAEDASKIMKQPLSKLAKKSCGSHEVEENGSVFVRLLKASGLTLKTGDNQ 68

Human    66 NQLAVDQIAFQKKLFQTLRRHPSYPKIIEEFVSGLESYIEDEDSFRNCLLSCERLQDEEASMGAS 130
            |||.||||.||:||||.||:||||||:|||||:|||||.||.||.||||||||||||||||||..
  Rat    69 NQLGVDQIIFQRKLFQALRKHPSYPKVIEEFVNGLESYTEDIDSLRNCLLSCERLQDEEASMGTF 133

Human   131 YSKSLIKLLLGIDILQPAIIKTLFEKLPEYFFENKNSDEINIPRLIVSQLKWLDRVVDGKDLTTK 195
            |||||||||||||||||||||.||||:|::.||:::.|.|::||||:||||||||:||.|||||:
  Rat   134 YSKSLIKLLLGIDILQPAIIKMLFEKVPQFLFESESRDGISMPRLIISQLKWLDRIVDSKDLTTQ 198

Human   196 IMQLISIAPENLQHDIITSLPEILGDSQHADVGKELSDLLIENTSLTVPILDVLSSLRLDPNFLL 260
            :|||||:||.|||||.||||||||||||||:||||||:||::|||||||||||.||||||||||.
  Rat   199 MMQLISVAPVNLQHDFITSLPEILGDSQHANVGKELSELLVQNTSLTVPILDVFSSLRLDPNFLS 263

Human   261 KVRQLVMDKLSSIRLEDLPVIIKFILHSVTAMDTLEVISELREKLDLQHCVLPSRLQASQVKLKS 325
            ::|||||.||||:||||||||:||||||||...:||||:||||||::||..||||:||||.||||
  Rat   264 EIRQLVMGKLSSVRLEDLPVIVKFILHSVTDSTSLEVIAELREKLNVQHFTLPSRIQASQSKLKS 328

Human   326 KGRASSSGNQESSGQSCIILLFDVIKSAIRYEKTISEAWIKAIENTASVSEHKVFDLVMLFIIYS 390
            ||.||||||||:|.:.||:|||||||||||||||||||||||||...|.:|||..|:.||.|||.
  Rat   329 KGLASSSGNQENSDKDCIVLLFDVIKSAIRYEKTISEAWIKAIERIQSAAEHKALDVAMLLIIYG 393

Human   391 TNTQTKKYIDRVLRNKIRSGCIQEQLLQSTFSVHYLVLKDMCSSILSLAQSLLHSLDQSIISFGS 455
            |:|||||.::|:|||||:|.|||||||.||||.|.|||||:|.|||.|||:|.||.||.||.|||
  Rat   394 TSTQTKKGVERLLRNKIQSDCIQEQLLDSTFSTHCLVLKDICPSILLLAQTLFHSQDQRIILFGS 458

Human   456 LLYKYAFKFFDTYCQQEVVGALVTHICSGNEAEVDTALDVLLELVVLNPSAMMMNAVFVKGILDY 520
            ||.||||||||||||||||||||||:|||||||||.||||||||:|||.|||.:||.|:||||||
  Rat   459 LLCKYAFKFFDTYCQQEVVGALVTHVCSGNEAEVDAALDVLLELIVLNASAMRLNAAFIKGILDY 523

Human   521 LDNISPQQIRKLFYVLSTLAFSKQNEASSHIQDDMHLVIRKQLSSTVFKYKLIGIIGAVTMAGIM 585
            |:|:|||||||:|.:|||||||:|...|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   524 LENMSPQQIRKIFCILSTLAFSQQPGTSNHIQDDMHLVIRKQLSSTVFKYKLIGIIGAVTMAGIM 588

Human   586 AADRSESPSLTQERANLSDEQCTQVTSLLQLVHSCSEQSPQASALYYDEFANLIQHEKLDPKALE 650
            |.||:...:.||..|::|.||.|||||||||||||:|.||.||:|||||||||||..||.||.||
  Rat   589 AEDRTMPSNSTQRSASVSSEQHTQVTSLLQLVHSCTEHSPWASSLYYDEFANLIQERKLAPKTLE 653

Human   651 WVGHTICNDFQDAFVVDSCVVPEGDFPFPVKALYGLEEYDTQDGIAINLLPLLFSQDFAKDGGPV 715
            ||..||.||||||||||.|.||||||||||||||||||.:|||||.||||||.| |:||||...|
  Rat   654 WVAQTIFNDFQDAFVVDFCAVPEGDFPFPVKALYGLEECNTQDGIVINLLPLFF-QEFAKDVSQV 717

Human   716 TSQESGQKLVSPLCLAPYFRLLRLCVERQHNGNLEEIDGLLDCPIFLTDLEPGEKLESMSAKERS 780
            |||||.||.:||||||.:||||||||.|||||||:|||.|||||:||.||||||||||||||:||
  Rat   718 TSQESSQKSMSPLCLASHFRLLRLCVARQHNGNLDEIDALLDCPLFLPDLEPGEKLESMSAKDRS 782

Human   781 FMCSLIFLTLNWFREIVNAFCQETSPEMKGKVLTRLKHIVELQIILEKYLAVTPDYVPPLGNFDV 845
            .||||.|||.|||||:||||||:||||||||||:|||.:||||.||||||||.||||||..:.|:
  Rat   783 LMCSLTFLTFNWFREVVNAFCQQTSPEMKGKVLSRLKDLVELQEILEKYLAVIPDYVPPFTSVDL 847

Human   846 ETLDITPHTVTAISAKIRKKGKI-ERKQKTDGSKTSSSDTLSEEKNSECDPTPSHRGQLNKEFTG 909
            :|||:.|.:.:|::||.|.|||. .:|||.|.|..|.:|||..|..||||..||.:.|::||.||
  Rat   848 DTLDVIPRSNSAVAAKSRHKGKTGGKKQKADSSTASCTDTLLTEDTSECDVAPSGKSQVDKESTG 912

Human   910 KEEKTSLLLHNSHAFFRELDIEVFSILHCGLVTKFILDTEMHTEATEVVQLGPPELLFLLEDLSQ 974
            ||.||.:.|.|..|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
  Rat   913 KEGKTFVSLQNYRAFFRELDIEVFSILHSGLVTKFILDTEMHTEATEVVQLGPAELLFLLEDLSQ 977

Human   975 KLESMLTPPIARRVPFLKNKGSRNIGFSHLQQRSAQEIVHCVFQLLTPMCNHLENIHNYFQCLAA 1039
            |||:.|||...:||.|.|||||||||||||.|||.|:|||||.|||||||||||||||:||||.|
  Rat   978 KLENRLTPSFTKRVCFFKNKGSRNIGFSHLHQRSVQDIVHCVVQLLTPMCNHLENIHNFFQCLGA 1042

Human  1040 ENHGVVDGPGVKVQEYHIMSSCYQRLLQIFHGLFAWSGFSQPENQNLLYSALHVLSSRLKQGEHS 1104
            ||..|.|...|..||::.||||||:|||:||.|.||.||:...|..||.|||.||:|||||.|..
  Rat  1043 ENLSVNDKARVTAQEHYTMSSCYQKLLQVFHALLAWKGFTHQSNHRLLRSALEVLASRLKQTEEG 1107

Human  1105 QPLEELLSQSVHYLQNFHQSIPSFQCALYLIRLLMVILEKSTASAQNKEKIASLARQFLCRVWPS 1169
            ||||||||||..||||...|||||||.|||:||||.:||||....|.|||:||||:|.|||.||.
  Rat  1108 QPLEELLSQSFSYLQNLQHSIPSFQCGLYLLRLLMALLEKSAVPTQKKEKLASLAKQLLCRAWPH 1172

Human  1170 GDKEKSNISNDQLHALLCIYLEHTESILKAIEEIAGVGVPELINSPKDASSSTFPTLTRHTFVVF 1234
            |||||:...||.||.|||||||||:::|||||||.|||||||:|:||||||||||||||||||:|
  Rat  1173 GDKEKNPTFNDHLHDLLCIYLEHTDNVLKAIEEITGVGVPELVNAPKDASSSTFPTLTRHTFVIF 1237

Human  1235 FRVMMAELEKTVKKIEPGTAADSQQIHEEKLLYWNMAVRDFSILINLIKVFDSHPVLHVCLKYGR 1299
            |||||||||||||.::.|||.||||:|||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||
  Rat  1238 FRVMMAELEKTVKGLQAGTATDSQQVHEEKLLYWNMAVRDFSILINLMKVFDSYPVLHVCLKYGR 1302

Human  1300 LFVEAFLKQCMPLLDFSFRKHREDVLSLLETFQLDTRLLHHLCGHSKIHQDTRLTQHVPLLKKTL 1364
            .|||||||||||||||||||||:||||||:|.||:||||||||||||||||||||:|||||||:|
  Rat  1303 RFVEAFLKQCMPLLDFSFRKHRDDVLSLLQTLQLNTRLLHHLCGHSKIHQDTRLTKHVPLLKKSL 1367

Human  1365 ELLVCRVKAMLTLNNCREAFWLGNLKNRDLQGEEIKSQ--NSQESTADESEDDMSSQASKSKATE 1427
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||  :|.|:|:::|||.|:|..|:::|
  Rat  1368 ELLVCRVKAMLVLNNCREAFWLGTLKNRDLQGEEIISQHPSSPENTSEDSEDGMTSYVSRNRA-- 1430

Human  1428 VSLQNPPESGTDG 1440
              :::..:...||
  Rat  1431 --IEDGEDEANDG 1441

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
FANCD2	NP_149075.2	Interaction with FANCE	1..291		223/289 (77%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..37		24/35 (69%)
		FancD2	35..1415	CDD:464225	1059/1382 (77%)
		Interaction with BRCA2	248..359		86/110 (78%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	868..906		17/38 (45%)
Fancd2	NP_001001719.1	FancD2	38..1420	CDD:464225	1059/1382 (77%)